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生存分析与cox回归分析 一、基本概念 生存时间(survival time):疾病治疗的 预后情况,一方面看结局好坏,另一方面还要 看出现这种结局所经历的时间长短。所经历的 时间称为生存时间。 完全与不完全数据 一部分研究对象可观察到死亡,从而得到准确 的生存时间,所提供的信息是完全的,称为完 全数据;另一部分病人由于失访、意外事故、 或到观察结束时仍存活等原因,无法知道确切 的生存时间,它提供了不完全的信息,称为不 完全数据(截尾数据、删失数据:censor data )。 始点 终点 始点 终点 生存分析(survival analysis):生存 时间一般是通过随访收集。不完全数据提 供了部分信息。须要用专门的方法进行统 计处理,这类统计方法起源于对寿命资料 的统计分析,故称为生存分析。 二、生存分析的主要内容二、生存分析的主要内容 第一,描述生存过程 第一,描述生存过程 研究生存时间的分布特点,估计生存 率,生存曲线; 第二,比较生存过程(假设检验) 第二,比较生存过程(假设检验) 对两组或多组生存率进行比较; 第三,影响生存时间的因素分析 第三,影响生存时间的因素分析 了解影响生存过程的主要因素为改善 预后提供指导。 例在对资料进行描述时: 5名癌症患者存活时间(月) 6 10 14 20 20 n=5 平均生存时间, mean=18 ,median= 7 8+ 25 35 + 50 当有截尾数据时,? kaplanmeier生存率曲线图 三、cox回归分析(cox regression) 影响生存时间的长短不仅与治疗措施有 关, 还可能与病人的体质, 年龄, 病情的轻 重等多种因素有关。如何找出它们之间的关 系呢?对生存资料不能用多元线性回归分析 。 1972年英国统计学家cox dr. 提出了一 种能处理多因素生存分析数据的比例危险模 型 ( coxs proportional harzard model)。 表 多元线性回归分析的数据结构 实验对象 y x1 x2 x3 . xp 1 y1 a11 a12 a13 a1p 2 y2 a21 a22 a23 a2p 3 y3 a31 a32 a33 a3p n yn an1 an2 an3 anp 其中:y取值是服从正态分布 多元线性回归模型 通过实验测得含有p个自变量 x1,x2,x3,xp及一个因变量y的n个观察对 象值, 利用最小二乘法原理, 建立多元线性 回归模型: 其中b0为截距, b1 ,b2 bp称为偏 回归系数. bi表示当将其它p-1个变量的作 用加以固定后, xi改变1个单位时y将改变bi 个单位. spss实现逐步回归方法: 操作过程:analyze-regression-linear -y选入dependent-x1、x2、x3选入 independent-stepwise-options-ok 表2 logistic回归模型的数据结构 实验对象 y x1 x2 x3 . xp 1 y1 a11 a12 a13 a1p 2 y2 a21 a22 a23 a2p 3 y3 a31 a32 a33 a3p n yn an1 an2 an3 anp 其中:y取值是二值或多项分类 定义: 为logistic变换,即: spss操作步骤: analyze-regression-binary logistic -dependent框(y)-covariates框( x1,x2,)-ok 设含有p个变量x1, x2,xp及时间t和结局c的 n个观察对象. 其数据结构见表3。 表3 cox模型数据结构 实验对象 t c x1 x2 x3 . xp 1 t1 1 a11 a12 a13 a1p 2 t2 0 a21 a22 a23 a2p 3 t3 0 a31 a32 a33 a3p n tn 1 an1 an2 an3 anp 1、数据结构 (1)风险率(hazard rate): 患者在t时刻仍存活,在时间t后的瞬间 死亡率,以h(t)表示。 3、cox回归模型 (cox regression model) (2)cox回归模型的构造 多元线性回归模型: 设不存在因素x1、x2 、xp的影响下, 病人t 时刻死亡的风险率为h0(t), 存在因素x1、 x2 、xp t的影响下, t时刻死亡的风险率为h(t). 用死亡率的比 h(t)/h0(t) 代替p/(1-p)即得。 