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文档简介

第二章1.DNA的变性 稳定核酸双螺旋次级键断裂,空间结构破坏,变成单链结构的过程。核酸的一级结构(碱基顺序)保持不变。2.复性 变性核酸的互补链在适当的条件下,重新缔合成为双螺旋结构的过程称为复性。3.碱基堆积力 层层堆集的芳香族碱基上电子云交错而形成的一种力,是使DNA结构稳定的最主要的因素 4.熔解温度当核酸分子加热变性时,其在260nm处的紫外线吸收会急剧地增加,当紫外线吸收变化达到最大变化的半数值时所对应的温度5.核酸杂交 当两条不同来源的DNA(或RNA)链或DNA链与RNA链之间存在互补顺序时,在一定条件下可以发生互补配对形成双螺旋分子,这种分子称杂交分子,形成杂交分子的过程称分子杂交6. 退火 变性的DNA经缓慢冷却后,两条互补链可重新恢复天然的双螺旋构象,这一现象称为复性,也称退火。第三章1、-螺旋(-heliv):蛋白质中常见的二级结构,肽链主链绕假想的中心轴盘绕成螺旋状,一般都是右手螺旋结构,螺旋是靠链内氢键维持的。每个氨基酸残基(第n个)的羰基与多肽链C端方向的第4个残基(第4+n个)的酰胺氮形成氢键。2、-折叠(-sheet): 蛋白质中常见的二级结构,是由伸展的多肽链组成的。折叠片的构象是通过一个肽键的羰基氧和位于同一个肽链的另一个酰氨氢之间形成的氢键维持的。氢键几乎都垂直伸展的肽链,这些肽链可以是平行排列(由N到C方向)或者是反平行排列(肽链反向排列)。3、-转角(-turn):也是多肽链中常见的二级结构,是连接蛋白质分子中的二级结构(-螺旋和-折叠),第一个氨基酸残基羰基氧与第四个残基的酰氨氮之间形成氢键;转角的第三个残基往往是甘氨酸。4、结构域:在蛋白质的三级结构内的独立折叠单元。结构域通常都是几个超二级结构单元的组合5、蛋白质变性:生物大分子的天然构象遭到破坏导致其生物活性丧失的现象。蛋白质在受到光照,热,有机溶济以及一些变性济的作用时,次级键受到破坏,导致天然构象的破坏,使蛋白质的生物活性丧失。6、复性:在一定的条件下,变性的生物大分子恢复成具有生物活性的天然构象的现象。7、等电点:当调节氨基酸溶液的pH值,使氨基酸分子中所含的-NH3+和-COO-数目正好相等,即净电荷为0,在电场中既不向阴极移动,也不向阳极移动,此时氨基酸所处溶液的pH值即为氨基酸的等电点,简称pI。8、肽:两个或两个以上氨基通过肽键共价连接形成的聚合物9、肽键:一个氨基酸的羧基与另一个的氨基的氨基缩合,除去一分子水形成的酰氨键。10、肽单位:又称为肽基,是肽键主链上的重复结构。是由参于肽链形成的氮原子,碳原子和它们的4个取代成分:羰基氧原子,酰氨氢原子和两个相邻-碳原子组成的一个平面单位。11、寡肽:一种特殊的氨基酸链,以游离态存在的小肽,可以保护全身的小动脉及微细动脉的健康12多肽:由两个以上的氨基酸通过一个肽键连接而成,称为多肽13、超二级结构:也称为基元(motif).在蛋白质中,特别是球蛋白中,经常可以看到由若干相邻的二级结构单元组合在一起,彼此相互作用,形成有规则的,在空间上能辨认的二级结构组合体14、透析(:通过小分子经过半透膜扩散到水(或缓冲液)的原理,将小分子与生物大分子分开的一种分离纯化技术15、电泳:蛋白质在溶液中解离成带电颗粒,在电场中可以向电荷相反的电极移动的现象16、盐析、加入高浓度硫酸铵、氯化钠等中性盐,破坏蛋白质颗粒的水化层,又中和了蛋白质的电荷,使蛋白质沉淀析出的现象17、分段盐析:调节盐浓度,可使混合蛋白质溶液中的几种蛋白质分段析出。