遗传学 第五章 真核生物特殊的染色体作图.ppt

第五章真核生物特殊的染色体作图,1作图函数,1的重组率被定义为一个遗传图距单位。当位点间隔较小时，利用重组率可以合理估计遗传距离；当位点间的距离很大时，直接利用重组率估计遗传距离就很不准确。作图函数反应的是重组率与实际遗传距离之间的关系,在某一特点染色体区域发生零次、一次、两次等不同类型交换的频率符合波松分布（poissondistribution）:f(i)=e-mmi/i!i是交换发生的次数；f(i)发生某一交换类型的频率，如f(1)、f(2)等；e为自然对数的底；m是每个减数分裂细胞发生交换的平均次数；f(i)=1-e-m因为发生交换后减数分裂产物的一半是重组型，所以重组频率Rf=1/2(1-e-m)若m很小时，Rf=1/2Xm,2.真菌类的染色体作图,真菌和一次单细胞藻类特点：每一个减数分裂细胞产生的四分子都被包含在一个孢囊状结构中，很容易被分离，从中可以对每一减数分裂的产物进行分析。,5.2.1两个连锁基因的作图,对于无特定排列顺序的四分子遗传分析叫做无序四分子分析Xab杂交组合的子囊中，四分子的基因型分为：亲代双型（PD）非亲代双型（NPD）四型（TT）当a，b不连锁时，PD与NPD的频率相同；当a，b连锁时，PD频率远远大于NPD。同时，减数分裂中a，b间可能发生不交换（NCO）,单交换（SCO）,双交换(DCO)等。对于ab两位点间遗传作图的关键在于四线双交换产生的NPD类型。如果四种双交换类型是随机的，双交换类型的频率为：DCO=4NPDSCO=TT-DCO=TT-2NPD交换平均次数m=SCO+2DCO=TT+6NPD将m转为遗传图距单位：图距1/2m=1/2X(TT+6NPD),5.2.2三个连锁基因的作图,假设acb是按顺序相互连锁的3个基因，与acb杂交后，由于各种交换，会产生各种类型的四分孢子。由于三次以上的交换发生的频率很低，所以仅仅考虑零次交换到二次交换的情况：第一类（NCO）：产生的四分孢子全是亲本型（PD，亲代双型）第二类:SCO(a-c,c-b),DCO(双线)，产生两种重组型孢子，两种亲本型孢子（TT,四型）第三类:DCO(三线），产生三种重组型孢子，一种亲本型孢子（TT,四型）第四类:DCO(四线)，产生全为重组型孢子（TT,四型）,确定基因顺序：根据三点测验中，双线双交换恰好换掉中间基因的特点，用DCO(双线)TT型，确定基因顺序。遗传距离的估计：校正后的遗传距离：遗传图距1/2xm=1/2(TT+6NPD).但数据中没有典型的非亲代双型（NPD）.在三个连锁基因的作图，因为同时考虑三个基因位点间关系，所得到的观测值比两个基因连锁作图时，更接近真实遗传距离，所以可以直接计算重组值：Rf(a-c)=1/2TT+NPD,寻找a+/+c类型Rf(b-c)=1/2TT+NPD，寻找c+/+b类型,5.3红色面包霉染色体的着丝粒作图：“+”(n)+“-”(n)2n减数分裂四分子-四分子分析有丝分裂OOOOOOOO,图51红色面包霉的生活周期,着丝点作图:以着丝点作为一个位点，估算某一基因与着丝点的重组值，进行基因定位红色面包霉:野生型子囊孢子成熟后黑色(lys+或+)赖氨酸缺陷型子囊孢子成熟迟灰色(lys-或)Lys+Lys-,图52红色面包霉不同菌株杂交产生非交换型和交换型,MI模式：当基因与着丝粒之间没有交换时，一对等位基因在第一次减数分裂时分开，这种分离模式为MI模式。四分子中排列方式为aa+,+aa八分子中排列方式为aaaa+,+aaaaMII模式:当基因与着丝粒之间发生交换时，一对等位基因在第二次减数分裂时分开，这种分离模式为MII模式。四分子中排列方式为a+a+,+a+a八分子中排列方式为aa+aa+,+aa+aa,例如：对红色面包霉线性八分子分析：,1.+aaaa1252.aaaa+1303.+aa+aa134.+aaaa+95.aa+aa+126.aa+aa11,其中，36是a/+与着丝粒交换的结果，即MII型交换的结果。,在交换型子囊中，每发生一个交换，一个子囊中只有半数孢子与着丝点发生重组。1/2交换型子囊数交换值=交换型子囊数+非交换型子囊数,5.4红色面包霉的两基因分离,如abX+杂交的子囊类型与数目：见书P114.1.属于PD的子囊数目远远大于NPD子囊数目，说明a,b是连锁的。2.a,b基因与着丝粒的交换并不独立。如当a与着丝粒交换时（MII),b与着丝粒也有交换（MII)，见第4组数据.说明，a,b在染色体的同一臂上。3.当a与着丝粒无交换时（MI),b与着丝粒却有交换（MII)，见第3组数据.说明，a在着丝粒与b之间。4.a,b间遗传图距1