慢病毒使用操作手册.docx

慢病毒使用操作手册： 1 慢病毒使用操作2 慢病毒安全使用规范3 悬浮细胞感染方法概要4 相关专业术语(详情可参考公司网站FAQ)5 细胞培养器皿的相关参数1、慢病毒使用操作手册1.1 慢病毒的储存与稀释:1.1.1 病毒的储存：用户收到病毒液后在很短时间内即使用慢病毒进行实验，可以将病毒暂时放置于4 保存；如需长期保存请放置于-80（病毒置于冻存管，并使用封口膜封口）A 病毒可以存放于-80 6个月以上；但如果病毒储存时间超过6个月，我们建议在使用前需要重新滴定病毒滴度B 反复冻融会降低病毒滴度：每次冻融会降低病毒滴度10%；因此在病毒使用过程中应仅尽量避免反复冻融，为避免反复冻融我们强烈建议客户收到病毒后按照每次的使用量进行分装。1.1.2 病毒的稀释：用户需要稀释病毒时，请将病毒取出置于冰浴融解后，使用培养目的细胞用PBS或无血清培养基(含血清或含双抗不影响病毒感染)混匀分装后4保存(请尽量在三天内用完) 分装后使用。1.2 慢病毒用于体外（In Vitro）实验：感染培养原代细胞和建系细胞1.2.1 慢病毒对各种细胞和组织的亲嗜性不同，用户使用Invabio提供的慢病毒之前可以通过查阅相关文献，了解慢病毒对您的目的细胞的亲嗜性，感染复数（MOI 值）以及在体（InVivo）注射所需要的病毒量。如果没有相关文献支持，可以通过感染预实验得到合适的感染复数（MOI 值）（使用24孔板检测病毒对目的细胞的亲嗜性）1.2.2 慢病毒感染目的细胞预实验1.2.2.1 慢病毒感染目的细胞预实验注意事项A测定慢病毒对目的细胞的亲嗜性时，需要同时设置对慢病毒亲嗜性较高的细胞(HEK293T，Hela）作为平行实验的对照细胞。B 在进行慢病毒感染实验时,可以用完全培养基（培养目的细胞用）稀释；理论上，含有血清，双抗或者其他营养因子的完全培养基不影响慢病毒的感染效率。C Invabio提供的病毒单位为TU/ml, 即每毫升中含有具有生物活性的病毒颗粒数。如：病毒滴度为1X108 TU/ml 即每毫升病毒液中至少含有1X108个具有生物活性的慢病毒颗粒。1.2.2.2 以24孔培养板为例，进行目的细胞和HEK293T 细胞的感染预实验实验前按照不同的MOI设置不同的感染孔，并根据MOI和细胞数量计算所需要的病毒量，如有必要可以使用PBS溶液或者无血清培养基稀释病毒原液第一天，准备细胞：在24孔培养板接种若干孔，每个孔内接种35X104个目的细胞，铺板时细胞的融合率为50%左右，每孔培养基体积为100 l；进行病毒感染时细胞的融合度约为70%左右。第二天，准备病毒：取出4保存的病毒，使用台式离心机离心20 秒（使病毒完全悬于离心管底部即可）；如果是冻存在-80的病毒需要先在冰上融化后使用。亦可以根据实验室的实际情况将按照MOI准确计算好的慢病毒稀释到培养基中，并尽可能保证所获得的含有慢病毒的培养基的总体积为最小体积，以期获得最佳的感染效率。第二天，感染目的细胞：病毒准备好之后，从培养箱中拿出细胞，首先观察细胞生长状态，如细胞状态较好则开始实验，a 使用移液器吸取准确体积的病毒液加入准备好的培养基b 吸去培养基的培养器皿中的培养基（如果细胞生长良好，密度适宜，则不用换液）c 在目的细胞和对照细胞中分别加入计算好的病毒液d 混匀后放于二氧化碳培养箱（37、5%CO2）孵育过夜注：感染前细胞的状态好坏对最终的感染效果高低影响很大，所以务必保证加病毒之前细胞处于良好的生长状态亦可以将预先准备好的培养基和慢病毒的混合液直接加入培养器皿中慢病毒对目的细胞的感染效率较低，通过提高MOI 值可以提高病毒的感染效率，但是当MOI高于20时，我们建议客户在培养基中加入ploybrene（8 g/ml左右）来提高病毒的感染效率。A 第三天，更换培养液：一般在24小时候后将含有慢病毒的培养液更换成正常培养液；在感染后观察细胞状态，如果慢病毒对细胞有明显毒性作用而影响细胞生长状态，可以最短在加病毒4小时候更换新鲜培养液后继续培养（建议在8-12小时更换为宜）。第一次换液后，如果慢病毒对细胞没有明显毒性作用，按照正常培养条件培养换液。