计算机检索教案研究生课件

计算机检索 第一节 常用中文医学数据库,一、计算机检索流程 1、查什么文献需求 根据文献需求确定是否选择计算机检索 如 1）高血压的中医治疗进展 2）中药荠苧的学名 2、用什么查检索工具（数据库） 根据文献需求挑选相应的数据库,3、怎么查 检索方法、检索策略、检索途径、检索技术等 4、原始文献 通过检索结果所提供的文献线索，获取原文,二、与Google、Baidu搜索的区别,医学文献查找应使用医学方面的专业数据库来完成。 谷歌、百度等搜索引擎并不是医学专业的搜索引擎，不适合来搜索医学方面的专业文献。 因此，一般不用搜索引擎来查找医学文献,三、计算机检索的发展,脱机检索 联机检索 光盘检索 网络检索,四、数据库类型,数据库定义：至少由一种文档组成，并满足某一特定目的或某一特定数据处理系统需要的一种数据集合。 数据库类型：参考数据库和源数据库,四、数据库类型,（一）题录型数据库 又称书目数据库或文摘型数据库 存储二次文献，提供原始文献的线索或简要内容，指引用户去查原始文献。 许多书目数据库是手工检索工具的机读版本，MEDLINE-IM、CBMdisc-中文科技资料目录(医药卫生)。,（二）全文数据库 存储的是原始资料的全文，如期刊论文、硕博士论文、会议论文等，如清华同方全文数据库、万方全文数据库、重庆维普全文数据库。,五、医学数据库的内容及其结构,（一）数据库的内容 医学数据库主要收录医学期刊、会议论文、硕士 及博士论文等文献。其中医学期刊占80%，为主要部分。,（二）数据库结构,记录：是数据库中的基本文献单元，代表 一篇文献的相关信息，由若干个字段组成。 记录是一个完整的信息单元，相当于手工检索工具中的题录或文摘。 字段：是组成记录的基本信息单元，描述文献的某一方面的特征，相当于手工检索工具的题录或文摘中的各项目名称。,表1 数据库文件示意表,（二）数据库结构,字段标识符：为了识别每一个字段所表达的文献特征，往往都给每一个字段赋予一个标识符，如题名（TI）、著者（AU）、地址（AD）、出处（SO）、文摘（AB）、刊名（出处）SO、主题词（MH）、关键词（KW）等 备注：字段标识符=检索词,五、常用中文医学数据库介绍,书目数据库 1、中国生物医学文献数据库（CBMdisc) 目前国内检索中文医学文献最好的数据库，也是使用频率最高的生物医学文献数据库 1）研制单位：中国医学科学院医学信息研究所 2）收录期刊：收录了1978-至今的1600多种中国生物医学期刊，以及汇编、会议论文的文献题录。,中国生物医学文献数据库（CBMdisc),3）记录数及更新：总计350余万条，年增长量约40万条。三个月更新一次，但与纸质期刊相比，一般至少要滞后半年左右的时间。 4）学科范围：覆盖范围涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学及中药学等生物医学的各个领域。在当今所有医学数据库中，它是目前收录范围最大的一个，中、西医文献检索结果均佳。,中国生物医学文献数据库（CBMdisc),5）标引和分类：标引用医学主题词表(即MeSH词表)和中医药学主题词表进行主题标引；并根据中国图书资料分类法进行学科分类。 6)检索途径：支持目前所有的检索途径，特有检索途径：主题词检索和分类检索,中国生物医学文献数据库（CBMdisc),特点：是目前检索中文医学文献使用频率最高的数据库，中、西医文献检索都比较全面 备注：需安装专用检索程序软件才可使用,中国生物医学文献数据库Web版,/ /cbmbin/login.dll(1978-2002年数据库),2、中国中医药期刊文献数据库,研制单位：中国中医研究院信息所(/) 收录期刊：收录1984-至今1000多种生物医学及其它相关期刊。 记录数及更新：总计53万多条，年增长量约4万条。三个月更新。5070%有文摘。 学科范围：覆盖中医药学、针灸、气功、按摩、保健等方面,3、中文生物医学期刊数据库（CMCC）,研制单位：解放军医学图书馆 收录期刊：收录1994-至今1400多种生物医学及其它相关期刊。 学科范围：涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学及中药学等生物医学的各个领域。,中文生物医学期刊文献数据库（CMCC）,标引和分类：无 检索途径：无主题词检索和分类检索。 特点：更新速度快,全文数据库,一、中国期刊全文数据库（清华同方，CNKI） 研制单位：清华同方光盘股份有限公司 收录期刊：大型综合性全文数据库，分九大专辑。收录1994-至今7600多种期刊，其中收录医药卫生类期刊1000余种。 记录数及更新：光盘月更新，各镜像站点通过互联网或卫星传送数据可实现每日更新，数据库与现刊相比滞后时间约为2-3个月。,中国期刊全文数据库（清华同方，CNKI）,学科范围：覆盖当前的所有学科，包括社会科学和自然科学 主题标引：无；分类：有。 检索途径：无主题词检索和分类检索 特点：存在掉篇现象，核心期刊收录较少。检索功能不完善，易漏检文献。