CN119490939A 一株粪肠球菌、检测剂、检测方法及应用 (中国医学科学院医药生物技术研究所)_第1页
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文档简介

CGMCCNO.318502024.09.04所xn_en中的耐药基因和毒力基因较多。本发明揭示了从MCD小鼠肝脏中提取出来的粪肠球菌xn_发展。粪肠球菌xn_en可以作为药物靶点筛选药23.根据权利要求2所述检测剂,其特征在于,所述粪5.权利要求1所述的粪肠球菌xn_en或权利要求2~4任一项所述的检测剂在制备下述一或者,利用权利要求1所述粪肠球菌xn_en或权利要求2~4任一项所述检测剂饲喂肝病10.根据权利要求7或9所述方法,其特征在于,所述预测或评估药物治疗肝病的效果3No.31850。[0009]本发明提供了上述技术方案所述的粪肠球菌xn_en或上述技术方案所述的检测剂4或者,利用上述技术方案所述粪肠球菌xn_en或上述技术方案所述检测剂饲喂肝[0015]本发明的有益效果:本发明提供了一株粪肠球菌xn_en,保藏编号为CGMCCNo.发明揭示了肝脏菌群中粪肠球菌xn_en在NAFLD发展中的重要作用,这将有利于开发新的faecalis于2024年9月4日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心5药物设计中可将粪肠球菌xn_en作为药物靶点,或者启发想到有抗菌活性及调节菌群能力[0024]作为另一种可选的实施方式,将所述粪肠球菌xn_en划线接种于哥伦比亚血培养190、200或210rpm。作为一种可选的实施方式,所述脑心浸液培养基的组成包括蛋白胨[0027]本发明提供了上述技术方案所述的粪肠球菌xn_en或上述技术方案所述的检测剂6如果粪肠球菌xn_en不生长或者生长状态受到抑制,则该待筛选的药物即可作为治疗肝病发明所述粪肠球菌xn_en接种于含不同药物浓度的培养基中,该药物的MIC值为能够抑制(1)菌株来源:构建患有非酒精性脂肪性肝炎的小鼠模型,构建方法具体为:7SEQIDNo.1:CTGGCTCCAAAAAGGTTACCTCACCGACTTCGGGTGTTACAAACTCTCGTGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGGGAACGTATTCACCGCGGCGTGCTGATCCGCGATTACTAGCGATTCCGGCTTCATGCAGGCGAGTTGCAGCCTGCAATCCGAACTGAGAGAAGCTTTAAGAGATTTGCATGACCTCGCGGTCTAGCGACTCGTTGTACTTCCCATTGTAGCACGTGTGTAGCCCAGGTCATAAGGGGCATGATGATTTGACGTCATCCCCACCTTCCTCCGGTTTGTCACCGGCAGTCTCGCTAGAGTGCCCAACTAAATGATGGCAACTAACAATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATCTCACGACACGAGCTGACGACAACCATGCACCACCTGTCACTTTGTCCCCGAAGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTGGTCAAAGGATGTCAAGACCTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGAGTGCTTAATGCGTTTGCTGCAGCACTGAAGGGCGGAAACCCTCCAACACTTAGCACTCATCGTTTACGGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAGCGTCAGTTACAGACCAGAGAGCCGCCTTCGCCACTGGTGTTCCTCCATATATCTACGCATTTCACCGCTACACATGGAATTCCACTCTCCTCTTCTGCACTCAAGTCTCCCAGTTTCCAATGACCCTCCCCGGTTGAGCCGGGGGCTTTCACATCAGACTTAAGAAACCGCCTGCGCTCGCTTTACGCCCAATAAATCCGGACAACGCTTGCCACCTACGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGTAGTTAGCCGTGGCTTTCTGGTTAGATACCGTCAGGGGACGTTCAGTTACTAACGTCCTTGTTCTTCTCTAACAACAGAGTTTTACGATCCGAAAACCTTCTTCACTCACGCGGCGTTGCTCGGTCAGACTTTCGTCCATTGCCGAAGATTCCCTACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCTGGGCCGTGTCTCAGTCCCAGTGTGGCCGATCACCCTCTCAGGTCGGCTATGCATCGTGGCCTTGGTGAGCCGTTACCTCACCAACTAGCTAATGCACCGCGGGTCCATCCATCAGCGACACCCGAAAGCGCCTTTCACTCTTATGCCATGCGGCATAAACTGTTATGCGGTATTAGCACCTGTTTCCAAGTGTTATCCCCCTCTGATGGGTAGGTTACCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCACTCCTCTTTCCAATTGAGTGCAAGCACTCGGGAGGAAAGAAGCGTTCG8有限公司完成全基因组测序分析。对原始测序数据进行质控和基因组拼接,使用NCBI_选取10株粪肠球菌和粪肠球菌xn_en通过NR库进行比对,可以得到物种转录序列NASH的小鼠肝脏中分离出的粪肠球菌xn_en是一个新预测得到的16SrRNA序列与NCBI的16S数据库进行比对,设置参数identify>95。选取在NCBI上下载参比菌株粪肠球菌ATCC29212的全基因组序列,绘制全基因组圈根据粪肠球菌xn_en和粪肠球菌ATCC29212的全基因组序列信息和VFDB、CARD数9[0052]耐药基因预测结果见图6和图7,根据图6和图7可知,粪肠球菌xn_en和粪肠球菌可知,粪肠球菌xn_en中与黏附、免疫逃逸、铁运输系统相关的毒力基因比粪肠球菌ATCC将实施例1中冻存的粪肠球菌xn_en于哥伦比亚血平板中划线复苏,37℃,有氧培浓度比例为28:1,之后按需加入培养基中配制成终浓度为0.1~1280μg/mL推测粪肠球菌xn_en比ATCC29212[0068]xn_en组:给予MCD饮食7周,并每周2次灌胃粪肠球菌xn_en,每次灌胃剂量为无明显脂肪空泡和胶原沉积,说明针对于粪肠球菌xn_en有抑菌效果的药物具有潜在的抗菌xn_en能够作为药物靶点筛选药物,有抗菌活性及调节菌群能力的药物可能也会有抗[0074]尽管上述实施例对本发明做出了详尽的描述,但它仅仅

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