英文医学数据库检索（1）

英文医学数据库检索1,2,概述,外文文摘数据库检索 Medline与Pubmed, EMBASE, SciFinder Scholar, BioSIS Previews, Engineering Village, Dialog 外文全文数据库检索 OVID Full Text, EBSCOhost, Elsevier SDOS, SpringLink, ProQuest Medical Library, Kluwer Online Journals OCLC FirstSearch,3,中南大学图书馆（ ）,4,校园网外文数据库（ ）,5,一、Medline概述 1.书目数据库: NLM, 最重要 2.来源：5200+期刊（80+国家, (LSTRC), ） 90%英文，涉及医学各领域 3.获取: 印刷、联机、光盘、网络,Medline与PubMed,6,印刷型检索工具,n Index Medicus医学索引(IM) (Cumulated Index Medicus, CIM) n Index to Dental Literature n International Nursing Index,9,联机检索,1964年开发MEDLARS，MEDLINE成为使用频率最高的数据库,10,光盘检索,1980s至今 SilverPlatter Medline on CD(银盘),11,光 盘,12,二、PubMed概述（P.67）,检索系统: NCBI 免费： 检索: 最强、查全率高,13,主页,PubMed comprises more than 20 million citations for biomedical literature from MEDLINE, life science journals, and online books. Citations may include links to full-text content from PubMed Central and publisher web sites,14,获取全文2,15,PubMed Central (/pmc/),16,查找的文章提供两种格式,17,可在主页选择其他数据库检索,18,1. Pubmed的文献来源,Medline In-process citations Publisher-Supplied Citations,19,记录标识（1）,PubMed - in process, PubMed - as supplied by publisher,PubMed indexed for Medline,20,2. PubMed记录的字段,可供检索和显示的字段共60多个 (表4-1-1),21,MEDLINE格式,22,TI - Lymphedema after treatment of breast cancer.,MH - Axilla,MH - Breast Neoplasms/*surgery,MH - Lymph Node Excision/*adverse effects,MH - Lymphedema/*epidemiology SO - Am J Surg 2004 Jan;187(1):69-72.,MESH字段(MEDLINE格式),23,医学主题词表(医学主题注释词顺表） （Medical Subject Headings)(MESH表）,24,MESH特性（优势）：规范,10例AIDS病人死亡因素分析 1例艾滋病患者的诊断 爱滋病患者常见之口腔表征治疗 获得性免疫缺陷综合征病人的健康教育,主题词：获得性免疫缺陷综合征,25,MESH特性： 支持副主题词限定,形式：MeSH词 / Qualifiers 作用：限定；扩大词量 举例：白血病的发病机制研究,白血病/病因学,副主题词:83个,26,MESH特性：扩展检索功能,MESH树状结构体系：主题词概念等级分类体系, 它将MeSH表中的所有主题词, 按照其词义范畴和学科属性,分门别类地归入15个大类,每个大类又逐级划分(主要类目见附录).每个主题词都在这种体系中至少有一个位置, 用来描述这种位置的号码称为树状结构号。,27,MESH特性：两种形式,自然语言顺序：心理学试验 倒装形式：,心理学，临床 心理学，比较 心理学，教育 心理学，实验 心理学，医学,28,三、检索途径与方法,基本检索 高级检索:Advanced Search 其他：Pubmed Tools,Pubmed Resources,29,主页,30,Q:遇到一个课题时,该选择何种检索方式?,31,基本检索： 检索方法（规则）,不区分大小写 逻辑组配检索 （1） NOT ，AND, OR （2）不输入默认为AND,vitamin c common cold,vitamin c AND common cold,32,PMID- 14706589,TI - Lymphedema after treatment of breast cancer.,AU - Ozaslan C,LA - eng,PT - Journal Article,MH - Axilla,MH - Breast Neoplasms/*surgery,MH - Lymph Node Excision/*adverse effects,MH - Lymphedema/*epidemiology SO - Am J Surg 2004 Jan;187(1):69-72.,格式：检索词字段标识 LymphedemaTI 1832篇 Ozaslan CAU 11篇 AxillaMH 7073篇,字段检索(教材P.86),33,举例（PUBMED）: 检索式 检出数量 Breast NeoplasmsMH 141536篇 Breast NeoplasmsMAJR 114513篇,灵活地扩大或缩小检索,34,检索举例,查找入学前儿童的哮喘治疗的 文献（综述文献/全文）,child, preschool mh AND asthma/therapy mh 5348篇（756篇/920篇）,35,检索结果,child, preschool mh AND asthma/therapy mh,36,获取全文1,37,获取全文2,38,日期检索,格式：YYYY/MM/DD date field 2009/10/06 edat 2008 dp 2008:2010 dp 2009/01:2010/03 edat,39,词语检索,自动词语匹配功能：输入未加任何限定的检索词时，系统依次进行匹配、转换和检索：MeSH转换表 刊名转换表 著者索引,40,liver cancer AND gene therapy 2744篇,(“liver