研-1讲-医学信息检索概述(修改版).ppt

医学信息检索与利用概述,邓小茹、张亚莉 广州医科大学 医学文献检索教研室,课程主要安排:,绪论（基础概念、理论） 中文期刊摘要库CBM 外文期刊摘要库PubMed 公共免费学术资源 中、外文全文数据库 文献管理工具 特种文献与开放存取OA 上机实习(条件允许),第一部分：基本概念 第二部分：检索技术 第三部分：医学常用数据库 第四部分：检索案例分析,世界医学协会赫尔辛基宣言,涉及人体的医学研究必须遵从普遍接受的科学原则，应对科学文献和相关资料全面了解，并有充分的实验和动物试验（如有必要）的基础上进行。 -世界医学协会赫尔辛基宣言,概 述,第一部分： 基本概念,文 献,文献（Document, Literature）是指记录着知识的一切载体； 医学文献就是记录着医学知识、信息的物质载体，如医学图书、期刊、会议录等等。,概 述,印刷型,缩微型,电子文献,按载体形式划分,文献的类型（按载体形式划分）,印刷型文献,图书,期刊,报纸,特种文献,图书,图书,图书,图书,期刊,报纸,报纸,报纸,图书,图书,期刊,期刊,期刊,期刊,期刊,期刊,期刊,特种文献,特种文献,特种文献,期刊,图 书（Books）,国内外公开出版的图书都有ISBN码（International Standard Book Number) 国内外公开出版的期刊都有ISSN码（International Standard Series Number) 一般阅读类书籍：注意选用经典教科书、浏览本专业或相关专业领域中的新书 参考工具书：注意利用字（词）典、手册、指南、年鉴、以及网络上的在线词典和大型参考数据库,ISBN号 内容系统 理论成熟 新颖性较差,图书,期刊,ISSN号 内容不系统 理论不成熟 新颖性较好,报纸,消息、报道 专业性不强 不适宜作学术论文引用源,电子版书、刊/ e-book，e-journal，及其它文献,印刷版书、刊/print，及其它文献,香港大学 馆藏缩微型文献示例,一次文献（原始文献) 二次文献 (书目文献、索引） 三次文献（教科书、参考工具书、综述等） 零次文献（私人笔记、试验记录、设计草图、口头交流的信息等）,按加工层次划分,文献的类型（按加工层次划分）,一次文献 Primary Document,又称原始文献。主要包括专著、期刊论文、科技报告、会议文献、学位论文、技术标准、档案资料以及专利文献等 具有创造性、新颖性、先进性和成熟性。是科研人员参考、学习、借鉴和利用的最基本、最主要的文献类型 但数量庞大、类型复杂、语种繁多、发表分散，需借助二、三次文献才能有效利用,中文期刊中通常以“论著”“研究报告”等形式出现； 外文期刊通常以 “original article” “journal article” “research article”等形式出现,二次文献 Secondary Document,指各种目录、索引、文摘等检索工具或书目型数据库。其主要功能是揭示和报道一次文献，提供查找原始文献的线索 具有简明性、浓缩性、汇集性和系统性的特点，是文献信息检索的主体 二次文献仅仅是对收集到的一次文献进行加工整理，著录文献特征，标引查找线索，但不会改变一次文献原有的内容,三次文献 Tertiary Document,指由各专家学者对大量的一次文献进行分析、综合、提炼、重组而形成的再生文献，是在原始文献的基础上进行再创作的成果 包括综述、评论、进展、预测等，各类词典、手册、年鉴、百科全书、教科书等各类参考工具书也属三次文献的范畴,特点：具有海量信息，汇集知识系统性、针对性和综合性强，参考价值大等特点，也是科研人员获取文献信息的重要来源。 中文期刊：综述、述评 外文期刊：review,期刊影响因子： 反映期刊的整体水平,期刊影响因子（Impact Factor, IF）指期刊近两年的平均被引用率，最早是由美国情报学家SCI创始人尤金加菲尔德(Eugene Garfield)博士在1972年提出来的 IF=(C2+C3)/(A2+A3),概 述,一种新的出版模式：公开获取（OA） 示例OA Journal Successes: PLoS Biology,features works of exceptional significance in all areas of biological science, from molecules to ecosystems, including works at the interface with other disciplines, such as chemistry, medicine, and mathematics Public Library of Science impact factor: 14.7,概 述,核心期刊：反映期刊的整体水平,核心期刊（Core