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化学信息学绪论食品安全事件之敌敌畏火腿2003年11月,“金华火腿敌敌畏”事件被曝光,金华市的两家火腿生产企业在生产“反季节腿”时,为了避免蚊虫叮咬和生蛆在制作过程中添加了剧毒农药敌敌畏。该事件导致金华市经营千年的城市名片瞬间蒙垢。食品安全事件之“苏丹红”2005年3月,上海市相关部门在对肯德基多家餐厅进行抽检时,发现新奥尔良鸡翅和新奥尔良鸡腿堡调料中含有“苏丹红一号”成分。事发后,肯德基餐厅停止售卖这两种产品,同时销毁所有剩余调料。”食品安全事件之三聚氰胺奶粉2009年1月,三鹿“三聚氰胺奶粉”案终审宣判。自08年7月始,全国各地陆续收治婴儿泌尿系统结石患者多达1000余人,9月11日,卫生部调查证实这是由于三鹿集团生产婴幼儿配方奶粉受三聚氰胺污染所致。食品安全事件之瘦肉精“瘦肉精” :瘦肉精是一类动物用药,例如莱克多巴胺(Ractopamine)及克伦特罗(Clenbuterol)等。将瘦肉精添加于饲料中,可以增加动物的瘦肉量。今年3月,媒体报道河南省孟州市等地养猪场采用违禁动物药品“瘦肉精”饲养生猪,有毒猪肉流入济源双汇食品有限公司。上述有毒物质检测、污染物检测、化学品合成、基因检测,该如何实现呢?求助于网络?报纸?杂志?期刊?求助于别人? 你是否会经常遇到下列问题& 如何使用网络数据库或电子资源?& 如何获取原文?& 我可以使用的免费资源有哪些?& 如何科学、合理地确定检索词、检索式? 目前,我们正进入一个飞速发展的信息时代。能否广泛、迅速地获取所需要的信息直接影响到科研、教学工作的效率与成败。在较短的时间里获取最有价值的信息,是每一位现代科技工作者必须具备的基本能力。从狭义上讲,在茫茫信息海洋中快速获取对自己有价值的信息主要取决于两个因素,一是了解掌握现有的信息源,即到什么地方去找自己需要的信息;二是用什么方法找,即如何获得信息。从广义上讲,信息获取的速度,获取知识的全面性和准确性,还取决于对本专业知识的了解和掌握情况,取决于对信息的表述语言(常常是某一种外语,如英语、日语)的掌握情况。在当今信息爆炸的时代,信息量随着时间的推移,急剧增加;随着计算机技术、电子技术的飞速发展,越来越多的信息存储于计算机软盘、硬盘或光盘上,并建立了相应的信息检索系统,即数据库检索系统,从而使信息的存储量更大、检索更方便。不同的信息开发商所收集的信息的专业领域常常有所不同,其检索系统、检索方法也不尽相同。因此我们要重点学习这些著名数据库的信息收集范围、检索系统的检索方法。随着INTERNE的出现与普及,特别是Web技术的发展,越来越多的专业信息数据库通过浏览器提供检索服务,从而使检索方法更简单,因此,Web界面下的信息检索是查找所需信息的重要环节。 由于还有相当比例的信息是以纸本形式存在的,这些印刷版的信息检索工具,可以满足那些没有条件进行计算机检索的读者,因此,我们必须了解它、掌握其使用方法。什么是化学信息学(chemoinformatics)?化学信息学是在信息科学与计算机科学、互联网高速发展的前提下近几年快速成长的化学化工与信息科学、计算机科学的边缘交叉学科。化学信息主要分为化学物质的化学信息和媒体形式的化学信息。前者是利用科学的原理和方法通过测量得到的化学成分的相关信息,如物质的物理、化学性质,物质中各成分的定性、定量以及结构信息,分子间的相互作用信息(包括化学反应信息) 等。 化学信息学是化学领域中近几年发展起来的一个新的分支,是建立在多学科基础上的交叉学科,利用计算机技术和计算机网络技术,对化学信息进行表示,管理,分析,模拟和传播,以实现化学信息的提取,转化与共享,揭示化学信息的实质与内在联系,促进化学学科的知识创新。化学信息学研究领域邵学广等认为化学信息学的研究内容主要包括:利用计算机技术和计算机网络技术对化学信息进行表示和管理;利用计算机网络技术对化学信息进行搜集、传播和共享;化学体系的计算机模拟和建模;利用计算机技术对复杂的化学信息进行解析,以快捷方便的方式最大限度地提取和利用信息。化学信息学的研究领域为:应用计算机方法或信息解决化学问题,对化学信息进行有效的存储、操作和处理,使化学信息合理地提升为化学知识。信息资源检索的意义和作用学习化学信息学的目的,就是要培养学生的信息意识和提高获取信息的能力。化学信息的检索、管理和利用具有以下的重要作用和意义:1. 启迪作用2. 拓宽视野3. 培养能力4. 培养素质部分化学信息学教材第二节 电子信息和数据库1. 电子信息电子信息资源主要是指通过计算机等设备以数字信号传递的数字信息资源组成的数据库。从信息检索的角度,数据库信息资源可分为:u 联机信息资源(联机信息检索)u 光盘信息资源(光盘信息检索)u Internet网络信息资源( Internet网络信息检索)联机信息资源检索联机信息资源始于20世纪50-70年代,用户使用检索终端设备,通过通信设施,与远程计算机相连,检索远程数据库中的信息资源,实现电子信息资源的远距离传输,使信息资源在全球范围内得到广泛的传播和高度共享。