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文档简介
Canoco 4.5 做CCA分析1.canoco 4.5 包括很多模块,我们一般使用到的就是WCanolmp,canoco for Windows 4.5, canoDraw for Windows这三个。2. 首先我们打开WCanolmp,将环境因子和物种信息分别保存为.dat 文件。2.1 用Excel打开环境因子文件同样用Excel 打开物种信息文件需要注意的是,两个dat文件的数据组数要一样,也就是enviro.dat里面复制保存了5列,spice.dat里面也要复制保存同样名称的5列,这5列一定包括图中红色区域。否则后面就会出现错误。见3.22.2 如果我们的数据一列表示一组数据,那么我们就要选择each column is a sample。2.3 保存好两个.dat文件后,不要着急打开工程模块,先新建一个文本文档,将文档后缀名改成sol,后面要用到。3.3.1 打开canoco for Windows 4.5模块,通过图中红色区域的图标新建一个project,或者打开filenew project。选择spices and environment data available,点下一步。3.2 按照要求点击Browse,将两个dat文件分别输入,最下面一栏将之前新建的sol文件输入。点击下一步。这时如果保存的数据组数不一样,就会出现错误。这个问题改好后,重新建一个project,不然会一直跳出来这个错误。之后一直下一步就好,最后点完成后出现con文件,命名后保存。3.4 在project中点击Analyze进行分析。3.5 分析后出现下图,点击CanoDraw,保存cdw文件,跳到作图3.6 点击create-biplots and joint plots-samples and env. Variables作图。出现下图,这时发现样点序号不是自己的标注,需要进行更改。如下图所示,点击Project-Setting,选择Appearance,在Sample labl
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