CN113742493B 一种病理知识图谱的构建方法及装置 （志诺维思（北京）基因科技有限公司）

司本申请提供了一种病理知识图谱的构建方疾病类实体对和用于表征疾病类实体对中的两医学规则知识库包括解读类实体对和用于表征解读类实体对中的两个解读实体之间关联的第于目标知识库形成目标病理知识图谱以进行存2根据不同语料来源的医疗文本数据，创建病理数据知识库，所疾病类实体对和用于表征疾病类实体对中的两个疾病实体之间关联的第一实读类实体对和用于表征解读类实体对中的两个解读实体之间关联的第二实体基于所述等价类实体，将所述病理数据知识库和所述医学规则知基于所述目标知识库形成目标病理知识图谱根据疾病变异解读关系，确定与所提取的第一疾病实体存在确定与所述变异解读实体存在一度解读关系或者多确定与所述变异解读实体存在基因变异解读关系的基因变异确定与所述基因变异序列存在一度解读关系或者多将存在一度解读关系的实体确定为解读类实体对，将解读类实体对将所述医疗文本数据输入实体识别模型，获得多个疾病类实体针对每个预测实体对，将该预测实体对输入关系识别模型，获得该基于所述预测实体关系，从所述多个预测实体对中筛选出符合实将筛选出的预测实体对确定为疾病类实体对，将筛选出的预将所确定的词向量和句子向量输入关系识别模型，获得预测从所述医学规则知识库的解读类实体对中提取多个第3从所述病理数据知识库的疾病类实体对中提取多个第将相似度最大的第一实体集和第二实体集中的第一疾病实体和第二疾病实体确定为将所述目标病理知识图谱以关系型数据库的形式接收用户的数据解读请求，所述数据解读请求中包括目标疾病实体如果确定搜索类型为单层查询或者短路径业务搜索，如果确定搜索类型为多层查询或者多路径业务搜索，则从图数输出与数据解读请求对应的搜索结果，所述搜索结果包括搜理数据知识库包括疾病类实体对和用于表征疾病类实体对中的两个疾病实体之间关联的第一实体关系；学规则知识库包括解读类实体对和用于表征解读类实体对中的两个解读实体之间关联的融合模块，用于基于所述等价类实体，将所述病理数据知识库根据疾病变异解读关系，确定与所提取的第一疾病实体存在确定与所述变异解读实体存在一度解读关系或者多确定与所述变异解读实体存在基因变异解读关系的基因变异4确定与所述基因变异序列存在一度解读关系或者多将存在一度解读关系的实体确定为解读类实体对，将解读类实体对算机程序被处理器运行时执行如权利要求1至6中任一所述的病理知识图谱的构建方法的5[0002]医疗知识图谱的构建目的大多是为了解决临床业务或者互联网医疗业务的场景6务搜索，则从关系型数据库中搜索与目标疾病实体对应的疾病类实体对和第一实体关系，理数据知识库包括疾病类实体对和用于表征疾病类实体对中的两个疾病实体之间关联的第一实体关系；学规则知识库包括解读类实体对和用于表征解读类实体对中的两个解读实体之间关联的7此处附图中描述和示出的本申请实施例的组件可以以各种不同的配置来布置和设计。因89[0048]在步骤S104中，将病理数据知识库和医学规则知识库通[0050]在步骤S105中，可以将目标病理知识图谱以关系型数据库的形式进行存储；和/适用于单层查询或者短路径的搜索业务，图数据库适用于多层查询或遍历查询的搜索业[0060]这里的关系识别模型是一种双向循环神经网络(GRU)加注意力机制的标准模型训[0064]将模型预测出的预测实体对和预测实体对中两个疾病类实体之间的预测实体关[0066]将筛选过后的预测实体对确定为最终的疾病类实体对并基于疾病类实体之间的[0071]基于第一疾病实体，确定出与其存在疾病解读关系的变异解读实体(疾病变异解度解读关系的顺序依次梳理出其他解读类实体类[0075]人工梳理出与变异解读实体存在基因变异解读关系的基因变异序列实体类别下[0082]根据前面创建的医学规则知识库中解读类实体对中获取疾病实体类别下的所有变异序列。[0099]具体的，在数据库中搜索出与目标疾病实体对应的疾病类实体对和第一实体关的方式进行训练。用这种学习方式对模型训练结果的平衡分数(F1)和准确率的指标要求[0109]该库和上一个库相连的地方是为疾病名，该实体与自身的关系为同义词和上下[0122]第一创建模块610，用于根据不同语料来源的医疗文本数据，创建病理数据知识医学规则知识库包括解读类实体对和用于表征解读类实体对中的两个解读实体之间关联得该预测实体对中的两个疾病实体之间的预测实[0144]第二获取模块，用于从医学规则知识库的解读类实体对中提取多个第一疾病实[0146]第三获取模块，用于从病理数据知识库的疾病类实体对中提取多个第二疾病实[0161]本申请实施例还提供一种计算机可读存储介质，该存储介质上存储有计算机程方案本质上或者说对现有技术做出贡献的部分或者该技术方案的部分可以以软件产品的