联机检索是指用户利用计算机检索终端设备, 通过拨号、电信专线及计算机互联网络, 从联机服务中心国际或国内的数据库中检索出自己所需要的信息的过程。检索是以人机对话的方式进行的, 用户在自己的终端上输人检索提问式, 联机服务中心的计算机就可以立即处理用户的请求, 在数据库中查找符合用户提问的数据, 并将检索结果回送至用户的检索终端上。用户可以随时修改检索提问, 直至获得满意的结果, 并可通过打印或传输立即得到检索的最终结果。联机信息资源检索优点:u 检索速度快、节省时间。u 不受地理位置的限制,实时检索。u 实现人机对话。u 检索质量高。u 检索内容新。联机信息资源检索缺点:u 检索费用较高。常见的收费项目包括计算机信息检索系统的机时费、文献记录的输出费以及通信网络使用费等, 尤其是使用国际联机检索系统, 通信费用更高。常用的联机信息检索系统:u Dialog系统:此系统是目前世界上最大的国际性联机检索服务机构, 总部设在美国旧金山附近的Paloalto市。数据库总数近千个,内容涉及自然科学、社会科学、工程技术、人文科学、事实报道及商业经济等领域。u Orbit系统是目前世界上第二大联机检索系统, 约有100个数据库, 分书目库、指南库和词典库, 是多学科的信息检索服务系统。u BRS系统的前身为纽约州立大学生物医学通信网,是一个综合性计算机联机书目检索服务中心, 有多个数据库, 其收集的重点在医学、药物学和生命科学方面, 也提供工程科学、教育、商业等数据库, 并独家经营工业标准和技术规范方面的数据库。u ESA一IRS系统, 即欧洲空间组织情报检索服务中心。它是欧洲最大的情报检索系统, 也是世界上第三大联机情报检索系统, 其总部现设在意大利的弗拉斯卡蒂, 目前拥有多个数据库, 大多为文献数据库, 也有部分指南数据库和数值数据库。u STN系统即国际科技信息网络。目前是世界著名的国际联机检索系统之一。 创建于1983年,提供完全的科技信息领域的在线服务。它是由美国化学文摘社CAS、德国卡尔斯鲁厄专业信息中心FIZ-Karlsruhe和日本科技情报中心JST共同合作经营的跨国网络数据库公司,是世界著名的国际联机检索系统之一。数据库类型有:书目型、全文型、名录型、数值型和混合型。有超过200个数据库。专业范围涉及: 化学化工、生命科学、生物技术、医药、农业、食品科技、工程技术、材料科学、计算机科学、电子技术、环境科学、地质学、数学、物理、能源、航空航天、人文科学和专利技术等,此外也有商情信息,如化工产品、医药、公司信息等。 u OCLC即联机计算机图书馆中心,总部设在美国的俄亥俄州,是世界上最大的提供文献信息服务的机构之一,它是一个非赢利的组织,以推动更多的人检索世界上的信息、实现资源共享并减少使用信息的费用为主要目的。光盘信息资源检索光盘信息是指存储于单机版光盘上的信息资源。光盘检索是指利用计算机设备对只读式光盘数据库一进行检索。是一种高密度的信息载体, 尤其是只读光盘作为数据库的存储媒介是非常合适的。缺点:u 数据库的更新较之联机检索系统明显落后。一般的更新周期为个月, 联机检索系统则可做到每日更新。u 光盘检索系统一次性投入资金较多。优点:u 存储密度高, 容量大。u 存取信息速率高, 能在瞬间完成检索。u 保存期长, 可反复使用, 不影响数据质量, 使用寿命长达年之上。u 价格低, 体积小, 便于携带, 便于复制。u 规格统一, 购买光盘时不必担心配套问题。u 自成体系, 光盘系统可以是一个独立的计算机系统, 单机光盘检索或小范围内的光盘网均可不受通信条件限制。u 操作界面友好, 易学易用。u 数据转录灵活方便。u 节省费用。因不受机时限制, 检索费用相对较低, 操作简单灵活, 允许反复修改检索策略, 能及时打印检索结果。u 采用人机交互式方式。常用光盘信息检索系统u 化学文摘光盘数据库(CA)。是由美国化学学会制作, 文摘内容对应于书本式化学文摘, 年文献量达773000条, 其中约123000条专利, 数据库文献内容及索引信息按月更新, 主要收录了世界范围内有关生物化学、物理化学、无机化学、有机化学等许多有关化学及化工方面的科技文献, 文献主要来自世界各国的科技期刊、专利、会议录、政府报告、学位论文和图书资料。u 工程索引光盘数据库(EI)。是由美国Knight Ridder公司出版, 使用KR-Ondisc system检索软件。主要收录工程技术类期刊5400多种、会议录2000多种, 技术报告、科技图书、学位论文等也有报道, 内容覆盖应用物理、光学技术、航空航天、土木、机械、电工、电子、计算机、控制、石油化工、动力能源、汽车船舶、采矿冶金、材料等领域。u 科学文摘光盘数据库(INSTEC), 是由美国UMI公司出版, 并采用“ProQuest”检索软件, 与印刷版文摘期刊科学文摘相对应;科学引文索引光盘数据库(SCI), 是由美国科学情报(ISI)所出版, 并使用ISI自己的检索软件。