如:血清球蛋白(50%(NH4)2SO4饱和度),清蛋白(饱和(NH4)2SO4)。18、超滤:超滤是一种加压膜分离技术,即在一定的压力下,使小分子溶质和溶剂穿过一定孔径的特制的薄膜,而使大分子溶质不能透过,留在膜的一边,从而使大分子物质得到了部分的纯化。19、非蛋白质氨基酸:指的是不在蛋白质分子中出现的那些氨基酸,它们以游离状态或结合状态存在于各种组织和细胞中。20. 稀有氨基酸:存在于蛋白质中的20种常见氨基酸以外的其它罕见氨基酸,它们是正常氨基酸的衍生物.21.变构效应:是指寡聚蛋白与配基结合,改变蛋白质构象,导致蛋白质生物活性改变的现象.它是细胞内最简单的调节方式.22.简单蛋白质:这类蛋白质只含由a-氨基酸组成的肽链,不含其它成分。23.结构蛋白质:由简单蛋白与其它非蛋白成分结合而成24.肽平面:组成肽键的原子处于同一平面,此平面称为肽平面。25.两面角 26.酸性氨基酸:(天冬氨酸(Asp)、谷氨酸(Glu))-NH2比-COOH数目少 强酸性溶液中,主要以正离子存在,向阴极移动 pI = (pK1 + pKR )/2 27.碱性氨基酸:(精氨酸、赖氨酸、组氨酸) 即能水解的氨基个数多于能水解的羧基个数(溶液呈碱性)的氨基酸. pI = (pK2 + pKR )/2 第四章1.全酶:具有催化活性的酶,包括所有必需的亚基,辅基和其它辅助因子2.辅因子:辅因子是指与酶(酵素)结合且在催化反应中必要的非蛋白质化合物。从广义上说,凡能促进酶及反应物进入活化状态从而加速酶催化反应的物质都能称为辅因子,它包括种类很广的物质。3.辅基 是与酶蛋白质共价结合的金属离子或一类有机化合物,用透析法不能除去。辅基在整个酶促反应过程中始终与酶的特定部位结合。4.辅酶 某些酶在发挥催化作用时所需的一类辅助因子,其成分中往往含有维生素。辅酶与酶结合松散,可以通过透析除去5.酶原:通过有限蛋白水解,能够由无活性变成具有催化活性的酶前体同功酶:催化同一化学反应而化学组成不同的一组酶。它们彼此在氨基酸序列,底物的亲和性等方面都存在着差异。6.单成分酶:只有一条肽链的酶,其相对分子质量为1300035000,一般是水解酶。7.寡聚酶:含有一条以上肽链的酶,相对分子质量为35000到几百万,多为糖代谢酶8.固相酶:又称固定化酶,水不溶酶。指水溶性酶经物理的或化学的方法处理后,吸附或共价结合在不溶性支持物上而仍具催化活性,从而在催化反应中以固相作用于底物。9.变构酶:变构酶是具有变构效应的酶。有些酶除了活性中心外,还有一个或几个部位,当特异性分子非共价地结合到这些部位时,可改变酶的构象,进而改变酶的活性,酶的这种调节作用称为变构调节,受变构调节的酶称变构酶,这些特异性分子称为效应剂。变构酶分子组成,一般是多亚基的,分子中凡与底物分子相结合的部位称为催化部位,凡与效应剂相结合的部位称为调节部位,这二部位可以在不同的亚基上,或者位于同一亚基。10.核酶:核酶是具有催化功能的RNA分子,是生物催化剂。核酶又称核酸类酶、酶RNA、 核酶类酶RNA。11.单体酶:仅有一个活性中心的多肽链构成的酶12.多酶复合体:几个酶嵌合而成的复合物,一般由26个功能相关的酶组成,它有利于一系列反应的连续进行,以提高酶的催化效率,同时便于机体对酶的调控。13.诱导酶诱导酶是在环境中有诱导物(通常是酶的底物)存在的情况下,由诱导物诱导而生成的酶。14.酶的活性中心:酶分子中直接与底物结合,并和酶催化作用直接有关的区域叫酶的活性中心或活性部位15.酶的活性基团 参与构成酶的活性中心和维持酶的特定构象所必需的基团为酶的必需基团16.酶的活性剂:凡是能提高酶活性的物质都称为激活剂,其中大部分是一些无机离子和小分子简单有机物。