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文档简介

2 遗传多样性,2.1 引言,遗传多样性(genetic diversity)也被称为种内多样性(within-species diversity)、种下多样性(intra-specific diversity or infra-specific diversity)。目前还没有一个可满足各种目的的遗传多样性的定义。,2.2 遗传变异的本质和起源,本质:DNA分子上四种碱基对的变异。 起源:所有能引起DNA分子上述变化的因素均可成为遗传变异的起源。,2.2 遗传变异的本质和起源,一个物种的遗传多样性的三个水平 个体内的遗传多样性 种群内不同个体之间的遗传多样性 种群之间的遗传变异,2.2 遗传变异的本质和起源,遗传多样性的意义 是物种自身生存和未来进化的资源 有利于人工育种 给种群带来适合度方面的优势,2.3 遗传多样性的检测,2.3.1 引言 对遗传变异进行评估的好处: 可以检测现有的解释遗传变异动力本质的数学和统计学理论 可以作为理解物种内部不同个体之间的关系、相似性和分歧的一种工具,2.3 遗传多样性的检测,遗传多样性的基本概念 丰富度:指一个种群中或一个种群的抽样中所存在的不同基因型的总数 均一度:指同一个种群或该种群的抽样中不同基因型的频率,2.3 遗传多样性的检测,2.3.2 基于DNA和染色体的方法 从个体拥有的基因多样性来考虑遗传多样性 通过每个细胞内所含有的DNA量来检测,2.3 遗传多样性的检测,真核生物可以从染色体的结构、大小、形状和数量来测量 通过线粒体DNA或叶绿体DNA中的成分进行检测,2.3 遗传多样性的检测,2.3.3 分子标记的方法 2.3.3.1 等位酶标记 等位酶是不同等位基因的同一基因位点的替代品,不同的等位酶带不同的净电荷而可通过电泳分离,2.3 遗传多样性的检测,等位酶标记的优点: 结果有效,技术简单 在种间层次上为DNA水平的变异提供了估计值 显性的杂合体和纯合体可以分开 可高效地处理大样本,2.3 遗传多样性的检测,等位酶标记的缺点: 取材有限,只适用于植物植物 仅能测量出结构基因限制性酶切位点的变异 酶的种类有限 数据不能证明2个变种是否为同种或显著不同,2.3 遗传多样性的检测,2.3.3.2 基于DNA分子的标记技术 通过限制性位点或限制性片段长度的变异,或者利用不同限制性位点的比较图谱,整个DNA序列上的任何变异都可以进行检测。其优点是排除了因发育状态或环境条件的影响所导致的在基因表达差异方面的潜在困难。,2.3 遗传多样性的检测,限制性片段长度多态性(RFLP)方法 聚合酶链式反应(PCR)和随机扩增多态DNA(RAPD)技术,2.3 遗传多样性的检测,微卫星技术 单核苷酸指纹技术 微卫星PCR扩增 锚定微卫星PCR扩增 有机扩增多态性微卫星 微卫星探针与RAPD或MP-PCR片段杂交 微卫星特异位点的分析,2.3 遗传多样性的检测,卫星DNA的分子标记技术的优点 可检测出高水平的多态现象 有高的可重复性 快速、简单、有效 没有放射性 在整个基因组中微卫星、小卫星分布均匀 没有多效性效应,2.4 遗传变异的决定性条件,物种种群内的遗传变异都是生物的、非生物的和内在的3方面因素相互作用的结果。这3方面因素既单独又共同作用以影响一个种群的遗传多样性。 一个物种存在的时间也决定着它的遗传变异。,2.4 遗传变异的决定性条件,非生物因素 气候变化 土壤特征,2.4 遗传变异的决定性条件,生物因素 竞争 共生 对抗,2.4 遗传变异的决定性条件,内在因素 种群大小 交配系

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