Internet网络信息资源Internet使用TCP/IP标准通信协议将全世界的计算机和计算机互联网互联,构成一个资源丰富的信息库。网络信息资源是指通过计算机网络可以利用的各种信息资源的总和。优点: 信息检索空间的拓宽。 交互式作业方式。 用户界面友好且操作方便。缺点: 检索结果中的误检率较高。 信息量大, 但也同时产生了信息污染、信息垃圾, 往往让读者对信息的真伪难以辨别。 网络通信费用较高。2.数据库数据库是以特定方式合理组织相互关联的数据集合。按所提供的化学信息内容,数据库主要可分为:u 文献数据库:存储参考文献信息的数据库,分为 书目数据库:SpringerLink,SD,Wiley等 全文数据库:ACS,RSC,SD,Wiley,SpringerLink等 专利数据库:USPTO,espcenet等u 事实数据库:存储和检索化合物的原始数据,有WebBook,Specinfo,Chemline,UForDAT,等。u 结构数据库:存储化合物的结构信息,有ICSD,CSD等。3. 在线化学数据库CA,Medline,Beilstein,DETHERM,Gmelin,WebBook,SpecInfo,KnowItAll,SDBS,CSD,ICSD,CASREACT,ChemInformRX,ChemReact等。第三节 信息检索的方法和技术1. 信息检索的方法普查法一种常规的信息检索方法。主要是根据不同的课题要求、不同的检索环境条件,选择最适当的工具(数据库)进行检索,常规步骤包括:检索课题的分析、检索策略的制定、检索策略的实施和调整、检索结果的筛选和整理、原始信息的获取等。普查法的成功关键在于正确的选择检索词,并选择合适的逻辑运算符选择关键词,构建一个合理地检索表达式,由近及远进行检索。追溯法以某一文献后所附的参考文献为线索,逐一追查原文;再根据这些原文后的参考文献逐渐扩大线索,不断追查下去,获得相关文献的方法。用追溯法查找文献可以以各种引文索引为工具,也可利用述评、总结性文章后面的参考文献。一般在没有适用的检索工具或检索工具不完备的情况下,利用追溯法可获得一批相关文献。相关法某些数据库带有相关检索的功能。可对检索结果的某一个文献记录提供相关记录的检索,并根据参考文献的相同的数目的多少排列检索结果的文献记录。如Web of Knowledge,Wiley-Blackwell等。跟踪法根据看文献实践,可获得某一领域中发表论文数量多且质量高的作者姓名,再使用该姓名继续进行检索该作者的所有文献,从中选择需要的部分,并定期跟踪该专家的最新研究结果。2. 信息检索技术布尔逻辑符检索(Boolean Operators):用布尔逻辑算符将检索词(关键词、主题词)、短语或代码进行逻辑组配,凡符合逻辑组配所规定条件的为命中文献,否则为非命中文献。它是信息检索中最常用的一种检索方法。逻辑算符主要有: .逻辑“与”(AND 或 *) 用于表达两个或两个以上检索词(关键词、主题词)之间的相交关系或限定关系运算。逻辑与检索能增强检索的专指性,使检索范围缩小。 2.逻辑“或”(OR或 + )用于表达两个或两个以上检索词(关键词、主题词)之间的并列关系。运算逻辑或检索扩大了检索范围,提高检索信息的查全率。此算符适于连接有同义关系或相关关系的词。 3.逻辑“非”(NOT或-)用于表达两个或两个以上检索词(关键词、主题词)之间中排除不需要的检索词(关键词、主题词)运算,可以缩小检索范围,增强检索的准确性。此运算适于排除那些含有某个指定检索词(关键词、主题词)的记录。但如果使用不当,将会排除有用文献,从而导致漏检。 对于一个复杂的逻辑检索式,检索系统的处理是从左向右进行的。在一个检索式中,可以同时使用多个逻辑运算符,构成一个复合逻辑检索式。复合逻辑检索式中,运算优先级别从高至低依次是非、与、或。可以使用括弧改变运算顺序。截词检索算符:在实际检索中,常遇到词干相同、词义相近的检索词,或同一词的单、复数形式,动、名词形式,英美拼法等,所谓截词检索,就是将通配符如“*”、“?”或“$”等等,放在检索词中检索者认为合适的地方截断,用截断的词的一个局部进行检索,并认为凡满足这个词局部中的所有字符(串)的文献,都为命中文献。这样,检索者不必输入完整的检索词。截词方式有多种,按截断的字符数量分,有有限截断和无限截断;按截断的位置分,有后截断、前截断、中间截断。后截断,是将截词符号放在一个字符串的右方,满足截词符左方所有字符的记录都为命中记录。从性质上讲,这是一种前方一致的检索。前截断,是将截词符放在一个字符串的左方,表示其右的有限或无限个字符不影响该字符串的检索,或者说这是一种后方一致检索,对汉语中的复合词组的检索非常方便。前截断和后截断可以结合使用,即中间一致检索。所谓有限截词,是在检索词后截去有限的字母,例如输入computer? ?,表示“?”可以有0-1个字母变化,系统即检出带有computer和computers的文献;输入stud? ?,表示截三个字母,可检索出带有study, studies, studied和studing等的文献。