医学文献检索与利用ppt课件.ppt

医学文献检索与利用,1,主要内容,文献基本知识文献检索基本知识Pubmed检索中文文献检索全文数据库检索网络资源检索与利用论文写作,2,文献检索教学,意识：信息应用能力：信息检索与评价技能：检出效率、结果、技巧,3,知识更新速度,半衰期：18世纪为8090年1920世纪初30年20世纪60年代15年20世纪80年代5年21世纪初3年左右,4,文献数量,全世界每天发表的论文达1300014000篇，每年登记的新专利达70万项，每年出版的图书达50多万种。Pubmed文献：1980年28万1990年40万2000年53万2010年93万,5,6,问题,辽宁省所有高校名录低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)正常值P53基因碱基序列结直肠癌循证医学治疗方案,7,问题,最近科里有个比较棘手的病例，诊断为紫癜性肾炎(肾病型)，先后经过甲强龙、环磷酰胺冲击，口服雷公藤、骁悉等治疗，但血尿和蛋白尿仍无好转。科里的老师决定组织病例讨论会，研究下一步治疗方案，也要求每位研究生针对患者的实际情况查找相关文献，准备在会上发言。哪有时间查文献?何况文献的作者们也是百家争鸣，各执己见，很多观点只是推测而已。,8,摸索,下班之后，去了图书馆的计算机室，进入维普期刊数据库。在关键词中输入“紫癜性肾炎”，搜出了几千条索引。再输入“肾病综合征激素耐药”，又搜出了几千条当时就晕了，看来找到真正有价值的文献也不那么容易。,9,回归,我赶紧到现刊阅览室，把最新一期中国实用儿科杂志关于肾病综合症诊疗进展的专题仔细阅读了几遍，认真作了笔记。再回到电脑室有针对性地查找，这次终于找到了有价值的文献。回去之后，我认真学习了这些文献，渐渐对这个患者的诊治有了更深入的认识。,10,体会,我们的前辈和同行们，在工作中也同样遇到过许多亟待解决却又找不到现成答案的实际问题。他们把丰富的个人经验和最新的科研成果结合，针对具体患者的实际情况，提出了各种解决方案。,11,研究生信息需求（开题）,目的：了解国内外研究动态与进展，掌握前人研究成果，寻找课题设计思路和依据方法：1、准确描述研究背景信息需求：机构、人员、热点与趋势、相似研究的材料与方法2、识别与选择合适信息源：期刊、专著、会议、学位论文、专利、专业数据库、科研基金项目、学术论坛3、文献检索、获取全文：专业工具、数据库4、信息跟踪：Alert(注册，email);RSS(网络订阅）,12,文献基本知识,文献(documents，literature)：是记录有知识的一切载体文献组成四要素：记录知识的具体内容记录知识的手段：如文字、图像、符号、声频、视频等记录知识的物质载体：纸张、光盘、录像带等记录知识的表现形态：图书、期刊、专利说明书等,13,文献的作用,积累、继承和交流作用科学研究的依据评价医学科技人员造诣的依据评价一个国家、单位的医学科技发展水平的依据领导决策的依据优先权作用,14,文献信息特点,数量庞大增长迅速分布分散内容交叉重复类型多样新陈代谢加快语种复杂性增加交流速度加快,15,文献基本知识,文献类型及其特点1.按载体划分:印刷型:book,serials,proceedings,thesis,patent,tech.Reports非印刷型:microfilm,A-Vmaterials,e-j2.按内容加工深度:一次文献,二次文献,三次文献,零次文献3、按文献获取难以程度：白色文献、灰色文献、黑色文献,16,图书,教材（textbook)根据各专业的教学需要，阐述某一学科或专业的基本知识的教学用书，基本按教学大纲编写只介绍基础知识和公认的见解，内容相对稳定，阐述系统完整，表达概括清楚，能使人获得有关学科领域的一般知识专著（monograph)针对某一专门题目分章节做出系统深入全面叙述的一种著作外文名著与著名出版社参考工具书（Referencebooks)根据一定需要收集有关资料并按特定的方法编排起来供人查考的文献（查考性、概括性、易检性）,17,参考工具书,字典、词典（dictionary)百科全书（encyclopedia)年鉴（yearbook,manual,almanac)手册（handbook)指南（directory)药学工具书：药典Martindale:Extrapharmacopiea,手册MerckIndex,字典中药大辞典,18,期刊(Periodical，Journal，magazine),特点：连续出版发行有固定的名称（刊名）相对固定的版式、篇幅和内容范围按一定的卷期号或年月顺序号连续出版内容：每期发表多个作者的多篇文章，内容不重复作者众多内容新颖、出版周期短，通报速度快信息量大，约占整个信息量的70%,19,医学期刊类型,按出版周期划分按内容功能划分：学术、检索、综述按学科类别划分按出版机构划分按载体形态划分,20,期刊文献类型,论著(originalarticle,journalarticle)综述(review)短篇报道(shortreport,briefcommunication