DNA条形码和分子标记及开发及利用高级培训班.doc

中国科学院计算技术研究所 北京海淀中科计算技术转移中心 ICTTRAIN-08-03-02 关于举办“生物信息学最新技术”暨“分子鉴定原理及应用”高级培训班的通知 各有关单位:随着分子生物学技术和生物信息学的发展，分子鉴定应用领域越来越广泛，其中基于DNA 条形码技术、基因组技术等进行鉴定和分类的研究已成为生物分类学研究中引人注目的新方向和研究热点。DNA条形码、基因组等技术的出现极大地增强人类监测、了解和利用生物多样性资源的能力，其在生命科学、法医学、流行病学，以及医药、食品质量控制等领域均具有广泛的应用前景。“智能信息处理技术”为人力资源与社会保障部中国科学院北京分院国家级专业技术人员继续教育基地培训点培训项目，“生物信息”为智能信息处理技术系列培训项目之一。为进一步推动我国生物信息学的发展，提高从业人员的技术水平，北京海淀中科计算技术转移中心（中科院计算所技术转移中心）举办“生物信息学最新技术”暨“分子鉴定原理及应用“DNA条形码和下一代（next generation）分子标记的开发及利用”高级培训班，并由北京嘉诚永恒科技有限公司具体承办，具体事宜通知如下：一、培训目标及特点：本培训分子鉴定应用，DNA测序，DNA条形码技术，基因组，遗传检测为主题，精心设计了具有前沿性，实用性和针对性强的理论课程和上机课程。培训邀请的主讲人均是有理论和实际研究经验的人员。学员通过与专家直接交流，能够分享到这些顶尖学术机构的研究经验和实验设计的思路。学员通过集中专题学习后能够扩展思路，在研究技术方面领悟更多。二、培训对象：大中专院校生物信息、生物计算、生命科学、医学、化学、农学、计算机科学、数学类专业的课程负责人、一线教师、教研室骨干人员、教学管理人员；科研单位从事生物、生命科学、微生物研究的相关人员；生物、医药、化学及相关企业的领导与技术骨干。三、时间地点： 2016年5月5日5月8日 武汉大学 （时间安排：第1天报到，授课3天）四 培训内容一分子鉴定的应用1、微生物、动物、植物资源普查2、检验检疫3、中药材真伪鉴定4、食品质量安全5、疾病诊断和预防6、分子育种二DNA测序技术-遗传检测的利器1、第一代测序技术：Sanger测序原理2、第二代测序技术：Illumina，454, Ion Torrent原理3、第三代测序技术：PacBio, Hellicos原理4、第四代测序技术:Oxford NanoPore原理5、Hybridization based methods6、测序技术的比较及展望 三Sequence-independent分子标记的开发及应用1、Restriction fragment length polymorphism （RFLP）2、Random amplified polymorphic DNA （RAPD）3、Simple sequence repeats （SSR）4、Single strand conformation polymorphism （SSCP） 5、Cleaved amplified polymorphic sequence （CAPS）6、Sequence characterized amplified region （SCAR）7、Amplified fragment length polymorphism （AFLP）8、Inter-retrotransposon amplified Polymorphism （IRAP）9、REtransposon-microsatellite amplified polymorphism （REMAP）四equence-dependent分子标记开发及应用1、常用的DNA条形码标记：ITS，ITS1，ITS2，trnH-psbA，rbcL-matK，COI等2、常用DNA条形码鉴定方法：sequence similarity-based （Blast， Hidden Markov Model），tree-based，cutoff-based3、筛选最优DNA条形码指标PCR amplification successSequencing efficiencySpecies distinguishing powerDNA barcoding gapDNA barcoding相关数据库BOLD: Barcode of Life DatabaseBOMMD: Barcode of Medicinal Materials Database五基于全基因组序列的新的分子标记的发现1、（真菌、动物）线粒体基因组测序方案: 实验方法纯化还是生信方法纯化组装方法：de novo vs. reference based注释流程: MFAnnotator vs. FUMGA特异性标记筛选流程2、（植物）叶绿体基因组测序方案：实验方法纯化还是生信方法纯化组装方法：de novo vs. reference based注释流程：CPGAVAS vs. DOGMA特异性标记筛选流程 五、主讲专家：主讲专家来自中科院等科研机构的高级专家，拥有丰富的科研及工程技术经验，长期从事生物信息领域项目研究，具有资深的技术底蕴和专业背景。6、 学以致用： 旨在帮助学员准确把握行业动态和发展趋势，了解企业对专业的要求与用人标准，从而能有针对性地设置教学体系，课程安排，将课程体系与企业用人的实际要求紧密结合起来,更能帮助学校寻找实训基地和铺设就业渠道。7、 颁发证书：学员经培训考试合格后可以获得： 1由人力资源和社会保障部中国高级公务员培训中心、全国信息化计算机技术水平教育培训管理中心颁发的生物信息工程师技术水平教育培训证书，证书可在人保部中国国家人事人才培训网查询（），可作为能力评价、考核和任职的重要依据。2由北京海淀中科计算技术转移中心颁发的生物信息工程师培训证书。注：请学员带两寸（蓝底）彩照2张（背面注明姓名）、身份证复印件一张。八、报名办法及费用：每人￥4300元（含报名费、培训费、资料费、考试费、证书相关费用）食宿统一安排，费用自理。请各有关部门统一组织本地区行政、企事业单位报名参加培训，各单位也可直接报名参加，报名回执表请传真至会务处。九、联系方式： 联系电话/传真：邮箱： 官方网址： 中国科学院计算技术研究所 北京海淀中科计算技术转移中心 北京嘉诚永恒科技有限公司 二零一六年三月二十八日 二零一六年三月二十八日 二零一六年三月二十八日 报 名 回 执 表单位名称通讯地址邮 编联 系 人电 话传 真学员姓名职务性别身份证号码邮 箱联系电话及手机培训地点武汉武汉武汉武汉武汉武汉培训费万 仟 佰 拾 元电汇日期汇款方式：请汇款至以下帐号之一户 名：北京海淀中科计算技术转移中心开户行：中国银行北京科学城支行账