无限截词是在检索词根后加一个“?”,表示该词后带任意字母的词都需要,如输入comput? 则可检出含有computers, computing, computered等的文献。限制检索算符:在编制检索式时,使用字段限制检索符可以限定检索词在数据库中出现的范围,对命中太多的记录再行筛选。如检索式:AU=Gordon? AND PY=199?,表示查找Gordon所写的、于1990年后发表的所有文献。这种字段检索可由代表文献内容特征的基本索引(Basic Index)字段和代表文献外表特征的辅助索引(Additional Index)字段中的单元词(Word)或多元词(Phrase)构成,前者含有所有与主题内容相关的词,如书目型数据库中的题目、文摘、规范词字段中的叙词等,后者含有记录中除基本索引字段外的那部分信息,如作者、语种、出版年等。位置逻辑检索算符又称全文查找逻辑算符,相邻度检索算符,原文检索符。由于布尔检索的“AND”运算要求AND两边的检索词在同一记录中同时存在才能命中文献,这就可能会引起误组配而造成大量误检,而位置逻辑检索是以原始记录中检索词与检索词间特定的位置关系为逻辑运算的对象,检索词用位置算符相连,就可以弥补布尔检索的缺陷。此外,这种检索也不必依赖先组式词表而直接使用自由词进行检索,因而可使检索结果更准确。第四节 文献类型及识别文献信息源的分类:按文献信息源的出版形式划分 图书 期刊 专利文献 科技报告 学位论文 其它按文献信息源的载体形式划分 手写型 印刷型 缩微型 声像型 电子型按对文献信息的加工深度划分 零次文献 一次文献 二次文献 三次文献1. 不同存储载体的信息资源印刷型文献利用纸张为存储介质,以手写、印刷为记录手段而产生的文献。包括油印、铅印、胶印、复印等印刷品及手稿。 载体:纸张实例:教科书记录手段:油印、石印、铅印、胶印、复印特点:可直接阅读,方便使用;但难于实现机械化和自动化;收藏文献占用空间大。缩微型文献是以感光材料为存储介质,利用缩微照相技术使文献缩微化的文献。 载体:感光材料 实例:缩微平片、缩微胶片记录手段:光学缩微技术特点:体积小;价格低;不能直接阅读声像型文献以磁性或感光材料为存储介质,利用特定的设备及技术,直接记录声音、图像信息的文献。 载体:磁性材料、感光材料实例:录像带、幻灯片记录手段:磁记录、光学技术特点:直观、生动、形象;成本高;不易检索和更新电子型文献以电子数据的方式将图、文、声、像等信息存储在磁光介质上,通过网络通信、计算机或类似设备再现的信息资源。载体:磁性材料实例:磁盘、光盘记录手段:计算机输入特点:存储密度高、速度快;易复制;成本高;不能直接阅读。2. 不同出版形式及内容的文献信息图书凡篇幅达48页以上并构一个书目单元的文献称为图书。国际标准书号(InternationalStandardBookNumber)的简称,是专门为识别图书等文献而设计的国际编号。国际标准书号(ISBN) 期刊期刊又称杂志,它是指采用统一名称定期或不定期出版的连续性出版物。ISSN(国际标准连续出版物编号,International Standard Serial Number)是根据国际标准ISO3297制定的连续出版物国际标准编码,其目的是使世界上每一种不同题名、不同版本的连续出版物都有一个国际性的唯一代码标识。 国际标准刊号( ISSN ) 国内统一刊号CN CN刊号标准格式是:CNXX-XXXX 前两位是各省(区、市)区号,北京 11 ;山东 37后四位是序号,一律从00019999,其中00010999为报纸,10005999为印刷版连续出版物,60008999为网络连续出版物,90009999为有形电子出版物(如:光盘)。 国内正式期刊的刊号是由国际标准刊号(ISSN)和国内统一刊号(CN)两部分组成,只有ISSN国际刊号而无国内统一刊号的期刊在国内被视为非法出版物。 报纸是以报道新闻及评论为主,出版周期比期刊更短,多为活页性连续出版物。其特点是内容丰富、信息量大、出版迅速、发行量大、读者众多。年度出版物年度出版物汇集年内重要资料,每年出版一次。它包括年报、年鉴及按年度出版、修订的百科全书等。特点:内容较为系统,资料性强、便于检索。科技报告 科技报告是科技工作者对科学、技术研究结果或研究进展的记录。 科技报告的特点(1)反映新的科研成果迅速;(2)内容多样化;(3)质量参差不齐;(4)保密性强;(5)每份报告独立成册,有连续编号。会议文献会议文献是指在各种会议上宣读、交流的论文、报告及其它有关文献。政府出版物政府出版物是指由政府机构制作出版或由政府指定出版商出版的文献。政府出版物的类型(1)行政性文件(2)科技文献专利文献专利文献是指实行专利制度的国家申请、审批专利过程中所产生的专利申请书、说明书及官方文件或出版物。其中最重要的是专利说明书。标准文献与标准化活动有关的一切文献都称为标准文献。其主体是标准,还包括标准形成过程的各种档案、宣传推广标准的手册及其它出版物。标准是按规定程序制订,经权威机构公认或主管部门批准的在特定范围内执行的规格、规则、技术要求等规范性文件。