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文档简介
中科院生物物理所朱平研究组2026助理研究员岗位面试模拟题库一、单项选择题(15题)冷冻电镜单颗粒重构技术,用来矫正电子束引起的运动、提高分辨率的关键校正步骤是()
A.CTF校正B.颗粒挑选C.运动校正(Motioncorrection)D.2D分类
答案:C
解析:运动校正,校正电子照射导致样品漂移;CTF是衬度传递函数校正。染色质基本重复单元核小体,DNA缠绕组蛋白八聚体的长度约为()
A.147bpB.200bpC.70bpD.300bp
答案:A
解析:147bpDNA在组蛋白八聚体外缠绕约1.67圈;连接DNA约20–60bp。以下哪一项属于表观遗传修饰,不改变DNA一级序列()
A.点突变B.DNA甲基化C.基因缺失D.染色体易位
答案:BCryo-ET(冷冻电子断层成像)最适合研究哪类样品()
A.高度均一、对称的纯化蛋白复合物
B.细胞原位、不均一生物大分子组装体/病毒在细胞内原位结构
C.小分子化合物结构
D.结晶蛋白
答案:B
解析:单颗粒适合均一纯化大分子;Cryo-ET适合原位、细胞内、异质样品。组蛋白H3K9me3修饰通常和哪种染色质状态相关()
A.活跃转录常染色质B.异染色质、转录抑制C.转录起始激活D.DNA修复
答案:BCTF(ContrastTransferFunction)在冷冻电镜中的作用是()
A.去除样品冰厚度
B.描述电镜衬度随空间频率的传递规律,用于图像校正
C.自动挑选颗粒
D.三维重构
答案:B病毒冷冻电镜结构解析中,对称性重构的优势是()
A.降低所需颗粒数量,提升信噪比
B.只能解析不对称病毒
C.无需CTF校正
D.不需要2D分类
答案:A核小体的组蛋白八聚体组成是()
A.H2A、H2B、H3、H4各1个
B.H2A、H2B、H3、H4各2个
C.H1,H2A,H2B,H3
D.H3、H4二聚体
答案:B冷冻电镜样品制备中,薄冰层的理想状态是()
A.厚冰,蛋白沉底
B.玻璃态无定形冰,无冰晶,厚度略大于样品尺寸
C.形成大量冰晶
D.完全干燥
答案:B
解析:冰晶会造成衍射伪影,破坏生物大分子结构。以下哪一个软件不属于冷冻电镜单颗粒重构主流软件()
A.RELIONB.CryoSPARCC.ChimeraXD.PyMOL(仅可视化,不做重构)
答案:D染色质高级结构中A/B区室(A/Bcompartment)描述正确的是()
A.A区室:转录活跃;B区室:转录沉默
B.A区室:异染色质;B区室:常染色质
C.A/B区室由DNA序列编码,与表观修饰无关
D.只有分裂期染色体存在A/B区室
答案:A病毒囊膜的主要成分是()
A.仅DNAB.脂质双层+膜蛋白C.纯多糖D.组蛋白
答案:B冷冻电镜达到原子分辨率,一般指优于()
A.10ÅB.3.5ÅC.20ÅD.50Å
答案:BHi-C技术主要用来测定()
A.蛋白质序列B.染色质三维空间相互作用、基因组空间构象
C.蛋白与DNA结合位点(ChIP)D.RNA表达量
答案:B组蛋白H1的主要功能是()
A.构成八聚体核心
B.结合连接DNA,稳定核小体、参与染色质高级折叠
C.催化DNA甲基化
D.识别DNA损伤
答案:B二、判断题(10题,√/×)冷冻电镜单颗粒分析,样品不需要结晶。(√)DNA甲基化修饰一定抑制基因转录。(×,启动子区甲基化常抑制;基因体甲基化不一定抑制)Cryo-ET需要采集不同倾角下的系列图像(tiltseries)。(√)核小体是30nm纤维的唯一必需单元,体内稳定存在30nm染色质纤维。(×,体内生理状态下30nm纤维并不普遍存在)RELION可以完成颗粒挑选、2D分类、3D重构与局部分辨率评估。(√)组蛋白修饰是共价修饰,可以遗传,属于表观遗传。(√)冰晶样品适合高分辨冷冻电镜解析。(×,冰晶产生伪影)单颗粒冷冻电镜只能解析高对称蛋白,完全不能处理动态、构象不均一复合物。(×,可以通过3D分类分离不同构象)病毒衣壳蛋白的对称信息可用于重构提升分辨率。(√)Hi-C的TAD(拓扑相关结构域)内部染色质互作频率低于TAD之间。(×,TAD内部互作更高)三、简答题(高频面试简答,附参考答案)1.简述单颗粒冷冻电镜的完整工作流程参考答案