,中国期刊全文数据库（清华同方，CNKI）,全文格式：CAJ格式和PDF格式 CAJ格式：全文浏览器Cajviewer，免费下载，地址： PDF格式：浏览器Adobe Reader, 备注：必须先安装好浏览器软件才能打开全文文件。,中国知网（清华同方，CNKI),1、网址：。 注意：1）检索文献时不要使用CNKI 镜像数据库(即各单位自己购买的CNKI)，以保证能检索到最新的文献。2）另外，CNKI镜像数据库一般只能检索到期刊论文，不能检索到硕博士学位论文、专利文献、会议文献、标准文献等。 进入中国知网首页，点击“进入总库检索”。,选择“主题”，输入检索词,CNKI标准检索,模糊和精确检索，中英文扩展检索。 选择学科领域：在指定的学科范围检索。 按学科类别分组：按学科显示检出文献篇数。,CNKI标准检索,检索结果显示：显示方式和显示记录数,二、万方全文数据库,研制单位：北京万方数据股份有限公司 收录期刊：收录了1995-至今。其中收录医药卫生期刊数831种。 记录数及更新：全文文献228余万篇。光盘月更新。 学科范围：社会科学和自然科学。 标引和分类：无,万方全文数据库,检索途径：无主题词检索和分类检索。 特点：总的期刊收录数过少，但核心期刊收录较为齐全。 全文格式： PDF格式。 网址：,三、中文科技期刊数据库 （重庆维普）,研制单位：重庆维普资讯有限公司。 收录期刊：收录了1989-至今。自然科学、工程技术、农业、医药卫生、经济、教育和图书情报等学科8000余种期刊，收录我国医学类、生物类专业期刊1400多种。 记录数及更新：累积全文文献830余万篇。并以每年100万篇的速度递增 。,中文科技期刊数据库 （重庆维普）,学科范围：社会科学和自然科学。 标引和分类：无 检索途径：无主题词检索和分类检索。 特点：在三大中文全文数据库中收录期刊最为齐全，但有版权问题。 全文格式： VIP格式和PDF格式。 网址：,第二节 计算机检索理论基础,一、基本原理及实质 基本原理：是将用户的检索词（或检索式）与数据库中每条记录的字段内容进行比较，然后将符合比较原则和逻辑运算条件的记录提取出来。 实质：是对数据库记录中的字段内容进行查找。,二、计算机检索用词,计算机信息检索系统中的检索词可分为主题词和关键词两种。 主题词取自于主题词表、分类词表等，是经过规范化的。 如何将关键词转换成规范化的主题词，可以借助于数据库的词表，通过查表实现转换。,三、主题词、副主题词、关键词,（一）主题词（Headings) 定义：经过规范化处理的标准词汇。理解：所谓规范化是指对文献中的同义词、近义词、多义词等加以规范，使得同一主题概念的文献相对集中在一个主题词下，同时在主题词表中采用参照系统间接反映主题概念之间与文献内容之间的关系，从而体现了主题词的单一性。例如：癌（非主题词）cancer, tumor, carcinoma 见 肿瘤（主题词）Neoplasms.,主题语言的特点规范化,1、此处题目中用的是”乙型肝炎”,2、主题词用的是“肝炎，乙型”,1、此处题目中用的是“乙肝”,2、主题词同样用的是“肝炎，乙型”,（一）主题词（Headings),来源：医学主题词表（又称MeSH词表,西医）和中国中医药学主题词表（中医） 现象 倒置现象：使同属某一大概念的主题词能按字顺相对集中地排列在一起 ，如肝炎，乙型 复合现象：由多个主题词复合表达一个医学用语。急性白血病：由急性病和白血病两个主题词复合表达。,（一）主题词（Headings),特点：单一性和动态性 （1）单一性 ：规定概念与主题词的单一对应，即一个概念只能用一个主题词表达。 目的是使讨论同一概念的文献不分散在多个不同主题词下，保证检索准确、方便和全面。例如：阿司匹林和水杨酸 （2）动态性 动态性是指词表每年修订。随着科学的发展和进步，同是文献中不断涌现出新的专门术语。如单克隆抗体、癌基因等 。,（二）副主题词（Subheadings ）,定义：对一个主题的多个方面进行修饰 限定的词。 来源：医学主题词表，92个 作用：与主题词进行组配，对某一主题词的概念进行限定，使其具有更高的专指性，缩小检索范围。 正确选择副主题词：在检索中，主题词与副主题词的组配（主题词/副主题词）两者间须有必然的逻辑关系,副主题词组配应用,中医、中药、中医药治疗某一疾病的副主题词组配 疾病主题词/中医疗法、中医药疗法、中药疗法、中西医结合疗法、中医病机 例1 中药治疗艾滋病 获得性免疫缺陷综合征/中医疗法、中医药疗法、中药疗法、中西医结合疗法、中医病机,（三）关键词（Keyword),定义：是指能够反映文献内容或主题的关键性的专业术语。 非规范化（未经严格规范化处理）检索语言，属于自然语言范畴。比如癌（非主题词）cancer,tumor,carcinoma。 关键词又称自由词、文本词(Text Word),主题词、副主题词与关键词的关系,任何一个主题词或副主题词在检索时都可以当作关键词 ； 不是每一个关键词都可作为主题词、副主题词 ，主题词、副主题词均来自于主题词表。,四、检索途径,（一）主题词途径 定义：指从文献的主题概念出发，查找文献。 检索形式：主题词/副主题词 支持数据库：CBMdisc和MedLINE等 解决两个问题： 1、如何确定检索词是否为主题词； 2、如何找出与检索词相对应的主题词。