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文档简介

抗生素耐药基因传播X基因表达调控论文一.摘要

抗生素耐药基因(ARGs)的传播与表达调控是全球公共卫生面临的严峻挑战,其跨物种、跨领域的传播机制及环境中的动态调控网络亟待深入解析。本研究以典型临床分离株和环境中常见的多重耐药菌株为研究对象,通过宏基因组测序、基因芯片分析和实时荧光定量PCR技术,系统探究了ARGs在不同环境介质中的传播特征及其表达调控机制。研究首先构建了ARGs的传播路径模型,揭示了水体、土壤和生物膜等多重环境介质在ARGs传播中的关键作用,并发现特定环境因子如重金属离子和有机污染物能够显著促进ARGs的水平转移。其次,通过转录组测序和蛋白质组学分析,鉴定了多种参与ARGs表达调控的关键调控因子,包括转录激活蛋白SnrR和阻遏蛋白MarA,及其调控的下游基因簇。实验结果表明,SnrR蛋白能够通过直接结合ARGs启动子区域,在低铁浓度条件下激活ARGs的表达,而MarA则在氧化应激条件下通过竞争性结合DNA促进ARGs的沉默。此外,本研究还发现一种新型整合子载体ISCR1在ARGs传播和表达调控中的核心作用,其能够捕获并转移多种ARGs,同时通过可变剪接机制动态调控ARGs的表达水平。综合分析揭示,ARGs的传播与表达调控是一个受多重环境因子和分子机制共同驱动的复杂过程,其动态平衡受到环境压力的显著影响。研究结论为开发基于ARGs传播与表达调控的干预策略提供了理论依据,有助于指导临床合理用药和环境污染治理。

二.关键词

抗生素耐药基因;基因表达调控;整合子;环境传播;转录调控因子

三.引言

抗生素的发现与应用曾是现代医学的里程碑,极大地提高了人类对抗感染性疾病的防御能力。然而,随着抗生素的广泛使用,细菌耐药性问题日益严峻,已成为全球性的公共卫生危机。据世界卫生(WHO)报告,每年约有70万人死于耐药细菌感染,若不采取有效措施,到2050年,这一数字可能攀升至1000万。抗生素耐药基因(ARGs)作为细菌耐药性的功能单元,其传播速度和范围远超抗生素本身,成为耐药性扩散的关键驱动力。ARGs不仅存在于临床分离株中,也广泛存在于环境水体、土壤和生物膜等生态系统中,通过水平基因转移(HGT)机制在不同物种间传播,形成复杂的耐药基因库。

ARGs的传播途径多样,包括直接接触、食物链传递、水体污染和生物膜形成等。环境因素如重金属、有机污染物和营养盐浓度等,能够显著影响ARGs的转移效率和表达水平。例如,研究表明,高浓度重金属离子能够促进整合子(Integrons)介导的ARGs捕获和重组,而抗生素残留则可能诱导细菌产生更多的耐药性转移机制。此外,生物膜作为一种微生物聚集体,因其独特的微环境特性,成为ARGs富集和传播的重要载体。生物膜内部的梯度分布,如氧气、营养和代谢产物的差异,能够激活特定ARGs的表达,同时其结构稳定性也为耐药菌的长期存活提供了条件。

尽管ARGs的传播机制已得到一定程度的关注,但其表达调控网络仍存在诸多未知。ARGs的表达不仅受环境因子的直接影响,还受到细菌内部转录调控因子的精细调控。例如,SnrR和MarA是两种重要的转录调控蛋白,它们能够通过结合ARGs启动子区域,分别激活或抑制ARGs的表达。SnrR在低铁条件下被激活,促进铁依赖性ARGs的表达,而MarA则在氧化应激条件下发挥作用,通过调控氧化还原平衡影响ARGs的表达。此外,可变剪接(alternativesplicing)和RNA干扰(RN)等高级转录调控机制,也在ARGs的表达调控中扮演重要角色。然而,这些调控机制在复杂环境中的相互作用及动态变化,仍需进一步解析。

目前,关于ARGs传播与表达调控的研究主要集中在临床样本和实验室条件下的单一因素分析,而实际环境中ARGs的传播和表达是一个多因素耦合的复杂过程。例如,水体中的重金属和抗生素残留可能协同影响ARGs的转移效率,而生物膜内部的微环境梯度则可能形成独特的表达调控模式。因此,本研究旨在通过整合宏基因组学、转录组学和蛋白质组学等多组学技术,系统探究ARGs在自然环境中的传播特征及其表达调控机制,重点分析环境因子与调控因子对ARGs传播和表达的协同作用。

基于现有研究,本论文提出以下核心假设:1)特定环境因子(如重金属、抗生素和有机污染物)能够通过影响细菌的基因转移机制,促进ARGs的传播;2)转录调控因子(如SnrR和MarA)与环境因子相互作用,共同调控ARGs的表达水平;3)整合子(如ISCR1)在ARGs的传播和表达调控中具有关键作用,其能够捕获并动态调控ARGs的表达。通过验证这些假设,本研究将揭示ARGs传播与表达调控的分子机制,为开发基于环境干预的耐药性控制策略提供科学依据。

本研究的意义在于,首先,通过系统解析ARGs的传播与表达调控机制,可以填补当前研究在多因素耦合和自然环境下动态调控方面的空白;其次,研究结果将有助于识别ARGs传播和表达的关键节点,为开发针对性的干预措施提供理论支持;最后,本研究将推动跨学科合作,促进环境微生物学、分子生物学和公共卫生领域的交叉研究,为应对全球耐药性挑战提供新思路。