neoplasms“MeSH Terms OR (“liver“All Fields AND “neoplasms“All Fields) OR “liver neoplasms“All Fields OR (“liver“All Fields AND “cancer“All Fields) OR “liver cancer“All Fields) AND (“gene therapy“MeSH Terms OR (“gene“All Fields AND “therapy“All Fields) OR “gene therapy“All Fields),41,精确短语检索,使用引号 “liver cancer” 6987篇 liver cancer 146836篇,42,截词检索：加*(截取前600个截词),检索：Immun* ImmunAll Fields OR immun21All Fields OR immun68All Fields OR immun70All Fields OR immunaAll Fields OR immunabeledAll Fields OR immunablationAll Fields OR immunabsorbantAll Fields OR immunabsorbentAll Fields OR immunabsorptionAll Fields OR immunabwehrAll Fields OR immunabwehrreaktionenAll Fields ,43,Q：检索免疫方面的文献，用immun*检索文献多，还是immunology检索文献多,Immun* 341839篇 Immunology 1115106 篇,44,Immun*,45,46,著者检索,姓在前用全称,名在后用首字母 Smith jau 14819篇 “smith J”au 2240篇 （2002年起可以采用全称）,47,Q：如何查询著者Yang发表的论文？,Yang Yin-Yangmh OR YangTW 用：YangAU,48,Q:利用基本检索时，如果要作一些限定，如何实现？（举例：检索“颅脑外伤对青少年及儿童生长激素的影响”）,49,利用limits,50,limits,时间,文献类型,研究类别,子集,文本选项,语种,性别,年龄,字段,51,craniocerebral trauma AND growth hormone,选择all child:0-18years,52,检索结果,53,高级检索,Search builder,Search history,More resoures,54,其他,Journals Database(查询期刊信息并检索) MeSH Database(获取主题词信息并检索) Single Citation Matcher (从文献外表特征查找单篇或一组论文) Batch Citation Matcher Clinical Queries(临床文献查询) Topic-Specific Queries Linkout(外部链接) Clinical Trials,55,主页,56,Journals Database,57,Single Citation Matcher,58,举例,查找夏家辉教授发表在“Nat Genet，1998；20（4）：370-3”的关于神经性耳聋基因的论文及相关信息,59,（1）输入已知条件,60,（2）显示结果,Nat genetta AND1998dp AND 20vi AND 4is AND 370pg AND xia jau,61,Batch Citation Matcher,62,Clinical Queries,Search by Clinical Study Category Find Systematic Reviews Medical Genetics Searches,63,过滤检索结果,64,Clinical Queries:Clinical Study Categories,按临床问题分类检索 可以根据需要选择检索文献更多一些或更少一些,65,Therapy,66,Topic-Specific Queries ：特定文献查询,Topic-Specific Queries,67,68,MedlinePlus(),69,Topic:高血压,70,Topic:高血压,71,印刷版: MeSH表,MeSH, Supplement to Index Medicus MeSH - Annotated Alphabetic List MeSH Tree Structures Permuted MeSH,电子版（1）-单独,电子版（2）-检索系统,/mesh,MeSH Database,72,电子版（1）,73,主题词信息,74,提供MESH主要系统,PubMed: MeSH Database CBMDisc: MESH词表 特点: (1)提供MESH信息: 含义,所能组配的副主题词信息,树状结构 (2)提供MESH检索途径:选择MESH,副主题词,是否扩展或加权,75,MeSH Database,76,树状结构表,All MeSH Categories Diseases Category Hemic and Lymphatic Diseases Hematologic Diseases Anemia Anemia, Aplastic Anemia, Hypoplastic, Congenital Anemia, Diamond-Blackfan Fanconi Anemia,下位词,上位词,77,Q：如何利用MeSH Database 查询“颅脑外伤对青少年及儿童生长激素的影响”相关文献？,78,选择Search Box with AND,79,进行检索,80,C,81,82,83,五、 检索举例,84,(1) 输入提问,85,检索结果：Summary,86,Summary,提供的信息：TI，AU，SO + 链接（Related articles+Full text) 三个细节：Filter your results；Find related Data；Search details,87,Related Articles：获取相关文献,88,Summary,Diabetesta AND xiang kauthor AND susceptibility genesti,89,如何转换显示格式？,选择文献Display settings 直接点击文献标题,90,Summary,91,（2） Display settings:Abstract,92,Abstract：MESH和Linkout,93,Abstract:全文链接+相关文献+引用+其他链接,94,Display Settings : Abstract (text),95,Q:如何获取更详细的信息？