医学文献检索技巧ppt课件

*复旦大学图书馆文献检索教研室1 医学文献数据库 MEDLINE 2010.4 *复旦大学图书馆文献检索教研室2 一、数据库概况 （一）编制单位：美国国立医学图书馆(NLM) 。 （二）收录学科内容： n主要收录生物医学、卫生保健以及生命科学相关 文献。 n包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工 艺学、基础研究；临床、护理、公共卫生、卫生 政策发展或相关教育活动的内容。 n2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植 物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学 方面的研究内容。 *复旦大学图书馆文献检索教研室3 （三）文献来源： n70多个国家和地区；近5000种生物医学期刊 n美国卫生研究院文献选择技术评估委员会 Literature Selection Technical Review Committee(LSTRC)评估挑选 nNLM和各专业协会的数据协作采集专家推荐。 n近年数据涉及37种语种，回溯至1949年的数据涉及 60种语种。47%为美国本土出版文献，90%为英文文 献，79%的文献有文摘。 （以上由2009年7月数据库提供） 一、数据库概况 *复旦大学图书馆文献检索教研室4 二、 MEDLINE的检索平台 n广域网免费平台： nNCBI-PubMed（含非MEDLINE数据） *复旦大学图书馆文献检索教研室5 n校园网内可用平台（IP控制）： nOvid SP nWeb of Knowledge nEBSCO nOCLC First Search 二、 MEDLINE的检索平台 *复旦大学图书馆文献检索教研室6 校园网内可用平台的Medline *复旦大学图书馆文献检索教研室7 PubMed数据库检索 *复旦大学图书馆文献检索教研室8 （一）开发机构： nNCBI（美国国立生物技术信息中心） nNCBI的任务: n利用计算机信息处理技术，建立分子生物学、生物化 学、遗传学知识的自动存储和分析系统，并开展相关 先进方法的研究。 n促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件 的使用。 n促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。 一、 PubMed简介 *复旦大学图书馆文献检索教研室9 NCBI网站 *复旦大学图书馆文献检索教研室10 NCBI提供的数据库 n检索大分子生物学数据 n获取GenBank, EMBL等数据库的核酸序列； n获取Swiss-port,PIR,PRF,PDB等蛋白质序列， 从核酸序列翻译到蛋白质的序列； n获取基因和染色体图谱；蛋白质三维结构数据 及大分子模式（MMDB）等其他生物信息数 据库检索。 nPubMed等文献数据。 *复旦大学图书馆文献检索教研室11 n广域网免费提供题录和文摘 n提供与原文的网址链接(部分免费获取） n提供检索词智能转换匹配 n界面简洁，操作简便 （二） PubMed的特点 *复旦大学图书馆文献检索教研室12 nMEDLINE Indexed 1966 to prensent的MEDLINE已标引数据 ，有MeSH字段和摘要，每条记录标有： PubMed-indexed for MEDLINE nOldMEDLINE 1949-1965年间的MEDLINE数据，无 MeSH字段和摘要，每条记录标有： PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966 （三） PubMed收录数据 *复旦大学图书馆文献检索教研室13 nMEDLINE Inprocess 最新的MEDLINE处理中数据，未标引，无MeSH字 段。每条记录标有： PubMed-in process。 nPublisher-Supplied 出版商提供的电子文献题录，每条记录标有: PubMed-as supplied by publisher，分为两类： n MEDLINE 收录，逐步转为In Process, Indexed状态 。 n Not MEDLINE：PubMed 收录，MEDLINE不收录， 一直标注PubMed-as supplied by publisher或PubMed （三） PubMed收录数据 PubMed记录状态子集 PubMed记录状态子集 *复旦大学图书馆文献检索教研室16 二、PubMed的检索功能 基本检索输入框 检索限制 高级检索 检索指南 检索工具： 特定文献检索 临床查询 专题查询 其他资源： 规范词数据库 期刊数据库 临床试验等 个人空间 *复旦大学图书馆文献检索教研室17 n检索栏可输入一个或多个检索词（系统默认空格 为AND检索） 如：aloe psoriasis（芦荟治疗牛皮癣的文献） 三、PubMed 基本检索规则 多个检索词输入 *复旦大学图书馆文献检索教研室18 n检索栏可输入布尔逻辑运算式：（运算符须大写） 如：asthma AND (therapy OR treatment) n字段限定符： ，空格按词组匹配 如：aloe AND psoriasisti 如：Stem cell transplantationti 三、PubMed 基本检索规则 *复旦大学图书馆文献检索教研室19 逻辑运算式输入： aloe AND psoriasisti 牛皮癣出现在篇名中 *复旦大学图书馆文献检索教研室20 字段限定 stem cell transplantationti *复旦大学图书馆文献检索教研室21 n著者检索：姓全称在前，名首字母在后，au 。 