外文医药类数据库(zdq).ppt

第六章 外文医药类数据库简介 主讲人 张德全 2011.9.8 主要内容 Medline和PubMed； 美国化学文摘（CA）； ISI web of knowledge; SpringerLink、Sciencedirect (SD)等全 文数据库。 MEDLINE美国全科医学文献数据库 1966- 编辑出版单位：美国国立医学图书馆(National Library of Medicine, NLM) 三种重要的纸本医学文献检索工具： Index Medicus(医学索引) Index to dental Literature(牙科文献索引)， International Nursing Index(国际护理索引) 收录范围：基础医学、临床医学、护理学、口腔医学、 兽医学、卫生保健及预防医学等 光盘出版发行单位：Silver Platter(银盘) 更新周期：月更新 MEDLINE光盘简介 收录了1965年以来 世界70多个国家和地区出版的 大约3900余种生物医学核心期刊的文献题 录和文摘 累计文献量已达1200万篇 并以每年40万条记录递增 88%的文献原文是英文 76%的文献有英文摘要 MEDLINE光盘简介 到目前为止，全世界有近20家出版商获准转换 MEDLINE数据库，发行MEDLINE的光盘产品， 其中包括SilverPlatter（银盘）、Cambridge、 DIALOG、OVID等公司 银盘公司出版的MEDLINE光盘数据库是我国医 学相关部门进口数量最大，使用频率最高的医 学文献光盘数据库 MEDLINE光盘数据库字段 MEDLINE光盘数据库字段 TI: Kharakteristika kDNK gena rpa43+ Schizosaccharomyces pombe: strukturnoeskhodstvo subedinitsy Rpa43 RNK-polimerazy I s subedinitsei Rpc25 RNK-polimerazy III. Characteristics of the cDNA of the Schizosaccharomyces pombe rpa43+ gene: structural similarity of the Rpa43 subunit of RNA-polymerase I with the Rpc25 subunit of RNA-polymerase III AU: Shpakovskii,-G-V; Shematorova,-E-K AD: Shemyakin-Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry, Russian Academy of Sciences, Moscow, Russia. gvsibch.siobc.ras.ru SO: Bioorg-Khim. 1999 Oct; 25(10): 791-6 IS: 0132-3423 PY: 1999 LA: Russian; Non-English CP: RUSSIA AB: We isolated and characterized full-length cDNA of the rpa43+ gene encoding one of subunits of the nuclear RNA polymerase I of Schizosaccharomyces pombe. MESH: *RNA-Polymerase-I-genetics; *RNA-Polymerase-III-genetics; *Schizosaccharomyces-genetics MESH: Amino-Acid-Sequence; Base-Sequence; DNA,-Complementary; Molecular- Sequence-Data; RNA-Polymerase-I-chemistry; RNA-Polymerase-III-chemistry; Sequence-Homology,-Amino-Acid TG: Animal PT: Journal-Article SH: chemistry; genetics RN: 0; EC 2.7.7.-; EC 2.7.7.- NM: DNA,-Complementary; RNA-Polymerase-I; RNA-Polymerase-III SI: GENBANK/AF129106 SB: Index-Medicus UD: 20001218 AN: 20110078 XREC: ABSTRACT (AB) MEDLINE光盘数据库单元记录实例 常用的逻辑运算符 逻辑与：AND 逻辑或：OR 逻辑非：NOT 常用的位置运算符 位置算符with： 检索式：A with B表示检索词A和检索词B 不仅同时出现在一条记录中，还要同时出 现在一个字段里。 