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_第二章三、简答题1、某DNA样品含腺嘌呤15.1%(按摩尔碱基计),计算其余碱基的百分含量。答:由Chargaff定则知:A=T,G=C,A+G=C+T 腺嘌呤含量为15.1%,所以胸腺嘧啶含量为15.1%,胞嘧啶和鸟嘌呤含量均为34.9%。2、核酸为什么是两性电解质,且可纯化得到DNA钠盐。答:核酸带有酸性的磷酸基团和碱性的氨基,因而具有两性电解质性质。 DNA具有极性基团,微溶于水,但DNA钠盐在水中溶解度较大,所以经过抽提可以得到DNA钠盐。四、问答题1、DNA双螺旋结构有些什么基本特点?这些特点能解释哪些最重要的生命现象?答:特点:a. 两条反向平行的脱氧多聚核苷酸链沿一个假设的中心轴右旋相互盘绕而形成。 b. 磷酸和脱氧核糖交替排列作为不变的骨架位于外侧,作为可变成分的碱基位于内侧,链间碱基按AT,GC配对(碱基配对原则,Chargaff定律) c. 螺旋直径2nm,相邻碱基平面垂直距离0.34nm,螺旋结构每隔10个碱基对重复一次,间隔为3.4nmDNA双螺旋结构模型的主要特征受到许多化学和生物学证据的支持,它揭示了DNA作为遗传物质的稳定性特征(碱基配对、双链互补、反向平行),这是DNA复制、转录和反转录的分子基础,亦是遗传信息传递和表达的分子基础。该模型的提出是本世纪生命科学的重大突破之一,它奠定了生物化学和分子生物学2、DNA和RNA的化学组成、分子结构和生理功能上的主要区别是什么?答:碱基不同,DNA为A、T、C、G,RNA为A、U、C、G和其它稀有碱基;核糖不同,DNA为脱氧核糖,RNA为核糖;分子结构,DNA为双链反平行结构,RNA为单链结构;DNA为遗传信息的载体,RNA为信息传递重起重要作用。3、比较tRNA、rRNA和mRNA的结构和功能。答:tRNA的二级结构特征:单链、三叶草叶形、四臂四环,三级结构特征:在二级结构基础上进一步折叠扭曲形成倒L型。功能:蛋白质合成的适配器分子,负责特定氨基酸的转运。rRNA的分子结构特征:单链,螺旋化程度较tRNA低,与蛋白质组成核糖体后方能发挥其功能。功能:核糖体的结构组成成分,催化RNA剪接反应。mRNA的分子结构,原核生物mRNA特征:先导区+翻译区(多顺反子)+末端序列,真核生物mRNA特征:“帽子”(m7G-5ppp5-N-3p)+单顺反子+“尾巴”(Poly A)。功能:把DNA中的遗传信息变成功能性蛋白的过程中起中介作用。4、作业题5、分子量碱基对平均分子量=碱基对数量,碱基对距离0.34nm,数量*单个距离为165nm,碱基对直径为2nm,体积为518nm3,一个螺旋3.6nm,螺旋数为45.86、因为染色质是由DNA和碱性组蛋白组成,所以用稀酸或高盐溶液处理,可以把碱性组蛋白从染色质上洗下来。7、原核生物mRNA特征:先导区+翻译区(多顺反子)+末端序列真核生物mRNA特征:“帽子”(m7G-5ppp5-N-3p)+单顺反子+“尾巴”(Poly ADNA复性:变性DNA的两条链通过碱基配对重新形成双螺旋的过程。DNA变性:DNA在高温、极端PH时黏度下降,碱基对之间的氢键断裂,堆积碱基之间疏水作用遭到破坏,双链DNA解螺旋形成单链。增色效应:DNA由双链变成单链的变性过程会导致溶液紫外光吸收的增加。减色效应:在核酸中由于碱基之间的氢键键合和碱基的堆积作用,造成核酸比同浓度游离核苷酸对紫外光的吸收减少。分子杂交:不同来源的单链核酸依据分子的互补性形成双螺旋的过程。核酸探针:能与特定目标核酸序列发生杂交,并含示踪物的核酸片段(DNA或RNA)。回文结构:碱基顺序颠倒重复因而具有2倍对称的DNA段落。Tm值:DNA热变性时,其紫外吸收增加值到达总增加值一半时的温度。Chargaff定律:任何一种DNA样品其腺嘌呤残基的数量等于胸腺嘧啶残基的数量,即A=T,鸟嘌呤残基的数量一定等于胞嘧啶残基的总数,即G=C。因此嘌呤残基的总数等于嘧啶残基的总数,即A+G=T+C。碱基配对:核酸中两条单链的碱基间主要通过氢键形成的一种特定的联系。即A=T、A=U、CG等。超螺旋DNA:具有超螺旋结构的DNA分子。有正超螺旋和负超螺旋DNA两种。在生物体内存在的DNA一般都是负超螺旋DNA。拓扑异构酶:在每个细胞内含有一些专门使DNA超螺旋或松弛得酶类,这些增加或减少DNA超螺旋的酶或者能改变DNA分子的拓扑连系数的酶。第三章1、 酶的抑制有哪些类型? 答:酶的抑制分为可逆的抑制作用和不可逆的抑制作用。可逆的抑制作用又分为竞争性抑制作用、反竞争性抑制作用和混合型抑制作用。 2、测定酶活力时为什么要测量初速度? 答:因为在过量的底物存在下,初速度与酶浓度成正比,可以避免产物的形成、反应体系中PH的变化、逆反应速度加快等对反应速度的影响。3、 和非酶催化剂相比,酶在结构上和催化机理上有什么特点? 答:酶分子中直接与底物结合,并和酶催化作用直接有关;酶采取与底物形成中间产物降低反应活化能的方式来加速化学反应。