)病例报告来信(letter)编者述评(editorial)更正(comment)摘要(abstract)消息(news)讲座(lecture,guide)书评(bookreview),21,期刊论文质量要求,主要看其“三性”：创新性、科学性、规范性论文内容上是否有创新性；科学性：目的明确、方法清楚、推导论证合理、结果真实、结论严谨、不夸大不延伸；规范性：论文的格式、语言文字、学术名词、量与单位、图表等论文评价标准：发表刊物、被引频次、下载次数、参考文献质量及时间专家评议：F1000,22,期刊(Periodical）,核心期刊研究中文核心期刊要目总览4/evaluation/中国科学引文数据库（CSCD）中国科技论文引文数据库（CSTPC）,23,期刊学术水平评价指标JCR,出版机构学术背景编辑部及编委组成作者组成基金论文比例出版频率发行量,24,期刊学术水平评价指标,国内外检索工具收录情况(Indexed)总被引频次(citedtimes)影响因子(IF)载文量(sourceitem)文摘率阅览利用率,25,期刊评价方法,文摘法引文法专家调查法流通统计法其它,26,文献组织与分类,学科分类:中国图书馆分类法R1预防医学、卫生学R2中国医学R3基础医学R4临床医学R5内科学R6外科学R7妇产科学R72儿科学R73肿瘤学R74神经病学与精神病学R75皮肤病学与性病学R76耳鼻咽喉科学R77眼科R78口腔科学R8特种医学R9药学,27,R医药、卫生.（第一级类目）R5内科学.（第二级类目）R56呼吸系及胸部系统疾病.（第三级类目）R563肺疾病.（第四级类目）R563.1肺炎.（第五级类目）R563.1+1大叶性肺炎.（第六级类目）,28,中国图书馆分类法,5大部类，22大类，6个总论复分表，30多个专类复分表、55811条类目混合小数层累制：复分表：对于临床各科（R5-R8），有专门复分表：01预防、控制和卫生02病理学、病因学03微生物学、免疫学04诊断学05治疗学06并发症07预后08诊疗器械、用具09康复例：R563.1-05肺炎治疗学,29,文献组织,标识词组织法keyword:同义词、近义词subjectheadings:唯一性textword:checktags:animal,human,30,检索语言,描述文献特征和表达检索提问的专用语言类型：组合方法：先组式（分类、标题词）、后组式（单元词、叙词）规范程度：规范（类目、主题词）、非规范（关键词、单元词）描述特征：内容（分类、主题）、外部（书名、作者、序号）本体语言（ontology),31,检索步骤,确定完整的题目：(综述原始研究)aspirin的药理学研究肝纤维化患者血清或肝组织内转移生长因子的检测及其临床意义分析检索目的、要求：了解背景、现状、基本知识提炼名词术语：选择检索工具：确定检索途径：制定检索策略：检索文献：获取全文：根据文献修正检索策略并重新检索文献：,32,文献检索基本知识,计算机检索工具：非印刷型数据库：数值型:CDC事实型:PDQ文献型:全文(fulltext):Springer检索型：pubmed,CBM,33,文献信息检索效果的评价,查全率:（recall）：指系统在进行某一检索时，检出的相关文献量占系统文献库中相关文献量的比率，反映该系统文献库中实有的相关文献量在多大程度上被检索出来。R（检出相关文献量/系统中相关文献总量）100%查准率（precision):指系统在进行某一检索时，检出的相关文献量占检出的文献总量的比率，反映每次从该系统文献库中实际检出的全部文献中有多少是相关的。P=(检出相关文献量/检出文献总量)100%查全率和查准率之间存在互逆关系。如果一检索工具的查全率较高，则其查准率将相对下降；反之查准率高，则查全率低。查全率和查准率只能相对提高，二者永远不可能同时达到100%。,34,文献信息检索工具的类型及特点,目录：bibliography题录：title摘要：abstract索引：index全文：Full-text,35,检索方法,工具法：优点：查全、查准缺点：收录范围、时差、检索途径浏览法：优点：获得最新文献缺点：遗漏文献追溯法：利用参考文献查找资料优点：扩大查找范围缺点：片面、遗漏文献,36,检索途径,Authorname:姓在前全称，名首字母缩写Title:Address:Keyword:Mesh（MedicalSubjectHeadings):Abstract:Grant:Publicationyear:Volume,issue:Subheadings:83个Source:,37,计算机文献检索,数据库类型及其构成databasefilerecordfield计算机检索技术逻辑运算：NOT,AND,OR,()字符运算：通配符：?(colo?r,wom?n,rat?)