位置算符near： 检索式：A near B表示检索词A和检索词B 不仅同时出现在一条字段里，还要同时出 现在一个句子里。Near n表示0n-1个间隔 。 运算符的优先级顺序 在一个检索式中，可以同时使用多个逻辑 运算符，构成一个符合逻辑检索式 运算符的优先级为： NOT NEAR WITH AND OR 如果有( )，则先运行( )的运算。 截词符、通配符、连缀符 截词符“*” Immun*=immunology, immune, 等等 通配符“?” colo?r = color, colour 连缀符“-” interleukin - 6 PUBMED文献检索整合平台 n全球最大生物医学文献检索系统 n收录生物医学及其它相关学科期刊近2万种 n包括已被MEDLINE数据库标引处理的期刊5000多 种 n与全球286家数据供应商建立链接提供全文的刊 种5828种 n由140个供应商提供811种免费刊,其中252种刊 为PMC期刊 n基因文库记录提供所有公开发表的核酸和蛋白 质序列及其生物学注释和书目文献等信息 PUBMED文献检索平台 n数据类型：期刊论文、综述、以及与其他数据资 源链接。 n特点：提供题录和文摘免费检索；提供原文的网 址链接； 提供相关文献链接; 提供临床专项检 索过滤; 提供检索词自动转换匹配； 操作简便 、快捷 n检索功能：主题词检索；入口词自动转换；自动 扩展；强大的检索辅助功能；原文获取和相关文 献的链接功能等 PUBMED与MEDLINE的区别 n加注信息标记： In process citation：提供MEDLINE尚未经规范处理的数据。 Publisher Supplied Citations：出版商直接提供电子记录， Old medline: MEDLINE文献尚未进行新词表更新的记录 Out of scope: 其它学科期刊 n收录范围广：生命科学相关的非医学专业期刊 n收录记录新：MEDLINE数据标引前的最新题录 n文献类型全：提供电子原文链接（部分免费） CA on CD数据库介绍 CA on CD光盘数据库由美国化学学会制作， 文摘内容对应于书本式化学文摘。该数据 库收录世界范围内有关生物化学、物理化学、 无机、有机化学等众多化学及化工方面的科技 文献，年文献量达773,000条，其中约123,000 条专利。文献来源种类包括科技期刊、专利、 技术报告、学位论文、会议录以及图书。 数据库文献内容及索引信息按月更新。 数据库检索软件为Windows版本，用户需进 入图书馆光盘系统才能使用。 CA on CD的检索方法 CA on CD提供四种基本检索途径： Browse 浏览检索 Search 高级检索 Substance 化学物质名称检索 Formula 分子式检索 其他检索途径 相关词检索 登记号检索 Browse 检索事项 1. 点击图标进入索引浏览页面； 2.浏览检索缺省状态为word index，其范围包 括文献题目、文摘、关键词、普通主题词表 、 机构、地址等； 3.关键词输入不区分大小写；可全拼输入也可 采用不完全拼写方式； 4.词与词之间无需使用逻辑或位置算符； 5.在索引表中，用Ctrl或Shift键可 以选择多个词（最多不能超过20个）同时 检索，词与词之间的关系默认为“OR”； 6.索引表一般按字母顺序排列； 系统提供的索引有： Word 文献中的关键词 CAS RN 登记号 Author 作者 Gen Subj 普通主题词表 Patent No. 专利号 Formula 分子式 Compound 化合物名称 CAN CA号 Organization 机构全称 Org.Words 机构名称中含有的词 Journal 刊名 Language 语言 Doc Type 文献类型 CA Section CA分类 Year 出版物的年代 Updata 数据更新 Search检索事项（一） 1. 使用Search检索可达到多路径同时检索的效果 ； 2. 逻辑算符为：AND、OR、 NOT； 3. 输入框之间的逻辑缺省状态，是“AND” ； 4. 同一字框内可使用逻辑算符“OR”连接成简单检 索式； 如：Strength or toughness 5. 位置算符Word Relationship Same Document 表示关键词在同一记录中 出现； Same Paragraph 表示关键词在同一字段中 出现； Word Apart 表示关键词间允许的最大间 隔 词数0-9； Exact Order 表示精确检索。 Search检索规则（二） 6. 模糊算符 * 用于表示词的首尾模糊检索 例： optic* ，命中 optic，optics，optical等。 例： *assay*，命中 immunoassay,radioimmunoassay ,assaying 等 ； ？表示中间模糊检索，一个？代表一个字符，可 使用多个？