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文档简介
1、Lammps在拉伸过程中的应用,杰克,目录,1。LAMPS软件简介1.1软件LAMPS,即大规模原子/分子大规模并行模拟器,可以翻译成由美国桑迪亚国家实验室开发的大规模原子和分子并行模拟器,主要用于一些与分子动力学相关的计算和模拟工作。LAMMPS可以支持数百万个原子和分子系统,包括气相、液相或固相、各种系综,并为各种潜在功能提供支持。1.LAMPS软件介绍,1.2软件运行(在linux操作系统下)LAMPS本身没有图形界面,模拟计算过程在linux终端进行。计算时,用户需要编写一个输入脚本,有时还需要编写一个数据文件。将文件(如果有数据文件,连同数据文件一起)放在与编译的lmp
2、_serial以及相关的潜在函数相同的目录中。当从终端进入这个目录时,需要的命令是:cd /Desktop/compute。然后,进入。/lmp_serial 并输入。在终端开始计算。分子动力学模拟结果的准确性取决于原子间势函数的选择和势参数的准确性,势函数的选择是分子动力学模拟的前提。LAMMPS软件1.3势函数介绍,对于不同的金属,其EAM势函数需要通过拟合金属的宏观参数来确定。目前,许多适用于不同材料的原子势函数已经发展为EAM势和其他多体势。应该注意的是,每个潜在函数都有一定的应用范围。潜在功能下载:/potentials/
3、,1. LAMPS软件介绍,1.4中文件结构,初始化,原子定义,设置,运行模拟,在什么条件下,了解:什么原子结构,设置,开始模拟,1。lampps软件简介,1.4文件结构,(1)初始化相关命令包括:单元3360选择单元系统,lampps提供lj、real、metal三个单元系统的二维模拟或三维模拟,默认为三维边界:边界条件:周期边界或自由边界atom_style:定义模拟系统中原子的属性(2)原子定义lammps提供两种定义原子的方法: (1)根据晶格创建原子,涉及命令3:lammps软件介绍,1.4中的文件结构,(3)设置设置:力场系数,模拟参数,输出选项等。固定命令是LAMMPS中的一个重
4、要命令,它包括许多子命令。一系列边界条件、时间积分、诊断选项等。可以应用。输出选项由热电、转储、重启命令设置。(4)运行模拟,2。LAMMPS在拉伸过程中的简单应用,2.1在文件中,(1)初始化单元金属边界p p p邻居2.0 bin #截断半径邻域_修改延迟1检查是原子_样式原子#原子类型(2)原子定义晶格面心立方3.615区域盒块0 300 28 0 10创建_盒1盒创建_原子1盒质量1 63.546,2 . LAMMPS在拉伸过程中的简单应用,2.1在文件中, (3)设置成对类型的组对组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组边界组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组组LAMMPS在拉伸过程中的简单应用,文件中的2.1,(3)设置修正1左设置力0.0空空速度左设置0.0空空单位箱转储1所有xyz 200 Cu _ 0.002.xyz修正2所有nve修正3所有温度/
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