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3-3-2-3-6-1 参考 Linkage Disequilibrium 指標挙動3-3-2-3-6-1(3/3)3-3-2-3-6-1 参考 Linkage Disequilibrium 指標挙動Reference：Devlin B and Risch N，A comparison of linkage disequilibrium measures for fine-scale mappingGenomics 29：311-322，(1995)連鎖不平衡程度表現指標複数提案、同一2 SNP間関係表現場合、用指標異値得。主、以下5LD指標(、D、d、Q )及、d加計6指標用。指標特徴挙動視覚化。要点、各指標値、(1)完全連鎖、否点、(2)Allele frequency影響受点、(3)間対称性、否点、点主相違点。Haplotype frequency以下表記HaplotypeFrequencyABPAbPaBPabPP条件P+P+P+P1Min(P)P、網羅。全指標計算式分子(N：Numerator)共通、NPP-PP書N用指標書下DdQdN/SQRT(P+P)(P+P)(P+P)(P+P)N/Minimum(P+P)(P+P),(P+P)(P+P)N/(P+P)P)N/(P+P)(P+P)N/(PP+PP)(N/(P+P)(P+P)。、組換率関係、世代数n用指標書表DdQ(1/P)SQRT(P/P)(1-P)(1-P)(1-)(1+P/P)(1+P/P)/(1+P/P)(1-)(1-)P/P(1-)(1+(P/P-1)/(P/P+1)(1-)関係、頻度関係関数。挙動描図完全連鎖場合挙動() 条件：P0, PP0.8, P0.2, 0P，P0.8、Pw 変動範囲0,0.8LD指標w 関数化以下。Y1Y2DY3Y4dY5QY6d挙動描図2完全連鎖場合挙動(2)条件：P0, P0.8, PP0.2, 0P0.2、Pw 変動範囲0,0.2LD指標w関数化以下。LD指標値w0Y1Y2DY3Y4dY5QY6d挙動描図3D 0.5固定場合他指標挙動条件：PP/9, P0.8, D0.5、
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