现代医学研究的信息资源与管理 ppt课件.ppt

现代医学研究的信息资源与管理 1 1制定检索策略与文献信息查询 选题立题之初 应 围绕研究目的 检索所有相关文献信息 全面剖析研究背景 现状以及存在问题 2 查询哪些医学信息源 可及的信息资源或文献数据库又有哪些 能否做到查新查全 要回答这些问题 需要事先做好一系列筹划设计 包括 构建可查询的检索问题 确定检索范围和文献信息资源库 制定检索策略评估检索结果等 3 一 制定检索策略常由PECOT内容组成 人群或病人 population patients 暴露或干预因素 exposure intervention 比较 comparison 结果 outcomes 时间 time 等要素 分解多个独立词汇 作为初始检索用词 参考检索数据库词典 选择与初始检索用词最接近的标准检索词 4 根据检索目的和范围 合理选用 检索用词 包括主题词和副主题词 与逻辑运算符 如逻辑和 AND 逻辑或 OR 逻辑非 NOT 位置运算符 如WITH NEAR IN 范围运算符 一 等 截词符 以及通配符 等 5 制定检索策略时应同时兼顾检索的敏感性 sensitivity 和特异性 specificity 若提高查全率 要制定高敏感性的检索策略 扩大检索范围 如选用 逻辑或 截词符等 若要提高查准率 需制定高特异性的检索策略 缩小检索范围 提高相关文献的检出率 如选用 逻辑和 位置运算符等 6 二 文献信息检索选择信息资源库与检索工具 MEDLINE 美国 医学索引在线PubMed EMBASE 中国生物医学文献数据库 ChineseBiomedicalLiteratureDatabase CBM 等 特点 收录文献范围广 包罗万象 条目数量庞大 收录互有交叉 质量不一 7 图4 1文献信息检索流程 8 三 检索过程与结果评价全面评价检索质量 避免漏检或误检 应对检索策略 检索过程以及文献信息检索结果的完整性 真实性和重要性等进行综合评价 9 四 文献信息检索流程实例演示1 提出一个可用于检索的研究问题 如 降压治疗能否降低 型糖尿病伴有高血压病人的病残率和病死率 在该研究问题中 病人 patients 为 型糖尿病伴有高血压病人 干预 intervention 为 降压治疗 比较 comparison 为 与未降压组相比 结果 outcomes 为 病残率和病死率 10 2 制定检索策略 实施检索 1 选择一个文献检索数据库 如PubMed 2 确定检索主题词 设计检索策略 1 diabetestype2 hypertension MeSH Limits ClinicalTrial Human 2hypertensiveType2diabetic MeSH Limits ClinicalTrial Human 3 management OR therapeutic 4 mortality OR mobility 5 10R 2 AND 3AND 4 11 3 检索结果 52篇相关文献 截至2007年7月 1 ErdmannE DormandyJA CharbonnelB Massi BenedettiM MoulesIK SkeneAM PROactiveInvestigators Theeffectofpioglitazoneonrecurrentmyocardialinfarctionin2445patientswithtype2diabetesandpreviousmyocardialinfarction resultsfromthePROactive PROactive05 Study JAmCollCardiol 2007Mayl 49 17 1772 1780 Epub2007Apr16 PMID 17466227 PubMed indexedforMEDLINE 12 2 WeberMA BakrisGL DahlofB PittB VelazquezE GupteJ LefkowitzM HesterA ShiV WeirM KjeldsenS MassieB NesbittS OfiliE JamersonK BaselinecharacteristicsintheAvoidingCardiovasculareventsthroughCombinationtherapyinPatientsLivingwithSystolicHypertension ACCOMPLISH trial