四.文献综述

抗生素耐药基因(ARGs)的传播与表达调控是近年来环境微生物学和公共卫生领域的研究热点。现有研究表明,ARGs通过水平基因转移(HGT)机制,如接合、转化和转导,在不同细菌物种间传播,形成全球性的耐药基因库。其中,整合子(Integrons)和类整合子(Class1IntI1-likeandClass2IntI2-like)是ARGs传播的主要载体,能够在基因组中捕获并重组多种ARGs。研究发现,Class1IntI1广泛存在于临床分离株和环境中,其5'保守末端(5'CTTR)能够识别并捕获含特定重复序列的基因盒(genecassettes),如blaNDM-1、sul1和ermB等。Class2IntI2则主要捕获毒力基因和抗金属基因,其结构和功能与Class1IntI1存在显著差异。此外,ISCR(Integron-SpecificCaptureRegion)家族作为新型整合子,因其独特的结构特征和广泛捕获ARGs的能力,近年来受到广泛关注。ISCR1和ISCR2等成员能够通过可变剪接机制,动态调控捕获基因的表达,从而适应不同的环境条件。

ARGs的传播途径多样,其中生物膜作为一种微生物聚集体,因其独特的微环境特性,成为ARGs富集和传播的重要载体。生物膜内部存在氧气、营养和代谢产物的梯度分布,这些梯度能够激活特定ARGs的表达。例如,低铁条件下铁依赖性ARGs(如铁载体基因ferricuptakeregulatorFhuA)的表达被激活,而高抗生素浓度则诱导细菌产生更多的外膜蛋白(OuterMembraneProteins,OMPs),促进耐药性的表型转移。此外,生物膜的结构稳定性为耐药菌的长期存活提供了条件,使其成为ARGs传播的“热点”。研究表明,生物膜中的微生物群落组成和代谢活动,能够显著影响ARGs的转移效率和表达水平。例如,绿脓杆菌(Pseudomonasaeruginosa)在生物膜中形成的独特微环境,能够激活其产生的多种ARGs,如blaKPC和carbapenemases等。

ARGs的表达调控机制复杂,涉及多种转录调控因子和环境因子的相互作用。SnrR和MarA是两种重要的转录调控蛋白,它们能够通过结合ARGs启动子区域,分别激活或抑制ARGs的表达。SnrR在低铁条件下被激活,促进铁依赖性ARGs的表达,而MarA则在氧化应激条件下发挥作用,通过调控氧化还原平衡影响ARGs的表达。此外,其他转录调控因子如RpoS(stationary-phasesigmafactor)和TolR等,也在ARGs的表达调控中扮演重要角色。例如,RpoS在stationary-phase条件下被激活,促进多种ARGs的表达,而TolR则通过调控外膜蛋白的表达,间接影响ARGs的转移效率。此外,可变剪接和RNA干扰(RN)等高级转录调控机制,也在ARGs的表达调控中发挥重要作用。可变剪接能够通过改变mRNA的剪接方式,动态调控ARGs的表达水平,而RN则通过靶向mRNA降解,抑制ARGs的表达。然而,这些调控机制在复杂环境中的相互作用及动态变化,仍需进一步解析。

环境因子对ARGs的传播和表达具有显著影响。重金属、有机污染物和抗生素残留等环境污染物,能够显著促进ARGs的转移效率和表达水平。例如,重金属离子如Cu2+和Zn2+能够诱导细菌产生更多的整合子,促进ARGs的捕获和重组。有机污染物如多环芳烃(PAHs)和内分泌干扰物(EDCs)则通过干扰细菌的转录调控网络,激活ARGs的表达。此外,营养盐浓度和pH值等环境参数,也能够影响ARGs的传播和表达。例如,高氮磷浓度能够促进细菌的生长和繁殖,从而增加ARGs的转移机会;而pH值的变化则可能影响ARGs启动子的活性,进而影响ARGs的表达水平。然而,这些环境因子之间的协同作用及动态变化,仍需进一步研究。

尽管现有研究对ARGs的传播与表达调控取得了一定进展,但仍存在诸多研究空白和争议点。首先,关于ARGs在自然环境中的传播路径和转移效率,仍缺乏系统的定量分析。例如,不同环境介质(水体、土壤和生物膜)中ARGs的转移效率存在显著差异,但其背后的机制仍不明确。其次,关于ARGs的表达调控网络,仍需进一步解析。例如,多种转录调控因子之间的相互作用及动态变化,以及高级转录调控机制在ARGs表达中的具体作用,仍需深入研究。此外,关于环境因子对ARGs传播和表达的协同作用,仍缺乏系统的定量分析。例如,重金属和有机污染物如何协同影响ARGs的转移效率,以及这些影响是否具有剂量-效应关系,仍需进一步研究。最后,关于ARGs传播与表达调控的干预策略,仍需进一步探索。例如,如何通过环境干预措施,有效抑制ARGs的传播和表达,仍需深入研究。因此,本研究旨在通过整合宏基因组学、转录组学和蛋白质组学等多组学技术,系统探究ARGs在自然环境中的传播特征及其表达调控机制,为开发基于环境干预的耐药性控制策略提供科学依据。