1、 结构专一性酶对所催化的分子化学结构的特殊要求和选择2 、立体异构专一性 酶除了对底物分子的化学结构有要求外,对其立体异构也有一定的要求。三、问答题:1 共性:1、加快化学反应的速度;2、只能缩短反应达到平衡所需的时间,而不能改变反应的平衡点 。个性:1、极高的催化效率 2、高度的专一性 3、活性可调控4、易受环境变化的影响2、1、酶浓度(比例) 2、底物浓度(单分子酶促米氏方程) 3、温度(钟形曲线) 4、pH(钟形曲线) 5、激活剂 (速度增快) 6、抑制剂(竞争性抑制、非竞争性抑制、反竞争性抑制) 3、已做作业题。4、竞争性抑制 E + S= ES- P + E E +I= EI(竞争底物结合位点)非竞争性抑制 E + S= ES- P + E E +I= EI EI+S=EIS竞争其他位点。(书101-103)5、敌百虫等有机磷农药能以乙酰胆碱酯酶活性中心的丝氨酸以共价键结合,使其失活。而乙酰胆碱酯酶与中枢神经系统有关,能引起乙酰胆碱的过度积累,导致持续兴奋,最终导致害虫死亡。6、7题看作业。8、酶(E)与底物(S)结合生成不稳定的中间物(ES),再分解成产物(P)并释放出酶,使反应沿一个低活化能的途径进行,降低反应所需活化能,所以能加快反应速度。原因:1、酶促反应过程中的共价键重排 ,在酶与底物的功能基团之间发生许多类型的反应: 1、某些功能基团可与底物发生瞬间的相互作用,激活底物参加反应; 2、底物上的一些基团会临时性地被转移到酶的基团上。2、酶和底物之间非共价的相互作用 酶能与底物通过许多弱非共价键而形成特殊的ES复合物,每个非共价键的形成都伴随着小量自由能的释放,许多弱键相互作用的集合促进ES复合物的稳定。9、辅酶或辅基一般指小分子的有机化合物,二者之间没有严格的界限。一般说,辅基与酶蛋白通过共价键相结合,不易用透析等方法除去,辅酶与酶蛋白结合较松,可用透析等方法除去而使酶丧失活性。自然界中的没的种类很多,而维生素当中的许多是酶的辅酶或辅基。如脱氢酶类的辅酶均为NAD或NADP,转氨酶类的辅酶都是磷酸吡哆醛。名词解释酶的活性中心:酶分子中直接参与和底物结合,并与酶的催化作用直接相关的部位。具有结合部位和催化部位两个功能部位。酶原:不具催化活性的酶的前体。活力单位:酶活力的大小、即酶量的多少用酶活力单位(U)表示。比活力:每毫克酶蛋白所具有的活力单位数。诱导契合学说:酶的活性中心在结构上具柔性,底物接近活性中心时,可诱导酶蛋白构象发生变化,这样就使使酶活性中心有关基团正确排列和定向,使之与底物成互补形状有机的结合而催化反应进行。酶的活性中心不是与底物本身互补,而是互补于激发态底物,通过激发态底物转化成产物。米氏常数:反应速度为最大反应速度一半时所对应的底物浓度,它是因酶和底物而异的特征常数。协同效应:一个效应物分子与变构酶的变构中心结合后对第二个效应物分子结合的影响。竞争性抑制作用:酶的竞争性抑制剂与它的底物竞争与酶的活性部位结合,当竞争性抑制剂与酶的活性部位结合后,其底物不能与酶结合;许多竞争性抑制剂与酶的底物的结构相似,可与酶结合形成EI复合物,但,酶不能催化其发生反应。非竞争性抑制作用:抑制剂不能与游离酶结合,但可与ES复合物结合并阻止产物生成,使酶的催化活性降低.多酶体系:在完整细胞的某一代谢过程中,由几个酶组成的反应链体系。同工酶:存在于同一种属或不同种属,同一个体的不同组织或同一组织、同一细胞,具有不同分子形式,能催化相同的化学反应,但酶蛋白的分子结构、理化性质及生物学性质等方面都存在差异的一组酶。共价调节酶:某些酶可以在其它酶催化下对其多肽链上某些基团进行可逆的共价修饰,使其处于活性与非活性的互变状态,从而调节酶活性。这类酶称为共价调节酶。固定化酶:将水溶性酶用物理或化学方法处理,固定于高分子支持物(或载体)上而成为不溶于水,但仍有酶活性的一种酶制剂形式,称固定化酶。别构效应:一个效应物分子与变构酶的变构中心结合后对第二个效应物分子结合的影响。ribozyme:核酶(ribozyme)是具有催化功能的RNA分子,是生物催化剂.维生素:维生素是参与生物生长发育和代谢所必需的一类微量有机物质。辅酶:一般指小分子的有机化合物,辅酶与酶蛋白结合较松,可用透析等方法除去而使酶丧失活性。辅基:一般指小分子的有机化合物,辅基与酶蛋白通过共价键相结合,不易用透析等方法除去。激活剂:凡是能提高酶活性,加速酶促反应进行的物质称为该酶的激活剂。抑制剂:某些物质能使酶的活性部位中的催化(结合)基团或维持酶的构像所必需基团的化学性质改变而降低酶活力甚至使酶活完全丧失,能引起这种抑制作用的物质称为某酶的抑制剂。第六章三、1、呼吸链上的电子在传递过程中产生的能量驱动H+从线粒体基质跨过内膜进入到膜间隙,从而形成跨线粒体内膜的H+电化学梯度,这种电化学梯度转变为质子驱动力,驱使H+返回线粒体基质。由于线粒体内膜对H+的不通透性,H+只能通过内膜上的质子通道F0返回,这样H+驱动力为ATP的合成提供了能量内膜对H+的不通透性,随着电子传递的进行,H+在外室积累,形成电势差。 