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文档简介
微生物及其鉴定简述 1 微生物及其分类 定义:个体难以用肉眼观察的一切微小生 物之统称。 细胞机构分类分为原核微生物和真核微生 物 非细胞类:病毒和亚病毒。 特征:体小面大、吸多转快、生长繁殖快 2 原核微生物(prokaryotic microbe):指核质和 细胞质之间不存在明显核膜,其染色体由 单一核酸组成的一类微生物。 原核微生物包括古菌(即古细菌)、真细 菌、放线菌、蓝细菌、粘细菌、立克次氏 体、支原体、衣原体和螺旋体。 真核微生物:真菌球菌、藻类(部分)、原生 动物(部分)。 3 原核生物与真核生物的区别 比较项目原核生物真核生物 实 例 细菌、蓝藻、放线菌、衣原体、支原体(支原体细胞最小,且无细胞壁)酵母菌等真菌、衣藻、高等植物、动物 细胞大小较小(110微米)较大(10100微米) 细胞 结构 细胞壁不含纤维素,主要成分是肽聚糖;细胞器只有一种,即核糖体;细胞核没有核膜 (这是最主要的特点)、没有核仁、没有染色质(体),但有核物质,叫拟核 细胞壁的主要成分是纤维素和果胶;有核糖体、线 粒体、内质网、高尔基体等多种细胞器;细胞核有 核膜、核仁、有染色质(体) 主要细胞 增殖方式 二分裂有丝分裂、无丝分裂、减数分裂 代 谢 类 型 同化作用多为异养型、少数为自养型(包括光合作用和化能合成作用自养型),异化作 用多为厌氧型、少数为需氧型。光合作用的部位不是叶绿体而是在光合片层上;有氧呼 吸的主要部位不在线粒体而是在细胞膜 同化作用有的是异养型、有的为自养型,异化作用 有的为厌氧型、有的为需氧型。光合作用的部位是 叶绿体;有氧呼吸的主要部位是线粒体 生殖方式无性生殖(多为分裂生殖)有性生殖、无性生殖 遗传方面遗传物质DNADNA DNA分布 拟核(控制主要性状);质粒(控制抗药性、固 氮、抗生素生成等性状) 细胞核(控制细胞核遗传),线粒体和叶绿体(控 制细胞质遗传) 基因结构编码区是连续的,无内含子和外显子编码区是不连续的、间隔的,有内含子和外显子 基因表达 转录产生的信使RNA不需要加工;转录和翻译通常 在同一时间同一地点进行(在转录未完成之前翻译 便开始进行) 转录产生的信使RNA需要加工(将内含子转录出的 部分切掉,将外显子转录出的部分拼接起来);转 录和翻译不在同一时间同一地点进行(转录在翻译 之前,转录在细胞核内、翻译在细胞质的核糖体) 遵循遗传规律不遵循基因分离定律和自由组合定律 细胞核遗传遵循基因分离定律和自由组合定律,细 胞质遗传不遵循基因分离定律和自由组合定律 可遗传变异的来 源 基因突变基因突变、基因重组、染色体变异 进化水平低高 4 病毒 定义:一类由核酸和蛋白质等少数几种成分组 成的“非细胞生物”,但是它的生存必须依赖 于活细胞。 结构:蛋白质衣壳和核酸 5 病原微生物 引起人和动物致病的微生物叫病原微生物,有八大类 : 1,真菌:引起皮肤病,深部组织上感染。 2,放线菌:皮肤,伤口感染。 3,螺旋体:皮肤病,血液感染 如梅毒,钩端螺旋体 病。 4,细菌:皮肤病化脓,上呼吸道感染,泌尿道感染 ,食物中毒,败血压症,急性传染病等。 5,立克次体:斑疹伤寒等。 6,衣原体:沙眼,泌尿生殖道感染。 7,病毒:肝炎,乙型脑炎,麻疹,艾滋病等。 8,支原体:肺炎,尿路感染。 6 临床微生物的意义 结核、病毒性肝炎、龋齿和牙周病、性病等均由病原微生物引起 (1)感染是疾病死因的重要原因之一 肿瘤病人本身免疫力低,防止和控制感染是非常重要的,这类病人感染很容易造 成死亡。 呼吸系疾病:主要是感染。 损伤包括创伤、烧伤等,感染的控制极为重要 脑血管疾病、心脏疾病等,也很容易发生感染。 (2)病原微生物与某些肿瘤密切相关 HCV、TTV皆与肝癌有关 幽门螺杆菌与胃癌有关 HCMV与成神经细胞癌、Wilm瘤、前列腺瘤、宫颈癌、睾丸癌、Kaposi肉瘤、结 肠癌等有关,HSV-2与宫颈癌有关等 (3)病原微生物与心脏病的关系 风湿性心脏病溶血性链球菌 病毒性心肌炎和心包炎柯萨奇病毒B组 肺炎衣原体与冠状动脉硬化和心脏病的发生有关 甲链和金葡菌等可引起急性和亚急性细菌性心内膜炎 7 临床微生物 葡萄球菌属 链球菌属 肠球菌属 奈瑟菌属和卡他莫拉菌 肠杆菌科 非发酵革兰氏阴性杆菌 临床真菌感染 8 金黄色葡萄球菌 金黄色葡萄球菌 (Staphyloccocus aureus Rosenbach) 是人类的一种重要病原菌, 隶属于葡萄球菌属(Staphylococcus )。有“嗜肉菌“的别称。可引起许多严 重感染。细菌按形态可分为:球菌, 杆菌,和螺旋菌。 金黄色葡萄球菌是人类化脓感染中最 常见的病原菌,可引起局部化脓感染 ,也可引起肺炎、伪膜性肠炎、心包 炎、金黄色葡萄球菌肠炎等,甚至败 血症、脓毒症等全身感染。金黄色葡 萄球菌的致病力强弱主要取决于其产 生的毒素和侵袭性酶。 9 链球菌属 定义:细胞沿一个平面分裂,常排列成链状的 细菌。 链球菌是化脓性球菌的另一类常见的细菌, 广泛存在于自然界和人及动物粪便和健康人 鼻咽部,大多数不致病。医学上重要的链球 菌主要有化脓性链球菌、草绿色链球菌、肺 炎链球菌、无乳链球菌等。 引起人类的疾病主要有:化脓性炎症、毒素 性疾病和超敏反应性疾病等。 10 肠球菌属 肠球菌属拉丁学名(Enterococcus Thiercelin and Jouhaud,1984) 细胞球形或卵圆形,0.6 2.0m 0.62.5m,在液体培养基中呈成对 或短链。 广泛出现于环境中,特别脊椎动物的粪便; 有时引起化脓感染。 11 奈瑟菌属 瑟菌属是一群革兰阴性,有菌毛,大多成双排列 的需氧性球菌. 对人致病的只有脑膜炎奈瑟菌和淋病奈瑟菌. 除淋病奈瑟菌寄居于尿道粘膜外,脑膜炎奈瑟 菌及其他奈瑟菌均寄居于鼻咽腔粘膜. 12 卡他莫拉菌 卡他莫拉菌(Moraxella catarrhalis,MC)也有称 卡他布兰汉菌(Branhamellacatarrhalis,BC)是 寄居于人类上呼吸道的莫拉菌属的一种细 菌。 引起人类的疾病主要有:儿童和老年人的上 呼吸道感染,成人下呼吸道感染,儿童上颌 窦炎、中耳炎、肺炎以及成人的慢性下呼吸 道感染。 13 肠杆菌科 常见菌属 埃希氏菌属:包括5个种,即大肠埃希菌、蟑螂埃希菌、 弗格森埃希菌、赫尔曼埃希菌和伤口埃希菌。临床最常见的 是大肠埃希菌。大肠埃希菌俗称大肠杆菌,大多数菌株是人 类和动物肠道正常菌群。致病性:主要是侵袭力、内毒素、 肠毒素等致病因素引起各种炎症(如胆囊炎、泌尿系感染、 肺炎、新生儿脑膜炎、伤口感染、菌血症及腹泻等)。内毒 素还可引起发热、休克、DIC等。 沙门氏菌属:通过动物的消化道传染致病,统称为沙门氏 菌病。病型有伤寒与副伤寒(统称肠热症)、食物中毒、败 血症,还可引起慢性肠炎。 志贺氏菌属:该属是人类细菌性痢疾的病原菌,通称痢疾 杆菌。 14 克雷伯氏菌属:存在于土壤、水、谷物等自然界以及人或 动物的呼吸道。当肌体免疫力降低时,能引起多种感染。有 肺炎克雷伯氏杆菌、臭鼻克雷伯氏杆菌和鼻硬结克雷伯氏杆 菌3种。 沙雷氏菌属:一般存在于土壤、水、植物、动物以及人类 的肠道和呼吸道中,是引起医院内感染的重要条件致病菌。 有粘质沙雷氏菌、液化沙雷氏菌、深红沙雷氏菌等。 变形杆菌属:水、泥土、阴沟及各种腐败的动、植物中最 多,它们是条件致病菌,在特殊情况下能使人致病。 耶尔森氏菌属:该属有鼠疫杆菌、假结核杆菌和肠结肠炎 杆菌3种。 15 非发酵革兰氏阴性杆菌 定义:一群不发酵葡萄糖或仅以氧化形式利用葡萄糖的 需氧或兼性厌氧、无芽孢的革兰阴性杆菌 种类:包括假单胞菌属、不动杆菌属、寡养单胞菌属、 伯克霍尔德菌属、黄杆菌属和产碱杆菌属细菌,多为条件 致病菌,主要引起院内感染。