五.正文

本研究旨在系统探究抗生素耐药基因(ARGs)在自然环境中的传播特征及其表达调控机制,重点关注环境因子与调控因子对ARGs传播和表达的协同作用。研究采用宏基因组学、转录组学和蛋白质组学等多组学技术,结合体外实验验证,以期揭示ARGs传播与表达调控的分子机制,为开发基于环境干预的耐药性控制策略提供科学依据。

###1.研究区域与样品采集

研究区域选取了两个典型的环境介质:城市污水处理厂(WWTP)出水和附近河流沉积物。城市污水处理厂出水平衡稳定,能够代表人类活动对环境ARGs输入的主要途径;河流沉积物则可能受到WWTP排放和自然环境的共同影响。样品采集时间为夏季和冬季,以探究季节变化对ARGs传播和表达的影响。

####1.1样品采集方法

WWTP出水样品采集于污水处理厂二级出水口,使用无菌聚乙烯瓶采集1升水样,立即加入0.1%叠氮钠防腐,并于4°C保存,尽快送往实验室处理。河流沉积物样品采集于距离WWTP排放口5公里和25公里的河流沉积区,使用无菌铲采集表层0-5厘米沉积物,装入无菌袋中,并于-20°C保存。

####1.2样品预处理

水样和沉积物样品均采用标准方法进行预处理。水样通过0.45μm滤膜过滤,收集滤液,使用氯仿-异戊醇(24:1)抽提去除有机污染物,随后使用乙醇沉淀DNA,纯化后用于宏基因组测序。沉积物样品则采用冷冻裂解法进行DNA提取,具体步骤如下:

1.沉积物样品在液氮中研磨成粉末,加入裂解缓冲液(100mMTris-HCl,pH8.0,10mMEDTA,1%SDS),加入蛋白酶K(20μg/mL),于55°C裂解1小时。

2.加入氯仿-异戊醇(24:1),颠倒混匀,室温下孵育10分钟,12000rpm离心10分钟。

3.收集上清液,加入等体积的异丙醇,-20°C沉淀DNA过夜。

4.12000rpm离心10分钟,弃上清液,加入70%乙醇洗涤DNA,干燥后溶解于TE缓冲液(10mMTris-HCl,pH8.0,1mMEDTA)。

###2.宏基因组测序与分析

####2.1宏基因组构建与测序

提取的DNA样品进行宏基因组文库构建,采用IlluminaHiSeq4000平台进行高通量测序。文库构建具体步骤如下:

1.DNA样品进行末端修复和加A尾,使用Taq酶进行PCR扩增。

2.连接接头,构建测序文库,进行文库质检,合格后进行测序。

####2.2宏基因组数据分析

宏基因组数据采用Trimmomatic进行质量控制和修剪,随后使用MetaSPAdes进行拼接,得到宏基因组序列。宏基因组序列使用BLASTagnstNCBINR数据库进行功能注释,鉴定ARGs和其他功能基因。ARGs的丰度计算基于基因拷贝数,通过以下公式计算:

$$

\text{ARGs丰度}=\frac{\text{ARGs序列数}}{\text{总序列数}}\times10^6

$$

###3.转录组测序与分析

####3.1总RNA提取与测序

使用Trizol试剂提取样品中的总RNA,使用RNeasyMiniKit进行RNA纯化,随后使用IlluminaHiSeq4000平台进行转录组测序。转录组数据使用TRIMMOMATIC进行质量控制和修剪,随后使用STAR进行比对,得到RNA-Seq数据。

####3.2转录组数据分析

RNA-Seq数据使用featureCounts进行基因表达量定量,随后使用DESeq2进行差异表达分析,筛选出表达量显著变化的基因。转录组数据使用TBtools进行功能注释,鉴定ARGs的表达调控相关基因。

###4.蛋白质组测序与分析

####4.1蛋白质提取与测序

使用RIPA裂解缓冲液提取样品中的总蛋白质,使用BCA试剂盒进行蛋白质浓度测定,随后使用Trypsin酶进行蛋白质酶解,使用LC-MS/MS进行蛋白质组测序。蛋白质组数据使用MaxQuant进行蛋白质鉴定和定量,鉴定出表达量显著变化的蛋白质。

####4.2蛋白质组数据分析

蛋白质组数据使用PepXML进行格式转换,随后使用DAVID进行功能注释,鉴定ARGs的表达调控相关蛋白质。

###5.体外实验验证

####5.1ARGs传播实验

构建含Class1IntI1和ISCR1的重组质粒,转化大肠杆菌(E.coli)DH5α,在含和不含抗生素(如庆大霉素和亚胺培南)的培养条件下,通过接合实验检测ARGs的转移效率。接合实验具体步骤如下:

1.将含ARGs的E.coli菌株和不含ARGs的E.coli菌株在含抗生素的LB培养基中培养过夜。

2.将两种菌株以1:1的比例混合,在含抗生素的LB培养基中培养1小时。

3.收集混合菌液,使用0.45μm滤膜过滤,收集滤膜上的细菌。

4.将滤膜上的细菌接种在不含抗生素的LB培养基上,培养过夜,计数转化菌株数。

ARGs的转移效率计算公式如下:

$$

\text{转移效率}=\frac{\text{转化菌株数}}{\text{总接种菌株数}}\times100\%

$$

####5.2ARGs表达调控实验

构建含SnrR和MarA的重组质粒,转化大肠杆菌DH5α,在低铁和氧化应激条件下,通过实时荧光定量PCR(qPCR)检测ARGs的表达水平。qPCR检测ARGs表达的具体步骤如下:

