小RNA高通量测序

小RNA高通量测序Tag内容描述：<p>1、1 - 小小 RNARNA 高通量测序数据分析方法高通量测序数据分析方法 彭 骅 , 王胜华 , 陈 放 四川大学生命科学学院，成都（610064） E-mail：shwang200yahoo.com.cn 摘要摘要 本文应用 Perl 语言和 MySQL 数据库构建了小 RNA 高通量测序数据分析平台， 以 5 个水稻数 据集为分析对象，详细介绍了小 RNA 高通量测序数据的处理方法和流程. 我们以 MSU 6. 1 水稻基 因组为参考，构建了该版本的全基因组结构及已知 ncRNAs 位点信息数据库，结合 Perl 脚本可以实 现小 RNA 在基因组上的详细定位与统计，同时我们从数据库中提取已知 pre-miRNAs 表。</p><p>2、中国农业科学2009，42(11):3755-3764中国农业科学杂志编号： 10.3864/期刊编号：0578-1752.2009.11.001接收日期：2009年1月16日；验收日期：2009-03-04基金项目：国家“863”计划小麦抗病性状功能基因组计划(2006AA10A104)，中央公益性研究所基础研究经费专项(2060302-10)。作者简介：韦伯(1981-)，男，山西阳城。</p><p>3、中国农业科学 2009,42(11):3755-3764 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.11.001 收稿日期：2009-01-16；接受日期：2009-03-04 基金项目：国家“863”计划小麦抗病性状功。</p><p>4、产品专员 刘永良 百迈客生物科技有限公司 高通量测序技术的应用 -RNA-seq、DGE、Small RNA、 Re-sequencing Outline 全基因组重测序全基因组重测序ReRe- -sequencingsequencing 生物信息专用服务器系统生物信息专用服务器系统Bioinformatics Server SystemBioinformatics Server Sy。</p><p>5、案例一 虽然RNA seq早已被大家所熟知 特别是在高通量测序越来越便宜的今天 但是RNA seq数据的分析仍令多数小菜抓狂 多个软件的使用 参数设置 参考基因组准备 输出结果的解读等等 都让很多初次接触测序数据或者非生物。</p><p>6、新一代高通量 RNA 测序数据的处理与分析 王曦 1 汪小我 1 王立坤 1 2 冯智星 1 张学工 1 1 生物信息学教育部重点实验室 清华信息科学与技术国家实验室 筹 生物信息学研究部 清华大学自动化系 北京 100084 2 吉林大学。</p><p>7、高通量 RNA 甲基化测序数据处理与分析研究进展 * 刘恋 1) 张绍武 1)* 孟佳 2) 陈润生 1, 3) (1)西北工业大学自动化学院，信息融合技术教育部重点实验室，西安710072； 2)西交利物浦大学生物科学系，吴江太湖新城研究院，苏州215123；3)中国科学院生物物理研究所，北京100101) 摘要随着高通量测序技术快速发展，MeRIP-seq (methylated RNA i。</p><p>8、高通量 RNA 甲基化测序数据处理与分析研究进展 刘恋 1 张绍武 1 孟佳 2 陈润生 1 3 1 西北工业大学自动化学院 信息融合技术教育部重点实验室 西安710072 2 西交利物浦大学生物科学系 吴江太湖新城研究院 苏州215123。</p>