Journal） 是指那些发表该学科（或该领域）论文较多、使用率（含被引率、摘转率和流通率）较高、学术影响较大的期刊 它们具有数量少（一般占期刊总数的5-15%），但信息量大（占期刊信息量的50%以上） 浏览核心期刊可在较短的时间 内掌握较多的信息，了解最新的科研动态等,概 述,国际三大索引： SCI科学引文索引: Science Citation Index EI工程索引: The Engineering Index ISTP科技会议录索引: Index to Scientific & Technical Proceedings 国内三大自科核心期刊目录 中文核心期刊(医学:223种) - 北京大学图书馆 中国科技论文统计源期刊-中国科学技术信息研究所 中国科学引文数据库(CSCD) -中国科学院文献情报中心,核心期刊,概 述,核心期刊的意义,反映期刊的整体学术水平； 提高阅读效率； 对于数据库检索系统来说，是“好”文献的过滤器（filter）（在线浏览）,概 述,医学文献的现状和发展趋势,数量大、增长快 出版类型复杂多种 内容分散、交叉、重复 新陈代谢频繁、传播迅速,概 述,医学文献的增长情况,概 述,8000 articles published per day 25,000 biomedical journals in print 1500 medical articles onto Medline per day,Whats so difficult about medical articles?,概 述,信息检索的基本原理,信息存储时，将采集到的大量分散的源信息（一次文献），经过标引著录，加工整理，使之有序化后形成各类信息集合（数据库） 信息检索时，将要查找的信息特征标识与信息集合中已存储的信息特征标识进行比较、匹配，双方特征标识完全一致或部分一致时，检索即为命中,概 述,信息检索的基本原理示意图,文献信息,检索标识,数据库,标引,存储,检索表达式,检索提问,规范检索语言,检索,匹配运算,输出检索结果,采集,分 类,按检索对象划分： 数据检索(data retrieval) 事实检索(fact retrieval) 文献检索(literature retrieval) 按检索技术手段划分： 手工检索 计算机检索 网络查询与交流,确定性检索，可直接获得解答,概 述,数据检索,又称数值检索，检索对象为特定的数值数据，主要回答“是多少”一类的问题，属于确定性检索的范围。如：物质的各种参数、电话号码、银行帐号、各类统计数字、化学药物的理化常数，常用计量等 数据检索需借助相关的参考工具书或通过数值型数据库,概 述,事实检索,又称事项检索，检索对象为特定的事实，主要回答“是谁”或“是什么”一类的问题，也属于确定性检索。如：名词、概念、标准、法律法规等 事实检索主要借助参考工具书或事实型数据库。如美国MedlinePlus平台的drug information，dictionary等数据库,概 述,文献（型）检索,以某些特定的文献为检索对象，检索结果是关于某一课题的切题文献或相关文献。 如：查国内外近五年关于“早老素与老年痴呆的关系”方面的研究文献 文献检索属于相关性检索，系统仅提供相关的文献线索、文献摘要或全文以供检索者参考阅读和分析研究 文献检索借助手工检索工具或大型期刊文献数据库（书目型或全文型数据库）,概 述,数值数据库(Numeric Database) 存储各种统计、实验、测量等方面的数据 事实数据库(Fact Database) 存储描述事物等信息的情况过程和现象的事实（如各类电子版字辞典） 文献数据库（Literature Database),数据库类型,概 述,文献型数据库,书目数据库(Bibliographic Database) 存储文献的外部特征，主要包括文献的题名、著者、著者单位、所载期刊刊名，出版年、卷、期和起止页码，可以包括摘要，但不包括文献的全文 全文数据库(Full Text Database) 与书目数据库相对而言。主要存储原始文献的全文，如期刊论文、报纸新闻、法律法规、政府出版物等,概 述,文献型数据库的一般结构,数据库 （data bank） 文档 （file，通常按年限划分） 记录（record，单元论文） 字段（field） 字段用来记录和描述每篇文献的外表特征和内容特征。（如：题名、作者、摘要）,概 述,数据库常见字段,题名（Title, TI） 著者（ Author, AU） 著者单位地址（Address, AD） 出处（Source, SO） 摘要（ Abstracts, AB） 文献类型（Publication type, PT） 文献题录三要素（线索）：题名 著者 出处,题 录,概 述,第二部分： 检索技术,不论是最早的单机或联机检索，或是目前流行的网络查询，一般使用的检索技术主要包括： 布尔逻辑检索 截词检索 邻近检索（位置检索） 字段限定检索 网络信息检索规则,概 述,1. 