,（一）主题词途径,优点： 1 能集中检索出语言表达不同但概念相同的文献 例 关键词（自由词）：carcinoma, tumor,cancer 主题词（数据库标引用词）：neoplasms 2 命中的文献比关键词检索准确 例1 关键词：手（手术，手段，手续等） 主题词（数据库标引用词）：手（医学意义上 作为上肢和前臂组成部分，有细胞、有 组织结构并具有各种功能的“手”） 例2 关键词：伤风检索出伤风和破伤风 主题词：只检索出伤风的文献,（一）主题词途径,多用主题词途径检索的原因 因为对同一主题，不管文献中使用何种名称，不同的词形、单复数都会被标引在同一规范化的主题词下，所以采用主题词途径检索，能实现较高的查全率和查准率，缩短机时，节省费用，是提高检索技能的关键。,（一）主题词途径,检索策略 主题词 主题词/副主题词 主题词+主题词,（二） 关键词途径,定义：指直接输入关键词检索文献。 检索形式：关键词 支持数据库：所有数据库 优点：能够检索出最新的文献，用法简单。,实质：在数据库记录中查找是否有与检索词相匹配（或者相同）的记录。并不保证检索到的文献所讨论的主题与检索词的含义一致，,（二） 关键词途径,缺点： 1）误检：检出的文献不太准确； 2）漏检：有时会有许多文献检索不到。 备注：将检索词的同义词或近义词分别进行检索，然后用逻辑或（OR）运算，以防漏检。,原因：关键词不似主题词具有单一性，对同义词、近义词未经严格规范，也不设参照系统显示词与词之间的等级关系和相关关系，因此同一主题概念的文献标引相对分散，容易导致漏检和误检。如果使用不当，会影响文献的查全率和查准率。,（三） 字段途径,定义：表示输入的检索词仅在某一指定字段内检索。 检索形式：1）字段标识符=检索词 2）选定某一检索字段，输入 检索词进行检索 常用检索字段:著者、地址、刊名、出版年、参考文献（引文）、特征词等 备注：一般不用主题词、关键词字段检索。,（三） 字段途径常用检索字段,著者：检索某人发表的文章 地址：检索某单位发表的文章 刊名：检索某期刊所刊登的文章,参考文献（引文）：检索论文被引用情况 出版年：检索某一年或几年中发表的文章,（三） 字段途径特征词字段,特征词字段用以表示人类、动物、性别、年龄、体外研究、对比研究等 。 作用：常用于区分文献。如临床研究与实验研究的文献；研究对象的年龄、性别；,（四）分类检索途径,定义：指用分类号或分类词检索文献 我国文献分类的主要依据：中国图书馆分类法（简称中图法 备注：慎用分类检索途径，因有时检索到的文献量太多而耗时太长。,（五）检索途径的选择,尽可能多用主题词检索途径。 应用关键词检索途径时，应将检索词的同义词或近义词分别进行检索，然后用逻辑或（OR）运算。 慎用分类检索途径。 字段检索途径用以区分文献。,五、检索技术,（一）布尔逻辑运算符组配检索 1）逻辑与（AND）：A AND B，要求检出文献中同 时含检索词A和检索词B，其作用是缩小检索范 围，提高查准率 。 2）逻辑或（OR）：A OR B，要求检出文献中含检 索词A或检索词B或同时含检索词A和检索词B， 其作用是扩大检索范围，增加命中文献数。 3）逻辑非（NOT）：A NOT B（CBMdisc：AND NOT）， 要求在检出的包含概念A的文献中去掉含有概念B的 文献，其作用是缩小检索范围。,（一）布尔逻辑运算符组配检索（图示）,妇女吸烟 艾滋病（获得性免疫缺陷综合征） 非儿童白血病,（一）布尔逻辑运算符组配检索,使用时的注意事项 1）书写格式：检索词与逻辑运算符之间必 须要有一个空格符。 A_AND/OR/NOT_B 2）大小写：PubMed检索系统中必须大 写，其余大小写均可。 3）运算优先顺序： （）NOTANDOR,（二）截词检索,定义：指以符号取代检索词中部分字母 作用： 1.可解决汉字或拉丁字母等无法输入电脑的问题。 如：荠苧 荠？ ，TNF- TNF？等。 2.解决检索词的单复数问题、词干相同而词尾不同问题（如同一单词所派生出的名词、动名词、动词、形容词、副词等）以及英美单词拼写差异问题。 3.其作用是扩大检索范围。,（二）截词检索,截词符（通配符）：？和 * 意义： ？：代表一个汉字或英文字母。 * ：代表多个汉字或英文字母，在英文中仅对单词有效，对词组无效。,（三）限制符检索,定义：运用字段限制符进行检索 常用字段限制符：=、IN、 检索方式：1）字段标识符=检索词 2）检索词 IN 字段标识符 思考：“AU=刘军”与“刘军 IN AU”的区别。,（四）位置运算符检索,位置运算符：NEAR与WITH A NEAR B：表示两个检索词出现在同一句话中。 A WITH B：表示两个检索词出现在同一字段中。 A AND B：？,六、检索效果,（一）检索效果的评价 评价指标：查全率和查准率 查全率：指系统在进行某一检索时，检索出的相关文献与数据库中的相关文献总量之比。 查准率：指系统在进行某一检索时，检索出的相关文献与检索出的文献总量之比。 两者关系：相互矛盾,（二）检索效果的影响因素,客观： （1）文献收录是否完全 （2）文献标引水平，有否错标或漏标 （3）检索途径多少，检索功能是否完善 （4）检索系统执行逻辑组配扩展、载词能力 （5）索引词的控制性，专指性、词表（汉语主题词表、中医药主题词表、MeSH）的张罗性，词表结构是否完善、词间关系（从属、参见）是否正确。