2 、a为各种吸能反应直接提供自由能 b携带能量,细胞能量流动的货币 c作为磷酸基供体 3、能荷= ATP+0.5ADP/ATP+ADP+AMP,由ATP 、 ADP和AMP的相对数量决定,数值在01之间,反映细胞能量水平。 能荷对代谢的调节可通过ATP 、 ADP和AMP作为代谢中某些酶分子的别构效应物进行变构调节来实现。 4、磷酸化合物,当其磷酰基水解时,释放出大量的自由能。这类物质称为高能磷酸化合物。 ADP,ATP,1,3-二磷酸甘油酸,磷酸肌酸,磷酸烯醇式丙酮酸,四、1、糖类、脂肪、蛋白质等有机物质在细胞中进行氧化分解生成CO2和H2O并释放出能量的过程称为生物氧化。 在活的细胞中(pH接近中性、体温条件下),有机物的氧化在一系列酶、辅酶和中间传递体参与下进行,其途径迂回曲折,有条不紊。 氧化过程中能量逐步释放,其中一部分由一些高能化合物(如ATP)截获,再供给机体所需。在此过程中既不会因氧化过程中能量骤然释放而伤害机体,又能使释放的能量尽可得到有效的利用。 相同点:氧化方式(加氧、脱氢、失电子)、消耗氧量、最终产物、释放能量 不同点:区别生物氧化体外氧化反应条件温和剧烈催化剂酶反应过程分部一步能量释放逐步突然能量形式热能,ATP热能,光能产物生成间接直接 2、在能量转换中扮演了极其重要的角色,能释放大量的能量。ATP有特殊的结构,内有2个高能的不稳定的酸酐键,4个相距很近的负电荷,能将细胞的放能反应和吸能反映偶联在一起。ATP是能量运转的“共同中间体”3,线粒体内膜上有哪几种电子传递链?电子传递链 (electron transfer chain,ETC)是一系列电子载体按对电子亲和力逐渐升高的顺序组成的电子传递系统.所有组成成分都嵌合于线粒体内膜或叶绿体类囊体膜或其他生物膜中,而且按顺序分段组成分离的复合物,在复合物内各载体成分的物理排列也符合电子流动的方向.其中线粒体中的电子传递链是伴随着营养物质的氧化放能,又称作呼吸链. 线粒体中的电子传递链的主要组分包括:黄素蛋白;铁硫蛋白;细胞色素;泛醌.它们都是疏水性分子.除泛醌外,其他组分都是蛋白质,通过其辅基的可逆氧化还原传递电子. 它们在膜表面形成四个复合体,称为复合体(NADP脱氢酶复合体),复合体(琥珀酸脱氢酶复合体),复合体(细胞色素还原酶复合体),复合体(细胞色素氧化酶复合体)。NADH依次经过复合物、辅酶Q、复合体、细胞色素C、复合体最终把电子传递给氧气,并将质子排到线粒体膜间隙最终经线粒体ATP合酶生成2.5个ATP.FADH2经复合体、辅酶Q、复合体、细胞色素C、复合体最终把电子传递给氧气,并将质子排到线粒体膜间隙最终经线粒体ATP合酶生成1.5个ATP.由于前者的生成ATP量大于后者,所以前者称为主电子传递链,后者称为次电子传递链。4,线粒体外产生的NADH是如何进入线粒体氧化的?线粒体膜没有相应的NADH载体,所以跨膜的方法是穿梭作用。磷酸甘油穿梭系统 (细胞液)(线粒体基质) 2、 苹果酸天冬氨酸穿梭系统 五|名词解释生物氧化: 糖类、脂肪、蛋白质等有机物质在细胞中进行氧化分解生成CO2和H2O并释放出能量的过程称为生物氧化(biological oxidation),其实质是需氧细胞在呼吸代谢过程中所进行的一系列氧化还原反应过程.氧化磷酸化: 代谢物在生物氧化过程中释放出的自由能用于合成ATP(即ADP+PiATP),这种氧化放能和ATP生成(磷酸化)相偶联的过程称氧化磷酸化。底物水平磷酸化: 物质在生物氧化过程中,常生成一些含有高能键的化合物,而这些化合物可直接偶联ATP或GTP的合成,这种产生ATP等高能分子的方式称为底物水平磷酸化磷氧比(P/O): 呼吸过程中无机磷酸(Pi)消耗量和氧消耗量的比值称为磷氧比.呼吸链: 线粒体内膜上存在多种酶与辅酶组成的电子传递链,可使还原当量中的氢传递到氧生成水。解偶联剂作用: 所有破坏生物氧化与磷酸化相偶联的作用,即抑制氧化磷酸化的作用即解偶联作用.能荷: 能荷是细胞中高能磷酸键状态的一种数量上的衡量,能荷大小可以说明生物体中ATP-ADP-AMP系统的能量状态。细胞内的能量状态取决于ATP、ADP及AMP的相对浓度。贮存在腺苷酸体系的总能量与其中的焦磷酸基的数目成正比。(7)-氧化除起始活化消耗能量外,是一个产生大量能量的过程。饱和脂肪酸从头合成是一个消耗大量能量的过程。 第七章1.么人摄入过多的糖容易长胖?人吃过多的糖造成体内能量物质过剩,进而合成脂肪储存故可以发胖,基本过程如下:葡萄糖丙酮酸乙酰CoA合成脂肪酸酯酰CoA葡萄糖磷酸二羧丙酮3-磷酸甘油脂酰CoA+3-磷酸甘油脂肪(储存)脂肪分解产生脂肪酸和甘油,脂肪酸不能转变成葡萄糖,因为脂肪酸氧化产生的乙酰CoA不能逆转为丙酮酸,但脂肪分解产生的甘油可以通过糖异生而生成葡萄糖。2写出一摩尔软脂酸在体内氧化分解成二氧化碳和水的反应历程,计算产生的ATP摩尔数。见课本P3063请列出乙酰CoA可进入的代谢途径。来源:1)多糖经糖酵解生成丙酮酸,再经过丙酮酸脱氢酶系的作用系形成乙酰CoA。2).