公司产品资料指厂商为推销产品而印制的各种宣传资料、技术资料。如公司介绍、产品目录、样本、说明书等,它反映厂家、公司及产品的有关信息,对产品采购,仪器设备的维护、使用及新产品开发具有重要价值。3. 不同加工层次的文献信息一次文献作者以自己的研究成果为基础创作或撰写,并通过某种渠道而公开的文献;对知识的第一次加工;具有创造性;大多数期刊论文、科技报告、学位论文、会议文献、专利文献、技术档案等。二次文献对一次文献进行浓缩、整序及加工处理而成的具有报道和检索作用的文献;对知识的第二次加工;有序化;提供一次文献线索;目录、题录、文摘等检索工具。三次文献指从一次文献中提取数据、事实和有关结论,并经过综合分析与重新组合而编写的文献。对知识的再加工;提供文献检索;综述、专著;字词典、百科全书零次文献指未经公开发表或未交流于社会的文献;论文草稿、谈话记录、实验记录、书信科技文献信息源举例全文数据库:一种一次文献数据库,能够直接为用户提供原始资料或具体数据。 内容新颖丰富 叙述具体详尽 参考价值大 数量庞大 分散美国化学会(The American Chemical Society 简称ACS) 是一个化学领域的专业组织,成立于1876年。现有163000位来自化学界各个分支的会员。美国化学会每年举行两次涵盖化学各方向的年会,并有许多规模稍小的专业研讨会。 美国化学会拥有许多期刊,其中美国化学会志(Journal of the American Chemical Society)已有128年历史。ACS全部45种期刊都有了网络版。ACS旗下期刊基本都是化学界的领军刊物。如the Journal of the American Chemical Society,Analytical Chemistry,Chemical Reviews,Environmental Science & Technology,Inorganic Chemistry,Journal of Agricultural and Food Chemistry,The Journal of Organic Chemistry,The Journal of Physical Chemistry ABC,Macromolecules,ACS Nano,Nano Letter等。RSC(英国皇家化学学会)(Royal Society of Chemistry,简称RSC)是欧洲最大的化学组织。该协会成立于1841年,由约4.5万名化学研究人员、教师、工业家组成的专业学术团体,出版的期刊及数据库一向是化学领域的核心期刊和权威性的数据库。其出版的期刊及数据库是化学领域的核心期刊和权威性数据库,共包括24种电子期刊、4种数据库,RSC期刊大部分被SCI收录,在被引用次数最多的化学期刊之列。RSC 电子期刊与资料库主要以化学为核心及其相关主题,包括:Analytical Chemistry (分析化学), Physical Chemistry (物理化学), Inorganic Chemistry (无机化学), Organic Chemistry (有机化学), Biochemistry (生物化学), Polymer Chemistry (高分子化学), Materials Science (材料科学), Applied Chemistry (应用化学), Chem. Engineering (化学工程), Medicinal chemistry (药物化学)。爱思唯尔()是一家经营科学、技术和医学信息产品及出版服务的世界一流出版集团。通过与全球的科技与医学机构的合作,公司每年出版2000多种期刊和1900种新书,以及一系列创新性的电子产品,如ScienceDirect 、Scopus、MD Consult、在线参考书目等。公司“树下老人”的Logo象征:老人象征研究的学者;榆树葡萄藤象征出版的丰硕的智慧;Nonsolus,是指not alone,老人手握葡萄藤,象征老人(研究的学者)和榆树(出版成果)需共存而相辅相成。John Wiley & Sons Inc.(约翰威立父子出版公司)1807年创立于美国, 是全球历史最悠久最知名的学术出版商之一,享有世界第一大独立的学术图书出版商和第三大学术期刊出版商的美誉。Wiley Online Library是John Wiley & Sons Inc 的学术出版物的在线平台,提供包括:化学化工生命科学医学高分子及材料学工程学数学及统计学物理及天文学地球及环境科学计算机科学工商管理法律教育学心理学社会学等14学科领域的学术出版物。该出版公司出版的学术期刊质量很高,尤其在化学化工生命科学高分子及材料学工程学医学等领域。目前出版的近500种期刊中,2005年有一半以上被SCI、SSCI、和EI收录。德国斯普林格(Springer-Verlag)出版社是世界上最大的科技出版社之一,始创于1842年,以出版学术性出版物而闻名于世,它也是最早将纸本期刊做成电子版发行的出版商。