ahypertensivepopulationathighcardiovascularrisk BloodPress 2007 16 1 13 19 PMID 17453747 PubMed indexedforMEDLINE 13 3 检索结果与文献信息评价需对获取文献的质量 时效性等展开严格评价 注意所获得文献信息一般有3 6个月的滞后期 14 2常见的医学信息资源 发展中国家的临床研究者 在查询文献信息时 经常会遇到截然相反的两种困境 一方面是有用或高质量信息不足或缺乏 由于经费缺乏或其他条件限制 大量文献原文无法获取 形成 信息孤岛 另一方面则是信息泛滥问题 大量杂乱的灰色信息无处不在 研究者又面临着如何从海量的信息资源中提取有价值信息的困境 为此 了解现有医学信息资源的类别与分布 掌握一些基本的查询方法 学会利用互联网或其他电子信息资源 将有助于及时追踪研究领域的最新进展 全面了解专业学科的最新发展动态 15 一 常见的医学信息源种类与分布医学信息来源很广 包括电子文献检索数据库 如MEDLINE 课题研究进展报告 学术会议资料 引文索引 论著和教科书以及个人经验交流等 在图4 2中 主要医学信息源若按照可及数量和关联度大小排列 就形成了金字塔状的分布结构 其中与研究问题高度相关的信息源主要是电子文献检索数据库 这些数据库以固定的标准词汇建立索引 利用索引可以进行精确的检索 在图4 2金字塔中 越向下的部分 与研究问题相关的文献分布密度越低 塔底为WWW来源信息 密度最低 大部分为躁度信息或灰色文献 但若只查询高密度医学信息源 可能会漏掉部分有用文献信息 但要查全这部分信息 则又可能花费大量的时间和人力 得不偿失 因此需要结合检索目的 在两者之间进行权衡 16 图4 2医学文献信息金字塔 17 医学信息级别分布 呈金字塔状 高级别文献信息数量少 分布在塔尖 低级别文献信息数量庞大 分布在塔底 一般来讲高级别文献信息是由低级别信息综合提炼加工而成 例如 临床实践指南评价查询结果时 应判断获取的文献信息类型 级别分布是否呈金字塔状 18 二 电子文献检索数据库指南 系统评价 RCT试验研究其他计量研究等 全文数据库则收录了原始文献的全部内容 如Cochrane系统评价数据库 19 电子文献数据库允许综合应用逻辑 位置运算符等制定检索策略 寻求图书管理员的帮助 利用熟悉的检索方法 实现快速有效的检索 20 表4 1电子文献数据库一览 21 三 灰色文献资源库电子文献数据库是临床研究的主要医学信息源 但大多只能得到摘要 无法获取文献全文 存在发表性偏倚 大约25 临床研究在10年内并无文献发表 因无法被电子文献数据库收录而出现缺失 论文发表年限平均为5年 倘若得到阴性结果 则很少被发表 如公开发表文献中有85 报告结果有统计学意义 一些主要医学杂志 如BMJ JAMA和柳叶刀杂志 只有10 阴性结果的论文被发表 22 另外文献的收录也存在地域性偏倚 如在一个收录了3000 4000种杂志的文献数据库中 只有2 的文献来自中低收入的发展中国家 发表在这些国家国内杂志上的文献超过90 并没有被主要电子检索数据库收录 为弥补电子文献数据库的上述缺陷 可查阅一些灰色文献数据库作为重要补充 灰色文献对临床研究也很重要 如有研究表明 系统评价和Meta分析中若不考虑灰色文献 将可能导致效应量被高估10 以上 23 灰色文献 是指由各级政府部门 学术机构 商业与其他机构生产的 不以赢利为目的的印刷品和电子产品 形式多种多样 可以是各种报告 进展报告 技术报告 统计报告 市场研究报告 也可以是论文 讨论进展 技术说明与标准 非营利性的译文 著作 技术与商业文件 非营利性的官方文件等等 这些文献信息未经过严格评价 缺乏可信度 所以称为灰色文献 24 较为常用的灰色文献数据库 国家图书数据库与目录库 相关学术组织或机构网页及链接数据库等 包括数量庞大的 有潜在价值的网页 这些网页是由一些小的或不知名的机构 非政府组织 NGO 学术研究中心 私人公司及咨询公司等创建 25 一 国家图书数据库与目录建立与发展国家图书数据库与目录 对国内外研究者均很重要 例如 我国出版了科学论文文摘与索引 收录的文献 大部分以中文发表 表4 2列出了一些国家级图书数据库 26 表4 2国家文献数据库一览 27 国家图书数据库与目录可能无网络版和光盘版 检索需要付费 检索系统也需要进一步完善 如增加一些检索辅助功能等 28 二 相关组织机构网页一些组织机构 如国际发展研究中心 