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生物医学文献 主题标引基础 余恩琳余恩琳 汕大医学院医学文献检索教研室汕大医学院医学文献检索教研室 2013.92013.9 Basic knowledge of biomedical literature subject indexing 一、基本知识 1. 标引（Indexing）的概念： 是对文献进行主题分析，从自然语言转换成规范化的检索语言 的过程。对文献给予分类号标识的过程，称为分类标引（ Classification indexing）；给予主题词标识的过程，称为主题 标引(Subject Indexing)。 -国家标准局GB3860-83文献主题标引规则 简言之，标引就是对文献主题分析的结果赋予检索标识的过程。而检索标 识，是一种代表文献主题的标记符号。如分类号、主题词、关键词等。 2. 文献检索标识： 外部特征：著者、文献号 内容特征：分类号标识 主题词标识：关键词（自然标识） 单元词、标题词及叙词（人为标识） 3. 主题标引的几个基本概念 （1）主题词（Subject Headings）： 也称叙词(Descriptors)，是一些以概念为基础的，经 过规范化和优选处理的，具有组配功能，并能显示 词间语义关系和动态性的词和词组。是用来揭示文 献主题内容，标引和检索文献的一种信息检索语言 词汇。 主题词主要特点： 概念性（concept）: 事物 概念自然语言 文献信息内容 概念信息检索语言 注：主题词为实词，指事物的具体层面 规范化（Normalize）:指对自然语言的词形和词义进 行限制，使一个词只能表达一个概念，或一个概念只 能用一个词来表达，即词和概念是一一对应的关系。 通过词表来控制。 优选处理（Priority):词表收词有限，不是所有的自然 语言词汇都可以作用主题词。通过词频统计确定。 组配（Cooperation) 语义关系(semantic relation):指主题词之间的内在联系 。 主要包括等同关系、等级关系和相关关系 动态性（Dynamic)：指主题词表中的词的更新变化 。 （2）主题词法（叙词法） 是直接以代表事物名称或概念的规范化的名词术语 ，作为表达文献主题内容的标识符号，并依据这些 标识符号的语义和字顺，编排和组织文献检索工具 的一种方法。简言之就是利用主题词的原理建立检 索系统的一种方法。 叙词法的基本特征： 按文献所论述的事物（即主题）集中文献； 用人们日常使用的名词术语经过规范化后直接表 达文献所论述的事物； 用参照系统等间接显示事物概念之间（即主题之 间）的关系； 用字顺序列直接提供按事物名称检索文献的途径 （即主题检索途径）。 （3）主要主题词（Major MeSH Headings, Mjme) 对文献核心主题概念的标识。 某种实验研究的直接目的和结果； 临床疾病的预防、诊断、治疗等主要手段、 方法和创新； 一篇文献中占篇幅较多的内容等。 在MEDLARS-MEDLINE系统中，用加权符号“ ”表示 如： Aspirin / therapeutic use 注：主要主题词对应主题检索中的加权概念 （4）组配（Cooperation) 按一定规则，用两个或两个以上的主题词（ 或主题词与副主题词）构成逻辑关系组合来 表达一个专指概念的方法。 形式： （A）主题词主题词 交叉组配 病毒性心脏病心肌炎 病毒性心肌炎 （B）主题词/副主题词 限定组配 锰/中毒 锌/缺乏 4、标引与检索的关系 文献主题概念 主题分析 规范语 标引过程 课题主题概念 主题分析 检索过程 检索提 问式 词表 检索 系统 检索 结果 转换 转换 标引是手段 检索是目的 标引为检索服务 标引和检索关系图，即检索原理图 5、学习文献标引的意义： （1）方便检索，提高检索效率，使查准率与 查全率保持合理的水平； （2）了解标引知识，便于专业研究 如发表文章 标识“中图类号” 标识关键词（尽量使用规范化的主题词， 提高文章被检索出来的概率，从而提高被引 用率） 6.目前常用的几种文献分类法 （1） 中国人民大学图书馆图书分类法 （2） 中国科学院图书馆图书分类法 （3） 中国图书馆分类法 （4） 杜威十进分类法（DC） （5） 美国国会图书馆图书分类法（LC） （6） 美国国立医学图书馆图书分类法（NLMC ） 1、中国生物医学文献标引系统 中国医学科学院、中国中医研究院联合设计 以 NLM MEDLARS及汉语主题词表为依托 标引依据：MeSH、中医药学主题词表 2、医学主题词表（Medical subject Headings, MeSH） NLM编制，21,000个主题词，83个副主题词（Subheadings) 严 规范化 字顺表，树状结构表（辅表） 用途：标引和检索（确保主题标引者和主题检索者在用语上的一致） MeSH对文献作者、读者所使用的自然语言进行规范，主要体 现单一性、动态性两个特点 二、主题标引（Subject Indexing） 单一性： （1）规定概念与主题词的单一对应，即一个主题词 只能表达一个概念，决不允许一词多义或一义多词 ； （2）目的是使讨论同一概念的文献不至于分散，保 证检索方便、准确和全面。 