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蛋白质复合物识别算法相关研究目录TOC\o"1-3"\h\u16044蛋白质复合物识别算法相关研究 [30]中基于多种群遗传算法GA(GeneticAlgorithm)进行实验,GA是一种最基本的进化算法,该算法通过模拟生物的进化过程在解空间内搜索最优解。GA运行固定的迭代次数,并在检查产生的所有簇后选择最合适的阈值,从而选择最佳簇,算法主要包括以下七个步骤:步骤1:种群初始化;步骤2:根据优化的目标函数计算种群中个体的适应值;步骤3:设置种群的最大迭代次数,并令当前迭代次数为1;步骤4:设计合适的选择算子对种群个体进行选择,选择的个体将进入交配池中,以组成父代,用于交叉变换产生新的个体;步骤5:根据交叉概率判断父代个体是否需要进行交叉操作。其中,交叉算子设计的优劣主导着算法性能的优劣;步骤6:根据变异概率判断父代个体是否需要进行变异操作,目的是确保种群多样性,防止种群陷入局部最优;步骤7:种群迭代次数递增,跳转到步骤4迭代执行,直至迭代次数达到最大。对于集群,EA算法初始化它的多个种群总体,每个种群代表一个确定性版本的相同概率图,通过对边赋予不同的阈值生成同一输入图的多个确定性版本,多个群体的每个染色体代表一个完整的聚类解。EA算法具有很好的鲁棒性且适用范围广,它产生新功能的能力较强,可根据数据特征自动调整自身参数与目标数据保持一致,还可以做出改进和优化,以取得最佳适应结
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