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化学信息学作业 INTERNET： PubMed文献查找 化学与分子工程学院化学与分子工程学院20042004级级 王志鹏王志鹏 0041016700410167 NCBI - PubMed Established in 1988 as a national resource for molecular biology information, NCBI creates public databases, conducts research in computational biology, develops software tools for analyzing genome data, and disseminates biomedical information - all for the better understanding of molecular processes affecting human health and disease. PubMed的优势 当今化学与生物科学在许多领域的界限已 经逐渐模糊，化学研究常涉及生命科学的 前沿课题。 PubMed可以为在这些领域工作 的科学家提供很多便利。 PubMed包含70多个国家出版的数千种生物 医学杂志，收集了从20世纪60年代中期至 今的一千多往条文献引文记录，涉及生物 、医药、分子生物学、护理、保健等多方 面的文献。功能强大, 使用也比较方便. 下面我将以具体的实例介绍如何在PubMed 中查找文献。 抗体芯片（Antibody Microarray，抗体微阵 列），是蛋白质芯片的一种，是检测生物 样品中蛋白表达模式的新方法。这种新技 术使得研究人员可以在一次实验中比较生 物样品中成百上千的蛋白质的相对丰度， 将极大促进蛋白质组目前的研究状况 因为以现有的技术中对蛋白质进行这种复 杂的分析是非常困难的。 Clontech公司第一代的抗体芯片Ab Microarray 380 （Cat.No.K1847-1）包含固定在玻璃片基上的378 种已知蛋白质的单克隆抗体，可以在一次简单实 验中同时检测样品中的378种蛋白质的表达情况， 并且可以在一张芯片上对两种样品的表达模式进 行比较分析。这使得抗体芯片在毒性实验、疾病 研究和药物开发上有广泛的应用前景。 首先进入首先进入NCBINCBI的主页的主页 http:/在左上方在左上方 点击点击PubMedPubMed 进入进入PubMedPubMed，在提问框中输入要查询的，在提问框中输入要查询的 关键词关键词 “ “Antibody Antibody MicroarrayMicroarray” ” 需要注意的是，应在查找的关键词上加引 号，否则将按进行Antibody AND Microarray 查找。 可以选择特定的检索入口检索，比如在提 问框中输入：“Antibody Microarray”title 其 中方括号表示规定检索次的检索入口： 提问框中输入“Antibody Microarray”title的查找结 果见下图，一共有21条文献。列出的文献均为在文 献的标题中出现关键词“Antibody Microarray”。 此外，PubMed的另一个功能是可以在Display一栏 中选择列出相关文献的其他信息. 举例说明:在Display的下拉菜单中选择Citation一项，即可获 得标题中包含关键词“Antibody Microarray”的被引用情况 如果你想了解文献摘要（Abstract)中含有关键词“Antibody Microarray”的相关信息，可以选择“Abstract”项 查找结果显示文献条目共有条，可见该领 域的研究是相当热门的 在查找结果中选择感兴趣的文献，例如第十四篇 A prototype antibody microarray platform to monitor changes in protein tyrosine phosphorylation.点击作 者的名字可以得到这篇文章的摘要和全文链接。 而点击Related Articles 则可以得到这篇文章所引 用过的参考文献。 点击此处得到该篇文献的摘要 和全文链接 点击此处得到这篇文章 引用的参考文献 点击作者的名字，得到这篇文献的文摘和全文链接：点击作者的名字，得到这篇文献的文摘和全文链接： 点击 后进入如下页面： 全文链接 这里已经可以看到文献的全部内容了，如果你想以PDF方式 打开该文献，请点击“full text(PDF)” 点击此处获得PDF格 式的全文内容 再点击”Begin manual download” 得到如上图所示的网页，可以点击“保存文件副本” 保存为PDF格式 点击”related articles”得到此文献引用的参考文献目录 还蛮多的嘛,呵呵 第二个题目 螯合疗法(chelation therapy)是一门把有毒的化学 物质如铅、砷和其它重金属排出体外的技术。治 疗包括使用叫做螯合剂的特殊药物。 把螯合疗法 作为治疗铅中毒的有效办法已有四十多年了，美 国食品药品管理局也批准了这种方法。近年来， 一些另类疗法的从业者推荐螯合疗法用于大量的 其它情况，特别是冠状动脉疾病(动脉硬化症)。 但是目前，没有科学证据表明螯合疗法除了对重 金属中毒起作用外，还对癌症或其它疾病有用。 Our duty 在PubMed上查询螯合疗法(chelation therapy)的相关文献,了解在这一领域的研究 进展. 按照前述方法, 在提问框中输入要查询的关 键词,输入“chelation therapy”key word, 便 可以得到在此领域内的文献条目. 也可以输入“chelation therapy”title，同样 可以得到相关的信息 输入“chelation therapy”key word后得到上图所示的结果 ，共有条文献 可见该领域的研究相当成 熟，后来人要想超越难度 很大啊 输入“chelation therapy”title，得到上图所示的文献条目 可以看到，文献的排序是按照时间先后来的最新的文 献放在最前面 注意看时间 选择一篇最新的文献，如第一篇文献，查看该文 献的摘要和全文链接 点击第一篇文献“Lead toxicity and chelation therapy.” 的作者名单，如下图： 全文链接 点击“full Text”图标，进入以下页面： 进入下图所示的页面 点击上图所示的图标处，进入以下页面： 全文链接，与第一个查 询任务相同，不再赘述 这是AJHP的主界面，提供搜索功能，在Keyword(s)一栏 中输入“chelation therapy”, 点击GO，进入以下页面： 可以搜索到很多该杂志登载过的关于“chelation therapy”方面的文献 ，点击“full Text”或“PDF”可以看到全文，点击“Abstract”可以看到还 文献的摘要 点击“Full Text”后进入上图所示页面，点击“Full Text(HTML)” 天下没有免费的午餐，居然需 要注册， 要求输入用户名和密码，且为有偿服务， 不能免费注册 但是已经检索到这篇文章所在的期刊、卷 数和页码，凭借这些信息可以北大图书馆 的电子期刊中查找到这篇文献： 可惜北京大学图书没有购买该期刊的电子 版，不过知道了上述信息，想查找全文应 该是很方便的 检索的一些特色功能 询问栏下的l