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文档简介
1、生物小分子芯片,蛋白质芯片,一:蛋白质芯片?,蛋白质芯片是指将蛋白质或多肽固定于支持介质表面,用于样品成分和蛋白质之间相互作用的分析,也叫做蛋白质微阵列,二:蛋白质芯片支持介质,聚丙烯酰胺胶;聚偏二氟乙烯膜;硝酸纤维素膜,载玻片;硅片;纸;PDMS(聚二甲基硅氧烷);金。,聚丙烯酰胺胶配方: 3%的丙烯酰胺(丙烯酰胺:甲叉双丙烯酰胺=3:1)、40%甘油、0.0002%亚甲基蓝、0.012%TEMED(四甲基乙二胺),三:作为支持介质的条件,(1)与蛋白质能发生物理或化学上的反应 (2)要最大限度的保持蛋白质的活性 (3)不能或几乎不与被检测物发生相互作用 (4)化学性质相对不活泼,四:蛋白质
2、芯片探针,抗原-抗体;酶与底物;mRNA-蛋白质,凡是能两两互补配对的都可以将其中一种固定于支持介质上,五:蛋白质固定的原理及技术,原理:物理吸附、离子吸附、共价结合 方法:接触点制;喷墨点制;无掩膜光刻技术;喷墨合成;基于掩膜的光刻技术;微珠芯片;电化学芯片,六:不同固定方法的优缺点,物理吸附不牢固但是对蛋白质的活性影响最小 离子吸附较物理吸附要牢固,对蛋白质的活性影响较共价结合小 共价结合最牢固,但是对蛋白质的活性影响最大甚至会导致蛋白质失活,七:蛋白质芯片分析技术,(1):荧光/同位素检测技术,(2):原子力显微技术,(3):表面等离子体共振技术,(4):多光子检测技术,(5):表面增强
3、激光解吸附/离子化技术,(6):基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术,八:不同分析方法的对比,荧光同位素检测技术:操作简单;标记困难。,原子力显微技术:检测灵敏;样品用量少;无需标记;检测速度慢;价格昂贵。,表面等离子共振技术:灵敏度高;样品用量少;无需标记;成本较低;检测范围有限。,基体辅助激光解析电离飞行时间质谱技术:灵敏度高;检测速度快;难找到合适的光敏感化学物;要求较高纯度的蛋白质;无法进行定量检测,九:蛋白质芯片的应用,1:医学研究与临床诊断,2:药物筛选、测试与新药开发,3:食品卫生安全检测,Development and application of a fluorescence
4、 protein microarray for detecting serum alpha-fetoprotein in patients with hepatocellular carcinoma,Journal of International Medical Research 2016, Vol. 44(6) 14141423,Microarray preparation,乙醛修饰载玻片甲胎蛋白固定于载玻片(24h;4) 玻片浸泡在200ul blocking 缓冲液中(2h;37)PBS 缓冲液冲洗4次,每次2秒,室温室温晾干,4储藏。,AFP quantification,利用兔子获
5、得甲胎蛋白的多克隆抗体,标记上生物素与玻片反应(30min;37)PBS缓冲液冲洗两次(室温;5s)荧光标记链霉亲和素试剂反应(30min;37)PBS冲洗四次(室温;5s) 血清样品与玻片反应(30min;37)PBS冲洗四次(室温;5s),ELISA,50ul AFP蛋白和样品添加到试剂盒反应2h;37 200ul洗脱液洗脱5次添加50ul生物素标记的甲胎蛋白抗体(1h,37)添加50ul SP conjugate(30min;37)添加50ul染料(10min;37)50ul反应停止液450nm的条件下测定吸光度。,Result,80 ng/ml, 40 ng/ml, 20 ng/ml,10 ng/ml,5 ng/ml, 2.5 ng/ml,1.25 ng/ml,0.0625ng/ml,0.03125 ng/ml,甲胎
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