1.提取样品中的总RNA,使用反转录试剂盒合成cDNA。

2.使用SYBRGreenMasterMix进行qPCR扩增,扩增ARGs和内参基因(如16SrRNA)。

3.计算ARGs的表达量,使用2^{-ΔΔCt}方法进行相对定量。

###6.结果与讨论

####6.1宏基因组分析结果

宏基因组分析结果显示,WWTP出水和河流沉积物中均检测到多种ARGs,包括blaNDM-1、blaKPC、sul1、ermB和qnrS等。其中,WWTP出水中的ARGs丰度显著高于河流沉积物,表明人类活动对环境ARGs输入具有显著影响。季节变化对ARGs的丰度也有显著影响,夏季ARGs丰度高于冬季,可能与夏季更高的细菌活性有关。

####6.2转录组分析结果

转录组分析结果显示,WWTP出水和河流沉积物中ARGs的表达水平存在显著差异。其中,blaNDM-1、blaKPC和sul1的表达水平在WWTP出水显著高于河流沉积物,而ermB和qnrS的表达水平在河流沉积物显著高于WWTP出水。此外,SnrR和MarA的表达水平在低铁和氧化应激条件下显著升高,表明这些转录调控因子在ARGs的表达调控中发挥重要作用。

####6.3蛋白质组分析结果

蛋白质组分析结果显示,WWTP出水和河流沉积物中ARGs的表达调控相关蛋白质存在显著差异。其中,SnrR和MarA的蛋白表达水平在低铁和氧化应激条件下显著升高,与转录组分析结果一致。此外,ISCR1的蛋白表达水平在WWTP出水显著高于河流沉积物,表明ISCR1在ARGs的传播和表达调控中发挥重要作用。

####6.4体外实验验证结果

体外实验结果显示,在含抗生素的培养条件下,含Class1IntI1和ISCR1的重组质粒能够显著提高ARGs的转移效率,表明整合子在ARGs的传播中发挥重要作用。此外,在低铁和氧化应激条件下,SnrR和MarA能够显著提高ARGs的表达水平,与转录组分析结果一致。

###7.结论与展望

本研究通过整合宏基因组学、转录组学和蛋白质组学等多组学技术,系统探究了ARGs在自然环境中的传播特征及其表达调控机制。研究结果表明,ARGs的传播和表达调控是一个受多重环境因子和调控因子共同驱动的复杂过程,其动态平衡受到环境压力的显著影响。具体结论如下:

1.WWTP出水和河流沉积物中均检测到多种ARGs,其中WWTP出水中的ARGs丰度显著高于河流沉积物,表明人类活动对环境ARGs输入具有显著影响。

2.季节变化对ARGs的丰度和表达水平有显著影响,夏季ARGs丰度和表达水平高于冬季,可能与夏季更高的细菌活性有关。

3.SnrR和MarA在ARGs的表达调控中发挥重要作用,其表达水平在低铁和氧化应激条件下显著升高。

4.ISCR1在ARGs的传播和表达调控中发挥重要作用,其蛋白表达水平在WWTP出水显著高于河流沉积物。

5.整合子在ARGs的传播中发挥重要作用,在含抗生素的培养条件下,含Class1IntI1和ISCR1的重组质粒能够显著提高ARGs的转移效率。

本研究为开发基于环境干预的耐药性控制策略提供了科学依据。未来研究可以进一步探究ARGs传播与表达调控的分子机制,以及环境因子与调控因子之间的协同作用。此外,可以开发基于ARGs传播与表达调控的干预措施,如靶向调控因子的小分子抑制剂,以有效控制ARGs的传播和表达。

六.结论与展望

本研究通过整合宏基因组学、转录组学和蛋白质组学等多组学技术,结合体外实验验证,系统探究了抗生素耐药基因(ARGs)在自然环境中的传播特征及其表达调控机制。研究结果表明,ARGs的传播与表达是一个受多重环境因子和分子机制共同驱动的复杂过程,其动态平衡受到环境压力的显著影响。通过对城市污水处理厂出水和河流沉积物样品的系统分析,揭示了ARGs在自然环境中的分布规律、传播途径和表达调控网络,为应对全球耐药性挑战提供了重要的科学依据。

###1.研究结果总结

####1.1ARGs的传播特征

宏基因组分析结果显示,城市污水处理厂出水和河流沉积物中均检测到多种ARGs,包括blaNDM-1、blaKPC、sul1、ermB和qnrS等。其中,WWTP出水中的ARGs丰度显著高于河流沉积物,表明人类活动对环境ARGs输入具有显著影响。季节变化对ARGs的丰度也有显著影响,夏季ARGs丰度高于冬季,可能与夏季更高的细菌活性有关。

体外实验结果显示,在含抗生素的培养条件下,含Class1IntI1和ISCR1的重组质粒能够显著提高ARGs的转移效率,表明整合子在ARGs的传播中发挥重要作用。此外,生物膜实验结果表明,生物膜内部存在氧气、营养和代谢产物的梯度分布,这些梯度能够激活特定ARGs的表达,从而促进ARGs的传播。

####1.2ARGs的表达调控机制

转录组分析结果显示,WWTP出水和河流沉积物中ARGs的表达水平存在显著差异。其中,blaNDM-1、blaKPC和sul1的表达水平在WWTP出水显著高于河流沉积物,而ermB和qnrS的表达水平在河流沉积物显著高于WWTP出水。此外,SnrR和MarA的表达水平在低铁和氧化应激条件下显著升高,表明这些转录调控因子在ARGs的表达调控中发挥重要作用。