脂肪酸的-氧化中脂酰CoA经过脱氢、加水、脱氢、硫解可以生成乙酰CoA。3).微生物中由乙酸在辅酶A、ATP、乙酰辅酶A合成酶的参与下活化成乙酰CoA。 去路:1). 乙酰CoA进入乙醛酸循环(柠檬酸循环)2). 乙酰CoA在肝细胞中生成酮体3). 乙酰CoA用于脂肪酸的生物合成4). 乙酰CoA用于胆固醇的生物合成5). 乙酰CoA进入乙醛酸循环中(植物、微生物)问答题1(a)氧化发生在线粒体;而合成发生在细胞质。(b)氧化使用辅酶A;合成用ACP。(c)氧化用NAD和FAD,而合成用NADPH。(d)氧化是3-羟酰基CoA的L-异构体;而合成是D-异构体。(e)氧化时是羧基变甲基;合成时是甲基变羧基。(f)氧化用的酶是分立的,而合成用的酶组成一酶复合物。(g)氧化为乙酰CoA;合成为丙二酸单酰CoA。(h)-氧化除起始活化消耗能量外,是一个产生大量能量的过程。饱和脂肪酸从头合成是一个消耗大量能量的过程。 2脂肪分解成甘油和脂肪酸,甘油在甘油激酶催化下形成3-磷酸甘油,再进一步在磷酸甘油脱氢酶作用下生成磷酸二羟丙酮,磷酸二羟丙酮可转变为3-磷酸甘油醛进入糖酵解的逆反应异生为葡萄糖。脂肪酸经过-氧化生成乙酰辅酶A,再进入乙醛酸循环异生成葡萄糖。3由于糖供应不足,机体需动员大量的脂肪酸供能,同时生成大量的乙酰辅酶A。此时草酰乙酸进入糖异生途径,又得不到及时的回补而浓度降低,因此不能与乙酰辅酶A缩合成柠檬酸,在这种情况下,大量积累的乙酰辅酶A衍生为乙酰乙酸,-羟丁酸和丙酮,前两者都是酸性物质,酸性物质在体内堆积超过了机体的代偿能力时,血的PH值就会下降(7.35),这时机体容易发生酸中毒。酸中毒易使解质代谢失去平衡,导致其他代谢紊乱,不利于健康。名词解释-氧化:脂肪酸每次氧化只失去一个碳原子即羧基碳原子,生成缩短了一个碳原子的脂肪酸和二氧化碳脂肪酸-氧化:肪酸在一系列酶的作用下,在碳原子和碳原子之间断裂,碳原子被氧化成羧基,生成含有两个碳原子的乙酰辅酶A,和较原来少两个碳原子的脂肪酸-氧化:脂肪酸的碳原子羟化生成-羧脂肪酸,再经醛脂肪酸生成,-二羧酸,然后在-端或-端活化,进入线粒体进入-氧化,最后生成琥珀酰CoA必须脂肪酸:不能被细胞或机体以相应需要量合成或从其膳食前体合成,而必需由膳食供给的多不饱和脂肪酸。酰基载体蛋白:通过硫脂键结合脂肪酸合成的中间代谢物的蛋白质(原核生物)或蛋白质的结构域(真核生物)。酮体:脂肪酸氧化分解的中间产物乙酰乙酸、-羟基丁酸及丙酮,三者统称为酮体。酸中毒:体内大量积累的酸性物质超过了机体代偿能力时,血液ph值降低,易出血酸中毒。类脂:主要是指在结构或性质上与油脂相似的天然化合物。它们在动植物界中分布较广,种类也较多,主要包括蜡、磷脂、萜类和甾族化合物等第八章 氨基酸代谢 三、简答题 催化蛋白质降解的酶有哪几类?它们的作用特点如何? 肽酶 蛋白酶 。 它们对所作用的反应底物有严格的选择性,一种蛋白酶仅能作用于蛋白质分子中一定的肽键,如胰蛋白酶催化水解碱性氨基酸所形成的肽键。2 ,人类对氨基酸的终产物是什么?鸟类对氨基代谢的终产物是什么?答:尿素 尿酸 3维生素B族中有哪些成员是与氨基酸代谢有关的?请简述之。答:维生素B1,维生素B2,泛酸 ,维生素B6。维生素B1常以硫氨素焦磷酸酯的形式存在,构成a-酮酸氧化脱氢酶系的辅酶焦磷酸硫胺素(TPP),其主要功能是参与a-酮酸氧化脱羧作用;维生素B2和磷酸结合形成磷酸核黄素,又成为黄素单核苷酸(FMN),FMN和一分子AMP缩合,形成黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD)。FMN,FAD为黄酶的辅酶,参与氧化还原反应与氨基酸代谢密切相关;泛酸与氨基酸代谢也有重要的作用;维生素B6常以磷酸酯的形式存在,构成磷酸吡哆醛和磷酸吡哆胺和磷酸吡哆醇,前两者是多种酶,如氨基酸转氨酶和氨基酸脱氢酶的辅酶,参与氨基酸代谢。四、问答题 1氨基酸脱氨后产生的氨和a-酮酸有哪些主要的去路?答:氨基酸脱氨后产生的氨可通过鸟氨酸循环以尿素的形式排出体外或是生成NH4+在机体内被利用。 氨基酸脱氨后产生的a-酮酸可生成糖及其代谢中间产物或脂肪及其代谢中间产物,或者是糖及其代谢中间产物再转化为脂肪及其代谢中间产物,参与柠檬酸循环,氧化分解释放能量,最终彻底氧化生成水和二氧化碳。2,在氨基酸代谢中,哪些氨基酸可形成草酰乙酸进入糖代谢途径?答:天冬氨酸和天冬酰胺。试述天冬氨酸彻底氧化分解成CO2和H2O的反应历程,并计算产生的ATP的摩尔数、答:天冬氨酸在体内氧化分解二氧化碳和水的代谢途径:天冬氨酸(通过谷草转氨酶和-酮戊二酸)草酰乙酸(PEP羧基酶和GTPGDP+二氧化碳)磷酸烯醇式丙酮酸(丙酮酸激酶和ADPATP)丙酮酸(丙酮酸脱氢酶合酶和CoA-SH二氧化碳和NAD+NADH)乙酰CoA(柠檬酸合酶和草酰乙酸到CoA-SH)柠檬酸(异构酶)异柠檬酸(异柠檬酸脱氢酶和NAD+NADH和二氧化碳)-酮戊二酸(-酮戊酸脱氢酶和CoA-SH二氧化碳和NAD+NADH)琥珀酰CoA(琥珀酰CoA合成酶伴随ADPATP和GDP到GTP CoA-SH )琥珀酸(琥珀酸脱氢酶和FAD到FADH2)延胡索酸(延胡索酸酶)苹果酸(苹果酸脱氢酶和NAD+NADH H+)草酰乙酸在这个过程中共生成2分子ATP(GTP),4分子NADH,1分子FADH2。