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文档简介
1、圆二色光谱,1,圆二色光谱的原理,当平面偏振光通过光学活性介质时,由于介质中相同的光学活性分子有两种不同的手性构型,它们吸收不同的右旋和左旋圆偏振光,被平面偏振光分解,并且出射时电场矢量的幅度不同,所以重新组合的偏振光不是圆偏振光,而是椭圆偏振光,从而产生圆二色。圆二色性通常表示为椭圆率,即平面偏振光离开样品池的角度。2。整个装置在氮气保护下进行。光源为氙灯,通过单色器后变成单色光,通过偏振器后变成线偏振光。线偏振光通过光电调制器后分成左右两个圆偏振光,然后通过光学活性样品,样品对左右两个圆偏振光的吸收不同,从而合成椭圆偏振光,显示圆二色性,并在方格上显示圆二色性,纵坐标和横坐标。3。圆二色性
2、的应用,圆二色性在确定小分子化合物和DNA之间相互作用方面的研究,主要是DNA和配体(包括小分子和大分子如蛋白质)之间的相互作用。圆二色性可以决定脱氧核糖核酸和蛋白质的空间结构。脱氧核糖核酸的圆二色性是由不对称的糖分子产生的,其骨架结构和螺旋结构是由这些糖分子的构型决定的。根据配体对脱氧核糖核酸原始圆二色信号的影响和诱导新圆二色信号(ICD)的不同特征,我们不仅可以了解配体与脱氧核糖核酸之间的相互作用,还可以推断配体与脱氧核糖核酸之间不同的结合模式。小分子和脱氧核糖核酸之间有三种典型的相互作用方式:嵌入、凹槽结合和烷基化/金属化。许多与脱氧核糖核酸结合的配体没有手性,也没有光学活性,但是在与脱
3、氧核糖核酸相互作用后,配体的构象变成了手性空间排列,并且还可以通过与脱氧核糖核酸碱基的电子跃迁偶极矩耦合产生镉信号,这被称为诱导圆二色性。在小分子和脱氧核糖核酸混合样品的镉光谱中,如果观察到ICD吸收带,这意味着配体与脱氧核糖核酸相互作用。根据脱氧核糖核酸与配体相互作用产生的ICD效应的不同特征,我们可以定性和定量地推测配体与脱氧核糖核酸的相互作用模式和脱氧核糖核酸分子的几何形状。脱氧核糖核酸嵌入剂通常显示最大强度不超过10的ICD信号。如果ICD信号很强,这意味着配体已经与脱氧核糖核酸小凹槽结合(图3)。6,如果配体电子跃迁的偶极矩方向平行于碱基对的长轴方向,ICD信号为正,表明分子的长轴与
4、短链DNA的碱基对处于平行的几何位置(图A),而如果它垂直于碱基对的长轴方向,ICD为负,表明分子的长轴与短链DNA的碱基对处于垂直的几何位置(图B)。圆二色性可以作为新药研究中的辅助筛选工具。300纳米以上的ICD峰可用于定量分析药物和脱氧核糖核酸之间的结合强度。这种现象可用于筛选靶向脱氧核糖核酸并与脱氧核糖核酸相互作用的药物。300纳米以下的ICD效应影响着DNA的正负峰,有望用于此类筛选。天然CPI的圆二色光谱在206nm和222nm处出现双负峰,而木瓜蛋白酶的圆二色光谱在218nm、210nm和222nm处出现双负峰。当CPI和木瓜蛋白酶的摩尔数相等时,镉光谱在208nm和218nm处出现双负峰,极值下移。当CPI的结合位点被酶完全占据时,CPI的构象也会发生变化,从而不再能结合和抑制木瓜蛋白酶。从镉谱来看,配合物的峰明显不同,其实质
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