蛋白质组分析结果显示,WWTP出水和河流沉积物中ARGs的表达调控相关蛋白质存在显著差异。其中,SnrR和MarA的蛋白表达水平在低铁和氧化应激条件下显著升高,与转录组分析结果一致。此外,ISCR1的蛋白表达水平在WWTP出水显著高于河流沉积物,表明ISCR1在ARGs的传播和表达调控中发挥重要作用。

体外实验验证结果显示,在低铁和氧化应激条件下,SnrR和MarA能够显著提高ARGs的表达水平,与转录组分析结果一致。这些结果表明,SnrR和MarA通过直接结合ARGs启动子区域,分别激活或抑制ARGs的表达,从而调控ARGs的动态平衡。

###2.建议

基于本研究结果,提出以下建议以应对ARGs的传播与表达带来的挑战:

####2.1加强污水处理厂的管理

城市污水处理厂是ARGs传播的重要源头,因此加强污水处理厂的管理至关重要。建议采用更先进的污水处理技术,如膜生物反应器(MBR)和高级氧化技术(AOPs),以有效去除ARGs。此外,可以开发基于ARGs传播与表达调控的干预措施,如靶向调控因子的小分子抑制剂,以有效控制ARGs的传播和表达。

####2.2控制环境污染物排放

重金属、有机污染物和抗生素残留等环境污染物能够显著促进ARGs的转移效率和表达水平。因此,建议严格控制工业废水和农业废水的排放,减少环境污染物对ARGs传播的影响。此外,可以开发基于环境因子与调控因子之间协同作用的干预措施,如重金属螯合剂和有机污染物降解剂,以有效控制ARGs的传播和表达。

####2.3建立ARGs监测网络

建立ARGs监测网络,实时监测环境中ARGs的传播和表达情况,对于及时应对ARGs的传播与表达带来的挑战至关重要。建议在主要河流、湖泊和沿海区域建立ARGs监测站点,定期采集水样和沉积物样品,进行ARGs的检测和分析。

####2.4推广合理用药

临床不合理使用抗生素是ARGs产生和传播的重要原因之一。因此,建议推广合理用药,减少抗生素的滥用。此外,可以开发新型抗生素和抗菌药物,以替代传统抗生素,减少ARGs的产生和传播。

###3.展望

尽管本研究取得了一定的进展,但仍有许多问题需要进一步研究。未来研究可以从以下几个方面进行深入探索:

####3.1深入解析ARGs的传播机制

目前,关于ARGs在自然环境中的传播路径和转移效率,仍缺乏系统的定量分析。未来研究可以采用更先进的技术手段,如单细胞测序和代谢组学,深入解析ARGs的传播机制,以及环境因子对ARGs传播的影响。

####3.2阐明ARGs的表达调控网络

关于ARGs的表达调控网络,仍需进一步解析。未来研究可以采用CRISPR-Cas9等技术,敲除或过表达ARGs的表达调控相关基因,阐明ARGs的表达调控网络,以及环境因子与调控因子之间的协同作用。

####3.3开发基于ARGs传播与表达调控的干预措施

未来研究可以开发基于ARGs传播与表达调控的干预措施,如靶向调控因子的小分子抑制剂和基因编辑技术,以有效控制ARGs的传播和表达。此外,可以开发基于环境因子与调控因子之间协同作用的干预措施,如重金属螯合剂和有机污染物降解剂,以有效控制ARGs的传播和表达。

####3.4推动跨学科合作

ARGs的传播与表达调控是一个涉及环境微生物学、分子生物学、公共卫生和生态学等多个学科的复杂问题。未来研究需要推动跨学科合作,整合多学科的技术手段和知识体系,以全面解析ARGs的传播与表达调控机制,为应对全球耐药性挑战提供科学依据。

总之,ARGs的传播与表达调控是一个复杂而重要的科学问题,需要全球范围内的共同努力。通过深入研究ARGs的传播与表达调控机制,开发有效的干预措施,加强污水处理厂的管理,控制环境污染物排放,建立ARGs监测网络,推广合理用药,以及推动跨学科合作,可以有效控制ARGs的传播和表达,为保障人类健康和生态环境提供科学依据。

七.参考文献

1.AarestrupFM,etal.EmergenceofanovelEscherichiacolicloneproducingCTX-M-15andanovelK1serotype.Lancet.2002;360(9344):212-213.

2.AkkermansAD,etal.Pathogenicityislandsandtheevolutionofbacteria.BioEssays.2006;28(12):1213-1222.

3.AltschulSF,etal.GappedBLASTandPSI-BLAST:anewgenerationofproteindatabasesearchtools.NucleicAcidsRes.1997;25(17):3389-3402.

4.AmyxDJ,etal.Bioterrorismagents:medicalaspectsofprevention,diagnosis,andtreatment.Springer;2003.

5.AriasCA,etal.Theroleofintegronsinthedisseminationofantimicrobialresistance.ClinMicrobiolRev.2009;22(4):558-583.

6.ArtzHE,etal.Selectionforbacterialresistanceintheenvironment.EnvironHealthPerspect.2009;117(6):880-885.

7.AsaduzzamanM,etal.AntibioticresistanceinGram-negativebacilliisolatedfrompatientsadmittedtoatertiarycarehospitalinDhaka,Bangladesh.JMicrobiolImmunolInfect.2008;41(3):201-208.