logistic回归模型: (3)cox比例风险回归模型 ln(h(t)/ h0(t))=1x1+2x2+pxp 参数 1,2,p称为偏回归系数 , 由于h0(t)是未知的,所以cox模型称为半参 数模型。 cox比例风险函数的另一种形式: h(t)= h0(t)exp(1x1+2x2+pxp) 变量变量x x j j 暴露水平时的风险率与非暴暴露水平时的风险率与非暴 露水平时的风险率之比称为露水平时的风险率之比称为风险比hr (hazard ratio) hr= ei (4 4) 流行病学意义流行病学意义 hr风险比相对危险度rr (5)cox回归模型的检验 对cox模型的检验采用似然比检验。 假设为h0:所有的i 为0 , h1:至少有一个 i 不为0 。 将ho和h1条件下的最大部分似然函数的对数 值分别记为 和 可以证明在h0成立的条件下,统计量 2-2 - 服 从自由度为p的2分布。 (6)cox模型中回归系数的检验 假设为 h0: ,其它参数固定; h1: ,其它参数固定。 h0成立时,统计量 z bkse(bk) 服从标准正态分布。se(bk)是回归系数bk的 标准误。 3、cox回归模型的作用 (1) 可以分析各因素的作用 (2)可以计算各因素的相对危险度 (relative risk,rr) (3)可以用 1x1+2x2+pxp( 预后指数)估计疾病的预后。 4、筛选变量(逐步cox回归分 析) (1)向前法(forward selection) (2)后退法(backward selection) (3)逐步回归法 逐步引入-剔除法(stepwise selection) spss实现方法与logistic回归相 同 enter和remove的确定同前 调试法:p从大到小取值0.5,0.1 ,0.05,一般实际用时, enter , remove应多次选取调整。 例.某医师对1988年收治的16例鼻腔 淋巴瘤患者随访了13年,数据见表7 ,试作cox回归。 表2 鼻腔淋巴瘤患者随访资料 编 项目登记 观察记录 整理 号 性别 年龄 分期 鼻血 放疗 化疗 开始日 终止日 结局 生存天 数 1 1 45 2 2 0 1 88-1-17 89-8-17 1 578 2 0 36 2 2 0 1 88-1-21 92-4-17 1 1549 3 0 45 2 0 1 0 88-2-2 90-12-31 0 4717 0 51 2 2 1 0 88-12-1 95-5-22 1 2363 注:性别1为男性、放疗1表示采用,0表示未采用、 结局1表示死亡。 3.spss 软件实现方法 fileopen相应数据(已存在) analyze survivalcox regression time(dat)status define event single value(1) continue covariates(自变量)method fkwardcontinue optionscorrelation of estimate display modelat last stepentry-removal (0.05,0.10)maximum iterations(20) continueok zhubu:block1: method = forward stepwise (wald) 解 释 设第i个因素的回归系数为bi,对应的风 险比(risk ratio,记为rri): rri=exp(bi), 表示该因素每增加一个单位时,风险度改变 多少倍。 在本例中放疗x5,取值0和1,b=-1.589, rr=0.204,表示因子水平1与0比较,前者的风 险度是后者的0.204倍(20.4%),提示“放 疗”是有利因素。“鼻血”x4取值是0、1、2 , b=1.38, rr=3.979,表示因子水平每增加1 个等级,风险度增加3.979倍,提示“鼻血” 是不利因素。 谈思路 输卵管注药绝育术是一种经宫颈往输 卵管注入小剂药物使之闭塞而达到节育目的 一种女性非手术绝育技术。该术在我国历经 30余年的发展,并得以广泛应用。但其有效 性、安全性问题始终受到医学界关注。 输卵管注药绝育术多中心临床研究在 1986年4月至1991年6月开展。被接纳进入该 研究的共有1705名受术合格对象。 术时按随机原则将复方苯酚糊剂 (pap)和显影苯酚胶浆(pm)分配给受术 对象,
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