截词符：(transplant*,pregnan*)邻近运算：near,with,same字段限定：，IN其它：词组限定、扩展检索、加权检索、精确与模糊检索、跨库检索,38,检索策略构建,分析检索课题，明确检索要求：内容、信息类型、限定条件选择检索工具，确定检索途径：编制检索表达式：检索结果评价，调整检索策略：获取全文：,39,检索策略制定,检索词提炼与转换：怀孕妊娠，子宫纤维瘤活性、降解、吸收普查、防治逻辑组织：因果关系：阿司匹林致胃溃疡眼结核致失明相关关系：眼弓形体病并发青光眼幽门螺旋杆菌与胃溃疡应用关系：维生素C对哮喘的治疗作用,40,阿司匹林致胃溃疡阿司匹林副作用AND胃溃疡病因学，化学诱导眼结核致失明眼结核并发症AND盲病因学眼弓形体病并发青光眼弓形体病并发症AND青光眼并发症,41,幽门螺旋杆菌与胃溃疡幽门螺旋杆菌微生物学AND胃溃疡病因学，病理学维生素C对哮喘的治疗作用维生素C治疗应用AND哮喘药物疗法,42,计算机检索注意事项,多个检索词逐个分步检索，最后用逻辑运算组合肺纤维化细胞因子肺泡灌洗液#1AND#2AND#3选择检索字段并利用二次检索功能充分利用各种限定功能注意检索结果的存储与打印处理格式,43,全文获取,本馆馆藏网络数据库馆际互借（NSTL)网络免费资源与作者联系其它,44,pubmed,/pubmed//文献来源：medline:有meshin-processcitations：无mesholdmedline：有meshpublishersupplied:无mesh,45,pubmed检索方法,一般检索：术语，作者姓名自动匹配功能：mesh-journal-phrase-author-拆分术语用AND组合截词运算：不包括空格词组，关闭自动匹配功能，不能主题扩展词组：“”，包括主题但不扩展，拆分组合限定检索方式：词组、主题词、字段、辅助命令：limit,preview/index,history,clipboard,detail,display,sendSinglecitation,batchcitation,clinicalqueriesRSS,PMC,myNCBI结果处理格式,46,练习题,工具:CBM,PUBMED近五年有关高血压遗传学研究的综述文献心功衰竭的体外反博疗法临床研究文献肝纤维化患者肝组织或血清中转移生长因子的检测方法及其临床意义研究文献,47,练习题,肺动脉高压药物治疗现状慢性乙型肝炎的免疫治疗进展C反应蛋白与糖尿病血管并发症的关系骨髓干细胞治疗心肌梗死的研究与展望,48,生物信息学数据库,Entrez:/SRS:www.lionbio.co.uk/publicsrs/序列数据库结构数据库基因组数据库文献数据库其他二次数据库,49,中国生物医学文献数据库（CBM),文献来源：国内出版生物医学刊物数据库类型：检索型，可链接全文数据库主要特点：同pubmed,有分类检索检索链接：作者、期刊、关键词、特征词、主题词和副主题词、相关文献主题词：医学主题词表、中国中医药学主题词表分类：中国图书馆分类法医学专业分类表缺省：题目、主题词、关键词、文摘、刊名,50,中国知网（CNKI）,按学科分专辑：全文型数据库检索方法：初级检索、高级检索、专业检索检索途径：主题、篇名、关键词、摘要、作者、第一责任人、单位、刊名、参考文献、全文、年、期、基金、中图分类号、ISSN、统一刊号主题途径：中英文篇名、中英文关键词、机标关键词、中英文摘要关键词：中文关键词、英文关键词、机标关键词结果超链：作者、机构、关键词（中英文）、知网节注意事项：精确与模糊、增加检索项、词频、最近词、扩展词,51,万方数据,分G网与医学网（中华系列）全文数据库（可跨库检索）期刊论文可做主题词、副主题词检索附加服务：作者空间、机构空间、关键词导航,52,检索工具,常用工具：pubmed,BA(BIOSIS),CA(SciFinder),SCICBM全文数据库收录范围：检索途径：结果处理方式：检索辅助命令：,53,文献检索型数据库检索,检索型数据库：如PUBMED、SCI、BA特点：收录某一学科的全部或大部分各语种文献，文献类型和数量多文献格式规范，著录标准文献标引全面、深入，揭示完整、规范检索途径多，检索策略规范，可应用多种技术检索文献检索结果多为题录或摘要，几乎不提供全文,54,全文数据库：如EBSCO、OVID、CNKI、万方数据库,收录特定某一出版集团出版或代理商代理的全部或部分期刊，收录文献的数量和范围都有限文献格式不规范，著录标准不严格文献标引不全面、深入检索途径少，可应用的检索技术少，一般仅有二次检索功能检索结果为全文，可提供全文文献,55,全文数据库使用,收录文献范围检索途径是否提供二次检索或相应手段浏览器类型,56,检索策略,选词：主次-词性（主题词、关键词、自由词-相关词（同义词、近义词）-词义转换组合：逻辑运算、字符运算、限定检索实施策略修订：重新选择合适的词及检索途径,57,扩检方法,OR组配主题词扩展去掉副主题词减少限制使用自由词字符运算(*、?),58,缩检方法,AND组配加权检索，使用主要主题词增加副主题词增加限制使用专指主题词使用文中词,59,文献整理,EndnoteRefviz,60,科技查新,查新题目委托：立题、立项、成果、论文项目申报级别：国家、省、市、校查新材料汇总：论文、报告、总结查新要点：突出成果查新范围：文献类型、