Springer Link系统就是通过www发行的电子全文期刊检索系统,有2000余种期刊,划分成11个出色的在线图书馆,分别是:化学、计算机科学、经济学、工程学、环境科学、地理学、法学、生命科学、数学、医学、物理学和天文学。ProQuest学位论文(一次文献)ProQuest公司是世界上最早及最大的博硕士论文收藏和供应商,该公司的ProQuest Dissertations and Theses(PQDT)数据库收录有200多万篇国外高校博硕士论文的文摘索引。国内若干图书馆、文献收藏单位每年联合购买一定数量的ProQuest学位论文全文,提供网络共享。目前,该库收录国外博硕士学位论文逾20万篇,年增1万多篇。中文数据库(一次文献)电子图书数据库(一次文献)专利数据库(一次文献)标准数据库(一次文献)科学引文索引美国科学引文索引(Science Citation Index, 简称 SCI )于1957 年由美国科学信息研究所(Institute for Scientific Information, 简称 ISI)在美国费城创办,是由美国科学信息研究所(ISI)1961年创办出版的引文数据库.SCI(科学引文索引 )、EI(工程索引 )、ISTP(科技会议录索引 ) 是世界著名的三大科技文献检索系统,是国际公认的进行科学统计与科学评价的主要检索工具,其中以SCI最为重要,创办人为加菲尔德(Garfield)。科学引文索引以布拉德福 (S. C. Bradford)文献离散律理论、以加菲尔德 (E. Garfield)引文分析理论为主要基础 ,通过论文的被引用频次等的统计 ,对学术期刊和科研成果进行多方位的评价研究 ,从而评判一个国家或地区、科研单位、个人的科研产出绩效 ,来反映其在国际上的学术水平。因此 ,SCI是目前国际上被公认的最具权威的科技文献检索工具。科学引文索引以其独特的引证途径和综合全面的科学数据,通过大量的引文进行统计,然后得出某期刊某论文在某学科内的影响因子、被引频次、即时指数等量化指标来对期刊、论文等进行排行,被引频次高,说明该论文在它所研究的领域里产生了巨大的影响,被国际同行重视,学术水平高。由于SCI收录的论文主要是自然科学的基础研究领域,所以SCI指标主要适用于评价基础研究的成果。而基础研究的主要成果的表现形式是学术论文,所以,如何评价基础研究成果也就常常简化为如何评价论文所承载的内容对科学知识进展的影响。科学引文索引是当今世界上最著名的检索性刊物之一 ,也是文献计量学和科学计量学的重要工具。通过引文检索功能可查找相关研究课题早期、当时和最近的学术文献,同时获取论文摘要;可以看到所引用参考文献的记录、被引用情况及相关文献的记录。1976 年,ISI 在 SCI 基础上引出期刊引用报告(journal citation report, JCR),提供了一套统计数据,展示科学期刊被引用情况、发表论文数量以及论文的平均被引用情况。在 JCR 中可以计算出每种期刊的影响因子(Impat Factor, IF)。影响因子的高低,在一定程度上可以反应一个期刊的影响力。SCI和SCIE的区别SCI和SCIE(SCI Expanded)分别是科学引文索引及科学引文索引扩展版(即网络版),主要收录自然科学、工程技术领域最具影响力的重要期刊,前者收录期刊 3600 多种,后者收录期刊 6000 多种,学科覆盖 150 多个领域。SCI选刊原则 基本出版标准:时效性、编辑惯例、英文文献编目信息和同行评议过程等方面。 编辑内容:需要仔细考察一个期刊的编辑内容,以确定它在一个或多个ISI数据库中的位置。 国际多样性:在论文水平上考察期刊,看其作者是否来自世界各地;也注重期刊编辑和编委会的国际多样性。 地域性期刊:为了全面地反映全球范围内科学研究和发展情况,并在每个学科范畴有较平衡的收录, ISI 也力求收录最优秀的地域性期刊。当评估一本地域性期刊而不是国际性期刊时,ISI尽量比较它与同地区的其它期刊的内容。如果这个区域还没有同类期刊被收录,那么ISI认为有必要收录这个地区的这本期刊。 引文分析:引文数据有助于ISI确定对研究团体最重要、最有用和最有影响力的出版物。使用SCI的注意事项u 要明白SCI的选刊方针(基本的出版标准、期刊的内容、SCI的国际代表性、引文分析)。SCI的源期刊既需要照顾各个学科,又不能数量过多。u 要正确理解影响因子(impact factor, IF)。期刊的IF值不能看成是影响论文质量的决定性因素。影响因子(impact factor) 定义:IF是某期刊前两年发表的论文在统计当年的被引用总次数除以该期刊在前两年内发表的论文总数。 意义:IF是相对统计值,可克服大小期刊由于载文量不同所带来的偏差。一般来说,影响因子越大,其学术影响力也越大。 IF值是逐年波动,年载文量300篇的期刊IF值波动幅度就比年载文量30篇的要小。 不同学科的期 刊IF之值差别很大,一个活跃学科(如临床医学)诸期刊中的最小IF值可能超过不活跃学科(如数学)诸期刊中的最大IF值。用IF值衡量不同学科期刊的学术水平没有任何意义。 