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文档简介
1、CRISPR-Cas9系统的基因修饰理论与实践,1。基因表达、干扰基因表达(过表达或低表达)或表达突变体并检测其相关生理功能的研究方法是基因功能研究的重要途径之一;基因表达技术质粒转染、病毒转染等传统方法被广泛使用,但同时它们也有缺点;1基因修饰的方法及其各自的优势,质粒-瞬时转染-一些细胞的低效率-不稳定的表达结果和内源性表达的干扰;质粒稳定细胞的表达结果不稳定,筛选效率不高,可能干扰重组插入基因组中其他基因的表达;病毒-瞬时感染-表达结果不稳定,质粒在细胞复制过程中容易丢失,随机插入基因组可能干扰其他基因的表达;新一代的基因编辑技术使用重组酶在基因组水平上修饰基因,产生稳定的遗传特性,直接
2、作用于内源,减少表达干扰。目前,已有CRISPR/Cas9等成熟技术;DNA,NHEJ和HDR,DNA修复机制和基因编辑原理,非同源末端连接,NHEJ),同源定向修复(HDR),5,ZFN和塔伦,ZFN和塔伦的基因编辑原理,6,李振华,范安荣,大卫等,2013,科学,(6121) :819-823。哺乳动物细胞基因组编辑,7,矮胖线虫,斑马鱼胚胎,果蝇,2013 .科学,(6148) :833-6。rice,crispr/cas9系统生成的模型,monkey,1 crispr-cas概述,1987年。当日本大阪大学研究由细菌编码的碱性磷酸酶基因时,发现在该基因的编码区附近有一个不寻常的由简单重
3、复序列组成的DNA片段,并且在该片段的两端有一个不太长的特殊序列。自2013年以来,研究人员在包括科学和自然生物技术在内的著名期刊上发表了许多关于CRISPR-Cas系统的文章,并成功实现了人类、小鼠、斑马鱼等物种的精确基因修饰。1 CRISPR-Cas概述,CRISPR-Cas:一种源于细菌获得性免疫并由核糖核酸指导用Cas蛋白修饰靶基因的技术。CRISPRR-Cas主要由两部分组成:识别、切割、1 CRISPRR-Cas概述、1.1 CRISPR结构、CRISPRR:(簇状规则间隔短回文重复序列)是一个特殊的DNA重复序列家族,广泛分布于细菌和古细菌的基因组中。CRISPR基因座通常由高度
4、保守的短重复序列组成,长度通常为2148 bp,由2672 bp的间隔区隔开。CRISPR通过这些空间识别目标基因。1.1 CRISPR结构,1.2 Cas家族,Cas(CRISPRR相关):它存在于CRISPRR位点附近,是一种双链核酸核酸酶,它能在导向核糖核酸的指导下切割靶位点。它具有类似于民间酶的功能,但它不需要形成二聚体来发挥作用。CRISPR-Cas系统的发现CRISPR-Cas是许多细菌和大多数古细菌的天然免疫系统。通过对入侵病毒和核酸的特异性识别,利用Cas蛋白进行切割,从而实现自身免疫。CRISPR-Cas系统、CRISPR-Cas系统、CRISPR-Cas系统的发现赋予原核细
5、胞对外源基因的特异性免疫,这种特异性是由间隔区决定的。在针对噬菌体攻击的宿主防御中,细菌已经进化出针对自然界中大量噬菌体的CRISPR介导的适应性免疫。这种免疫功能是通过CRISPR间隔序列的动态变化,即通过添加或删除间隔来实现的。2 CRISPR-Cas系统的目标要求,最重要的要求:PAM(原间隔基邻近基序)是NGG。CRISPR-Cas靶向系统要求在人类基因组中平均每8bp出现一个NGG聚甲基丙烯酸甲酯。在2013年1月29日发表于自然生物技术的文章利用CRISPR-Cas系统进行细菌基因组的RNA指导编辑中,作者利用CRISPR-Cas系统用设计好的DNA模板替换相应的基因,实现了对基因
6、的靶向修饰。3.1双RNA: CAS介导的编辑模板替换,3.2 SG-RNA: CAS介导的基因修饰,发表于2013年1月29日的自然生物技术,其中作者使用合成的SG RNA来指导Cas9内源核酸酶修饰斑马鱼胚胎基因。3.2 SG-RNA: CAS介导的基因修饰,3.2 SG-RNA: CAS介导的基因修饰,3.2 SG-RNA: CAS介导的基因修饰,CAS9,SG-RNA,发表于2013年2月15日的科学杂志上,作者使用了一个含有两个间隔基的crRNA来靶向不同的基因以实现两个,3.3 Cr-RNA: CAS介导的双基因修饰,3.3 Cr-RNA: CAS介导的双基因修饰,4 CRISPR
7、-Cas系统前景分析,其中在2013年4月12日发表在细胞干细胞上的文章“通过用Crispers替换TALENs提高人类多能干细胞基因组编辑的效率”中,作者使用Talens和Crispers分别以0%-34%和51%-79%的效率修饰了相同的基因。4 CRISPRR-Cas系统前景分析,从实际角度来看,CRISPRR比TALENs更容易操作,因为每对TALENs都需要重新合成,而CRISPRR的gRNA只需要替换20个核苷酸。4 CRISPR-Cas,只有一个sgRNA可以合成,以实现基因的特异性修饰,而Cas蛋白不是特异性的。编码sgRNA的序列不超过100bp,因此它比构建TALENs和Z
8、FNs更简单和方便。较短的sgRNA序列也避免了由超长和高度重复的TALENs编码载体引起的并发症。技术优势,5我们的工作使用CRISPR-Cas9载体肿瘤基因m来编辑和敲除卵巢癌细胞HeLa,过程-引物设计a . sgrna(4);B.px459-cas9载体构建、HeLa细胞转染和基因靶筛选(一次);c .确定母克隆(2-3个母克隆)的基因切割;单克隆筛选(2-3轮,100个亚克隆)。对母克隆8-31-M进行了测序,对子克隆8-31-12-d-M进行了测序。模板cccgcaggctggacac-ttcgtggaggctcaagag 11-5-1 cccgcgcaggctggacac-tcgtggaggctccaaag(缺失2个碱基,11-5-2 cccgcgcggctggacac-ggaggctccaaag(缺失6个碱基,无代码移位)11-5-3 cccgcgcaggctggacac-ggaggctccaaag(缺失6个碱基,11-5-5 cccgcggcgcgctggacac-tcgtggaggctccatc
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