IDRC 世界银行 卫生研究发展委员会 COHRED 或卫生研究世界论坛 GFHR 等正逐步将其内部文件 报告发布到网上 对此类组织机构网页查询 可分类进行检索 29 1 发展组织机构类 如世界银行 USAID CIDA DFID WHO UN AusAID和欧盟等 这些机构因是大量卫生研究的资助方 定期会将研究进展 技术报告等发布在网页 2 专业组织机构类 如国际HIV AIDS联盟 疟疾国际基金会 国际抗结核和肺病联合会等 这些组织和机构随时发布与疾病有关的最新信息以及研究进展报告等 3 国家级研究机构类 如非洲医学研究基金会 印度医学研究会等 这些研究机构也会定期发布资助项目的研究报告 30 三 WWW网页链接查询互联网目前已有超过500亿个人网页 可用Google和Yahoo等搜索引擎检索 最近在对7个Cochrane系统评价进行再评价的一项研究中 通过检索WWW网页查询未公开发表文献 结果共耗时21小时评价了429个相关网页 从中新发现了9个临床试验 由于缺乏索引 同时搜索范围广 涉及整个Internet网 查询很费时 即使有检索策略 WWW检索结果的精度仍很差 会得到大量无关文献 31 四 其他专门灰色文献数据库一些特殊文献数据库专门收集不同类型的灰色文献 例如 学位论文摘要 dissertationsabstracts 收录了自1861年以来超过1000所著名大学的硕士与博士论文 欧洲灰色文献信息系统 SIGLE 则收录了在欧洲范围内的未公开发表的论文 学位论文 进展报告以及其他非正式文献等 32 3对检索文献的严格评价 对检索到的医学文献信息 还须对其质量进行严格评价 不同研究类型的文献 均有相应的严格评价工具或标准 如JAMA用户指导手册 CASP严格评价技巧项目网等提供了一系列严格评价标准 用来评估系统评价 随机对照试验 病例对照研究 队列研究 描述性研究 诊断试验和经济学评价研究等不同类型文献 33 一 常见文献的严格评价工具由于随机对照试验采用了随机 盲法以及设置对照组 最大限度地控制了混杂和偏倚对结果的影响 确保了结果的真实性 被认为是一种论证强度较高的设计方案 因而在临床研究中备受推崇 相关文献发表很多 成为临床证据的重要来源 对随机对照试验的质量评价方法发展很快 Moher早在1995年就列举了34种随机对照试验质量评价工具 Juni等通过手检又额外发现了另外14种工具 但现有的评价工具还不是很严格 工具不同 质量评价结果也不尽相同 其中Jadad工具已得到初步认可 该工具设置的评价内容包括 是否随机 盲法质量如何 是否有对失访或中间退出的描述 方案分配是否隐藏等 详见第五章 第十五章 34 对系统评价文献的质量评价方法就是与QUOROM中设置的项目逐一进行比对 QUOROM是用来规范系统评价的标准报告格式 包括18个条目 其中9个循证条目覆盖了系统评价报告中的摘要 简介 方法与结果等方面内容 详见第六章 35 JAMA用户指导手册针对定量研究文献设置了5项指导性评价原则 研究对象是否与研究问题有关 研究对象的选择是否有充足的理由 数据资料的收集方法是否与研究目的与场所匹配 数据资料的收集是否完整充分 足以描述观察事件 资料的分析是否合适以及发现的结果是否被充分证实 这5项原则对一般定量研究文献的评价均有一定的参考价值 已被广泛的应用到临床研究文献初步评价中 36 二 WWW来源文献的评价工具与上述常规文献相比 WWW来源文献与报告大多为灰色文献 因此 对其严格评价显得尤为重要 尽管目前有一些专用工具评价WWW文献信息质量 但这些文献信息大部分还不能算做真正的研究文献 另外 尽管工具很多 如仅在1997 2002年6年间就发现了98种评价工具 但没有一个工具提供了信度与效度的检验结果 这些评价工具的实际测试结果与预期设想的测量结果是否一致也并不清楚 因此 在这里并没有具体列出这些评价工具 最好还是使用上述被广泛认可的严格评价工具与标准 37 4电子文献及非常规文献信息的引用格式 电子出版物的引用格式不同常规文献 主要是基于以下特点 38 1 资料的多样性与媒介载体的多样性不同类型的电子文献均有各自的引用及表达格式 资料和媒介的多样性导致出现多种排列格式 电子文献信息主要来源有 基于印刷出版物的在线文档 电子杂志文献 电子文献数据库 WWW网页 CD ROMS 公告栏信息 私人电子邮件等 引用格式不尽相同 39 2 电子文献信息的动态性非固定 动态性是电子文献信息的特色 也许昨天发现的文献 第二天就移到了其他地方或者内容发生改变 