具体到一篇文章,可能引用次数小到零,即无人引用,也可能大到几百上千。同一作者在IF值小的期刊上发表的论文的引用次数完全可能超过他她在IF值大的同类期刊上发表的另一篇论文。因此IF值只是评价期刊的宏观指标。勿轻视SCI 勿滥用SCIu 勿轻视 严格评议和学术民主是SCI源期刊的优点 利用SCI有助于加强道德自律 利用SCI有利于调动教师积极性u 勿滥用 不能单靠SCI为大学或研究机构排学术榜 用SCI评价个人时切忌简单从事二、信息素质(信息素养)Information literate people know how to find, evaluate, and use information effectively to solve a particular problem or make a decision-whether the information they select comes from a computer, a book, a government agency, a film, or any number of other possible resources. 具备信息素质的人,能够识别何时需要信息,知道如何查找、评估和有效利用需要的信息来解决实际问题或者做出决策,无论其选择的信息来自于计算机、图书馆、政府机构、电影或者其它任何可能的来源。信息素质的构成n 信息意识:影响信息需求的准确表达;支配信息行为;决定信息利用率。n 信息知识:信息基础知识、信息技术知识。n 信息能力:信息素质最核心的组成部分,包括信息需求分析和表达能力、信息获取能力、信息分析和处理能力、信息利用能力。n 信息道德:调节信息生产者、加工者、传递者、使用者之间行为规范的总和。信息道德素质u 个人的信息活动应与社会的整体目标协调一致,并承担相应的社会责任和义务。u 遵循信息法律与法则,能够抵制各种迷信的、淫秽的、违法的、反动的信息,不制作、传播、消费不良信息。u 不侵犯他人的知识产权、商业秘密和隐私权,正确处理信息创造、信息服务、信息使用三者之间的关系。u 恰当使用与合理开发信息技术,不利用信息技术进行犯罪活动。信息素质的评价标准标准一:具有信息素质能力的学生能确定所需要信息的性质和范围。标准二:具有信息素质能力的学生能有效而又高效地获取所需要的信息。标准三:具有信息素质能力的学生能评判性地评价信息及其来源,并能把所遴选出的信息与原有的知识北京和价值系统结合起来。标准四:具有信息素质能力的学生,无论是个体还是团体的一员,能有效地利用信息达到某一特定的目的。标准五:具有信息素质能力的学生懂得有关信息技术的使用所产生的经济、法律和社会问题,并能在获取和使用信息中遵守公德和法律。1.了解与信息和信息技术有关的道德、法律和社会经济问题。2.能遵守有关获取和使用信息资源的法律、规章、机构的制度和行业规范。3.能在传送作品或表现形式时使用同一格式去引用信息来源。美国高等教育信息素质能力标准 抄袭定义从中华人民共和国著作权法来看: 著作权法所称抄袭、剽窃,是同一概念(为简略起见,以下统称抄袭),指将他人作品或者作品的片段窃为己有。抄袭侵权与其他侵权行为一样,需具备四个要件: 第一,行为具有违法性; 第二,有损害的客观事实存在; 第三,和损害事实有因果关系; 第四,行为人有过错。 由于抄袭物需发表才产生侵权后果,即有损害的客观事实,所以通常在认定抄袭时都指已经发表的抄袭物。因此,更准确的说法应是,抄袭指将他人作品或者作品的片段窃为己有并发表。 学术不端十大行为 中国青年报 2006年11月15日1、抄袭剽窃他人成果在论文、研究报告、著作等科研成果中抄袭剽窃他人的实验数据、图表分析甚至大段的文字描述。这种现象存在于少数科技人员特别是少数硕士生、博士生和刚参加工作的青年学者中。2、伪造篡改实验数据在实验数据、图表分析中,随意编造数据或有选择性地采用数据证明自己的论点,这比抄袭剽窃他人成果造成的影响和后果更恶劣。3、随意侵占他人科研成果利用职权在自己并无贡献的论文或成果上署名,把他人科研成果据为己有;将通过会议、评审等过程获得的特殊信息和思想随意传播;在论文被录用或成果获奖后任意修改作者排序和著作权单位;为论文顺利发表或成果获奖私自署上知名科学家名字;为完成科研任务或求得职称晋升,无关的同事、同学、亲友间相互挂名。4、伪造申请者或签名为申请到更多的科研项目和经费,伪造申请者和主要成员,假造申请书中的个人信息以及冒名顶替他人签名。5、编造虚假简历在求职或晋升职称时,编造虚假学历、任职情况、学术成果、获奖经历等。6、重复发表论文论文一稿两投甚至一稿多投;将某一刊物已发表的文章原封不动或改头换面后重新投到另一刊物;将国外刊物以外文形式发表的论文以中文作为原创性论文在国内发表而不注明。7、学术论文质量降低和育人不负责任部分学者为提高论文数量,将可用一篇完整论文发表的科研成果分为多篇投稿;论文发表中引用文献注释不明确;部分教授为完成科研任务招收几十名甚至上百名研究生为自己工作、挂名发表大量论文,而无法全面有效教育培养研究生,使研究生素质大面积滑坡。