研究猪品种生长激素(pGH)基因的多态性.doc

研究猪品种生长激素(pGH)基因的多态性 赵先萍1，曹果清2 （1.山西省畜牧兽医学校030024；2.山西农业大学动物科技学院030801） 摘要：本文在对猪品种生长激素基因多态性进行研究的同时，借助于PCR和测序技术，对11个猪品种的生长激素基因全序列多态性进行检测，43个SNPS和1个位于内含子3的7bp缺少片段被检测出，结果表明，猪品种之间的某种遗传分化在某种程度上不仅仅与地理的分布有关，同时和其基因的交流也有着直接性的关系。 关键词：猪品种；生长激素；基因；多态性 猪生长激素主要是猪垂体前叶分泌的单链多肽类激素，对于猪的生长发育有着重要的调节作用。近些年来，猪品种生长激素基因多态性的研究始终成为科学界研究的重点之一1。 1材料和方法 样品和提取基因组DNA。选取11个品种的猪作为研究的对象，其中4头成华猪，4头大河猪，4头大河乌猪，5头杜洛克猪，6头长白猪，9头内江猪，6头荣昌猪，12头太湖猪，5头压雅南猪，5头约克夏猪，5头藏猪，共65个个体。基因组DNA的提取采取酚氯仿法。 PCR产物纯化、目的基因扩增以及序列测定。扩增pGH基因全序列和测序的引物采取Olig06.0软件进行，PCR反应试剂其反应体系的总体积则是50微升，其PCR反应的条件中温度控制为94，时间为10分钟；PCR产物借助于2.0%低熔点的琼脂糖凝胶进行回收。对其检测后的回收产物采取测序反应，反应产物经过醋酸钠纯化、干燥以及变性后，并借助于全自动序列分析仪分析其序列。 数据的分析。序列测定的结果在分析的过程中借助于DNAstar开始BLAST分析2。对猪品种的核苷酸分歧度、净遗传距离以及品种内核苷酸多样度及逆行那个分析，猪品种间固定指数和其品种间的变异程度用Areliquin2.0软件包的分子方差进行分析。猪品种间PCH基因树构建的过程中采取Megaversion。 2结果 猪品种生长激素基因SNPS分析。 猪品种生长激素基因的可靠序列总共有1960bp，含有内含子和外显子。43个SNPS和1个位于内含子3的7bp缺少片段被检测出，猪品种生长激素基因序列的变异种存在一定的转换偏倚现象。 猪品种生长激素基因单倍型。结果显示，65个序列中单倍型有55种，同时单倍型的多样度为0.997，其中大河乌猪、太湖猪、长白猪、藏猪以及雅南猪品种单倍型多样度高达1，而成华猪品种内单倍型多样度最低为0.5。 猪品种生长激素基因分子方差分析。分子方差分析结果表明，品种内方差组分为74%，而品种间方差组分占整个猪品种生长激素基因全序列总变异的27%，其品种间差异极为显著，P0.05。猪品种生长激素基因在猪的品种间存在明显的遗传分化，内江猪和成华猪、约克夏猪和荣昌猪、长白猪和大河乌猪以及藏猪和大河猪之间的生长激素基因结构差异相对不显著，P0.05，但是其他品种间生长激素基因结构差异较为显著，P0.05。 3讨论 猪品种生长激素基因序列的多态性分析结果表明，生长激素基因全序列的一级结构中SNPSs位点较为丰富，同时PCR过程中，有着较小的错配可能性。pGH基因编码区其多肽中含有216个氨基酸，而其成熟的猪生长激素的蛋白中氨基酸的数量仅仅为191个。pGH蛋白的前导肽主要是以后总分子内的伴侣，调控着pGH生物活性在细胞内的转运和其定位，进而使得不同猪品种生长发育性能存在差异。猪品种生长激素基因自身进化过程和其品种的进化在内含子区均有体现，而猪品种之间的某种遗传分化在某种程度上不仅仅与地理的分布有关，同时和其基因的交流也有着直接性的关系。 4结语 本文通过对猪品种生长激素基因多态性进行研究，研究总结出猪品种之间的某种遗传分化在某种程度上不仅仅与地理的分布有关，同时和其基因的交流也有着直接性的关系。 参考文献： 1张浩，强巴央宗.藏猪生长激素基因（pG