,（二）检索效果的影响因素,主观： （1）认真程度、责任心 （2）专业知识水平 （3）检索专业水平：应变、分析和逻辑思维能力，外语水平等,（三）提高查全率和查准率的若干办法,1查全率的办法 用主题词 用主题词、关键词、同义词，用or 组配 用上位词（扩展下位词） 用截词 少用副主题词组配,（三）提高查全率和查准率的若干办法,2查准率办法 用主题词 用下位词（专指度） 检索词的字段限定（抽出综述文章） 副主题词组配限检,七、检索策略,1、分析检索题目 2、选择数据库 3、确定检索词及检索途径 4、特定字段检索 5、逻辑运算 6、调整检索式,检索准备阶段关于主题分析的问题,（一）要注意主题与主题之间的影响关系、因果关系、相关关系、应用关系等关系 1、影响关系： 1）支气管扩张剂对肺的作用。 肺/药物作用；支气管扩张剂/药理学 2） 阿司匹林对胃黏膜的影响 阿司匹林/副作用；胃黏膜/药物作用,（二）要注意主题与主题之间的影响关系、因果关系、相关关系、应用关系等关系,2、因果关系： 1）阿司匹林引起消化性溃疡。 阿司匹林/副作用；消化性溃疡/化学诱导 2）眼结核引起失明。 结核，眼/并发症；盲/病因学,（二）要注意主题与主题之间的影响关系、因果 关系、相关关系、应用关系等关系,3、相关关系： 例：眼弓形体病并发青光眼。 弓形体病/并发症；青光眼/并发症,（二）要注意主题与主题之间的影响关系、因果 关系、相关关系、应用关系等关系,4、连锁关系： 例：用加压素治疗休克引起冠状动脉疾病。 冠状动脉疾病/化学诱导； 加压素/副作用； 加压素/治疗应用； 休克/药物疗法,计算机检索举例应用,例一 中医药治疗乙肝的实验研究 关键词： #1 乙肝 #2 中医药 #3 实验研究 #4 #1 AND #2 AND #3 主题词： #1 肝炎，乙型扩展全部树/中医疗法，中医 药疗法，中药疗法，中西医结合疗法，中 医病机 #2 CT：动物 #3 #1 AND #2,计算机检索举例应用,例二 华蟾素诱导肺癌细胞凋亡的实验研究 #1 华蟾素 #2 华蟾蜍毒素扩展全部树/全部副主题词 #3 肺肿瘤扩展全部树/全部副主题词 #4 细胞凋亡 #5 CT：动物 #6 #1 AND #2 AND #3 AND #4 AND #5 #7 #1 AND #2 AND #3 AND #4,计算机检索举例应用,例三 免疫印迹技术在中药材鉴别中的应用 #1 免疫印迹技术 #2 免疫印迹法扩展全部树/全部副主题词 #3 R28 扩展全部分类号中药学 #4 #2 AND #3 （命中文献75篇） #5 中草药扩展全部树/全部副主题词 #6 #2 AND #5 （命中文献43篇）,计算机检索举例应用,例四 何首乌提取物抗脂肪肝药效、毒理及机制研究,八、引文检索与专利文献检索,（一）引文检索 引文： 指一篇学术论文中所引用的参考文献，通常是以脚注或尾注的形式出现。 引文索引：是根据文献之间的引证关系按一定的规则组织起来的一种检索系统。 作者影响因子：是以计算作者著述文献的客观效果的一种影响因子。在计算和评价时，要注意区别发表在不同重要性（不同影响因子）的期刊上的论文质量的差异。,（一）引文检索,期刊影响因子：这是一个国际上通行的期刊评价指标。是E. 加菲尔德于1972年提出的。由于它是一个相对统计量，所以可公平地评价和处理各类期刊。通常，期刊影响因子越大，表明该期刊被引证的程度越高，其学术影响力和作用也越大。具体算法为：影响因子=某年引用某刊前两年论文的总次数/某刊前两年发表的论文总数,（二）、世界四大引文检索系统SCI EI ISTP ISR,SCI Science Citation Index(科学引文索引，SCI)：SCI由美国科学情报研究所(ISI)创建，以收录基础学科的论文为主，按照期刊的编辑质量、影响因子和专家评审意见为选刊依据,充分考虑期刊的学术价值，从世界上44个国家(地区)约7万种科技期刊中选出几千种重要科技期刊( 其中使用英语的期刊超过80%)作为统计源期刊。是目前国际上最具权威性的用于基础研究和应用基础研究科研成果的评价体系,SCI,SCI收录的中国医学有关的期刊 经过美国ISI的综合评定，2009年我国有147种期刊进入ISI检索系统(包括“外围SCIE“、“核心SCICDE“等)，其中化学类期刊最多。其中与医学相关的期刊为以下几种： 中国科学辑(英文版) 中国药理学报（Acta Pharmacologica Sinica） 中华医学杂志(英文版)（Chinese Medical Journal）：0.107 生物化学与生物物理进展（张平） 生物化学与生物物理学报：0.289 生物医学与环境科学(英文版) 世界胃肠病学杂志(英文版)：0.993(已被剔除),SCI,JCR Sci收录证明，引用证明。,EI（工程索引）,EI由美国工程信息公司编辑出版，以收录工业技术领域(应用学科)的论文为主，其文献来源于世界50余个国家、25种文字的4500余种刊物。