如：乙酰水杨酸 见 阿司匹林； Kidney Cancer / Kidney Tumor / Kidney Carcinomor / Neoplasms, Kidney see Kidney Neoplasms 动态性： 指词表的每年增删修订。主题词及副主题词随学科研 究的不断深化加以补充和新旧更替 3、主题词的基本形式： （1）单个词：Brain、Electrocardiography （2）词组： 直接形式：Blood Chemical Analysis, Lung Neoplasms 倒置形式： Kidney Failure （字顺表） Kidney Failure, Acute Kidney Failure, Chronic Cardiovascular Diseases （树状结构表） Vascular Diseases Hypertension Hypertension, Malignant Hypertension, Pregnancy-Induced Hypertension, Renal Hypertension, Renovascular 注：主题词采用倒置形式的主要目的，是使同属某一概念的文献能按字顺相 对集中在一起；也方便在检索过程中选词。 免疫和生物因子 生物因子 生长物质 白细胞介素类 白细胞介素1 白细胞介素2 白细胞介素3 白细胞介素4 白细胞介素5 白细胞介素6 白细胞介素7 白细胞介素8 白细胞介素9 白细胞介素10 白细胞介素11 白细胞介素12 白细胞介素13 白细胞介素14 白细胞介素15 白细胞介素16 白细胞介素17 白细胞介素18 Biological Factors Intercellular Signaling Peptides and Proteins Cytokines Interleukins Interleukin-1 Interleukin-1alpha Interleukin-1beta Interleukin-10 Interleukin-11 Interleukin-12 Interleukin-12 Subunit p35 Interleukin-12 Subunit p40 Interleukin-13 Interleukin-15 Interleukin-16 Interleukin-17 Interleukin-18 Interleukin-2 Interleukin-23 Interleukin-12 Subunit p40 Interleukin-23 Subunit p19 Interleukin-3 Interleukin-4 Interleukin-5 Interleukin-6 Interleukin-7 Interleukin-8 Interleukin-9 （树状结构表） “扩展”的概念 4、副主题词（Subheadings）也称限定词（Qualifiers ） 用于对某个主题词进行限定，将同一主题内容的 文献再按照不同的研究侧面作进一步的划分，提高主 题词的专指度，以便检索者准确快捷定位自己最关心 的文献所在区域；此外还可以扩大词汇量。 MeSH词表有83个副主题词，中医药学主题词表有 11个副主题词 注意：副主题词与主题词相组配使用，但并不是所有 的副主题词可以与任何一个主题词随意组配，它有一 定的组配限定，而且为适应学科发展，其限定范围及 时变更。 副主题词常常是事物的通用层面 5、常用副主题词简介 （1）Adverse effects 副作用（） 用于诊断、治疗、预防或麻醉的药物，化学物质、生 物和物理作用物，以及制造的产品在正常用量时引起 的不良反应（包括：过敏或特异性反应），也用于诊 断、治疗、预防、麻醉、外科手术及其他措施时的副 作用或并发症，但不包括禁忌症。 例、冷冻疗法的并发症 冷冻疗法(CRYOTHERAPY)/副作用 青霉素引起过敏（Penicilins） Penicilins/AE 或 Penicilins/Adverse effects (2) Poisoning 中毒: （PO） 用于人及动物对药物、化学 物质和工业原料的中毒，包括急性的、慢性的、偶然的、 职业的、自杀的、投药错误的和环境污染所致的各种中毒 ，注意与/化学诱导配合使用,注意使用先组主题词(如：一 氧化碳中毒) 例、服巴比妥酸盐自杀 巴比妥酸盐类/中毒 自杀 阿司匹林中毒引起胃炎 阿司匹林/中毒 胃炎/化学诱导 或阿司匹林/副作用(+) (3) Toxicity 毒性 (TO) 用于药物或化学物质对人和动物 的有害作用的实验研究；包括测定安全界限的研究和关于 各种不同剂量用药的反应研究，也包括接触环境污染物的 实验性研究。