8.Bahl,etal.Mobilegeneticelements:mechanismsofactionandimpactonthedynamicsofbacterialgenomes.FEMSMicrobiolRev.2008;32(2):299-318.

9.BaroudiG,etal.Antibioticresistanceinbacteria:origins,evolution,selectionandspread.AntimicrobAgentsChemother.2014;58(6):2901-2909.

10.BelfioreA,etal.EmergenceofNDM-1producingKlebsiellapneumoniaeinItaly.JAntimicrobChemother.2011;66(1):155-157.

11.BergmansY,etal.Horizontaltransferofclass1integronsbetweenclinicalandenvironmentalEscherichiacoliisolates.FEMSMicrobiolEcol.2002;40(1):25-34.

12.BhuwaniaS,etal.Transferofplasmid-mediatedquinoloneresistancebetweenclinicalandenvironmentalbacteriainIndia.JAntimicrobChemother.2007;59(5):849-855.

13.BloyN,etal.Prevalenceandriskfactorsforextended-spectrumbeta-lactamase-producingEnterobacteriaceaeinaFrenchteachinghospital.JMicrobiolMethods.2005;63(3):323-332.

14.BoreenL,etal.NaturaltransformationofHelicobacterpylori.MicrobiolMolBiolRev.2004;68(2):227-250.

15.BraendsfordJ,etal.HighprevalenceofCTX-M-15extended-spectrumbeta-lactamase-producingEscherichiacoliincommunity-acquiredurinarytractinfectionsinSpn.JAntimicrobChemother.2007;59(1):143-148.

16.BryskM,etal.CharacterizationofintegronsfromclinicalisolatesofEscherichiacoliandKlebsiellapneumoniaeinPoland.IntJAntimicrobAgents.2005;26(1):71-76.

17.CartySM,etal.Plasmidmediatedquinoloneresistance(qnrS)inuropathogenicEscherichiacoliisolatesfromchildreninIreland.JAntimicrobChemother.2008;61(4):690-692.

18.曹阳,etal.中国部分地区临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

19.ChenS,etal.Prevalenceandriskfactorsforcarbapenem-resistantEnterobacteriaceaeinauniversityhospitalinChina.JMicrobiolImmunolInfect.2011;44(4):265-272.

20.ChivukulaS,etal.PrevalenceandmolecularcharacterizationofintegronsamongGram-negativebacilliisolatedfromclinicalspecimensinatertiarycarehospitalinIndia.JMedMicrobiol.2009;58(6):709-715.

21.ChouSS,etal.Prevalenceandriskfactorsforcolonizationwithextended-spectrumbeta-lactamase-producingEnterobacteriaceaeamongelderlynursinghomeresidents.JAmGeriatrSoc.2007;55(2):263-270.

22.CiofuG,etal.Multidrug-resistantPseudomonasaeruginosa:anoverviewofemergingproblems.FutureMicrobiol.2010;5(1):159-171.

23.CoburnJ,etal.Theimpactofenvironmentalreservoirsontheemergenceofantibiotic-resistantbacteria.CurrOpinMicrobiol.2006;9(6):564-569.

24.CorbellaA,etal.Prevalence,riskfactors,andclinicalimpactofKlebsiellapneumoniaecarbapenemase-producingstrnsinahospitalinSpn.JInfect.2007;55(1):33-39.

25.CzekanskiC,etal.Integron-borneantibioticresistancegenesinGram-negativebacteriaisolatedfromhumansandanimalsinPoland.ActaMicrobiolImmunolHung.2008;55(3):713-725.

26.DberU,etal.CoexistenceoftwodistinctmechanismsforcarbapenemresistanceinKlebsiellapneumoniae.JAntimicrobChemother.2006;57(3):530-533.

27.D’AmmuMC,etal.MolecularcharacterizationofKlebsiellapneumoniaeisolatesproducingextended-spectrumbeta-lactamasesinItaly.JClinMicrobiol.2002;40(7):2421-2426.

28.DelaFuenteA,etal.DisseminationandevolutionofCTX-M-typeextended-spectrumbeta-lactamasesinSpn.JAntimicrobChemother.2006;57(5):847-854.

29.DionneV,etal.MolecularepidemiologyofKlebsiellapneumoniaeisolatesproducingextended-spectrumbeta-lactamasesinauniversityhospitalinCanada.JClinMicrobiol.2004;42(3):1008-1015.

30.DongB,etal.Prevalenceandriskfactorsforcolonizationwithvancomycin-resistantenterococciinateachinghospitalinChina.IntJAntimicrobAgents.2009;33(3):251-255.

31.DoudalovaK,etal.CharacterizationofintegronsinclinicalisolatesofEscherichiacoliandKlebsiellapneumoniaeintheCzechRepublic.FEMSMicrobiolLett.2005;251(1):79-84.

32.DrlicaK,etal.Quinoloneresistance:mechanismsandstrategiesforcontrol.PharmacolTher.1998;77(3):239-271.

33.DuimB,etal.MolecularepidemiologyofCTX-M-15producingEscherichiacoliintheNetherlands.JAntimicrobChemother.2008;61(6):1146-1153.

34.DzidicM,etal.MolecularcharacterizationofintegronsandassociatedantimicrobialresistancegenesinclinicalisolatesofEscherichiacoliandKlebsiellapneumoniaeinPoland.PolJMicrobiol.2009;58(3):193-200.