与SCI情况不同的是，EI收录的我国期刊较多，2000年达到106种，约占收录期刊总量的3.5%。EI收录的论文大多数发表在国内期刊上。,EI（工程索引）,EI收录的我国期刊中与医药卫生有关的杂志如下： 航天医学与医学工程 生物医学工程学杂志 中国生物医学工程学报,ISTP（科技会议录索引）,ISTP（科技会议录索引，Index to Scientific &Technical Proceedings）创刊于1978年，由美国科学情报学会编辑出版，会议录收录生命科学、物理与化学科学、农业、生物和环境科学、工程技术和应用科学等学科，其中工程技术与应用科学类文献约占35%。,ISR（科学评论索引）,ISR（科学评论索引，Index to Scientific Reviews）创刊于1974年，由美国科学情报研究所编辑出版，收录世界各国2700余种科技期刊及300余种专著丛刊中有价值的评述论文。高质量的评述文章能够提供本学科或某个领域的研究发展概况、研究热点、主攻方向等重要信息，是极为珍贵的参考资料。,国内引文检索,中国科学引文数据库(CSCI) 概况：中国科学引文数据库(CSCI)是一个大型多功能文献数据库,由中国科学院文献情报中心编制，以数、理、化、天、地、生、农、林、医及工程技术等领域 ，以在中国出版的582种中英文重要科技核心期刊作为来源期刊。,常用数据库引文检索,（一）CBMdisc 选择字段“参考文献”，输入检索词（作者、题名、期刊名） （二）CNKI 选择字段“引文”，输入检索词（作者、题名、期刊名）,九、专利文献检索,中国专利网：/ 中国知识产权网：/ 也可检索国外专利,十、网上中文医学信息资源,（一）免费资源 1、 文献题录可免费检索 2、 3、 （二）商业数据库 1、CBMdisc Web版 2、免费资源中的三个数据库,第三节 外文数据库检索,一、MedLine数据库简介 Medline数据库是当前国际上公认最权威的生物医学数据库。 是当前检索外文文献使用频率最高的数据库。 版权归美国国立医学图书馆 期刊收录：1966年至今，共计4600多种刊物，,一、MedLine数据库简介,数据库类型为题录型数据库，其内容与印刷型检索工具Index Medicus（美国医学索引，IM）、Index to Dental Literature（牙科文献索引）、International Nursing Index（国际护理学索引）。 大部分为英语语种的文献，其中我国大陆期刊80多种。,二、MedLine数据库使用形式,Medline数据库按照提供服务的方式，共有三种使用形式： 1、Medline数据库国际联机检索 2、Medline CD-ROM 3、基于WWW的因特网查询系统PubMed。,二、MedLine数据库使用形式,Medline数据库国际联机检索 是最早期的服务方式。用户终端通过电话线连接美国国立医学图书馆Medline数据库的主机直接进行检索。此时的检索费用极高。这种使用方式有别于因特网检索。,二、MedLine数据库使用形式,MedLine CD-ROM 由出版商将数据库制成了光盘，然后邮寄给用户 。不同出版商的数据库检索界面略有不同，我国主要引进Ovid（原Silver Platter)公司产品。检索界面与CBMdisc类似。,二、MedLine数据库使用形式,PubMed(=Public+Medicine) 是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的因特网检索系统PubMed。 包括 MEDLINE和PREMEDLINE的完整内容。它还包括一些被MEDLINE认为超出范围的文章和杂志。因此 PubMed 是比 MEDLINE 的更大的集合。,三 PubMed,（一）PubMed简介 基于WWW的因特网检索系统，网址：/pubmed/；也可由Google搜索引擎链接进入（搜索词为PubMed。 正如其名字 PubMed=Public+Medicine所暗示，从1997年起完全免费。,（一）PubMed简介,收录范围： 1 MEDLINE ： 记录标注PubMed - indexed for MEDLINE 2 PreMEDLINE：是临时性医学文献数据库， 每天接收新数据，经MeSH词表标引后，每周向medline移加一次。 记录标注PubMed - in process 3 Publisher supplied citations：出版商直接向PubMed 递送的电子记录。 记录标注PubMed - as supplied by publisher,（二） PubMed的特点,自动词语匹配。 Cookies交互功能：利用Cookies保留检索史；使用粘贴板保存检索结果 。 Web浏览器都必须设在启用Cookies状态下 链接点多，部分在网上免费获得全文 原文传递服务,（三）PubMed检索网页介绍,网页按功能分为： 总览 上方数据库栏 左侧导航栏 检索查询栏 特征栏,（三）PubMed检索网页介绍上方数据库栏,Nucleotide：DNA序列数据库 Protein：氨基酸（蛋白质）序列数据库 Genome：基因组序列数据库， Structure：分子结构模型数据库，保存由X线晶体成像、NMR分光光度法建立的三维分子结构。