B第六天，感染效率检测：在倒置荧光显微镜观察荧光，估计慢病毒感染目的细胞的效率；如何由于目的基因较大而造成选择的载体不能携带Marker Gene的，可以通过Real-timeRT-PCR检测目的基因的表达来拍评估感染效率。注意：Invabio提供的病毒载体上带有GFP 绿色荧光蛋白，用户可以在病毒感染96小时后用倒置荧光显微镜观察GFP 绿色荧光，以观察病毒对目的细胞的感染情况。如果慢病毒载体携带其他Marker Gene如RFPBFP可以用荧光显微镜在对应的激发光波长下观察荧光表达的情况慢病毒表达时间较慢，荧光表达所需时间较长，建议感染后96小时后观测荧光表达。感染后的细胞可以连续培养一周，通过观察荧光的表达时间和表达强度来确定慢病毒对目的细胞的感染情况。感染期间请根据细胞生长的情况对细胞进行及时换液，以保证细胞良好的生长状态。2、慢病毒使用安全使用规范Invabio提供的慢病毒为“自杀”性病毒，即病毒感染目的细胞后不会再感染其他细胞，也不会利用宿主细胞产生新的病毒颗粒。慢病毒中的毒性基因已经被剔除并被外源性目的基因所取代，属于假型病毒因此没有毒性作用。但该病毒仍然具有可能的潜在的生物学危险，Invabio建议不要使用编码已知或可能会致癌的基因的假型病毒。除非已经完全公认某个基因肯定没有致癌性，否则均不建议采用假型病毒进行生物学实验。如有疑问，请与我们联系。使用时请参照如下所示进行实验：2.1病毒操作时最好使用生物安全柜。如果使用普通超净工作台操作病毒，请不要打开排风机。2.2病毒操作时请穿实验服，带口罩和手套。2.3操作病毒时特别小心不要产生气雾或飞溅。如果操作时超净工作台有病毒污染，请立即用70%乙醇加1%的SDS 溶液擦拭干净。接触过病毒的枪头，离心管，培养板，培养液请于84 消毒液或1%SDS 中浸泡过夜后弃去。2.4用显微镜观察细胞感染情况时应遵从以下步骤：拧紧培养瓶或盖紧培养板。用70%乙醇清理培养瓶外壁后到显微镜处观察拍照。离开显微镜实验台之前，用70%乙醇清理显微镜实验台。2.5如需要离心，应使用密封性好的离心管，或者用封口膜封口后离心，而且尽量使用组织培养室内的离心机。2.6脱掉手套后，用肥皂和水清洗双手。3、悬浮细胞感染方法概要1.1 根据细胞的量将细胞在1.5ml 管中离心收集然后用100-200ul 的无血清培养液稀释细胞沉淀，以细胞完全浸没在培养基中为准1.2 按照MOI 换算病毒颗粒数量，吸取病毒液加入细胞中，将1.5ml 管放在37度培养箱中孵育30 分钟1.3 将管中混合溶液吸出加到培养皿中或孔里1.4 加入足够量的新鲜培养液1.5 12 小时后换液1.6 96 小时后观察细胞阳性率4、相关专业术语（详情可参考公司网站FAQ）常用术语：MOI:病毒感染复数传统的MOI 概念起源于噬菌体感染细菌的研究。其含义是感染时噬菌体与细菌的数量比值，也就是平均每个细菌感染噬菌体的数量。噬菌体的数量单位为pfu。一般认为MOI 是一个比值，没有单位，其实其隐含的单位是pfu number/cell。后来MOI 被普遍用于病毒感染细胞的研究中，含义是感染时病毒与细胞数量的比值，本手册中提到的MOI 都是沿用这个概念。然而，由于病毒的数量单位有不同的表示方式，从而使MOI 产生了不同的含义。能产生细胞裂解效应的病毒例如单纯疱疹病毒等习惯上仍用pfu 表示病毒数量，因此其MOI 的含义与传统的概念相同。MOI stands for Multiplicity of Infection. It is the ratio of infectious virus particles to the number of cells being infected. The recommended MOI is in the range of 0.1 (meaning that you inoculate 1 virus particle for every 10 cells) to 0.01. The general theory behind MOI is to introduce one infectious virus particle to every host cell that is present in the culture. However, more than one virus may infect the