8、学术评审和项目申报中突出个人利益在专业技术职称评聘、科研成果评审等过程中,因人情关系、利益驱动等原因,不能正确评价他人成果,利用职务权力和学术地位,走关系、拉选票,导致结论失去客观性、准确性和公正性;与自己无利益冲突情况下,尽量抬高对他人的评价,与自己有利益冲突情况下,贬低前人或他人成果,自我夸大宣传。9、过分追求名利助长浮躁之风部分科技工作者特别是一些有一定学术成就、在学术界有一定地位的人员,兼任太多社会和学术职务,真正用于科研的时间很少。10、违反实验动物保护规范在进行科研活动中,违反实验动物保护规范,如虐待动物等。国外学术协会关于抄袭的规定举例IEEE(电气电子工程师学会)抄袭包括但不限于:1)复制他人作品不承认归属;2)使用他人的素材但没有明确的标出或引用;3)重复使用自己或其他作者已发表的论文内容而不引用。ASME(美国机械工程师协会)对他人已存在来源的思想或表达的使用而不适当地指明出处。学会认为将任何类似的知识产权、数据以及解释等错误地据为己有也是抄袭。Elsevier(爱思唯尔出版集团)对他人已存在来源的思想或表达的使用而不适当地指明出处。学会认为将任何类似的知识产权、数据以及解释等错误地据为己有也是抄袭。抄袭案例北京大学某教授想象的异邦几乎与美国人类学家哈维兰的当代人类学(中译本)第四部分、第五部分、第六部分相同,甚至连结构段落顺序也没有改变,大改的只是原书中的一些小标题给去掉了。 但是作者在想象的异邦一书中的序言部分和参考文献部分没有一次提到美国作者哈维兰。德国国防部前部长卡尔特奥多尔楚古滕贝格(拜罗伊特大学)393页博士论文正文中,在其中324页发现有抄袭的地方,占总页数的82%。被迫辞去国防部长。欧洲议会副议长,德国人西尔瓦娜.科赫梅林1999年向海德堡大学提交的博士论文介于经济与政治之间的历史货币同盟:拉丁美洲钱币同盟 18651927存在大量抄袭,抄袭篇幅约达整个论文的四分之一。其被迫辞去辞去欧洲议会副议长、德国自由民主党欧洲议会党团主席和德国自民党主席团成员的职务。东北财经大学统计学专业硕士生袁新抄袭南京财经大学统计学专业硕士生曾康宁的硕士论文,两篇论文整体框架完全一样,只把论文中的地名“江苏”改为“山东”,把江苏的统计数据换成山东的统计数据,其余几乎一模一样。“这篇抄袭的论文几乎就是用替换键搞定的。”这名网友将抄袭者称为“史上最牛抄袭者”。2006年年底,南开大学发现2004年的一篇博士论文存在剽窃行为,该校学术委员会根据调查撤销了已授予的博士学位,并通知抄袭学生归还学位证书。 四川省中西医结合医院宋玉萍等发表在四川实用妇产科杂志2007年8月第23卷第8期的论文卵巢子宫内膜异位囊肿44例临床分析,涉嫌抄袭中大医学院侯红瑛、李小毛、郑军生等发表在辽宁中国实用妇科与产科杂志1999年8月第15卷第8期的卵巢子宫内膜异位囊肿66例临床分析一文。“抄袭率超过90%”。 另一篇是山西保德县人民医院王弘发表在实用医技杂志2007年10月第14卷第30期的产钳术失败7例分析一文,涉嫌抄袭中大医学院李小毛、沈宏伟、李大慈发表在中国实用妇科与产科杂志1996年第12卷第3期的产钳术失败8例分析一文,“抄袭率也超过90%”国际学术期刊晶体学报E分卷于2009年12月19日在其网站上公布,中国井冈山大学化学化工学院的讲师钟华、工学院讲师刘涛,两年内在该刊物发表的70篇文章存在造假,一次性予以撤销,并将该校列入黑名单。造价人被开除公职 追回所获奖励。如何避免学术不端行为 数据处理:论文中的数据必须是真实可靠的,不能有丝毫的虚假。 论文撰写:避免剽窃;在论文中标明引用他人已经正式发表的成果;写明论文工作所获得的资助情况。 论文署名:只有对论文的工作作出了实质贡献的人才能够做为论文的作者。 论文发表:一篇论文只能投给一家期刊,只有在确知被退稿后,才能改投其他期刊。 学术履历:写明自己获得的各种学位的时间;不应该利用中英表述的差异,通过“翻译技巧”来拔高自己在国外的学术地位和学术成就;在论文表中列举自己做为共同作者的论文时应该注明排名顺序;如果自己只是专著的主编,应该注明“编”或“Ed.”;如果自己只是参与写作专著中的某个章节,应该注明该章节文献的类型及其识别(一)文献的定义和属性以文字、图形、符号、声频、视频等手段记录和传播知识的载体就是文献。文献本身所固有的性质有四方面:一是知识信息性。这是文献的本质属性。任何文献都记录或传递一定的信息知识。离开知识信息,文献便不复存在。传递信息、记录知识是文献的基本功能,人类的知识财富正是依靠文献才得以保存和传播的。二是客观物质性。文献所表达的知识信息内容必须借助一定的信息符号、依附于一定的物质载体,才能长时期保存和传递。三是人工记录性。文献所蕴涵的知识信息是通过人们用各种方式将其记录在载体上的,而不是天然荷载于物质实体上的。四是动态发展性。文献并非处于静止状态,而是按新陈代谢规律运动着。随着人类记录水平的提高,信息交流的频繁,文
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