1)样品制备:纯化目标生物大分子/病毒,制备超薄玻璃态冰冷冻样品;
2)电镜数据采集:低剂量成像,获取大量蛋白颗粒二维投影图像;
3)图像预处理:运动校正、CTF衬度校正;
4)颗粒挑选,2D分类,去除污染和差颗粒;
5)三维初始模型重建、3D分类分离不同构象;
6)三维重构与分辨率评估;
7)原子模型搭建、精修与结构验证,可视化。2.简述核小体结构,以及表观修饰如何调控染色质状态参考答案
核小体是染色质基本单元:147bpDNA缠绕H2A/H2B/H3/H4八聚体,H1结合连接DNA。
表观修饰(H3K9me3、H3K4me3、乙酰化、DNA甲基化等)不改变DNA序列;乙酰化一般中和组蛋白正电荷,松散染色质,促进转录;H3K9me3招募异染色质蛋白,压缩染色质抑制转录。修饰可招募效应蛋白,调控染色质高级结构、转录、DNA修复。3.Cryo-ET和单颗粒冷冻电镜的区别,各自适用样品?参考答案单颗粒Cryo-EM:大量结构均一纯化大分子,采集二维投影,适合体外纯化蛋白/对称病毒,容易达到原子分辨率;Cryo-ET:采集同一样品不同倾角的断层序列,三维断层重建;适合细胞原位、不均一组装、细胞内病毒、原位大分子复合物;分辨率通常低于单颗粒,侧重原位结构。4.简述染色质A/B区室、TAD的概念参考答案
A/BCompartment:全基因组染色质互作Hi-C得到,A区室常染色质、转录活跃;B区室异染色质、转录沉默。
TAD拓扑相关结构域:基因组内局部自相互作用强的结构单元;TAD内部DNA频繁互作,TAD之间互作少;TAD边界隔离增强子与启动子的异常相互作用,调控基因表达。5.你计划如何设计一个课题,用冷冻电镜研究病毒与宿主复合物?参考答案(面试口述模板)表达纯化病毒-宿主蛋白复合物,生化验证复合物稳定结合;样品制备,筛选冰厚、浓度,冷冻制样;单颗粒数据收集,图像处理、重构,分离不同构象;搭建原子模型,分析相互作用界面;结合生化突变、细胞实验验证界面关键残基在病毒侵染中的功能;可进一步使用Cryo-ET观察细胞原位病毒组装。四、英文文献类问答(面试常考)名词翻译
Cryo-electronmicroscopy:冷冻电子显微术
Cryo-electrontomography(Cryo-ET):冷冻电子断层成像
Chromatin:染色质
Nucleosome:核小体
Epigenetics:表观遗传学
CTF:ContrastTransferFunction衬度传递函数五、综合论述题(答辩深度题)题目:染色质高级结构研究目前存在哪些科学问题?冷冻电镜技术能解决哪些局限?
参考答案要点
现有问题:体外解析的核小体/染色质结构难以完全还原细胞原位状态;体内染色质动态、异质性高;动态构象捕捉困难;表观修饰如何调控染色质折叠的分子机制不完全清楚。
冷冻电镜优势:单颗粒解析纯化核小体复合物原子结构;Cryo-ET观察细胞原位染色质组装;可捕获染色质动态构象。局限:原位样品分辨率受限;样品制备难度高;动态瞬时构象捕捉仍有挑战,常需要结合Hi-C、单分子、生化实验多技术联合。六、面试综合备考重点(本岗位重中之重)熟读朱平研究员课题组主页论文,重点看:染色质高级结构、病毒原位Cryo-ET、核
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