如: smith abau “paulsen e”au 三、PubMed 基本检索规则 逻辑运算式输入： Paulsen E撰写的芦荟 治疗牛皮癣的文章 *复旦大学图书馆文献检索教研室22 n刊名检索：全称或MEDLINE认可的标准缩写, so 如：Journal of investigative dermatologyso J invest dermatolso 三、PubMed 基本检索规则 输入刊名检索发表在该刊上 的文献（限定出处字段SO） *复旦大学图书馆文献检索教研室23 PubMed记录字段说明 文摘 第一著者单位地址 出版商提供文献识别号 著者群 版权说明 参考评论文献 合著者 文献参考评论 定稿版 校样版 输入日期 输入完成日期 电子出版日期 *复旦大学图书馆文献检索教研室24 电子出版日期 文献出版日期 数据加入PubMed日期 文献勘误 参考文献勘误 全部著者姓名 全部调研者姓名 作为文章主题的著者全称 文献相关注释 基金编号 基因符号 期编号 资助调研者 资助调研单位 国际标准期刊号 美国立医学图书馆识别号 期刊全称 *复旦大学图书馆文献检索教研室25 最后修订日期 规范词表词 规范词确立日期 系统组织的文摘 版权拥有者 题录提供机构的识别号 病史相关与原始记录 其他关键词 提供其他关键词的机构 数据提供者机构 文章总页数 出版商提供数据时间 期刊出版国 数据库文献编号 *复旦大学图书馆文献检索教研室26 作为主题词的个人姓名 出版状态 文献类型 出版模式（纸张或电子） 参考文献数 已撤回的文献 酶或化学物质代码 正在撤消中的文章 初版文献 修订和再版的文章 子专题文档 太空署提供的数据 二次文献数据库以及文章讨论的 分子序列访问号 原文来源 引用了病例的文献内部处理代码 标准期刊缩写 文献标题 翻译标题 更新文献 文献正在更新 期刊卷号 *复旦大学图书馆文献检索教研室27 n截词检索：treat* 可检出：treat, treated, treatment. n强迫短语检索：“ ”，不进行自动转换匹配和 扩展检索 如：“acute low back pain” “ang 1”（血管紧张素1缩写）检出1085篇 比较：ang 1 检出9956篇，误检多，其中有： 三、PubMed 基本检索规则 *复旦大学图书馆文献检索教研室28 *复旦大学图书馆文献检索教研室29 n自动转换匹配检索词： 对常用医学名词自动在规范词索引（主题词 、副主题词、物质名称）中转换、并默认在所有 记录字段中匹配。 如：renal failure kidney failureMESH OR (kidneyAll Fields AND failureAll Fields) OR (renalAll Fields AND failureAll Fields) 三、PubMed 基本检索规则 *复旦大学图书馆文献检索教研室30 结果显示页右侧Details 显示系统自动匹配转换 的检索词 *复旦大学图书馆文献检索教研室31 n自动转换匹配检索词： 如：hypertension therapy Details: (“hypertension“MeSH Terms OR “hypertension“All Fields) AND (“therapy“Subheading OR “therapy“All Fields OR “therapeutics“MeSH Terms OR “therapeutics“All Fields) 三、PubMed 基本检索规则 *复旦大学图书馆文献检索教研室32 四、PubMed 检索限制：Limits nPubMed主页、结果显示页、高级检索界面 均有Limits链接。 *复旦大学图书馆文献检索教研室33 全文、免费全文、摘要限定 出版日期限定 文献类型限定 语种限定 研究对象 人/动物限定 性别限定 年龄限定 各种专题的 子数据库限定 *复旦大学图书馆文献检索教研室34 五、PubMed 高级检索功能 n一个网页中集多种功能于一体 基本检索 检索细节 检索式编制 检索历史 其他检索资源 结果预览 检索框中只能输入检索词，不能输入检索式 。 多个字段检索要分多次输入。 检索历史中显示历次检索式、时间和检出篇数 。 可组配检索式，如：#1 OR #2，#1 AND child 点击编号可对检索式进行删除、保存等操作。 