宝德四核服务器在华南理工大学HPC系统的成功应用.doc

宝德四核服务器在华南理工大学HPC系统的成功应用最终用户简介：华南理工大学是直属教育部的全国重点大学，坐落在南方名城广州。经过五十多年的建设和发展，华南理工大学成为立足华南，面向全国，以工为主，理工结合，管、经、政、法、文、艺协调发展的综合性大学。校内设有中国教育和科研计算机网华南网络中心、广东省教育和科研计算机网络中心学校治学严谨，形成了团结、勤奋、求实、创新的优良校风，在华南理工引入高性能计算，有助于推进新的科研项目，提供数据论据。华南理工大学高性能计算系统是为教学科研的大型科学问题等进行并行计算和深度计算而需要建立的，属于计算密集型高性能计算项目。对LINKPACK值LINKPACK效率等要求达到最好。对研究方向所涉及的大规模高复杂性系统模型验证算法、大规模数据处理与服务等问题的研究提供有效的支撑平台，对在整个实验室运转过程中的各种高性能与大容量应用要求和服务提供支撑平台。从整体的角度考虑，我们推荐宝德HPC系统。优势是科研项目研发要求计算周期短、整体TCO成本降低、有很好的系统扩展能力。解决方案的描述：在Intel的支持下，宝德科技与华南理工大学构建了以10台宝德四核至强服务器PR2700D为计算节点的宝德Power Cluster8000高性能计算机系统，采用免费ROCKS中间件实现节点管理、任务分发和集群监控，互联网络采用千兆以太网，并用Intel优化编译工具和函数库等软件来优化应用，使系统的性能得到充分的发挥。立足宝德前期的成功案例和合作经验，在INTEL的大力支持下，宝德通过长达2个月的校方应用需求分析，运用INTEL解决方案中心的测试环境，同时兼顾后期校方的更大规模网格计算的扩展需要，针对性的推出了基于宝德四核至强服务器PR2700D的POWER 8000 HPC应用方案。华南理工大学HPC系统是基于网络、面向科研的高性能计算系统，需要以低成本实现高密度并行计算能力，宝德基于四核至强服务器的POWER Cluster8000 HPC系统具有开放性、可扩展、性价比高的特点，满足了华南理工的应用需求，因此被用户采用。该系统的基础是主控节点、计算节点等硬件基础平台的建设和互联系统的建设，主控和计算节点采用宝德四核至强服务器，考虑到计算密集型应用的需求，互联网络采用千兆以太网络，保护了用户的投资。业务方面：本项目是为华南理工量子力学、固体力学、流体力学、生物信息计算等进行并行计算和深度计算的需要而建立的HPC系统。宝德根据对用户现状和未来使用需求的充分了解，为其提供了POWER 8000 HPC系统解决方案，迅速提升了用户在教学科研活动中对大型科学计算的处理能力，缩短了多种高性能计算应用的计算时间，保障了科研教学的质量。同时，采用基于宝德四核至强服务器的计算平台，成本投入较小型机集群节省约60%，为用户创造了经济价值。本项目采用基于四核至强处理器的计算平台和千兆以太网互联网络，在多个测试实例中，用Intel编译器编译应用程序和MPI库函数比用GNU编译器获得20%以上的性能提升。在项目实施期间，宝德服务器在性能和稳定性方面表现优异，获得了用户的充分肯定和好评，为后期合作提供了坚实的基础。技术方面：宝德POWER Cluster8000 HPC系统分层次设计，按照Intel的高性能计算生态系统部署，自上而下，包括HPC并行应用程序、中间件集群管理、通信库以及各类软件优化工具、操作系统、计算节点和主控节点的硬件平台、互联网络系统等。基于宝德四核至强服务器的高性能计算系统，采用科学的层次化部署，将复杂的大型并行计算平滑移植到性价比良好的IA架构平台上，具有较好的稳定性、可扩展性和可靠性，不但为大型并行计算问题开拓出了新的解决方案，也为未来的网格计算做好了相当的理论设计基础。与目前主流的双核平台相比，宝德四核至强服务器减少了通信瓶颈并优化了性能。Intel四核处理器是单枚芯片，能够直接插入单一的处理器插槽中，但操作系统会利用所有相关的资源，将它的每个执行内核作为分立的逻辑处理器。通过在多个执行内核之间划分任务，多核处理器可在特定的时钟周期内执行更多任务。以英特尔至强5300处理器为例，产品具有：1.在更小的空间内提供更高的性能，比以前的双核处理器性能提高了约50；2.虽然性能提升了，功耗却和双核至强处理器一样，都是80瓦。3.有双倍的内核缓冲，能够做更多的分析型计算。在密集型高能效通用服务器所使用的处理器中，Intel全新四核至强处理器性能最高可达到速度最快的同类处理器的 2.5 倍。商业价值：宝德科技为华南理工大学设计的高性能计算HPC系统，能够提供高速、稳定、可扩展的运行环境，满足了华南理工教学科研中的大型科学计算的需求。宝德在本方案中采用了基于四核英特尔 至强处理器的服务器，对于高端用户，四核处理器的优势是显而易见的。多任务处理、数据分析等对计算性能要求较高的应用是多核服务器的主流应用。多核服务器在很多的应用领域上已经或即将得到用户的认可， 如海量数据处理、大规模网络应用、复杂科学计算及大型图形建模上，满足用户在数据库、创作3D图像、数学分析和网络服务等多线程多任务的处理需求。四核处理器的推出将进一步推动客户对创新服务器设计的需求，同时它还推动了客户加速实现其基础架构虚拟化的需求，以便简化和最大程度地发挥这些系统的能力。宝德拥有丰富的知识、产品和工具，在帮助客户充分发挥四核处理器的能力方面拥有独一无二的优势，这将有助于客户以更少的付出完成更多的任务。” 张云 深圳宝德科技有限公司总经理客户评价：我校在高性能计算和企业计算的后台、软件开发、应用方面有很高要求，长期使用SUN SMP机器，由于其具有高性能、扩展性，特别是solaris 10，是企业计算后台的唯一选择。由于宝德、Intel的合作，向我校提供四核样机和10多套双核安腾2服务器，使得有可能引进更为开放、性价比好的平台，对很多大学（应用数字化校园）是好机会。宝德、SUN工程师协助移植到四核平台，做了大量从驱程到系统的工作。 张凌 华南理工大学网络中心主任推荐系统配置： 以及该系统所选用的系统配置：硬件平台硬件环境：服务器机型宝德PR2700D服务器，共10台处理器内置两颗1.6GHz四核英特尔5310Clovertown至强处理器，8MBL2Cache内存1GBFBDDDR2533内存硬盘73GBSAS硬盘网卡Intel主板集成的双千兆以太网卡IntelPro/1000MT其他软件平台软件环境：操作系统：RedHatLinuxAS4.0应用软件