《文献检索新思维》PPT课件.ppt

文献检索新思维,张发宝 生物谷网站 上海北岸信息技术有限公司,什么是真正的文献检索?,检索(retrieve)查找(search, find) 有四层含义: 1 如何有效查找到所需文献 2 如何查全,查精所需文献 3 如何整理、归纳文献 4 从文献中得出有意义的结论,5S检索新理念,Select-选择合适的数据库 Search-如何精确查找文献 Sort-文献的筛选与归类 Systematize-文献管理软件的使用 Strategy-如何从文献中发现idea?,一、Select,1 期刊类、专利类、新闻类、会议类、书籍类等数据库；其它是专门的数据库，如药物数据库，中草药数据库，疾病数据库等。 最常用的期刊类。 中文：维普，万方，CNKI三大期刊知识库。超星、书生之家书籍库。 英文：Pubmed、SD、EBSCO、Springer、NPG、Ei Village、CAS、Kluwer,1 关键词检索 2 组合检索、二次检索、回溯检索,二、Search,如何将检索到的文献进行筛选和归类。检索一直有一个问题：不熟练检索的同学往往拼命查资料；而熟悉检索的同学往往内容太多，大量时间在重复检索和查找已检索过的内容。 正常：Search : Sort = 3 : 7 往往：Search : Sort = 5 : 5,三、Sort,原 则,1 只保留重要的资料-不要什么文献都要！许多新手往往只要查到的资料，就一定要保存下来，哪怕仅仅是相关。时间长了，这些不重要的资料，往往占住你主要地方。 2 一定要精细分类，并录入数据库。传统的电脑中按文件夹分类已不能适应时代的发展了。务必要用合适的软件进行归类。 3 要分精读与速读两类,四、Systematize,Reference Manage和Endnote 优点：处理英文较方便，前者属于老牌软件商了。但后者信息更新快，尤其是文献检索更新更快，近来应用更广。同时Endnote还能支持中文期刊的格式，这也是比较优秀的一面。 不利：价格比较贵，界面为英文的。,Note express,这是国内近年来发展最快的一款软件，同类软件还有文献王，但前者运行效率更高，适用面更广，对中英文支持都非常完善，升级更快，值得期待。,Strategy- 如何从文献中发现Idea?,文献怎么看？多看还是少看？ -看少了什么都不懂；看多了什么都不做了。 -走进文献，走出文献,出入法,1 文章背后的故事 2 文章与文章间的idea沟通。 许多文献你阅读完以后，觉得很完善，这一块似乎已经perfect了，实际上你需要更多思考这篇文章的缺陷，即使是CNS上的，同样有漏洞，这些漏洞有时是作者回避的，或尚未研究的东西，这里面就是新的idea来源。 如何读出文章背后的故事，这非常重要。读文献有两个境界，一是入，二是出。先要按作者意思去读文献，读懂它；其次按作者的方法去自己假设，从更高角度 看这篇文章，还有哪些不完善的地方？,找到成功背后的失败,如ES细胞培养的例子，一开始文献是记录XXX培养成功，保持不分化状态。你认为很高兴，但你是否注意到他曾经失败过多少次，或者说正常培养就失败。那么这背后到底是什么因素导致成功？什么因子？ 有时有些文献中一句话，里面可能是一个大课题。如ES细胞在无血清培养下会向神经细胞方向分化，因此必需有血清培养。这是常识，但为什么呢？这就一个大课题。 细胞凋亡需要ATP参与，是主动过程，这句话背后包含了这一层含义：ATP是凋亡必需的。但同样有另一个常识，细胞在死亡过程中ATP往往下降，这其中存在一个矛盾，就也是idea.,逆向思维,案例1：低氧导致细胞死亡。 这是常识，但是是否存在一种细胞，给它各种各样的刺激仍不会死亡？其机理是什么？ 案例2：为什么成年以后，心脏细胞，脑细胞不分裂了，而有些细胞却可以分裂？ -是不是因为细胞周期缺失了某些因子？如果人为补充这些因子又如何？ 案例3：细胞周期分裂大家都认为是G0-G1-S-M，那么我们能逆向进行吗？ 案例4：大象细胞大还是细胞多？ 为什么 案例5：蛇等有毒动物为什么不毒自己？蛇毒与Na通道关系,挑战经典,案例1：细胞周期中Cyclin D是必需的 -如果我knockout这个基因呢？ 案例2：大肠杆菌不能产生糖蛋白，这是基因工程上最头疼的难题。 -能否人为转入产生糖蛋白相关基因，让大肠杆菌也能产生人类的糖蛋白？ 案例3：癌症是干细胞？ 案例4：SiRNA，CaM的发现 案例5: TNF基因无法被SiRNA,比较延伸,将相似的文献做比较，总结异同 案例1：做骨髓间质干细胞（MSC）分化时： A+B-诱导向神经细胞分化 C+E诱导向内皮细胞分化 B+F诱导向脂肪细胞分化,B在MSC分化中作用,案例2：离子通道属性在高等生物神经细胞上研究已相对透彻。可以引出以下几个问题： （1）特殊物种：线虫，果蝇，蛇，或一些突变体上呢？ （2）特殊类型细胞：肿瘤细胞，胚胎干细胞，肾上皮？ （4）同一通道放在不同细胞上呢？如NMDA受体转到肾上皮呢？,交叉嫁接,如已知 ABC 和 FGC ，那么C可能是连接BG的关键，这里面可能会出现新的idea. 案例1：如长期关节炎患者，往往冠心病发生少。如服阿斯匹林可以减少心脏病 案例2：长期服用抗生素患者，患冠心病机率也下降-冠心病与支原体相关学说 案例3：神经细胞中观察到同一种信号分子在细胞中不同位置作用不同。那么在其它细胞呢？ 案例4：睡眠足，白天记忆好，why？-hypothesis: GABA对学习和记忆作用的多面性 案例5：RA，As2O3促白血病分化；低氧可以促进干细胞分化；,Gap junction,不要看不起gap junction的工作，这是绝大部分工作的源头。也是必要的。 要从gap junction工作中发现更多线索,生物谷：检索能力加速器,充分利用网络进行学习和交流-生物谷是首选平台 生物谷网站是生物行业最专业的网站，拥有网站，论坛，博客，面向不同人群的需求。 中国生命科学论坛 （交流中心） 生物谷博客： （个人信息中心） 生物谷网站： （信息获取源） 论坛可以用来交流和学习；博客是整理资料的重要的地方，可以将自己有用的资料，心得，想法，放在博客中，不断回馈，交流，以获得更多的idea. 如果将整理的内容放在博客中，时间长了，你会感觉很吃惊！它对科研具有重要的推动作用。,BIOON以前系列讲座,参见检索技巧论坛：/index.asp?boardid=17 Bioon全心奉献的系列检索讲座/dispbbs.asp?boardID=17&ID=476&page=1 Bioon新讲座-有机检索理念 /dispbbs.asp?boardID=17&ID=45046&page=1 BIOON新讲座-检索思维与知识管理 /dispbbs.asp?boardID=17&ID=156037&page=1,检索路漫漫 我们定成功