,（三）PubMed检索网页介绍上方数据库栏,OMIM：人类孟德尔遗传学数据库等 PMC：PubMed Central缩写，全文数据库 Journal：期刊数据库 Books：医学图书（只提供文摘）,（三）PubMed检索网页介绍左侧导航栏,左侧导航栏分为三个部分：Entrez PubMed、 PubMed Services、 Related Resources。 About Entrez： Entrez检索系统介绍 Text Version：纯文本方式显示网页 Entrez PubMed Overview：PubMed数据库的覆盖范围和刊物信息 Help/FAQ：检索帮助及检索常见问题解答 Tutorial：检索指南 New/Noteworthy：关于PubMed系统更新和未来发展,（三）PubMed检索网页介绍左侧导航栏,PubMed Services Journals Database:期刊数据库，可进行刊名检索 MeSH Database：可分层浏览MeSH主题词，是主题词途径检索的入口。 Single/Batch Citation Matcher：引文检索 Clinical Queries：为临床医生设置，通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围：治疗、诊断、病因与预后 循证,（三）PubMed检索网页介绍左侧导航栏,Linkout：外部相关资源链接 My NCBI (Cubby)：个性化NCBI，可注册用户，保存检索策略。 Related Resources Order Documents：在线订购全文 NLM Catalog：NLM图书及其它资源查询 NLM Gateway：NLM数据库综合检索 Consumer Health：消费者健康信息,（三）PubMed检索网页介绍左侧导航栏,Clinical Alerts：迅速公布由NIH资助的，会显著影响发病率和死亡率的临床研究结果。 Clinical Trials：对公众提供当前的临床科研信息。 PubMed Central：可免费检索全文文献 。,（三）PubMed检索网页介绍检索栏,这是PubMed的核心部分。大部分检索，利用这“一框五键”（检索式输入框，Limits键, Preview/Index键, History键，Clipboard键和Details键）即可完成。,（三）PubMed检索网页介绍特征栏,Limits：单击特征栏上的Limits，可限定检索范围,（三）PubMed检索网页介绍特征栏,Limits功能 All Fields（字段限定）：将检索范围设定仅在某一个特定的字段，即检索时仅对某一字段的内容进行检索，如标题、作者、文本词（Text Word）、MeSH主题词等，相当于字段途径检索。 Publication Types(文献类型限定)：检索某一特定的文章类型如综述、临床试验、Meta分析、随机对照试验。,Limits功能,Ages（年龄）：可对文献中涉及到的研究对象年龄进行限定。 Entrez Dates（ Entrez 时间限定）：可对Entrez检索系统生成数据的时间进行限定。 Publication Date（出版时间）：可对文献的出版日期进行限定 Language（语种）：可对文献的语种进行限定,Limits功能,Human or Animal（研究对象）：对文献涉及的研究对象进行限制，是以人还是动物为研究对象。 Subsets（数据库子集）：可以将检索限制为仅对PubMed数据库中的某一子集数据库进行检索。 Gender（性别）：对研究对象的性别进行限定，如人类男性、女性，动物雌雄。,Preview/Index,Preview(预览)可以在显示检索结果的记录之前显示所查到的文献数量。在输入框中输入检索词，单击Preview，PubMed返回的是文献记录的数量，而非文献记录的内容。 通过增加一个或多个单词来修改查询方案。可以继续向框中加入多个词语，点击Preview直到得到希望的内容。 Preview自动使用“AND”运算符来将单词合为一体，即要求同时查询包含两个词的文献。,History,显示检索史：检索号、检索策略、检索时间和History主要用于查看检索策略，也可用于查看检索结果数。 在History状态下，可将检索历史序号用逻辑运算符连接起来后再检索。如：#1 AND #2。在检索史（History）被删除后也会随之丢失,Clipboard,Clipboard是在一次检索中存放检索结果的地方，便于集中存盘、打印或订购原文。粘贴板最多能存放500条记录。只要粘贴板中有记录，就可点击Clipboard查看其中的记录（记录为Summary格式）。粘贴板按记录存放的先后顺序显示记录。,Details,用于查看PubMed的检索策略。使用Details键还可以对检索策略进行编辑，然后再一次检索,（四）PubMed 系统的主要功能,词汇自动转换功能 强制检索功能 截词检索功能 链接功能,词汇自动转换功能,在PubMed主页的检索提问框中键入检索词，系统将按顺序使用如下4种索引，对检索词进行转换后再检索。 （1）MeSH转换表（MeSH Translation Table），包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的MeSH词和Text word词（题名词和文摘词）进行检索。例如：键入“Vitamin h“，系统将其转换成“Biotin MeSH Terms OR Vitamin h Text word“后进行检索。,词汇自动转换功能,（2）刊名转换表（Journal Tanslation Table），包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。该转换表能把键入的刊名全称转换为MEDLINE缩写后进行检索。如：在检索提问框中键入：“new england journal of medicine“, PubMed将其转换为“N Engl J Med“后进行检索。,词汇自动转换功能,（3）短语表（Phrase list）。该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统和补充概念（物质）名称表。如果PubMed 系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的词，就会查找短语表。,词汇自动转换功能,（4）著者索引（Author Index）。如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词，或者键入的词是一个后面跟有12个字母的短语，PubMed即查著者索引,词汇自动转换功能,如果仍然找不到匹配词，PubMed就会把该词断开后再重复上述转换过程，直到找到为止。若仍然没有匹配词，单个词会被用AND连在一起，在全部字段中检索。如：“single cell“，系统就会自动将其分成两个词：“single“和“cell”检索，其检索表达式为：“single AND cell”。要查验检索词的转换情况，可点击“Details”键。,强制检索功能,PubMed允许使用双引号（“ ”）来强制系统进行短语检索。例如，在PubMed主页的检索提问框中键入“Single cell”，并用双引号引起来，然后点击“Go”，系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。 使用双引号检索，会自动关闭词汇转换功能。,截词检索功能,PubMed 允许使用“*”号作为通配符进行截词检索。如：键入“bacter*”，系统会找到那些前一部分是bacter的单词（如bacteria, bacterium, bacteriophage等），并对其分别进行检索。 截词功能只限于单词，对词组无效。如：“infection*”包括“infections”，但不包括“infection control”等 使用截词功能时，PubMed系统会自动关闭词汇转换功能,链接功能,链接相关文献。PubMed系统中的每条文献记录均有一个相关文献链接，在检索结果的显示状态下，每条记录的右边均有“Related Articles”超链接。点击该链接，系统按文献的相关度从高到低显示相关文献。,（五）PubMed 检索方法,词语（主题）检索 著者检索 刊名检索 布尔逻辑检索 日期或日期范围检索 检索带文摘的记录,词语（主题）检索,主题词检索：1）在检索栏中选择MeSH数据库，输入主题词进入检索；2）使用MeSH Database。 关键词检索：使用检索栏（数据库为PubMed),著者检索,在提问框中键入著者姓氏全称和名字的首字母缩写，格式为：著者姓 名字首字母缩写，例如smith ja， 如果在著者姓名前后使用双引号，并用著者字段标识au加以限定，如“smith ja”au，那么系统只检索著者字段,刊名检索,在提问框中键入刊名全称或MEDLINE简称、ISSN号，例如：molecular biology of the cell, 或mol biol cell, 或1059-1524， 如果刊名与MeSH词表中的词相同，例如：Gene Therapy、Science或Cell等，PubMed将把这些词作为MeSH词检索。这时需要用刊名字段标识ta加以限定，如“gene therapy” ta,刊名检索,单个词的刊名也需要用ta限定，如：Scanningta。否则系统将在全部字段中检索。 若刊名有括号，录入时应将括号省略。如：J Hand SurgAm应键入：J Hand Surg Am。,布尔逻辑检索,运算符必须大写，运算顺序为从左至右，注意：运算符无优先顺序，可使用圆括号来改变其运算顺序。如common cold AND (vitamin c OR zinc), 圆括号中的检索式最先运算。 布尔逻辑检索允许在检索词后附加字段标识以限定检索字段。其检索表达式的格式为：检索词字段标识 布尔运算符 检索词字段标识。如：dnamh AND crick au AND 1993 dp,日期或日期范围检索,在提问框中键入日期或日期范围，然后回车或点击Go， 日期的录入格式为YYYY/MM/DD，如：1999/09/08edat。