； 例：organi?ation, 命中 organization, organisation; CH2?O2 ， 命中 CH2BrO2 ，CH2ClO2 7. 禁用词 an and as at by for from in not of on or the to with 检索技巧 开题前的准备工作十分重要，它包括对词性 的了解、词尾变化、同义词及该词是否符合 系统要求，同时还要了解数据库检索规则； 当你对关键词、主题词、规则非常清楚准确 时，可直接进入各种检索状态； 如果你对使用的词无把握或检索效果不好时 ，应核查索引指南加以确认； 充分利用相关词检索方式，扩大检索视野。 注意各种检索方式的不同功效，特别是 Form与Formular、Subst与 compound不同作用，使检索更加准确。 ISI Web of Knowledge平台 n整合内容: 不同类型、不同学科数据库的双向链接 二次文献与事实性文献的链接 二次文献与原始文献全文的链接 与图书馆馆藏目录系统OPAC的无缝链接 与科学计量学工具的整合链接 n ISI Web of Knowledge平台 n对科技信息业的贡献体现在： n实现不同文献资源之间的整合与沟通 n最大限度地保持知识体系的完整性 n提供科学研究的全方位信息 n提供高质量、可信赖的信息资源 n构成了一个动态的学术信息门户 ISI Web of Knowledge平台 nSCIE（Science Citation Index Expanded)： 内容与规模：收录自然科学26个学科领域内的核心期 刊5,800多种，涉及大小类目168个，数据周更新。是学 术界公认权威的科学技术文献检索工具。 价值与作用：揭示过去、现在、将来的科学研究之间 的内在联系，揭示科学研究中涉及的各个学科领域的交 叉联系，协助研究人员迅速地掌握科学研究的历史、发 展和动态，从而不断推动科技创新。 Journal Citation Reports (JCR) 世界权威期刊客观评价的有效工具 包含自然科学领域26个专业研究领域5600种权 威期刊。 对于每一份被收录的期刊提供：引文和论文数 量、影响因子、立即指数、被引半衰期、引用 半衰期、源数据列表、引用期刊列表、被引期 刊列表、主题分类、出版社信息、期刊标题变 化等。 作者可以用它找到最适合自己又最具影响力的 期刊，确定投稿方向。 研究人员可以用于发现与自己研究领域相关的 期刊。 ISI Web of Knowledge平台 1. ScienceDirect Elsevier SDOL / 是一个常用的、综合性数据库，涉及所有学 科领域. Elsevier Science 公司出版的期刊是国际公认 的高水平的学术期刊，大多数都被SCI、EI所 收录，属国际核心期刊。该公司近几年已经 与Pergamon、North Holland、Excerpt Medica 等著名出版社合并，将其出版的1100 多种期刊全部数字化，通过网络向用户提供 服务。 有待刊论文（Articles In Press），能够提 前几个月看到印本期刊的论文，还提供给 予电子邮件的快讯服务（E-mail Alert ） 。有2000余种期刊（部分无全文），其中 有800万篇全文文章，还可以检索超过 75000万篇的摘要信息。此外还有图书资 料。 出版物途径浏览（期刊/图书） 出版物名称字顺浏览 出版物所属学科领域浏览 高级检索入口 1.1 浏览(Browse) 入口：数据库首页左边浏览区域或上部导航条 的的“BROWSE”按钮，进入浏览界面。 系统提供按题名首字母字顺（Journals/Books Alphabetically)和按学科分类（Journals/Books by Subject）浏览期刊/T图书目录，从中选中刊名后， 单击刊名，进入该刊所有卷期的列表，进而逐期浏览 。 常见术语说明： Content Type 内容类型 Article Feed 提供RSS订阅 Apply 修改个性化设置和快讯订阅 Articles in Press ：待刊论文预印本之一 Accepted manuscripts: 是指已经接受的稿件 Uncorrected proofs:初步编审，在最终出版前还有可 能会修改 Corrected proofs: 完成审核 Sample Issue Online About this Journal Submit your Article 提交你的文章（投稿） Full Text + Links 带链接全文（WEB） PDF (284 K) PDF全文及其大小 1.2 检索： 快速检索（Quick Search ）：Title, abstract, keywords 高级检索： 组合与逻辑组配 专家检索(Expert Search)： 识别图标的意义；定制搜索结果；编辑保存检索策略， 在结果中检索检索；检索结果排序；下载 选中结果，发送题录 到邮件或生成引文 2.3 SpringerLink SpringerLink数据库是由世界著名的科技 出版集团德国的施普林格（S