贝尔斯坦的使用ppt课件.ppt

CrossfireBeilstein Gmelin化学手册网络数据库 1 内容提要 背景资料客户端软件安装CrossFireBeilstein Gmelin基本检索 2 背景资料 LeopoldGmelin 1788 1853Germanchemist1822discovererofpotassiumferricyanide1817 1819wrotetheHandbuchderChemiefirstedition 4thed 1843 1855 1848 1850translatedintoEnglishfortheCavendishSocietybyH Watts 3 背景资料 FriedrichBeilstein 1838 1906Russianchemist1881FirstEditionofBeilstein sHandbookofOrganicChemistry 1 500compounds 2 200pages 1988BeilsteindatabaseonlineatSTN1993FirstreleaseoftheCrossFiresoftwarefortheBeilsteindatabase1994TheBeilsteinDatabaseavailableunderCrossFireasin houseversionwithca 6 000 000organiccompounds ca 7 5min1999 4 背景资料 CrossfireBeilstein Gmelin 由Beilstein和Gmelin两个数据库组成 分别由德国BeilsteinInstitute和GmelinInstitute进行 前者收集有机化合物的资料 后者收集有机金属与无机化合物的资料 是传统贝尔斯坦有机化学手册 BeilsteinHandbuchderOrganischeChemie 及盖墨林无机与有机金属化学手册 GmelinHandbookofInorganicandOrganometallicChemistry 的电子化 5 背景资料 CrossfireBeilstein Gmelin Theworld slargestelectronicscollectionoforganicreactionsandchemicalfacts Theonlycomprehensive electronicallysearchablesourceofstructures properties andcitationsininorganicandorganometallicchemistry 6 背景资料 CrossfireBeilstein Gmelin 物质信息 化合物化学性质化合物物理性质化合物化合物结构信息化合物生物活性信息化合物参考文献信息 反应信息 化学反应信息制备物质的详细资料反应途径 引用文献信息 参考文献根据1980年 的重要有机化学文献索引整理的摘要 900万种化合物50万个 年增 1000万个有机化学反应 CrossfireBeilstein1771 200万篇参考文献80万篇摘要 7 背景资料 CrossfireBeilstein Gmelin 175Journals1771年 8 背景资料 CrossfireBeilstein Gmelin 化学结构数据化学反应 制备 物理性质化学性质参考文献 200万种无机和有机金属化合物14000种玻璃和陶瓷3200种矿物55000种合金110万篇文献15万篇摘要160万个反应 CrossfireGmelin1772 地质学 矿物学 冶金学信息资源材料科学 电子学 催化学信息资源 9 背景资料 CrossfireBeilstein Gmelin 62Journals1772年 10 背景资料 Elsevier MDL Crossfire等化学信息管理 药物研究开发等软件供应商探索生命科学 材料科学 化学工业信息学的领导者国际性公司 总部社在美国加州SanLeandro 在全球设有分公司 11 背景资料 创腾科技有限公司 MDLCrossfire中国地区总代理面向国内材料 生命科学领域用户提供分子模拟 化学 生物 材料信息学 高性能计算全面解决方案的专业计算机公司提供Crossfire的技术咨询 12 内容提要 背景资料客户端软件安装CrossFireBeilstein Gmelin基本检索方法 13 客户端程序安装 网络检索CrossFireBeilstein Gmelin需要安装客户端程序 CrossFireCommander6 0 CrossFireCommander7 0 新版本客户端具有更清晰的使用界面和页面HELP提示 14 客户端软件安装 步骤 适用中科院用户 升级程序的下载地址为 进入地址后 将Crossfire rar下载并解压缩后 双InstallShell exe 按提示安装 建议使用默认配置 CrossFireCommander6 0需要卸载 15 客户端软件安装 安装信息 适用中科院用户 权限控制方式为外部IP 内部私有IP 口令以中科院文献情报中心为例 16 客户端软件安装 安装信息 MDLISISDraw 是Crossfire平台上的特定产品 在这个平台上使用起来有时会比ISISDraw方便 但不能脱离此平台使用 安装中需要选择画图软件 是使用最广泛的一种 除了在Crossfire 还可以在MDL公司的其他各种产品中使用 MDLDraw ISISDraw的换代产品 操作起来更简单 相对于ISISDraw有很多改进 会逐渐取代ISISDraw 目前对于非MDL用户不是免费的 MDLCrossfireStructureEditor 17 内容提要 背景资料客户端软件安装CrossFireBeilstein Gmelin基本检索方法 18 CrossFireBeilstein检索 CrossFireCommander7 0界面结构 数据表格检索 结构检索 关键词检索 19 CrossFireBeilstein检索 CrossFireCommander7 0界面结构 5个功能按钮 20 CrossFireBeilstein检索 CrossFireCommander7 0的界面结构 菜单与功能快捷键 21 CrossFireBeilstein检索 选择数据库 选择数据库 22 CrossFireBeilstein检索 选择化学结构画图工具 确认选用的画图工具与安装的画图工具一致 23 CrossFireBeilstein检索 关键词检索 在 SearchAllText 中输入关键词 Truncate 截词选择 例 检索PVC的相关物质信息 24 CrossFireBeilstein检索 关键词检索 兰色的 Bar 提示关键词出现的频次 选择检索内容 SubstancesReactionsCitations 25 CrossFireBeilstein检索 关键词检索 View检索结果 命中记录Hits的数量 26 CrossFireBeilstein检索 关键词检索 双击某个Hit 浏览详细内容红色标志显示有生物活性的化合物 