共消耗1分子GTP。总共生成ATP个数为2+4*2.5+1*1.5-1=12.5.四、名词解释联合脱氨基作用 转氨基作用 必需氨基酸 一碳单位 生糖氨基酸生酮氨基酸 一碳单位:在代谢过程中,某些化合物(如氨基酸)可以分解产生具有一个碳原子的基团(不包括CO2),称为一碳单位,一碳单位的转移除了和许多氨基酸的代谢直接有关外,还参与嘌呤和胸腺嘧啶及磷脂的生物合成。必需氨基酸:凡是机体不能自己合成,必需来自外界的氨基酸,称为必需氨基酸。 人的必需氨基酸:Thr、Val、Leu、Ile、Met、Lys、Phe、Trp (His、 Arg)联合脱氨基作用:转氨基作用和氧化脱氨基作用联合进行的脱氨基作用方式。转氨基作用:在转氨酶的催化下, -氨基酸的氨基转移到-酮酸的酮基碳原子上,结果原来的-氨基酸生成相应的-酮酸,而原来的-酮酸则形成了相应的-氨基酸,这种作用称为转氨基作用或氨基移换作用。生糖氨基酸:凡能在分解过程中转变为丙酮酸,-酮戊二酸,琥珀酰CoA,延胡索酸,和草酰乙酸的氨基酸称为生糖氨基酸。生酮氨基酸:凡能在分解过程中转变为乙酰CoA和乙酰乙酰CoA的氨基酸称为生酮氨基酸。第九章 核苷酸代谢推荐网址:/list.asp?big=shzy&small=shxt&bigclassname=生化资源&smallclassname=生化习题核苷酸得从头合成:利用磷酸核糖、一些氨基酸、一碳单位及二氧化碳等简单物质为原料,经过一系列酶促反应,合成核苷酸的过程。核苷酸的补救途径:指碱基、核苷或脱氧核苷转变成为相应的单核苷酸的反应过程。三1.根据对底物的专一性分为:核糖核酸酶(Rnase 脱氧核糖核酸酶(Dnase 非特异性核酸酶 根据切割位点分为 : 内切核酸酶,外切核酸梅 牛脾磷酸二酯酶( 5端外切5得3) 蛇毒磷酸二酯酶( 3端外切3得5)脱氧核糖核酸酶(Dnase)只作用于DNA p1432.从头合成途径、补救合成途径(重新利用途径) p3433.生物体内脱氧核苷酸的合成一般通过还原反应,这种还原反应多发生在核苷二磷酸的水平上:在核糖核苷酸还原酶(也称核苷二磷酸还原酶)的作用下,核糖核苷二磷酸(NDP)可转变为相应的脱氧核糖核苷二磷酸(dNDP)。 P350四1.p144 原核生物中存在着一类能识别外源DNA双螺旋中4-8个碱基对所组成的特异的具有二重旋转对称性的回文序列,并在此序列的某位点水解DNA双螺旋链,产生粘性末端或平末端,这类酶称为限制性内切酶(ristriction endonuclease)。特异性很高、.常由46个核苷酸组成、.一般具有回文结构、少数内切酶识别序列中的碱基可以有规律地替换、.限制性内切酶的切口多形成粘性末端限制性内切酶是分析染色体结构、制作DNA限制图谱、进行DNA序列测定和基因分离、基因体外重组等研究中不可缺少的工具,是一把天赐的神刀,用来解剖纤细的DNA分子。2.尿酸:人类、鸟类、昆虫尿囊素:人类及灵长类以外的哺乳动物尿囊酸:硬骨鱼类尿素和乙醛酸:存在尿囊酸酶的鱼类和两栖类氨:甲壳类,海洋无脊椎动物 p3413.尿酸(尿酸盐)别嘌呤醇是次黄嘌呤的类似物,可与次黄嘌呤竞争与黄嘌呤氧化酶的结合:别嘌呤醇氧化的产物是别黄嘌呤,后者的结构由于黄嘌呤相似,可牢固的与黄嘌呤氧化酶的活性中心结合,从而抑制该酶的活性,使次黄嘌呤转化为尿酸的量减少,使尿酸结石不能形成。P342酶的竞争性抑制剂与它的底物竞争与酶的活性部位结合。P102第十章三、1、DNA复制时半保留的,如果把双螺旋DNA的每一条DNA链作为模板复制一条新链,就可以产生两个新的双螺旋DNA分子,这两个子代DNA分子都喊一条新链、一条旧链,所以DNA复制是半保留复制;当DNA复制叉向前移动时,两DNA亲本链方向相反,在复制叉上一条新链是连续合成的,另一条新练的合成则是不连续的,所以说DNA的复制是半不连续的。Cairns将3H-胸苷标记大肠杆菌DNA,经过近两代的时间,3H-胸苷掺入大肠杆菌DNA 。用溶菌酶把细胞壁消化掉,使完整的大肠杆菌染色体DNA释放出来,放射自显影,得到上图。非复制部分(C)银粒子密度较低,由一股放射性链和一股非放射性链构成。已复制部分站整个染色体的三分之二,其中一条双链( B )仅有一股链是标记的,另外一股双链( A )的两股链都是标记的,银粒子密度为前二者的两倍。染色体全长约为1100微米。日本学者冈崎发现在复制叉上一条新链是以片段的方式合成的。2、DNA复制的特点是:需要摸板,半保留,固定的起点和方向,半不连续,需要RNA作为引物。RNA转录的特点是:依赖DNA,有足迹法与启动子。3、(1) DNA聚合酶的高度专一性(严格遵循碱基配对原则,但错配率为10-4 10-5 )(2) DNA聚合酶的校对功能(错配碱基被3-5 外切酶切除后校正,可提高精确度102 103倍) (3)DNA复制起始时以RNA为引物(4) DNA复制后的错配修复系统(提高精确度102 103倍)4.