same cell which leaves a percentage of cells uninfected. This occurrence can be reduced by using a higher MOI to ensure that every cell is infected.5、细胞培养器皿的相关参数Flask/DishSurface (mm2)Cell numberMedia Volume96 well plate501.5-5.0104100 l48 well plate1003.0104-1.0105200 l24 well plate2008.0104-2.0105500 l12 well plate4011.6-4.01051.0 ml6 well plate9623.0-8.01052.0 ml35mm9623.0-8.01052.0 ml60mm28271.0-2.51066.0 ml100mm78542.5-6.410610.0 ml慢病毒载体的包装与纯化1 实验流程制备慢病毒穿梭质粒及其辅助包装原件载体质粒，四种质粒载体分别进行高纯度无内毒素抽提，共转染293T细胞，转染后8 h 更换为完全培养基，培养48h后，收集富含慢病毒颗粒的细胞上清液，对其浓缩后得到高滴度的慢病毒浓缩液,感染Hela细胞后定量PCR检测病毒滴度。体内和体外实验对慢病毒滴度的要求不同，生产过程中可以通过浓缩得到不同滴度的慢病毒颗粒。2 实验材料2.1慢病毒载体、包装细胞和菌株慢病毒载体系统（Tronolab）该病毒包装系统为四质粒系统，组成为pRsv-REV， pMDlg-pRRE，pMD2G, 目的干扰质粒。其中目的干扰质粒能表达绿色荧光蛋白（GFP）. pRsv-REV， pMDlg-pRRE，pMD2G含有病毒包装所必须的元件. 细胞株 293T，慢病毒的包装细胞，为贴壁依赖型成上皮样细胞，生长培养基为DMEM(含10% FBS)。贴壁细胞经培养生长增殖形成单层细胞。菌株 大肠杆菌菌株DH5。用于扩增慢病毒载体和辅助包装载体质粒。2.2 主要试剂试剂名称 生产厂家 货号包装细胞293T细胞株 中科院上海细胞所大肠杆菌菌株DH5 Invitrogen公司胎牛血清 Invitrogen公司胰蛋白酶 Invitrogen公司限制性内切酶 FermentasT4 DNA连接酶 NEB公司 M0202V质粒DNA提取试剂盒 Axygen公司制备感受态试剂盒 BIOSCIENCES凝胶回收试剂盒 Qiagen公司1kb/100bp ladder Fermentas2.3 主要仪器仪器名称 生产厂家 货号PCR仪 Applied Biosystems公司电泳仪 Bio-rad公司荧光倒置显微镜 奥林帕斯冷冻超速离心机 Hitachi细胞培养箱 healforce凝胶成像仪稳压DNA电泳仪 Tianneng恒温摇床 上海博讯仪器电热恒温培养箱 上海博讯仪器移液器 eppendorf电热恒温水浴锅 上海一恒实验设备有限公司数码凝胶处理系统 天能科学仪器一次性平皿 Cell-star烧瓶3 慢病毒载体系统质粒基本信息和图谱该病毒包装系统为四质粒系统，组成为pRsv-REV， pMDlg-pRRE，pMD2G, 目的穿梭质粒。其中穿梭质粒（目的穿梭质粒）含有能表达绿色荧光蛋白（GFP）；pRsv-REV， pMDlg-pRRE，pMD2G含有病毒包装所必须的元件。3.1穿梭质粒：目的穿梭质粒3.2 pRsv-REV3.3 pMDlg-pRRE3.4 pMD2G4 慢病毒生产实验步骤4.1 慢病毒包装细胞转染用胰蛋白酶消化对数生长期的293 T细胞，细胞密度为0.510时；重新接种于25 mL的15cm细胞培养皿，37，50 mL/L CO2培养箱内培养；4.2 制备慢病毒包装系统中四种质粒DNA溶液；pRsv-REV 10 g，pMDlg-pRRE 15 g，pMD2G 7.5 g,干扰质粒 20 ug 加入无菌水定容至1800 L, 再加入CaCl2 (2.5 mol/L) 溶液200 L，混匀，加入2BBS缓冲盐溶液2000 L，室温放置2030 min；4.3 当细胞密度达60%70%时转染. 将DNA和磷酸钙混合液转移至含单层细