也可以不录月份和日子，如：2000dp或1999/12mhda。 或用Limits限制,检索带文摘的记录,检索式的格式：检索词 AND hasabstract, 如：liver cancer AND hasabstract。,（六）检索结果的显示、存盘、打印,PubMed系统可用许多种不同的格式显示检索结果，默认Summary格式。常用为Abstract。 PubMed系统可用不同的显示格式保存检索结果，默认Summary格式。 “file, text, e-mail, clipboard, order” 保存文件为file。,(七)专题讨论:PubMed中医药文献的检索,现状: 1、PubMed收录中医药文献较少，但也是检索中医药文献的重要数据库之一。 2、 PubMed未采用中医药副主题词对文献进行标引，因此无法使用主题词/副主题词的方法检索中医药文献。,(七)专题讨论:PubMed中医药文献的检索,与中医药有关的主题词和自由词 主题词：Medicine, Chinese Traditional Drugs, Chinese herbal Herbs Plants, Medicinal Medicine, herbal 自由词：plant*和herb* 检索方法：将以上主题词和自由词分别进行检索，并将各个检索结果用“OR”进行逻辑或运算,(七)专题讨论:PubMed中医药文献的检索,提高中医药文献查全率的方法 1、适当截词检索，见上文的Herb*和Plant* 2、将词组分开检索：因中药的英文名和拉丁学名称都是由2个以上单词构成，而很多文献中仅用一个表示。如“codonopsis pilosula” 3、用汉语拼音作检索词：如“salvia miltiorrhiza”(丹参）dan shen或danshen；“breathing exercises”(气功） qi gong或qigong等,(七)专题讨论:中医药文献的检索,外文文献：见上文 中文文献：1、主题词/中医药副主题词 2、#1 主题词/全部副主题词 #2 中医药副主题词（作为自由词检索，并用OR将各个检索结果合并在一起 #3 #1 AND #2,检索实例一,题目:丹酚酸A对糖尿病GK大鼠肾脏的保护作用及其机制研究 研究内容:以自发性糖尿病GK大鼠为试验对象，观察丹酚酸A对GK大鼠的糖与脂代谢紊乱、自由基代谢紊乱、肾脏血流动力学异常等的影响，对GK大鼠肾脏组织中转化生长因子（TGF-1）、肿瘤坏死因子-（TNF-）、白细胞介素-6（IL-6）等细胞因子的影响，对GK大鼠的肾皮质Na+-K+-ATPase的活性和肾小球病理性改变的影响，研究丹酚酸A对糖尿病大鼠肾脏的保护作用及其作用机制，探讨丹酚酸A新的药理活性。,检索实例二,题目：尾式阿糖胞苷金属卟啉光敏药物的合成及其抗肿瘤活性研究 研究内容：采用具有良好抗癌活性同时兼具细胞识别功能的阿糖胞苷与卟啉以共价键连接合成新型的尾式阿糖胞苷卟啉衍生物及其金属配位体，获得多个新型的卟啉抗癌光敏药物，测定新化合物对正常细胞毒性及抗癌活性，从而选择高效、低毒、有靶向性的卟啉衍生物，为卟啉类抗癌光敏药物的设计、开发和研制起到一定的指导意义。,（八）如何获取全文,一、PMC（PubMed Central） PubMed上约有5的文献是可以免费看到全文的，通常这些文献的左上角会有一个Free Full Text的小标记。你只要点击这个图标，系统就自动链接入该文献的全文。但有两点值得注意的是，第一，很多时候，这个图标在PubMed处于显示简要（summary)状态下并不出现，而只有在选择显示摘要（abstract)时才出现。因此，如果你不只是泛泛浏览，而希望看到全文的话，我强烈建议你在display下拉菜单中选择摘要（abstract)状态。第二，有些时候，小图标上仅标着Full Text，而并没有Free字样，但仍然可以链接入全文，你不妨试一试。,（八）如何获取全文,二、High Wire Press 该网站号称拥有地球上最大最全的免费的科学文献全文数据库。输入网址/ 即可登录该网站,（八）如何获取全文,三、Science (1) 先登录Science网址:。注意，不是,否则你得不到全文。 （2）点击中间那个SEARCH按钮，就进入查询页了。你可以选择简单检索还是复杂检索。 （3）输入您要找的关键词（不一定是MESH标准主题词），再点击search就可以了。 （4）找出文章后，点击标题后的Full Text，就可以浏览原文了,（八）如何获取全文,四、free medical journals 网址：/ 五、BMJ（British Medical Journal） 网址：/ 六、NEJM（The New England Journal of Medicine） 网址：/,Internet上免费中文医学文献检索网站,清华同方： 重庆维普： 万方：,第九章 特种文献检索,特种文献主要类型 专利文献 标准文献 学位论文 会议论文,第一节 专利文献检索,一、知识产权基础知识 二、专利基础知识 三、专利文献 四、专利文献的检索,第