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文档简介
RNA的種類和結構
一、RNA的結構RNA分子中核苷酸之間的連接方式:3´,5´-磷酸二酯鍵RNA分子構象的多樣性二、信使RNA
信使RNA(messengerRNA,mRNA):蛋白質合成的範本,攜帶一個或幾個基因資訊到核糖體上指導蛋白質的合成。DNAmRNA蛋白轉錄翻譯原核細胞
細胞質細胞核DNA內含子外顯子轉錄轉錄後剪接轉運mRNAhnRNA翻譯蛋白真核細胞
大多數真核mRNA的5´末端均在轉錄後加上一個7-甲基鳥苷,同時第一個核苷酸的C´2亦甲基化,形成帽子結構。大多數真核mRNA的3´末端有一個多聚腺苷酸(polyA)結構,稱為多聚A尾。編碼區和非編碼區mRNA結構特點
甲基化(m7G5’ppp5’NmpNp--)
堿基5’,5’-三磷酸酯鍵間或甲基化三、轉移RNA
轉移RNA(transferRNA,tRNA):按照mRNA的資訊,準確地將相應的氨基酸轉運至核糖體,參加蛋白質的合成。
tRNA一般含有73-94核苷酸,單鏈20左右位置上為保守核苷酸含10~20%稀有堿基/修飾堿基3´末端為—CCA-OH;5´末端大多數為G,少數為CtRNA二級結構為典型的髮卡結構,互補鏈相接近形成雙螺旋區,在氫鍵的作用下,分子呈三葉草形。鏈內堿基配對:A-U、G-C、G-U
tRNA的二級結構——三葉草形DlooptRNA的三級結構——
倒L形
四、核糖體RNA
糖體RNA(ribosomeRNA,rRNA):核糖體的結構成分。核糖體作為RNA和蛋白質的複合物負責細胞內蛋白質的合成,是蛋白質合成的場所。
rRNA的種類(根據沉降係數)
沉降係數(sedimentationcoefficient,s)以每單位重力的沉降時間表示,並且通常為1~200×10-13秒範圍,10-13這個因數叫做沉降單位S,即1S=10-13秒原核生物5SrRNA23SrRNA16SrRNA真核生物5SrRNA28SrRNA5.8SrRNA18SrRNAE.Coli16SrRNA核糖體的組成
五.小干擾RNA(siRNA)由dsRNA介導的同源RNA降解過程。2006年諾貝爾生理學及醫學獎:interference,RNAi人工合成MicroRNA(miRNA)MicroprocessorComplexmiRNA的作用降解翻譯抑制第六節
核酸的變性,複性
和雜交一、核酸的紫外吸收
由於核酸中堿基的共軛雙鍵,所以對紫外光有強烈吸收,最大吸收峰在260nm附近,利用這一特性可進行核酸的定量測定及純度分析。A260的應用
DNA或RNA的定量A260=1.0相當於:50μg/ml雙鏈DNA40μg/ml單鏈DNA(或RNA)20μg/ml寡核苷酸
判斷核酸樣品的純度DNA純品:A260/A280=1.8RNA純品:A260/A280=2.0(1.8~2.0DNA樣品合格,小於1.8含有蛋白質,大於2.0含有RNA)二、DNA的變性與複性1.變性(denaturation):在某些因素(如溫度、
pH等)的影響下,DNA雙螺旋區的氫鍵斷裂和堿基堆積力的破壞,使雙鏈變成單鏈,但不發生共價鍵的斷裂。變性DNA黏度降低,紫外吸收增加(增色效應,hyperchromiceffect)。2.
複性(renature):
當變性因素消除後,變性DNA
的兩條鏈通過堿基配對重新形成雙螺旋的過程,
紫外吸收降低(減色效應,hypochromiceffect
)。 3.DNA的淬火(quench):雙螺旋DNA溶液加熱變性之後,使溶液的溫度急速降至零度,DNA不能複性而保持單鏈狀態,這種冷處理過程叫做“淬火”。4.退火(anneal):變性DNA在緩慢冷卻時,可以複性,此過程稱為“退火”DNA的紫外吸收光譜變性引起紫外吸收值的改變
增色效應:DNA變性時其溶液A260增高的現象。DNA變性的本質是雙鏈間氫鍵的斷裂
結構:螺旋→線團理化性質:紫外吸收↑粘度↓生物活性:生物活性↓或喪失
理化性質:紫外吸收↓粘度↑高於Tm值5℃
退火(annealing)生物活性得到部分恢復複性過程淬火5.DNA複性動力學DNA複性過程基本上符合二級反應動力學,其中第一步為慢反應,因為兩條鏈必須依靠隨機碰撞找到一段堿基配對的部分,首先形成雙螺旋。第二步為快反應,尚未配對的其他部分堿基配對相結合,象拉鎖鏈一樣迅速形成雙螺旋。三、DNA的熔解溫度(meltingtempratureTm)
DNA在加熱變性時,紫外吸收增加值達總增加值一半時(雙螺旋結構失去一半時?)的溫度稱為該DNA的變性溫度,也稱熔點或熔解溫度,用Tm
表示。DNA的Tm值一般在82—95度之間,每種DNA都有一個特徵性的Tm值。
解鏈曲線
如果在連續加熱DNA的過程中以溫度對A260值作圖,所得的曲線稱為解鏈曲線。
影響Tm值的因素DNA的均一性:均質DNATm值範圍較窄,異質DNATm值的範圍較寬DNA中G-C對的含量
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