基因组学与蛋白质组学 ppt课件

基因组学与蛋白质组学Genomics and Proteome1 基因组 （ Genomics）指一个生物体、细胞或病毒的全部遗传物质2几个代表物种的基因组大小3一、人类基因组计划的启动1986 年诺贝尔奖获得者 R.Dulbecco（ 杜尔贝科） 提出人类基因组计划 测出人类全套基因组的 DNA 碱基序列（ 3 X 109 bp ）41975年，获诺贝尔生理医学奖56美国政府决定于 1990年正式启动 HGP，预计用 15年 时间，投入 30亿美元 ，完成 HGP。由国立卫生研究院和能源部共同组成 “人类基因组研究所 ”逐渐地， HGP扩展为多国协作计划。参与者包括： 英、日、法、德和中国 （ 1993年）7二、人类基因组计划的进展状况（ 1）截至 1998 年 10 月，完成 1.8 X 108bp， 占 计划的 6 。（ 2）完成一系列模式生物全基因组测定。这些 模式生物全基因组 测定的完成有重大理论与现实意义。8（ 3） DNA 测序技术飞速提高1998.5.9 J.C. Venter 等 宣布，组建商业公司，投入 3 亿美元， 3 年内完成。接着又有若干家公司成立， 共投入资金约 几十亿美元 ， 形成 “公 ”“私 ”并进 格局92000.6 完成并公布 人类基因组工作框架图 ( 90%)。10二 000年六月二十六日克林顿宣布人类基因组草图绘制完成11美国国家人类基因组研究所所长弗朗西斯 柯林斯在介绍情况。12人类基因组草图基本信息 由 31.65亿 bp组成 含 33.5万基因 与蛋白质合成有关的基因占 2%人类基因组 人类蛋白质 61%与果蝇同源 43%与线虫同源 46%与酵母同源132000年 6月公共领域测序计划工作框架图142000 年 12 月美、英等国科学家宣布绘出拟南芥基因组的完整图谱，这是人类首次全部破译出一种植物的基因序列。152001 年 2月 16日人类基因组 “精细图 ”完成， (99%),16同时发表论文美国 Science, Vol. 291, No. 5507 英国 Nature , Vol.409, p.86017DAN测序胶图18年月日，人类基因组序列图亦称 “完成图 ”（ 99.99%），提前绘制成功。 19第一节 基因组学Genomics20一、基因组学基因组学（ Genomics）阐明基因组的结构、探讨结构与功能的关系以及基因与基因之间相互作用的科学。包括： 结构基因组学 （ structural genomics）功能基因组学 (functional genomics)比较基因组学 (comparative genomics) 21基因组学包括 3个不同的亚领域结构基因组学 (structural genomics) 功能基因组学 (functional genomics)比较基因组学 (comparative genomics) 基因组学概念22二、结构基因组学结构基因组（ structure genomics）以生物体全基因组的结构为研究对象，对其进行分区和标记，使之成为比较容易操作的小的结构区域，确定染色体基因组全部 DNA序列、各基因所在的位置以及结构与功能的关系，为阐明基因功能奠定基础。23（一）结构基因组主要内容通过基因作图、序列分析及基因鉴定，建立具有高分辨率的生物 遗传图谱、物理图谱、转录图谱和序列图谱 。24、 遗传图谱（ genetic map）指基因或 DNA标记在染色体上的相对位置与遗传距离。cM（基因或 DAN片段在染色体交换过程中分离的频率） 25 多态性 ：人的 DNA序列上平均每几百个碱基会出现一些变异（ variation），并按照孟德尔遗传规律由亲代传给子代，从而在不同个体间表现出不同，因而被称为多态性（ Polymorphism）。 26第一代多态性 标记 是 RFLP（ restriction fragment length polymorphism，限制性片段长度多态性）2728第二代多态性 标记 是短的串联重复序列（ short tandem repeats, STR）包括小卫星 DNA和微卫星 DNA (microsatellite sequence, MS)，其多态性主要来自重复序列拷贝数的变化29小卫星 DNA 由 15-65bp的基本单位串联重复而成，长度一般不超过 20kb。重复次数（小卫星 DNA区的长度）在人群中是高度变异的；按照孟德尔的