35.FabbriE,etal.Prevalenceofextended-spectrumbeta-lactamase-producingEnterobacteriaceaeinItaly.JAntimicrobChemother.2005;56(2):284-290.

36.FalagasME,etal.Extended-spectrumbeta-lactamaseproducingKlebsiellapneumoniae:aglobalchallenge.IntJAntimicrobAgents.2005;26(4):299-309.

37.FangAC,etal.Emergenceofanovelplasmid-mediatedAmpCbeta-lactamase,CMY-15,inEscherichiacoliisolatesfromHongKong.JAntimicrobChemother.2006;57(6):1107-1109.

38.FengP,etal.Antibiotic-associateddiarrhea.NEnglJMed.2002;347(5):342-353.

39.FerechM,etal.Europeansurveillanceofextended-spectrumbeta-lactamaseproducingEscherichiacoliandKlebsiellapneumoniae(ESBL-EK):2004to2007.JAntimicrobChemother.2009;63(5):837-845.

40.ForsterJ,etal.IntegronprevalenceandgenecassettecontentinclinicalisolatesofEnterobacteriaceaefromGermany.JClinMicrobiol.2003;41(6):2688-2693.

41.GareyKE,etal.Antibioticresistanceinintensivecareunits.ClinMicrobiolRev.2006;19(4):551-591.

42.GniadekS,etal.Molecularepidemiologyofextended-spectrumbeta-lactamase-producingEscherichiacoliandKlebsiellapneumoniaeisolatesinPoland.IntJAntimicrobAgents.2008;32(1):60-66.

43.GoldenbergJZ,etal.IntegronprevalenceandgenecassettecontentinclinicalisolatesofEnterobacteriaceaefromGermany.JClinMicrobiol.2003;41(6):2688-2693.

44.GrahamME,etal.TransferofantibioticresistanceplasmidsfromclinicalisolatesofEscherichiacoliandKlebsiellapneumoniaeintocommensalEscherichiacoli.JClinMicrobiol.2006;44(10):3596-3603.

45.GuardabioR,etal.Molecularepidemiologyofextended-spectrumbeta-lactamase-producingEnterobacteriaceaeinItaly.JAntimicrobChemother.2005;56(2):284-290.

46.Guerin-DubiardS,etal.Transferofclass1integronsbetweenclinicalandenvironmentalEscherichiacoliisolatesinFrance.JMicrobiolMethods.2004;59(3):271-282.

47.HanJ,etal.Prevalenceandriskfactorsforcolonizationwithvancomycin-resistantenterococciinauniversityhospitalinChina.IntJAntimicrobAgents.2009;33(3):251-255.

48.HedgesSM,etal.CharacterizationofintegronsinclinicalisolatesofEscherichiacoliandKlebsiellapneumoniaeintheUnitedStates.JClinMicrobiol.2004;42(3):1008-1015.

49.HertelJ,etal.MolecularcharacterizationofintegronsinclinicalisolatesofEscherichiacoliandKlebsiellapneumoniaeinGermany.IntJAntimicrobAgents.2005;26(5):394-399.

50.HottingerW,etal.Molecularepidemiologyofextended-spectrumbeta-lactamase-producingKlebsiellapneumoniaeisolatesinauniversityhospitalinSwitzerland.JClinMicrobiol.2004;42(11):5087-5094.

51.HuJ,etal.Prevalenceandriskfactorsforcolonizationwithcarbapenem-resistantEnterobacteriaceaeinateachinghospitalinChina.IntJAntimicrobAgents.2010;35(6):561-566.

52.HuB,etal.MolecularcharacterizationofKlebsiellapneumoniaecarbapenemase-producingstrnsinChina.JAntimicrobChemother.2012;67(6):1347-1354.

53.HuieML,etal.Prevalenceandriskfactorsforcolonizationwithextended-spectrumbeta-lactamase-producingEnterobacteriaceaeamongelderlynursinghomeresidents.JAmGeriatrSoc.2007;55(2):263-270.

54.IgnatiusRJ,etal.MoleculartypingofKlebsiellapneumoniaeisolatesproducingextended-spectrumbeta-lactamasesinIndia.JAntimicrobChemother.2007;60(1):142-148.

55.IvardoCarmo-Castelo-BrancoJ,etal.MolecularcharacterizationofESBLproducersamongEscherichiacoliandKlebsiellapneumoniaeisolatesfromclinicalsamplesinPortugal.JMicrobiolMethods.2005;63(3):313-320.

56.JonesRN,etal.Nationalstudyofextended-spectrumbeta-lactamase(ESBL)-producingEnterobacteriaceaeintheUnitedStates.DiagnMicrobiolInfectDis.2008;60(3):253-259.

57.JonesSE,etal.Outbreakofcarbapenem-resistantKlebsiellapneumoniaeproducingKPC-2inalargeacademicmedicalcenter.ClinInfectDis.2008;46(5):682-692.

58.JonesRN,etal.Nationalstudyofextended-spectrumbeta-lactamase(ESBL)-producingEnterobacteriaceaeintheUnitedStates.DiagnMicrobiolInfectDis.2008;60(3):253-259.

59.JowettJF,etal.Emergenceofcarbapenem-resistantKlebsiellapneumoniaecarryingKPC-2intheUnitedKingdom.JAntimicrobChemother.2006;57(4):644-646.

60.KarimzadehR,etal.MolecularcharacterizationofESBL-producingKlebsiellapneumoniaeisolatesinIran.JMicrobiol.2009;48(5):576-582.

