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文档简介

2.5 DNA的修复l 由于染色体由于染色体 DNA在生命过程中占有至高在生命过程中占有至高无上的地位,无上的地位, DNA复制的准确性以及复制的准确性以及DNA日常保养中的损伤修复就有着特别日常保养中的损伤修复就有着特别重要的意义。重要的意义。表 2-13 大肠杆菌中 DNA的修复系统2.5.1错配修复( mismatch repair)细胞能够通过准确的错配修复系统识别新合成链中的错配并加以修正,DNA子链中的错配几乎完全能被修正。图 2-28 根据母链甲基化原则找出错配碱基的示意图。a.发现碱基错配。b.在水解 ATP的作用下, MutS,MutL与碱基错配位点的 DNA双链相结合。c.MutS-MutL在 DNA双链上移动,发现甲基化 DNA后由 MutH切开非甲基化的子链。l 该系统识别母链的依据来自 Dam甲基化酶,它能使位于 5GATC序列中腺苷酸的N6位甲基化。一旦复制叉通过复制起始位点,母链就会在开始 DNA合成前的几秒种至几分钟内被甲基化。图 2-29碱基错配修复过程示意图2.5.2 切除修复碱基切除修复 ( Base-excision repair)l 所有细胞中都带有能识别受损核酸位点的不同的糖苷水解酶,能特异性切除受损核苷酸上的N-糖苷键,形成去嘌呤或去嘧啶位点,统称为 AP位点。图 2-30 DNA分子中常见的几种核苷酸非酶促转变反应a.脱氨基反应图 2-30 DNA分子中常见的几种核苷酸转变反应b.脱嘌呤反应( N-糖苷键被水解)DNA repair bybase excisionDNA分子中一旦产生了 AP位点,内切酶就会把受损核苷酸的糖苷 -磷酸键切开,移去 AP位点附近小片段 DNA,并由 DNA聚合酶 I和DNA连接酶共同完成修复。核苷酸切除修复( nucleotide-excision repair)l 当 DNA链上相应位置的核苷酸发生损伤,导致双链之间无法形成氢键,则由核苷酸切除修复系统负责修复。DNA repair bynucleotide excision损伤发生后,首先由DNA切割酶(excinuclease)在已损伤的核苷酸 5和 3位分别切开磷酸糖苷键,产生并移去 DNA小片段,然后由 DNA聚合酶合成新片段,并由 DNA连接酶完成修复中的最后步骤。大肠杆菌和人类细胞中的核苷酸切除修复过程示意图在原核生物中受损核苷酸 3端的第 5位, 5端的第 8位磷酸糖苷分别被 DNA切割酶切开。在人类细胞中,受损伤核苷酸 3端第 6位,5端的第 23位磷酸糖苷键分别被 DNA切割酶切开。2.5.3 重组修复 (Recomhinant repair)l 又称 “复制后修复 ”,发生在复制之后l 受损伤的 DNA链复制时,产生的子代 DNA在损伤的对应部位出现缺口。l 完整母链 DNA与有缺口子链 DNA进行重组交换,将母链上相应片段填补子链缺口处,而母链出现缺口。l 以另一条子链 DNA为模板,经 DNA pol合成一新 DNA片段填补母链缺口,最后由 DNA ligase连接完成修补。2.5.4 DNA的直接修复(direct repair)l 生物体内还存在 DNA损伤直接修复而并不需要切除碱基或核苷酸的机制。l DNA光解酶( photolyase)能把在光下或经紫外光照射形成的环丁烷胸腺嘧啶二体及 6-4光化物( 6-4-photoproduct)还原成为单体。紫外光诱发形成嘧啶二体此外,生物体内还广泛存在着使 O6-甲基鸟嘌呤脱甲基化的甲基转移酶,以防止形成 G-T配对。O6-甲基转移酶使 O6甲基化鸟嘌呤恢复成鸟嘌呤2.5.5 SOS反应(反应( SOS response)SOS反应是细胞 DNA受到损伤或复制系统受到抑制的紧急情况下,细胞为求生存而产生的一种应急措施。修复结果只是能维持基因组的完整性,但留下的错误较多,又称为错误倾向修复( error-prone repair),使细胞有较高的突变率。SOS反应主要包括DNA 的修复:有利于细胞存活 产生变异:导致细胞癌变或进化2.6 DNA的转座( DNA Transposition)l DNA的转座,或称移位( ransposition),是由可移位因( transposable element)介导的遗传物质重排现象。2.6.1转座子的分类和结构特征l 转座子( transposon, Tn)是存在于染色体 DNA上可自主复制和位移的基本单位。l 转座子分为两大类:插入序列( insertional sequence)复合型转座子插入序列( insertional sequence, IS)l 最简单的转座子不含有任何宿主基因而常被称为插入序列( insertional sequence, IS),它们是细菌染色体或质粒 DNA的正常组成部分。一个细菌细胞常带有少于 10个 IS序列。l 常见的 IS序列都是很小的 DNA片段(约 1kb),末端具有倒置重复序列,转座时常复制宿主靶位点 4 15bp的 D N A形成正向重复区。l 大部分 IS序列只有一个开放读码框,翻译起点紧挨着第一个倒置重复区,终止点位于第二个倒置重复区或附近。l IS1含有两个分开的读码框,只有移码通读才能产生功能型转座酶。表 2-14 IS序列的结构特征比较复合式转座子( composite transposon)l 是一类带有某些抗药性基因(或其他宿主基因)的转座子,其两翼往往是两个相同或高度同源的 IS序列。l 一旦形成复合转座子, IS序列就不能再单独移动,因为它们的功能被修饰了,只能作为复合体移动。l 除了末端带有 IS序列的复合转座子以外,还存在一些没有 IS序列的、体积庞大的转座子( 5 000bp以上) TnA家族。常带有 3个基因,一个编码 -内酰胺酶( AmpR),另两个则是转座作用所必须的。l 所有 TnA类转座子两翼都带有 38bp的倒置重复序列。2.6.2真核生物中的转座子l 1.玉米中的控制因子( controlling ele

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