在History中快速显示检索式与检出篇数 显示转换规范词及运算的详细过程，可确定规范词 *复旦大学图书馆文献检索教研室35 六、PubMed其他资源 1. Mesh Database（规范化医学主题词表） n功能： n确定规范化主题词 n查看主题词词义注释、树状结构表 n选择副主题词、扩展下位主题词、指定主要主题词 n进入途径： nMeSH Database链接：PubMed主页，Advanced Search 界面 nMeSH选项：基本检索框前Search下拉菜单的 文章A 著者用词： 肾衰竭 renal failure 规范主题词MeSH： 肾功能衰竭 kidney failure 文章B 著者用词： 肾功能衰竭 Kidney failure 规范主题词MeSH： 肾功能衰竭 kidney failure 词表中：肾衰竭 见 肾功能衰竭 renal failure see kidney failure （2）医学主题词表（MeSH） *复旦大学图书馆文献检索教研室37 进入 MeSH *复旦大学图书馆文献检索教研室38 MeSH词检索 例1：2006-10年关于舌根癌治疗的文献。 n课题分析： n舌根癌的不同表达形式（OR）： tongue base cancer、 cancer/carcinoma/tumor of tongue base、 cancer of the base of tongue n治疗的不同表达形式（OR） ： therapy/treat/treatment, surgery, radiotherapy n两个概念之间：舌根癌 AND 治疗 *复旦大学图书馆文献检索教研室39 输入自由词， 查找规范词 未匹配到规范词 选择提示中相关 上级概念词舌癌 *复旦大学图书馆文献检索教研室40 只查重点论述的文献 *复旦大学图书馆文献检索教研室41 系统自动扩展检索下位词， 勾选后不检索下位词 树 形 结 构 上位词 该词无下位词 *复旦大学图书馆文献检索教研室42 输入舌根的自由词检索式， 进行AND运算。 *复旦大学图书馆文献检索教研室43 初步结果， 未限定年份 *复旦大学图书馆文献检索教研室44 *复旦大学图书馆文献检索教研室45 设定的限制 *复旦大学图书馆文献检索教研室46 输入(tongueti AND baseti AND (cancerti OR carcinomati OR tumorti) AND (therapy OR treat* OR surgery OR radiotherap* OR rehabilitat*) 自由词检索查全文献 *复旦大学图书馆文献检索教研室47 加工中，无MeSH词 *复旦大学图书馆文献检索教研室48 比MeSH多10篇 *复旦大学图书馆文献检索教研室49 排序方式选择 Abstract格式提供全文 链接、规范词等信息 MEDLINE格式提供 所有字段信息 *复旦大学图书馆文献检索教研室50 点击标题显示 文摘增强格式 文献归类功能 PMC免费全文链接 *复旦大学图书馆文献检索教研室51 文摘增强格式 相关论文 MeSH词、物质名、 文献类型等信息 LinkOut外部资源链接 全文链接，我校订购的数据库可链全 文，需在校园网内设免费代理 相关的网上免费医学指南信息 全文链接，部分需连外网 *复旦大学图书馆文献检索教研室52 *复旦大学图书馆文献检索教研室53 输出方式选择 *复旦大学图书馆文献检索教研室54 输出方式选择（send to） nFile：保存检索结果为文本文件 nClipboard 剪贴板，多次检索，可暂存每 次检索需下载的记录，最后一起保存。 最 多允许存储500条，保留8小时。 nEmail: 通过邮件发送 nCollections：将检索结果存到My NCBI中 nOrder：全文传递服务，需帐号、收费。 *复旦大学图书馆文献检索教研室55 订阅最新结果 点击后点“XML”按钮 *复旦大学图书馆文献检索教研室56 需IE7.0以上版本 *复旦大学图书馆文献检索教研室57 定期点击链接，接收课 题最新相关论文 *复旦大学图书馆文献检索教研室58 MeSH词检索 例2：用MeSH检索2003-09年期间关于霉酚酸 酯在肾衰竭治疗中疗效观察的文献。 n课题分析： n匹配物质名称：mycophenolate mofetil n匹配主题词： renal failure, treatment effect（AND） n匹配副主题词： drug therapy, surgery, therapy *复旦大学图书馆文献检索教研室59 *复旦大学图书馆文献检索教研室60 *复旦大学图书馆文献检索教研室61 *复旦大学图书馆文献检索教研室62 *复旦大学图书馆文献检索教研室63 *复旦大学图书馆文献检索教研室64 *复旦大学图书馆文献检索教研室65 MeSH检索的优点 n查全同义词: 如：renal/kidney failure; tongue cancer/tumor n查全子概念: 如：chronic/acute kidney failure, ATN 自动扩展检索 下位词 上位词 勾选后不扩展下位词 *复旦大学图书馆文献检索教研室66 MeSH检索的优点 n根据树形结构调整检索词 缩小：不扩展下位词，或选用某个下位词； 扩大：选用上位词，或选用多个同位词； n了解同一概念的同义词、近义词，供自由词检索参考 款目词：规范词 所替代的不同表 达形式的自由词 *复旦大学图书馆文献检索教