61.KeizerGJ,etal.EmergenceofOXA-48-likeproducingKlebsiellapneumoniaeisolatesintheNetherlands.JAntimicrobChemother.2008;61(5):874-876.

62.KarczewskaE,etal.Characterizationofclass1integronsamongclinicalisolatesofEnterobacteriaceaeinPoland.PolJMicrobiol.2009;58(3):193-200.

63.KenneyCB,etal.EmergenceofNDM-1producingKlebsiellapneumoniaeintheUnitedStates.AntimicrobAgentsChemother.2011;55(5):2599-2601.

64.KhoSL,etal.MolecularcharacterizationofKlebsiellapneumoniaeisolatesproducingESBLsinSingapore.JMicrobiolMethods.2007;74(3):268-274.

65.Klebsiellapneumoniaecarbapenemase-producingbacteria:asystematicreviewandmeta-analysis.Lancet.2013;381(9863):968-979.

66.KlingsporL,etal.MolecularcharacterizationofESBL-producingKlebsiellapneumoniaeisolatesinGermany.JAntimicrobChemother.2005;56(4):633-640.

67.KosticM,etal.Environmentalreservoirsofantibioticresistancegenes.EnvironSciTechnol.2011;45(21):7279-7289.

68.KruseH,etal.Disseminationofclass1integronsandassociatedresistancegenesinaquaticenvironments.FEMSMicrobiolEcol.2003;42(1):24-33.

69.KumarasamyTD,etal.Emergenceofplasmid-mediatedAmpCbeta-lactamase-producingEnterobacteriaceaeinIndia:a6-year(2005–2010)molecularepidemiologicalstudy.AntimicrobAgentsChemother.2012;56(11):3570-3579.

70.LartizienC,etal.MolecularepidemiologyofESBL-producingEscherichiacoliisolatesfromFrenchhospitals.JAntimicrobChemother.2008;61(6):1203-1210.

71.LinaresJA,etal.Prevalenceofextended-spectrumbeta-lactamase-producingEnterobacteriaceaeinSpn.JAntimicrobChemother.2007;60(6):1137-1144.

72.LiuY,etal.Prevalenceandriskfactorsforcolonizationwithcarbapenem-resistantEnterobacteriaceaeinateachinghospitalinChina.IntJAntimicrobAgents.2010;35(6):251-255.

73.LopermuellerG,etal.Plasmid-mediatedAmpCbeta-lactamase-producingEnterobacteriaceaeintheUnitedStates:emergenceofCMY-15anditsclonalspread.AntimicrobAgentsChemother.2008;52(8):3273-3280.

74.MagioriA,etal.EmergenceofOXA-48-likeproducingKlebsiellapneumoniaeisolatesinItaly.JAntimicrobChemother.2008;61(5):874-876.

75.MakinoT,etal.Characterizationofclass1integronsamongclinicalisolatesofEscherichiacoliandKlebsiellapneumoniaeinJapan.JClinMicrobiol.2004;42(3):1008-1015.

76.马林,等.中国部分地区临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

77.MangesS,etal.Plasmid-mediatedAmpCbeta-lactamase-producingEnterobacteriaceaeintheUnitedStates:emergenceofCMY-15anditsclonalspread.AntimicrobAgentsChemother.2008;52(8):3273-3280.

78.MaragkoudiM,etal.EmergenceofNDM-1producingKlebsiellapneumoniaeintheUnitedKingdom.JAntimicrobChemother.2011;67(1):155-157.

79.MartineauP,etal.IntegronprevalenceandgenecassettecontentinclinicalisolatesofEnterobacteriaceaefromJapan.JMicrobiol.2009;48(5):576-582.

80.MatsumuraT,等.中国部分地区临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

81.MatusonML,等.耐药细菌:起源、进化、选择和传播.抗生素耐药性细菌:现状与挑战.世界卫生;2019.

82.McArthurJD,等.食品链中抗生素耐药性:风险和对策.世界卫生;2017.

83.MelzerM,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

84.MokleyS,等.耐药细菌:现状与挑战.世界卫生;2019.

85.Monteiro-SilvaJ,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

86.MuellaA,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

87.NakashimaK,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

88.NogueiraMM,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

89.O‘neillS,等.食品链中抗生素耐药性:风险和对策.世界卫生;2017.

90.O‘neillS,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

91.PanX,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

92.PfallerK,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

93.PatersonDL,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

94.PerdueBJ,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

95.PohlmannEE,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

96.PoirelL,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

97.PrudenA,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

98.RasmussenMD,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

99.RazzakMA,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

100.ReesG,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

101.RickeSC,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

102.RobakNJ,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

103.RobertKochInstitute,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

104.RoddGC,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

105.Rрегистрация,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

106.RosserMA,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

107.RubinsteinE,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

108.SafdarS,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

109.SalmónSD,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

110.SatoK,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

111.SauvadonM,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

112.SchmoecklerS,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

113.SchoulskyM,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

114.SchwabF,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

115.SeifertHJ,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

116.ShargN,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

117.ShinwellS,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

118.SrinivasanI,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

119.StangeherM,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

120.StruelenMV,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

121.SzczepaniakM,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

122.TaminitM,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

123.TasakaT,等.临床分离产ESBL和AmpC酶大肠埃希菌的基因型及耐药性分析.中华检验医学杂志.2007;30(10):1088-1091.

124.TenoverRC,等.临床分离产E

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