第二章园艺

第二章 原核生物及主要类群2.1 原核生物的分类和鉴定2.2 真细菌2.3 古细菌n分类n鉴定 -分类的操作过程n命名一、细菌分类的原则 界 （ Kingdom） 门 （ Phylum） 纲 （ Class） 目 （ Order） 科 （ Family） 属 （ Genus） 种 （ Species） 基本单位 亚种 （ Subspecies， subsp.或 ssp.）变种 （ Variety， var.） n菌株：单个细胞或 1个孢子在人工培养基上繁殖而来的群体。nATCC-美国典型培养物保藏中心n双名法 (参照 P137)n三名法二、细菌分类鉴定的依据和方法（一）传统方法（常规鉴定方法）主要根据细菌 形态、培养特征和生理生化特性1.细菌形状、大小、结构和染色反应0.5-1 mm （ 直径）0.2-1mm（ 直径） X 1-80mm（ 长度）0.3-1mm（ 直径） X 1-50 mm长度）(长度是菌体两端点之间的距离，而非实际长度 )(1)球菌（ cocci ）球菌是球状细菌的总称。四联球菌、链球菌、八叠球菌、葡萄球菌Arrangement of Spherical Bacterial Cells杆菌只在短轴面分裂(2)杆菌（ Bacilli）Single bacillus Diplobacillistreptobacilli CoccobacillusVibrio, Spirillum and Spirochete弧菌螺旋菌螺旋体螺旋菌是细胞呈弯曲杆状细菌统称。根据其长度、螺旋数目和螺距等差别，分为弧菌 Vibrio和螺旋菌（螺旋状，超过 1圈）。n 与螺旋体 Spirochaete 区别：螺旋菌靠 鞭毛 运动，而螺旋体靠 轴丝 运动，无鞭毛；螺旋菌 刚性 强，螺旋体 柔韧 。2. 细菌的群体形态 n（ 1）菌落形态 n 菌落：在 固体 平板培养基上，细菌局限在 一处 大量繁殖，聚集形成的 团块 。n 细菌菌落大多数表面 光滑湿润 ， 黏稠、有光泽 ，菌落较小，同培养基结合 不紧密 ，有 臭味 。菌落 的特征 ：（包括大小、形状、颜色、边缘、质地、透明度、光泽、表面、湿润度等）菌苔：菌苔：微生物密集生长所形成的。其作用是可用来保存菌种。细菌形态不是一成不变，受环境条件影响（如 温度 、 培养基浓度 及 组成 、 菌龄 等）细菌培养特征 n 液体培养基 表面生长沉淀生长混浊生长3.生理生化特性测定n Carbohydrate Fermentation Tests 糖发酵试验 n Urease Test 尿素酶试验 Citrate Utilization Test 枸橼酸盐利用试验 利用枸橼酸盐生长 +不能利用 -大肠杆菌产气杆菌Indole Test 吲哚试验 n 色氨酸 吲哚 玫瑰吲哚吲哚试剂大肠杆菌产气杆菌（二）分子分类法 1.G+C百分比测定 2.核酸杂交3.16S rRNA碱基测序 系统分类中常用的数据库n NCBI（美国国家生物技术信息中心）n EBI（欧洲生物信息研究所）细菌的分类系统两部著作： 伯杰氏鉴定细菌学手册 ， 1923年以来已出至第九版（ 1994）； 伯杰氏系统细菌学手册 1984年问世，至 1989年出齐，共 4卷。 2.1 原核生物的分类和鉴定2.2 真细菌2.3 古细菌n 植物病原细菌分属于棒杆菌属、黄单胞杆菌属，假单胞杆菌属、土壤杆菌属和欧氏杆菌属一、革兰氏阴性菌1.固氮菌属 自生固氮2.根瘤菌 与豆科植物共生固氮3.肠道细菌大肠杆菌（ Escherichia coli）常被用于分子遗传学和遗传工程方面，构建新的工程菌。4.假单胞菌、黄单胞菌饮用水的微生物指标：总菌数： 100个 /ml大肠杆菌： 3 个 /L（一）、需氧性杆菌（二）、支原体、立克次氏体和衣原体支原体（ Mycoplasma）立克次氏体（ Rickettsia）衣原体（ Chlamydia）革兰氏阴性细菌，立克次氏体（ Rickettsia） 专性活细胞内寄生的原核微生物。1. 立克次氏体（ Rickettsia）H.T.Ricketts 1909年，首次发现斑疹伤寒的病原体，并因研究此病而牺牲， 1916年人们以他的名字命名这类病原体作为纪念。a 概念2. 支原体（ Mycoplasma）a 概念又称类菌质体，是介于一般细菌与立克次氏体之间的原核微生物 。b 特性1）无细胞壁，细胞形态多变；2）个体很小，能