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文档简介
1、.,1,分子生物学常用检测技术 及临床应用,.,2,.,3,DNA四种核苷酸(A-T-C-G)组成的多聚骨架,所有组成DNA的核苷酸dATP,dTTP, dCTP,dGTP 都由三种成分组成: 1)一个2-脱氧核糖(戊糖) 2)一个含氮碱基 嘌呤:AG 嘧啶:T/C 3)三个磷酸基团 各单个核苷酸由5和3-碳形成的磷酸二酯键连接在一起,.,4,变性、复性、退火和淬火,.,5,基因,.,6,分子生物学常用技术,PCR(聚合酶链式反应) 核酸分子杂交 基因芯片技术(biochip) DNA 测序(DNA sequencing ) DNA重组技术(DNA recombination),.,7,一、聚
2、合酶链反应 (Polymerase Chain Reaction ,PCR),体外基因扩增技术,特异性强 灵敏度高 操作简单、省时 对待检原始材料质量要求低 高效率的基因扩增技术,.,8,(一)PCR原理,原理 双链DNA 变性 退火 链延伸 (膜板) (双链分成单链) (膜板与引物杂交) (DNA合成),不断重复,.,9,PCR反应体系,Mg2+,Mn2+,dCTP,dGTP,dTTP,dATP,Taq DNA 聚合 酶,模板,引 物,和 或 和,(二)PCR反应的设计及影响因素,.,10,PCR的种类,荧光定量PCR 通用引物PCR 多重PCR 巢式PCR RT-PCR 原位PCR 免疫P
3、CR ,.,11,TaqMan探针,荧光定量PCR,.,12,定量PCR的数学原理,PCR 理 论 方 程,N = N0 x (1+E)n,N:扩增数量 N0:起始模板数量 E:扩增效率 N:循环数,.,13,定量PCR的数学原理,CT = - k logN0 + b,Ct (Cycle threshold)值:是指每个反应管内的荧光信号到达设定域值(threshold)时所经历的循环数。,.,14,PCR的临床应用,对病原微生物核酸进行快速检测 弥补免疫检测的缺陷 缩短诊断的窗口期(如HBV,HIV) 用于药物疗效监测和评估 用于肿瘤基因表达方面的研究 用于遗传病的诊断,.,15,样本采集要
4、求,.,16,.,17,二、核酸分子杂交,根据核酸变性和复性的原理,不同来源的变性单链核酸分子在合适的条件下,通过碱基互补形成双链杂交体的过程称为核酸分子杂交(molecular hybridization)。,.,18,1、遗传病的诊断 2、病原体的鉴定 3、癌基因突变的检测 4、组织配型 5、亲子鉴定,核酸分子杂交的临床应用,.,19,三、基因芯片技术,基质材料分,有尼龙膜、玻璃片、塑料、硅胶晶片、微型磁珠等。,.,20,用点样法固定在玻璃板上的DNA探针阵列,原位合成法在玻璃等硬质表面上直接合成的寡核苷酸探针阵列,.,21,基因芯片技术的应用,1、药物筛选和新药开发 2、疾病诊断 3、环
5、境保护 4、司法 5、现代农业,.,22,四、测序技术,CTTGATCTTCAGGTAGGCCTGAATCCT,(一)一代测序技术,.,23,(二)二代测序技术,Illumina公司的Solexa和Hiseq应该说是目前全球使用量最大的第二代测序机器,这两个系列的技术核心原理是相同的。 Illumina/Solexa Genome Analyzer测序的基本原理是边合成边测序。 在Sanger等测序方法的基础上,通过技术创新,用不同颜色的荧光标记四种不同的dNTP,当DNA聚合酶合成互补链时,每添加一种dNTP就会释放出不同的荧光,根据捕捉的荧光信号并经过特定的计算机软件处理,从而获得待测DN
6、A的序列信息。,.,24,.,25,技术特点比较,第一代测序技术的主要特点是测序读长可达1000bp,准确性高达99.999%,但其测序成本高,通量低等方面的缺点,严重影响了其真正大规模的应用。 第二代测序技术大大降低了测序成本的同时,还大幅提高了测序速度,并且保持了高准确性,但在序列读长方面比起第一代测序技术则要短很多。,.,26,五、基因重组技术,基因重组是指一个基因的DNA序列是由两个或两个以上的亲本DNA组合起来的。 基因重组是遗传的基本现象,病毒、原核生物和真核生物都存在基因重组现象。,.,27,转基因植物 (抗虫、抗冻、抗病、高产) 转基因动物 基因工程药物和疫苗 基因治疗,基因重组技术的应用,.,28,小结,疾病的诊断 感染性疾病诊断 肿瘤性疾病诊断 遗传性疾病诊断 组织配型和器官移植 基因治疗 基
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