近半个世纪以来已成为医 院感染的重要病原菌。 其储菌库和感染源主要是医院环境和物件以及住院患者 ,主要传播途径为接触传播。临床感染类型分为菌(败) 血症、肺炎、泌尿道感染、烧伤和手术部位感染、脑膜 炎和眼科术后感染。 16 临床真菌感染 真菌感染引起的疾病称为真菌病,发病率最高的念 珠菌病和皮肤癣菌病。 浅部真菌(癣菌)仅侵犯皮肤、毛发和指(趾)甲,而深 部真菌能侵犯人体皮肤、黏膜、深部组织和内脏, 甚至引起全身播散性感染。 念珠菌:院内血源感染第四位,死亡率第一 曲霉:第二位最常见深部真菌病,死亡率高达60- 90% 念珠菌+曲霉=90%侵袭性感染 17 临床标本 主要包括:无菌体液,有不引起疾病的正常 菌群寄居 无菌体液:血液及骨髓标本、尿液标本、穿 刺液标本、导管 正常菌群寄居:粪便标本、痰和上呼吸道标 本、烧伤标本、生殖道标本、组织标本 18 常规检验 19 常规检验 病毒检验 直接检测:快速诊断方法 间接检测(病毒分离) 血清学检测 20 常规检验 病毒检验 21 梅里埃VITEK 全自动微生物检测系统原理及 其应用 工作原理 以每种细菌的微量生化反应为基础,不同种类的VITEK试 卡(检测卡)含有多种的生化反应孔,可达30种。 将手工分离的待检菌的纯菌落制成符合一定浊度要求的 菌悬液,经充填机将菌悬液注入试卡内,封口后放入读 数器/恒温培养箱,根据试卡各生化反应孔中的生长变 化情况,由读数器按光学扫描原理,定时测定各生化介 质中指示剂的显色并在打印机上自动打印。 可鉴定500多种细菌 22 Biolog公司全自动微生物鉴定仪 原理:利用微生物对不同碳源代谢率的差异,针对每 一类微生物筛选95种不同碳源,配合四唑类显色物质 (如TTC),固定于96孔板上(A1孔为阴性对照), 接种菌悬液后培养一定时间,通过检测微生物细胞利 用不同碳源进行新陈代谢过程中产生的氧化还原酶与 显色物质发生反应而导致的颜色变化(吸光度)以及 由于微生物生长造成的浊度差异(浊度),与标准菌 株数据库进行比对,即可得出最终鉴定结果。 Biolog微生物鉴定数据库容量是目前世界上最大的 ,可鉴定包括细菌、酵母和丝状真菌在内超过2650种 微生物,几乎涵盖了所有的人类、动物、植物病原菌 以及食品和环境微生物。 23 Biolog全自动微生物鉴定仪的优 点 可鉴定一些传统鉴定系统无法鉴定的重要的革 兰氏阴性好氧菌,如不动杆菌属, 气单胞菌 属、博代氏杆菌属, 嗜血杆菌, 假单胞菌(70多 种), 弧菌(22种)、耶尔森氏鼠疫杆菌(11 种)等 可鉴定一些传统鉴定系统无法鉴定的重要的革 兰氏阳性好氧菌,如芽孢杆菌、棒状杆菌、微 球菌、葡萄球菌属、链球菌等 与其它鉴定系统相比,新增了许多种类的厌氧 菌,如双歧杆菌(30种)、梳状菌、巨型链球 菌、乳酸杆菌(70种) 24 检测微生物的质谱 主要是气-质联用(GC-MS)、基质辅助激光 解吸飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)、电喷 雾质谱(ESI-MS)及热裂解亚稳态原子轰击 质谱(Py-MAB-MS)等 25 MALDI-TOF MS鉴定临床微生物 对于临床中的不同标本如鼻咽分泌物、咽拭 子、脑脊液、胸腹水、肛拭子及尿液等进行 微生物培养后,将其菌落进行质谱鉴定,据 统计MALDI-TOF MS能准确鉴定大部分革兰阳 性菌和革兰阴性菌如葡萄球菌属、链球菌 属、放线菌属、奴卡菌属、棒状杆菌属、红 球菌属、肠杆菌科细菌、变形杆菌、流感嗜 血杆菌、副流感嗜血杆菌、卡他莫拉菌、不 动杆菌属、耶尔森菌属等 26 难鉴定的菌株 革兰氏阳性菌: 在鉴定-溶血性链球菌过程中有一定问题,缓症 链球菌和口腔链球菌较难区分,且其与肺炎链球 菌也较难区分 革兰氏阴性菌: 不能严格
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