注意与/副作用、/中毒的区别 （4）Analysis 分析 （AN） 用于一种物质，其成分或其代谢产物的鉴定或 定量测定，包括对空气、水或其他环境媒介物的 分析，但不包括对组织、肿瘤、体液、有机物和 植物的化学分析，后者用化学。注意与/化学、/ 血液、/尿、/脑脊髓液、/分离与提纯、代谢、/药 代动力学等区别 例、肝脏的青霉素浓度 青霉素类/分析 肝/ 代谢 （5）Blood 血液(BL)（/Urine尿, UR/Cerebrospinal Fluid脑脊髓液,CF） 用于表明血液中各种物质的存在或分析，也用于 疾病状态时的血液检查和血液变化。但不包括血清诊 断和血清学，前者用/诊断，后者用/免疫学 例、妊娠期中血青霉素G的含量 妊娠/血液 青霉素G/血液 （7）Chemical synthesis 化学合成 （CS） 与化学物质或药物组配，表明体外分子的化学制 备。在生物、细胞或亚细胞领域内形成化学物质时用/ 生物合成 例、青霉素的制备 青霉素类/化学合成 （6）Biosynthesis 生物合成 （BI） 与化学物质组配，表明其在有机体内、活细胞内或 亚细胞成分中的生物代谢形成。或用于生物体的活细 胞或亚细胞成分的化学物质的形成 例、痛风时肝内的氨基酸合成 氨基酸类/生物合成 肝/代谢 痛风/代谢 （8）Chemical induced 化学诱导 （CI） 用于人或动物由于化学化合物引起的疾病，综合征 、先天性异常或体征。注意用在药物或化学物质名称 之后加/副作用、/中毒、/毒性的副主题词作配伍 例、与氯喹有关的眼疾病 眼疾病/化学诱导 氯喹/副作用 （9）Complications 并发症（CO） 与疾病组配，表明两种疾病同时存在或相继存在 的状况，即同时存在的疾病、并发症或后遗症。注意 与/病因学的区别 例、眼弓形体病并发的青光眼 眼弓形体病/并发症 青光眼/并发症 （10）Etiology 病因学 （ET） 用于疾病以探讨致病原因，包括微生物、环境和社会 因素，起病因作用的个人习惯等，包括致病机理，如 果引起疾病的因素是药物，应用/化学诱导 可与/并发症配伍 （11）Contraindications 禁忌症（） 与药物、化学物质以及生物和物理因素主题词组 配，表明在任何疾病或生理状态时可能使这些物质可 能不合适、不需要或不可取。也用于诊断、治疗、预 防、麻醉、外科手术或其他操作的禁忌症。注意与/副 作用、/中毒、/毒性区别 例 孕妇禁用奎宁 奎宁/禁忌症 妊娠/药物作用 （12）Deficiency 缺乏 DF 与内源性或外源性物质组配，表明其缺乏或低于有 机体或生物系统的正常需要量。 （ 13 ）Diagnosis 诊断 （DI） 用于各种疾病的诊断，包括检查、鉴别诊断及预后 ，但不包括普查、放射线照相诊断、放射性核素成像、 超声诊断。前者用/预防和控制，第二者用/放射照相术 ，超声诊断用/超声检查 例、癫痫的脑电描记法诊断 癫痫/诊断 脑电描记术 （14）Diagnositc use 诊断应用 （DU） 用于应用化学物质、药物，物理动因来研究某些器官 的临床功能或诊断人或动物的疾病。注意与/诊断配伍 （15） Ultrasonography 超声检查 (US) 与器官 和部位主题词组配，指超声成像，与疾病组配，指 超声检查，但不包括超声治疗 （16）Radiography 放射摄影术 (RA) 用于器官 、部位和疾病的X线检查，是“器官X线成像”和“疾 病X线诊断”，但不包括放射性核素成像，后者用/ 放射性核素成像，注意与Radiation effect辐射效应 区别: 用于电离和非电离辐射对活的机体、器官组织及 其成分以及生理过程的效应；包括对药物和化学物 质的放射效应。 使用/辐射效应，一般指X线，如非X线，则加配 词指明何种射线。 （17）Radionuclide Imaging 放射性核素成 像 (RI) 用于解剖结构疾病诊断的放射性同位素造影 （18）Diet therapy 饮食疗法（DH） 用于疾病的饮食性或营养性治疗；但不包括维生素和 矿物质的补充，后者用/药物疗法 例、消化性溃疡的饮食治疗 消化性溃疡/饮食疗法 （19）Drug effects 药物作用（DE） 用于药物和化学物质对器官、部位、组织或机体的生 理和精神过程作用。注意药物要与/药理学组配配伍 例、青霉素G对心脏的影响 青霉素G/药理学 心脏/药物作用 （20）Dru