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文档简介

1、0,第14 章 核酸的物理化学性质,DNA与RNA的差异(了解),核酸的物理化学性质,核酸的化学结构和作为高聚物大分子决定着其物理化学性质。 核酸的糖苷键和磷酸二酯键:可被水解; 磷酸基和碱基:酸碱性质; 碱基:紫外吸收特性; 双螺旋结构:变性和复性。 DNA和RNA都微溶于水,不溶于有机溶剂,提取分离核酸时,可用乙醇将核酸从溶液中沉淀出来。,一、核酸的水解 二、核酸的酸碱性质 三、核酸的紫外吸收性质 四、核酸的变性、复性及杂交,核酸的物理化学性质,一、核酸的水解,(一)酸水解 糖苷键比磷酸二酯键更易被酸水解。 嘌呤碱基(DNA,37,pH 1.6)的糖苷键比嘧啶碱基(提高温度,175)的糖苷

2、键对酸更不稳定。 (二)碱水解 RNA的磷酸酯键易被碱水解,产生核苷酸(2-OH基参与反应),产生2核苷酸和3核苷酸 。 KOH较好,水解后用HClO4中和,由于KClO4溶解度较小,溶液中大部分K+即被除去。,(1)底物 RNase核糖核酸 DNase脱氧核糖核酸 (2)按作用方式 核酸内切酶:作用点在多核苷酸链的内部 核酸外切酶(5 3外切酶、3 5外切酶) (3)按磷酸二酯键断裂的方式 5磷酸酯键 3磷酸酯键 (4)其他:双链酶、单链酶,非特异性水解磷酸二酯键磷酸二酯酶 专一性水解核酸磷酸二酯键核酸酶,限制性核酸内切酶: 细菌中,识别并切割特异的双链DNA序列的一种核酸内切酶,专门降解外

3、来入侵的异种DNA,对自身无害。,(三)酶水解,一、核酸的水解,二、核酸的酸碱性质,核酸的碱基、核苷和核苷酸均能发生解离。在一定的条件下可形成兼性离子,为两性电解质,具有等电点。,三、核酸的紫外吸收,核酸最大吸收峰波长max在260nm处,可以作为核酸及其组份定性和定量测定的依据。,1、判断样品的纯度 分别读出260nm和280nm的A值,计算A260/A280。 纯的DNA的应大于1.8;纯的RNA应达到2.0。 2、对纯核酸样品的定量测定 测出260nm的A值,即可计算含量。,三、核酸的紫外吸收P507,增色效应:由于DNA变性,引起的紫外光吸收增加的效应 。 减色效应:由于DNA复性,引

4、起的紫外光吸收下降的效应 。 原理:双螺旋结构使碱基对的电子云发生重叠,减少了对紫外光的吸收。,(一) 核酸的变性 指核酸双螺旋区的多聚核苷酸链间的氢键断裂,变成单链结构的过程。 注意: 变性核酸将失去其部分或全部的生物活性。 核酸的变性并不涉及磷酸二酯键的断裂,所以它的一级结构(碱基顺序)保持不变 。 能够引起核酸变性的因素很多。温度升高(热变性)、酸碱度改变、甲醛和尿素等的存在均可引起核酸的变性。,四、核酸的变性、复性及杂交P508,DNA的变性过程,骤然冷却,如何判断核酸是否变性呢?,热变性和Tm,螺旋双链开始分开,螺旋双链一半解开,螺旋双链完全解开,DNA的变性过程是爆发式的,它在很窄

5、的温度区间内完成。 通常把加热变性使双螺旋结构失去一半时的温度称为该DNA的熔点或熔解温度,用Tm值表示 。 DNA的Tm一般在82-95之间。 RNA有局部双螺旋区, Tm较低;tRNA有较多双螺旋, Tm较高。,DNA的变性在紫外吸收上的变化,影响Tm的因素(了解): 1.DNA的均一性越高,Tm的温度范围越小。例如poly d(G-C),溶解过程发生在较小温度范围内。 2.G-C含量越高, Tm的值越大,当GC的含量上升1%,则Tm上升0.4。 经验公式:GC%=(Tm-69.3)2.44 3.介质的离子强度较高时, Tm的值较大,溶解范围小。,DNA制品不保存在极稀的电解质溶液中,(二

6、)核酸的复性,变性DNA在适当的条件下,两条彼此分开的单链可以重新缔合成为双螺旋结构,这一过程称为复性 。 DNA复性后,许多物化性质得到恢复。 DNA复性的程度、速率与复性过程的条件有关,与DNA自身也有关系。,四、核酸的变性、复性及杂交P508,变性核酸复性时需缓慢冷却,故又称退火。 ,复性时的 初始浓度 重复序列 拷贝数等 片段大小,定义:热变性的DNA在复性过程中,具有碱基序列部分互补的不同来源的DNA之间或DNA与RNA之间形成杂化双链的现象。 核酸杂交方法是一种分子生物学的标准技术,用于检测DNA或RNA分子的特定序列(靶序列)。,(三)核酸分子杂交,四、核酸的变性、复性及杂交P508,Sou

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