布尔逻辑检索技术,布尔逻辑检索是建立最早、应用最为广泛的检索理论和检索技术，也是最简单、最基本的计算机检索的匹配模式 逻辑检索以布尔逻辑表达式来表达用户的检索要求，并通过逻辑运算符连接两个以上的检索词，从而实现两个以上概念的逻辑组配检索,概 述,布尔逻辑示意图,运算符：AND，* 起缩小检索范围，提高查准率的作用,运算符：OR，+ 起扩大检索范围，提高查全率的作用,运算符：NOT，- 起缩小检索范围，用于去除检出文献中不需要的部分,逻辑与,逻辑或,逻辑非,布尔逻辑表达式,child and asthma 小儿哮喘 lung cancer and smoking 吸烟与肺癌 trace elements not zinc 除锌以外的微量元素 肝癌或肝细胞瘤的诊断 (肝癌 or 肝细胞瘤) and 诊断 优先级：（ ）NOT AND OR,概 述,布尔运算符在不同的检索系统中有不同的表达方式（在线浏览） 清华同方的“中国学术期刊全文库” CBM PubMed Google et al.,概 述,2. 截词检索技术,截词检索(Truncation)是将检索词截断，取其中的一部分片段，再加上截词符号一起输入计算机，系统自动将词片段与数据库中的索引词匹配，凡含有该词片段的文献均被检出。 截词方式主要有： 右截词符 “*” （*=0-n个字符） 中间截词符 “ ？” (？=0-1个字符),输入Pain*，即可检出：Pain, painful, painless, painness， painkiller,概 述,3. 网络信息检索规则,包含或排除检索（加减检索）：+，- 词组检索（强制检索）： “ ” 自然语言检索：任意词或句子 模糊检索：可以自动修正提问错误，给出正确信息 概念检索：系统自动对某一概念词及其同义词或近义词加以识别并自动匹配检索 多语种检索：系统自动翻译转换不同语种,概 述,检索技术的发展趋势,目前信息检索技术正逐步从书目检索向全文检索和多媒体检索方向发展，智能化检索将成为未来计算机网络信息检索的发展趋势 在学习应用传统检索技术的同时，也要不断地注意学习更先进的检索技术,概 述,文献检索语言概述,文献检索语言是根据文献信息检索的需要而创制的一种人工语言，又叫做文献存储或检索语言（标引、索引、检索语言） 文献信息检索语言既是汇集、组织、存储文献的手段和工具，又是沟通文献管理者、文献用户、以及文献作者三方的桥梁 系统学习了解有关检索语言的基本知识是提高检索效率的重要环节,概 述,检索步骤小结,分析检索课题 选择数据库 选择检索途径 确定检索词 构筑检索提问式并作检索操作 调整检索策略 输出检索结果 获取原始文献 创建文献跟踪服务,概 述,第三部分： 医学常用数据库,图书馆的基本服务项目,藏书建设（书刊采购、文献编目） 图书借还、新书介绍、图书导读 电子文献阅览（多媒体、视听资料、图书馆局域网络技术服务） 报刊阅览、文献复制、文献传递 读者培训（信息检索课教学、组织专题讲座） 参考咨询（委托检索、定题服务、深层指导） 学术研究、数字化文献信息开发、信息管理,全文型数据库(一次文献) Elsevier(MD consult)、 Wiley 、Springer、EBSCO host、Proquest、 Karger、BMJ、OVID(LWW) 、BMC、Pubmed central、PLoS、CHKD、万方数据、维普 文摘型数据库(二次文献) Medline(Pubmed)、Embase、SCI、CBMdisc 事实型数据库(三次文献) Clinical Evidence、Cochrane library,常用医学文献数据库的类型,概 述,图书馆网址：210.38.58.8,广医医学文献资源,概 述,1、总体情况,2、电子期刊,2、电子期刊（摘要及全文型）,第四部分： 检索案例分析,检索获取医学专业信息的意义,1、科学研究的需要 确定研究方向 借鉴研究方法 2、临床诊疗的需要 借鉴同行新的诊疗方法 循证医学的需要 医疗事故鉴定 3、科研管理、人才评价的需要 追踪某一机构,某个团体或个人的研究热点 寻求合作方向,案例分析：,我校组建免疫研究所，引进人才前的准备工作 (文献学指标和核心成果的评价) 个人信息，工作经历 发文情况: 发文量 SCI发文量 F发文量 ESI：高引 被引情况: 关键论文的被引频次 专利情况 在研项目 获得奖项 对关键科研成果的分析，形成评价报告,拟引进人才： Ferrandon Dominique, FRANCE,个人信息，工作经历，研究兴趣来源：个人网页，直接接触，沟通交流 发文量等文献学评价信息来源：公开的专业数据库，专业网站 在研项目，获奖情况