甚至完全消失 3 引文信息有可能不完整例如一些网页信息残缺 没有作者姓名或者发表年限 甚至没有题目等 4 引用格式多样化现有温哥华格式 美国心理学会格式 APA 哈佛格式等三种通用引用格式 其中温哥华格式已被国际医学杂志编辑委员会所接受 另两种格式也有所应用 40 一 电子出版物文献的基本引用格式与要素电子信息文献的主要引文要素包括 作者或编者 发表年限 题目 论文或书籍 杂志名 卷号 期号 媒介类型 页码 获得途径 进入时间等 41 对于某个特定的参考文献 引文要素并不要求完全具备 如上述带括号要素 属于可选项 但下面三种要素则是电子参考文献所必备的 42 一 媒介类型一些文献信息可通过多种媒介途径获取 如CD ROM 光盘 印刷品或在线方式等 因此电子参考文献必须标明获取途径 43 范例1 COHREDWorkingGrouponResearchtoActionandPolicy 2000 LessonsinResearchtoActionandPolicy CaseStudiesfromSevenCountries Online COHRED Geneva Switzerland COHREDDocument2000 10 Available http www cohred ch documents COHREDweb lssues papers researchtoaction pdf 3February2003 哈佛格式 该文献为COHRED工作组的一份报告 可以纸质版或PDF的文件格式获得 若仅是通过在线阅读浏览 下载打印或在显示器上阅读 应在题目加上标识 online 44 范例2 Hodnett E D 2000 Supportduringpregnancyforwomenatincreasedrisk CochraneReview inTheCochraneLibrary CD ROM Issue2 UpdateSoftware Oxford UK 哈佛格式 范例2为一篇系统评价 来自Cochrane系统评价数据库 采用哈佛引用格式 Cochrane评价文献可以通过Cochrane图书馆光盘或者借助OVID在线获得 在此例中 需要在题目中加注 CD ROM 45 二 获得途径出版商与出版地对于电子文献意义不大 获取途径才是引文中最重要的内容 互联网上的文献或者网页 需提供URL地址 若同时有多个在线数据库与电子杂志汇编 需提供单个数据库或电子杂志汇编的名称 具体的说明格式包括 从 处拷贝 或 可从 处获得 等 46 范例3 电子杂志文献NotessGR 1997 OntheNet InternetSearchTechniquesandStrategies ONLINEMagazine Online 21 4 Available http 47 三 获取日期互联网信息具有动态性 这就意味着位置 内容会经常变换 甚至完全消失 因此 获得文献的具体日期应包括在引文中 温哥华与哈佛格式在引文的末尾处均用方括号标出 而ASA格式则是将获取的日期与途径合并在一起 见范例4 同时应注意与前两种格式不同 ASA格式并不要求标明媒介类型 48 范例4 VandenBos G Knapp 2001 Roleofreferenceelementsintheselectionofresourcesbypsychologyundergraduates JournalofBibliographicResearch 5 117 123 RetrievedOctober13 2001fromhttp jbr org articles html 49 四 引文序列号和页码的编排格式温哥华格式是按照引用的顺序 每个参考文献给予一个序列号 哈佛与ASA格式则在正文中插入作者与日期 并用圆括号标出 不论何种格式 引用文献的页码必须标明 一些电子文献 特别是WWW网页 页码的意义不大 例如一篇电子文献只有一页网页 但可打印50页 对此 不用页码标明文献的具体位置 但可以利用符号或者用缩写 para 注明段落序号 范例5 Myers 2000 para 5 APA格式 50 二 WWW网页在引用WWW网页时 若不能确定网页的具体作者 可在作者姓名位置用网页名称代替 不能用推测的作者姓名 温哥华格式允许直接采用网站组织或负责人名称替代 这在作者不明以及文献转移或丢失时很有帮助 也可以从网站组织或负责人处 获取找到该引用文献的途径与方法 在引用一般网