反转录作用即以RNA为模板合成DNA,这与通常过程中遗传信息从DNA到RNA的方向相反,故称为逆转录作用。5.一,转录物5末端的三磷酸与一分子GTP缩合成5帽子 二,由RNA末端核苷酸转移酶催化,3端添加PolyA尾巴 三,剪切,剪去内含子,拼接外显子四、1、(1)提取目的基因:获取目的基因是实施基因工程的第一步。如植物的抗病(抗病毒 抗细菌)基因,种子的贮藏蛋白的基因,以及人的胰岛素基因干扰素基因等,都是目的基因。(2)目的基因与运载体结合,将目的基因与运载体结合的过程,实际上是不同来源的DNA重新组合的过程(3)将目的基因导入受体细胞,目的基因的片段与运载体在生物体外连接形成重组DNA分子后,下一步是将重组DNA分子引入受体细胞中进行扩增。(4)目的基因的检测和表达,目的基因导入受体细胞后,是否可以稳定维持和表达其遗传特性,只有通过检测与鉴定才能知道。2.首先DNA分子结构具有相对的稳定性,DNA分子中的脱氧核苷酸和磷酸交替排练的顺序稳定不变碱基互补的原则稳定不变,独特的双螺旋结构构成DNA分子的稳定结性。其次能够控制蛋白质的合成,从而控制新陈代谢过程和性状,第三能够自我复制,使后代好吃一定的连续性。第四,能够产生可遗传的变异 DNA 双螺旋结构的提出开始,便开启了分子生物学时代.分子生物学使生物大分子的研究进入一个新的阶段,使遗传的研究深入到分子层次,生命之谜被打开, 人们清楚地了解遗传信息的构成和传递的途径.在以后的近50年里,分子遗传学,分子免疫学,细胞生物学等新学科如雨后春笋般出现,一个又一个生命的奥秘从分子角度得到了更清晰的阐明,DNA重组技术更是为利用生物工程手段的研究和应用开辟了广阔的前景.在人类最终全面揭开生命奥秘的进程中,化学已经并将更进一步地为之提供理论指导和技术支持3.DNA复制酶类一季他们各自的功能为:1DNA解螺旋酶:解开双链DNA 2引物酶和引发体:启动RNA引物合成 3DNA拓补异构酶:解除由于链的解开而使DNA螺旋结构产生的拓补学张力 4DNA聚合:确保DNA从5末端向3末端方向合成 5DNA连接酶:连接DNA主链上留有的磷酸二酯键裂口 6单链结合蛋白:结合在解开的DNA单链上名词解释中心法则:在细胞分裂的过程中,通过DNA复制把亲代细胞所含的遗传信息忠实地传递给两个子代细胞。在子代细胞的生长发育过程中,这些遗传信息通过转录传递给RNA,再由RNA通过翻译转变成相应的蛋白质多肽链上的氨基酸排列顺序,由蛋白质执行各种各样的生物学功能,使后代表现出与亲代相似的遗传特征。半保留复制:双螺旋DNA的每一条DNA链作为模板复制一条新链,就可以产生两个新的双螺旋DNA分子,这两个子代DNA分子含有一条新链、一条旧链,所以DNA分子都含有一条新链、一条旧链。转录:遗传信息从基因转移到RNA的过程。RNA聚合酶通过与一系列组分构成动态复合体,并以基因序列为遗传信息模板,催化合成序列互补的RNA,包括转录起始、延伸、终止等过程反转录:反转录是以RNA为模板合成DNA的过程,也称逆转录。这是DNA生物合成的一种特殊方式。冈崎片段:在DNA不连续复制过程中,沿着后随链的模板链合成的新DNA片段。随后共价连接成完整的单链。其长度在真核与原核生物当中存在差别,真核冈崎片段长度约为100200核苷酸残基,而原核为10002000核苷酸残基。突变:遗传物质的结构或成分发生突然变化的现象。复制叉:一个正在复制的DNA双螺旋分子复制处解链呈Y形的部位SSB:单链结合蛋白DNA体内重组:DNA分子或分子间发生遗传信息的重新组合基因:存在于细胞内有自体复制能力的遗传物质单位。基因组:个体或细胞所含的全套基因的总和。在原核生物中即一个连锁群中所含的全部遗传信息。切除修复:切除修复 (excission repairing):也称核苷酸外切修复,这是一种取代紫外线等辐射物质所造成的损伤部位的暗修复系统。此系统是在几种酶的协同作用下,先在损伤的任一端打开磷酸二酯键,然后外切掉一段寡核苷酸;留下的缺口由修复性合成来填补,再由连接酶将其连接起来。第十一章四、2三种主要RNA:信使RNA,含有一条或多条多肽中的氨基酸顺序的信息;转运RNA,可以阅读编码在mRNA中的信息,并在蛋白质合成中转运合适的氨基酸到生长中的多肽链上;核糖体RNA分子与蛋白质结合,形成复杂的蛋白质合成器核糖体。此外,还有许多行使调控和催化功能的特殊RNA。3.1.与上一阶段所产生的复合物受位上mRNA密码子相对应的氨基酰tRNA进入受位。2在转肽酶的催化下,将给位上tRNA所携的甲酰甲硫氨酰(或肽酰)转移给受位上新进入的氨基酰tRNA,与其所带的氨基酰的氨基结合,形成肽键。3移位核糖体向mRNA的3端挪动相当于一个密码子的距离,使下一个密码子准确定位在受位,同时带有肽链的tRNA由受位移至给位,此步需要肽链延长因子、Mg2+与供给能量的GTP。近来发现核糖体在受(A)、给(P)位外,还有tRNA的另一结合位置,即E位。