27 CrossFireBeilstein检索 关键词检索 可访问的数据内容可访问的数据数量链接相关数据内容 点击快捷键show显示化合物结构窗口 28 CrossFireBeilstein检索 数据和事实的超链接 链接Reaction详细数据 29 CrossFireBeilstein检索 访问参考文献 超链接获取参考文献记录超链接获取MDL LitLink文献提供服务 30 CrossFireBeilstein检索 访问参考文献 超链接参考文献详细内容部分参考文献提供经过整理的摘要 31 CrossFireBeilstein检索 访问参考文献 超链接获取MDL LitLink文献提供服务注册服务 32 CrossFireBeilstein检索 结果显示方式 选取检索结果记录的显示方式 33 CrossFireBeilstein检索 结果显示方式 利用快捷键选取显示的数据内容 HitOnly 只显示与检索条件匹配的数据 34 直接查询相关记录 不用重新提问 CrossFireBeilstein检索 相关记录检索 35 CrossFireBeilstein检索 检索历史 显示特定日期的检索内容 选取并复制检索内容到 Query 36 37 CrossFireBeilstein检索 保存 打开提问式 点击 SaveQuery 保存提问式点击 OpenQuey 单击文件名预览保存提问式点击 OpenQuey 双击文件名copy检索提问 38 CrossFireBeilstein检索 提问集 Querties 显示 Today Yesterday s Previous 的检索提问 Queries 直接 Copy 检索提问 39 CrossFireBeilstein检索 数据表格检索 数据表格索引区包括6种索引 查询内容填充区 40 CrossFireBeilstein 数据结构 41 CrossFireBeilstein检索 数据表格检索 单击数据索引名称浏览索引详细内容选择数据域名称 42 CrossFireBeilstein检索 数据表格检索 点击 Selectforsearch 查询内容自动添入 SearchField 对索引内容的描述与检索样例可以locate索引内容在 tree 中的位置 43 CrossFireBeilstein检索 数据表格检索 输入查询数据的名称点击 Find 双击显示的数据域名称 该名称自动填充到数据表格检索区 44 CrossFireBeilstein检索 数据表格检索 例 检索CASno 122 01 0化合物的相关信息 输入数据域 填充检索内容 List 提供相应内容的选择与自动填充 如果相应内容 则检索无结果 45 CrossFireBeilstein检索 数据表格检索 List 提供相应内容的选择 自动填充和预检 46 CrossFireBeilstein检索 数据表格检索 检索结果显示 47 CrossFireBeilstein检索 数据表格检索 输入查询词点击 Find 在 Tree 中以背景颜色显示结果双击查询结果 数据域名自动进入 FieldName Enlarge 可以独立显示数据检索表格 例 查询在760毫米汞柱下沸点 120c 不含氯元素的溶剂 同时查询其 Density Viscosity 信息 48 CrossFireBeilstein检索 数据表格检索 Enlarge 填充完毕的数据表格 49 CrossFireBeilstein检索 数据表格检索 检索结果中符合定义条件的数据一背景颜色显示 50 CrossFireBeilstein检索 预定义检索表格 利用 PredefinedSearchforms 简化检索条件的填充和予检索如果予检为零 则检索结构为零 9种预定义检索表格 51 CrossFireBeilstein检索 预定义检索表格 填充需检索内容利用List预检索定义的检索内容将自动进入 SearchField SubstanceIndentificationData PredefinedSearchforms 52 CrossFireBeilstein检索 预定义检索表格 输入检索内容 利用 List 进行预检索 例 查询化合物信息 CAS 610 96 6 MolecularFormula C8H7ClO2 53 CrossFireBeilstein检索 预定义检索表格 预检索显示可以检索到相关数据 54 CrossFireBeilstein检索 预定义检索表格 填充检索条件提交检索 55 CrossFireBeilstein检索 预定义检索表格 检索数据记录显示 56 CrossFireBeilstein检索 二次检索 Hitsets 对各命中集以列表显示 在 Hitsets 中选择不同的命中集组合进行二次检索 57 CrossFireBeilstein检索 结构检索 用 DrawStructure 打开画图工具或在 Structure Reactionsearch 中双击打开画图工具 58 CrossFireBeilstein检索 结构检索 如果无法打开画图工具 请确认是否正确的选择了画图工具在菜单 Option 中点击 SelectStructureEditor 59 CrossFireBeilstein检索 结构检索选项 立体化学检索条件选项区 结构检索半反应检索 子结构检索选项取代基位置 其他检索条件选项 60 CrossFireBeilstein检索 精确结构检索 旋转 删除 画笔 原子 键 环 化合物精确结构 61 CrossFireBeilstein检索 精确结构检索 化合物结构自动进入结构将化合物结构Copy到 Querybuilder 62 CrossFireBeilstein检索 精确结构检索 将化合物结构Copy到 Querybuilder 后开始检索 63 CrossFireBeilstein检索 精确结构检索结果显示 选择 Viewall 查看该化合物全部信息 64 CrossFireBeilstein检索 子结构检索 画出子结构在 Generics 中选取Beilstein定义的广义基团定义取代基的位置 65 CrossFireBeilstein检索 子结构检索 进行子结构检索 66 CrossFireBeilstein检索 子结构检索结果显示 显示红色的部分为检索的子结构 67 CrossFireBeilstein检索 保存 打开结构提问 用 SaveQuery 保存提问结构用 OpenQuery 复制提问结构 68 CrossFireBeilstein检索 反应检索 例 检索亚胺生成唑烷的反应途径 利用结构检索建立检索条件 69 CrossFireBeilstein检索 反应检索 选取反应模式绘制结构分别选中化合物分子结构 点击 Reactant Product 70 CrossFireBeilstein检索 反应检索 命中176Reactions 71 CrossFireBeilstein检索 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