,96,Display Settings: MEDLINE格式,97,(3)结果输出：send to,98,(4) 获取全文,99,PubMed检索相关问题,Q1:如何显示系统转换后的详细检索策略？,100,Summary格式：search details,101,高级检索: details,102,Details：详细的检索策略,(“liver neoplasms“MeSH Terms OR (“liver“All Fields AND “neoplasms“All Fields) OR “liver neoplasms“All Fields OR (“liver“All Fields AND “cancer“All Fields) OR “liver cancer“All Fields) .,103,Q2:如何一次检索多个数据库？,104,选择：all databases,105,统一检索界面,106,NLM Gateway(http:),107,检索结果,108,Q3：从我校医学图书馆检索PubMed有何差别？,109,医学图书馆：pubmed,110,检索,111,Q4:利用其他系统检索MEDLINE和PubMed检索MEDLINE有差别吗？,112,主要差别,1.费用: 免费：PubMed，gateway 收费：OVID、FirstSearch、WOK、 EMBASE 2.可检数据库 3.检索界面,113,EMBASE主页,114,4.检索功能,自动词语匹配(PubMed 、Gateway、EMBASE),115,5. 获取全文,PubMed Firstsearch OVID EMBASE,116,Q：如何在PubMed中得到个性化服务？,117,118,My NCBI,119,如何一次检索多个数据库？,120,选择：all databases,121,统一检索界面,122,NLM Gateway,123,检索结果,124,医学图书馆：pubmed,125,检索,126,MEDLINE网络检索,1.费用: 免费：PubMed，gateway 收费：OVID、FirstSearch、WOK、 EMBASE 2.检索服务 3.可检数据库 4.检索界面,127,5.检索功能,自动词语匹配(PubMed 、Gateway、EMBASE),128,6. 获取全文,PubMed Firstsearch OVID EMBASE,129,六、如何有效地利用PubMed查找所需文献,选择最准确的提问词 选择最合适的检索功能 调整检索策略,130,1. 选择最准确的提问词,例：如何查找IFN-的相关文献？,131,#1 IFN- 43345 篇 (转换：IFN-gammaAll Fields） #2 IFN 45884篇 （转换IFNAll Fields AND gammaAll Fields） #3 IFN gamma 45884篇 #4 Interferon gamma 60965篇 #5 #1 OR #2 OR #4 72006篇,132,Interferon gamma转换,“interferon-gamma“MeSH Terms OR “interferon-gamma“All Fields OR (“interferon“All Fields AND “gamma“All Fields) OR “interferon gamma“All Fields,133,2. 选择最合适的检索功能,例1：查找近两年多发性骨髓瘤 （multiple myeloma )的临床试验方面的英文文献（需全文）,134,Limits,135,检索结果,136,原拟检索式： mad cow disease epidemic study 20条 最合适的检索服务：Mesh Database “Encephalopathy, Bovine Spongiform / epidemiology” MeSH 435条,例2：疯牛病的流行病学研究,137,（1）MESH Database输词,138,（2）获取主题词,139,（3）组配副主题词,140,(4) Send to “Search Box with AND”,141,(5) search Pubmed,142,(6) 获取结果,143,例3： 多奈哌齐(Donepezil) 治疗阿尔茨海默病（Alzheimer Disease）的预后和系统评价的文献,144,Clinical Queries,145,prognosis,146,#1 (Donepezil Alzheimer Disease) AND (Prognosis/Broadfilter) 181篇 #2 (Donepezil Alzheimer Disease) AND (Prognosis/narrowfilter) 45篇 #3 (Donepezil Alzheimer Disease) AND Prognosis 278篇 #4 #1 or #2 or #3 407篇,147,系统评价,(Donepezil Alzheimer Disease) AND systematicsb,148,例4:性腺淋巴瘤与Fas、Fasl的关系,选择检索词 Sex gland lymphoma; Ovarian lymphoma Testicular lymphoma; Fas; Fasl 构成检索式-高级检索的History,149,History 构建检索式,150,3. 调整检索策略,检出文献过少扩大检索 检出文献过多缩小检索,151,扩大检索,利用“自动转换检索词”特性 增加相关词(增加OR组配面） 减少AND组配面 扩展检索 采用截词,152,截词检索举例,Transplantation 335805 Transplant* 355265,Stem cell transplantation 43575 Stem cell transplant* 16055,stem cell transplantation (“stem cell transplantation“MeSH Terms OR stem cell transplantationText Word),153,stem cell transplantAll Fields OR stem cell transplantationAll Fields OR stem cell transplantation/classificationAll Fields OR OR stem cell transplantationsAll Fields) OR s