氨基酰脱落后的tRNA先移至E位。4脱落当A位进入新的氨基酰tRNA后,空载的tRNA从核糖体的E位脱落。以后肽链上每增加一个氨基酸残基,就需要进位,转肽(形成新的肽键),移位和脱落。如此一遍一遍地重复,直到肽链增长到必要的长度。在肽链延长阶段中,每生成一个肽键,都需要直接从2分子GTP(移位时与进位时各1)获得能量,即消耗2个高能磷酸键化合物;但考虑到氨基酸被活化生成氨基酰tRNA时,已消耗了2个高能磷酸键(见前),所以在蛋白质合成过程中,每生成一个肽键,实际上共需消耗4个高能磷酸键。遗传密码:核苷酸序列所携带的遗传信息。编码20种氨基酸和多肽链起始及终止的一套64个三联体密码子。密码子:对应于某种氨基酸的核苷酸三联体。在转译过程中决定该种氨基酸插入生长中多肽链的位置。翻译:在多种因子辅助下,核糖体结合mRNA模板,通过tRNA识别该mRNA的三联体密码子和转移相应氨基酸,进而按照模板mRNA信息依次连续合成蛋白质肽链的过程。有意义链:互补于模板链的DNA链反义意链:用作RNA合成模板的链分子病:由于基因或DNA分子的缺陷,致使细胞内RNA及蛋白质合成出现异常、人体结构与功能随之发生变异的疾病。DNA分子的此种异常,有些可随个体繁殖而传给后代。如镰状细胞性贫血,是合成血红蛋白的基因异常所致的贫血疾患。氨基酰rRNA合成酶:第十二章名词解释:1. 反馈抑制:当反应序列中最终产物的量超出细胞的需要时,催化第一步反应的酶的活性可被终产物所抑制的调节作用叫做反馈抑制。2. 共价修饰:酶分子中的某些基团,在其它酶的催化下,可以共价结合或脱去,引起酶分子构象的改变,使其活性得到调节,这种方式称为酶的共价修饰。目前已知有六种修饰方式:磷酸化/去磷酸化,乙酰化/去乙酰化,腺苷酰化/去腺苷酰化,尿苷酰化/去尿苷酰化,甲基化/去甲基化,氧化(S-S)/还原(2SH)。3. 级联放大系统:在实现激素的调节过程中,从激素受体G蛋白AC -PKAPKA靶酶产生生理效应,不仅是一个激素信息的传递过程,而且还构成了一个生物效应的放大系统,信号在传递过程中被逐级放大。4. 第二信使:5. 限速酶:在整条代谢通路中催化反应速度最慢的酶,它不但可以影响整条代谢途径的总速度,还可以改变代谢方向,在代谢过程的一系列反应中,如果其中一个反应很慢,是成为整个过程中的限速步骤,催化此步骤的酶叫限速酶。6. 操纵子:原核细胞相关功能的结构基因常连在一起成一个基因簇,这样形成的一个包括启动子、操纵基因和结构基因的基因表达调控单位,被称为操纵子。7. 操纵子学说:操纵子编码同一个代谢途径中的不同的酶。一个基因簇被串联排列在染色体上一起转录,其转录起始由同一个启动子位点调节,通过同一个操纵基因控制,一开俱开,一闭俱闭,这就是原核细胞基因表达的操纵子学说8. 诱导酶:在环境中有诱导物(通常是酶的底物)存在的情况下,由诱导物诱导而生成的酶。诱导酶的生成除取决于诱导物以外,还取决于细胞内所含的基因。9. 阻遏作用:如果基因产物因信号分子浓度的增加而减少,这类基因称为阻遏基因,造成基因表达减少的现象叫作阻遏作用。简答题:1. 答:新陈代谢简称代谢,是细胞中各种生物分子的合成、利用和降解反应的总和,一般来说,新城代谢包括所有产生和储藏能量的反应,以及利用这些能量合成低分子量化合物的反应,但不包括从小分子化合物蛋白质与核酸的过程。生物新成代谢分为合成代谢和分解代谢。2. 反馈抑制是酶活性调节的一种方式,反馈用来说明生物化学代谢途径中,中间产物或终产物对前面某个反应速度的影响,凡是能使代谢过程速度降低的影响陈为负反馈反馈抑制作用。反馈抑制对生物合成途径非常重要,这种调节既经济又准确,它是用代谢途径的终产物抑制前面的酶来影响自生的合成,调节位点非常准确,同时避免了原料与能量不必要的浪费。3. 能荷是指高能磷酸键在总的腺苷酸库中所占的比例,代谢中的很多反应是可由能荷控制的,细胞可以调节代谢途径,将能荷维持在相当窄的范围内,在某些条件下,能荷值可作为细胞产能和需能代谢过程间变构调节的信号。4. 某些物质能与酶的非催化部位相结合,引起酶构象改变,从而影响酶的活性,进而影响代谢,叫作变构调节。酶分子中的某些基团,在其它酶的催化下,可以共价结合或脱去,引起酶分子构象的改变,使其活性得到调节,这种方式称为酶的共价修饰。两种调解都是引起酶的变化,从而引起活性的变化。不同点是变构调节通过某些物质与酶的非催化部位相结合使酶的构象发生变化,而共价修饰调节某些酶在其他酶的作用下,对其结构共价修饰,而使其活性形式处于高活性和相对较低的活性形式之间互相转变。 问答题:1. 答:三种物质在分解代谢中的部分产物是三羧酸循环的中间产物,在这过程中可以相互转换。糖经酵解可生成磷酸二羟丙酮,再-磷酸甘油,与糖有氧氧化产生的乙酰CoA所形成的脂肪酸合成脂肪,而脂肪分解所产生的甘油形成磷酸二羟丙酮可进入糖代谢,脂肪酸经b-氧化,产生乙酰CoA,再经三羧酸循环和糖异生可生成糖。糖经酵解生成-酮酸,与NH3反应生成氨基酸,形成蛋白质;蛋白质分解成氨基酸,再经脱氨基、转氨基或联合脱氨基等生成-酮酸,再生成糖。脂肪分解生成磷酸二羟丙酮和乙酰CoA可构成氨基酸碳架,再生成氨基酸;蛋白质分解生成的酮酸或乙酰CoA可合成脂肪酸。2. 答:1.核酸是细胞内重要的遗传物质,控制着蛋白质的合成,影响细胞的成分和代谢类型 2.核酸生物合成需要糖和蛋白质的代谢中间产物参加,而且需要酶和多种蛋白质因子。3.各类物质代谢都离不开具备高能磷酸键的各种核苷酸,如ATP是能量的“通货”,此外UTP参与多糖的合成,CTP参与磷脂合成,GTP参与蛋白质合成与糖异生作用。 4.核苷酸的一些衍生物具重要生理功能(如CoA、NAD+,NADP+,cAMP,cGMP)。 3. 答:略4. 答:当人体处于饥饿状态时,体内糖分缺乏,人体活动所需能量缺乏,草酰乙酸参与糖异生作用,而脂肪分解所生成的乙酰CoA因无法与草酰乙酸结合而生成酮体。5. 操纵子编码同一个代谢途径中的不同的酶。一个基因簇被串联排列在染色体上一起转录,其转录起始由同一个启动子位点调节,通过同一个操纵基因控制,一开俱开,一闭俱闭,这就是原核细胞基因表达的操纵子学说。包括乳糖酶的阻遏和乳糖酶的诱导,葡萄糖和乳糖对调控位点进行调控。6、转录起始调节的普遍模式有两种: 负调节作用:分子信号引起调节蛋白从DNA上解离,基因转录激活,转录开始;分子信号增强调节蛋白对DNA启动子的结合,启动子序列抑制,基因不转录,分子信号减弱时,调节蛋白对DNA启动子的结合减弱,启动子序列激活,基因转录。 正调节作用:分子信号引起调节蛋白从DNA上解离导致增强子解离,基因转录减少;分子信号增强调节蛋白对DNA增强子的结合,启动子序列激活,基因转录,分子信号减弱时,调节蛋白对DNA增强子的结合减弱,增强子序列抑制,基因不转录。第十三章名词解释1. SDS-PAGE: 即SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,以聚丙烯酰胺作为支持物的一种电泳方法。当SDS与蛋白质结合后,蛋白质分子即带有大量的负电荷,并远远超过了其原来的电荷,从而使天然蛋白质分子间的电荷差别就降低乃至消除了。与此同时蛋白质在SDS的作用下结构变得松散,形状趋向一致,所以各种SDS-蛋白质复合物在电泳时产生的泳动率差异,就反映了分子量的差异。2. 分子筛层析:即凝胶层析,固定相为多孔凝胶,是利用被分离混合物分子大小的不同,在流动相推动下穿过具有一定孔径的凝胶颗粒而达到分离目的的层析方法。3. 分配层析:利用被分离混合物不同组分在两相中分配系数的差别或溶解度不同而达到分离目的的层析方法。4. 吸附层析:利用被分离混合物不同组分在两相中吸附能力的大小不同而达到分离目的的层析方法。5. 分配系数:在层析过程中,物质即进入固定相,又进入流动相,在一定条件下,物质在固定相和流动相达到平衡时,它在两相中平均浓度的比值。6. 薄层层析:利用玻璃板作为固定相的载体,在板上涂上一薄层不溶性物质,再把待分析的样品加在薄层的一端,在密闭容器中,用适当的溶剂展层后达到分离鉴定的目的。7. 电泳:带电颗粒在电场的作用下 ,向着与其所带电荷相反的电极移动的现象称为电泳。8. 双缩脲反应:双缩脲可由两分子尿素加热至180左右生成,在碱性条件下能与铜离子结合生成紫红色络合物。9. 亲和层析:利用被分离混合物中某一生物大分子具有识别与被识别结合的亲和力特点而达到分离目的的层析方法。10. 浓缩效应:11. 纸层析:用滤纸作支持物,以纸上吸附的水为固定相的分配层析。12. 酶工程:酶制剂在工业上的大规模应用,主要由酶的生产、酶的分离纯化、酶的固定化和生物反应器四个部分组成。13. 柱层析:将支持物装在管中城柱形作为固定相,样品在固定相和流动相一起沿一个方向移动,以达到分离目的。14. 离子交换层析:利用被分离混合物带电性质与大小不同,从而与固定相交换剂上的平衡离子进行不同程度的可逆交换以达到分离目的。15. 酶的回收率:等于每一步骤所得的总活力与第一步骤的总活力之比值。16. 流动相:在层析的两相中,相对迁移率较大的一相。17. 固定相:在层析的两相中,相对迁移率较小的一相。18. 盐析:向蛋白质溶液中加入大量的盐类,蛋白质的溶解度逐渐下降,以致从溶液中沉淀出来。19. 透析:利用蛋白质等大分子不能通过半透膜的性质,使蛋白质和其他小分子分开。20. Rf值:即迁移率,它是样品原点到斑点中心的距离与样品原点到溶剂前沿的距离的比值。简答题:1.答:样品的性质、溶液的pH、电场强度、溶液的离子强度、电泳支持物影响2.答:利用混合物中各组分的物理化学性质(溶解度、吸附能力、分子形状和大小、分子极性、分子亲和力和分配系数等)的差异,使之通过一个由互不相容的两个相组成的体系,由于混合物中各组分在此两相中的分配浓度比例不同,就会以不同的速度移动而互相分离开。3.借助离心机高速旋转产生强大的离心力,使物质分离、浓缩、提纯的方法叫做离心技术,原理是根据物质的质量、沉降系数

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