如:Na+、K+、Ca2+、Mg2+、Cu2+、Zn2+、Co2+、Cr2+、Fe2+、Cl-、Br-、I-、CN-、NO3-、PO4-等;17.酶的抑制剂:能够引起酶的抑制作用的化合物则称为抑制剂18.酶活力:又称为酶活性,指酶催化一定化学反应的能力,通常以在一定条件下酶所催化的化学反应速度来表示.19.酶活力单位:酶活力单位的量度。1961年国际酶学会议规定:1个酶活力单位是指在特定条件(25,其它为最适条件)下,在1min内能转化1mol底物的酶量,或是转化底物中1mol的有关基团的酶量。20.比活:每分钟每毫克酶蛋白在25oC下转化的底物的微摩尔数。比活是酶纯度的测量。21.米氏常数:对于一个给定的反应,异至酶促反应的起始速度(0)达到最大反应速度(max)一半时的底物浓度。22.维生素:是一类动物本身不能合成,但对动物生长和健康又是必需的有机物,所以必需从食物中获得。许多辅酶都是由维生素衍生的23.温度系数:温度提高10,反应速度与原来反应速度之比,用Q10 表示第五章 糖代谢1糖酵解:将葡萄糖降解为丙酮酸并伴随着ATP生成的一系列反应。2三羧酸循环:丙酮酸以后的氧化都是在线粒体中进行的,可分为两个阶段进行:丙酮酸氧化为乙酰CoA,乙酰CoA的乙酰基部分经过一个循环式系列反应三羧酸循环(TCA循环)被彻底氧化成CO2和H2O,同时释放出大量能量。3磷酸戊糖途径那称为磷酸已糖支路。是一个葡萄糖-6-磷酸经代谢产生NADPH和核糖-5-磷酸的途径。该途径包括氧化和非氧化两个阶段,在氧化阶段,葡萄糖-6-磷酸转化为核酮糖-5-磷酸和CO2,并生成两分子NADPH;在非氧化阶段,核酮糖-5-磷酸异构化生成核糖-5-磷酸或转化为酵解的两用人才个中间代谢物果糖-6-磷酸和甘油醛-3-磷酸。4乙醇发酸5乳酸发酵6葡萄糖的异生作用:糖异生是指从非糖物质合成葡萄糖的过程。第六章 生物氧化1生物氧化:生物细胞将糖、脂、蛋白质等燃料分子氧化分解,最终生成CO2和H2O并释放出能力的作用称为生物氧化。 2氧化磷酸化电子从一个底物传递给分子氧的氧化与酶催化的由和i生成与磷酸化相偶联的过程3磷氧比:每消耗一个氧原子(或每对电子经呼吸链传递至氧)所产生的ATP分子数。 4底物水平磷酸化:代谢物在氧化分解过程中,有少数反应步骤由于脱氢或脱水而引起分子内部能量重新分布,形成了某些高能磷酸键,它可转移给ADP形成ATP的过程。5解偶联作用:所有破坏生物氧化与磷酸化相偶联的作用,即抑制氧化磷酸化的作用即解偶联作用.6解偶联剂 一种使电子传递与磷酸化之间的的紧密偶联关系解除的化合物,g2,4二硝基苯酚第七章 脂类代谢1脂肪酸的氧化:脂肪酸在体内氧化时在羧基端的-碳原子上进行氧化,碳链逐次断裂,每次断下一个二碳单位,即乙酰CoA,该过程称作-氧化2乙醛酸循环:植物细胞内脂肪酸氧化分解为乙酰COA之后,在乙醛酸体(glyoxysome)内生成琥珀酸、乙醛酸和苹果酸;此琥珀酸可用于糖的合成,该过程称为乙醛酸循环(GAC)。3.酮体:脂肪酸在肝脏中不完全氧化的中间产物,是羟丁酸(约占总量70、乙酰乙酸(约占30)和丙酮(含量极微)的统称。第八章 核酸的代谢1.限制性内切酶:限制性内切酶是基因工程中最主要的工具酶,限制性内切酶可识别4或6个特异核苷酸序列,切割特定切点。2.核苷酸从头合成 3.核苷酸的补救合成 4.核酸酶:核酸分解的第一步是水解核苷酸之间的磷酸二酯键,在高等动植物中都有作用于磷酸二酯键的核酸酶。不同来源的核酸酶,其专一性、作用方式都有所不同。有些核酸酶只能作用于RNA,称为核糖核酸酶,有些核酸酶只能作用于DNA,称为脱氧核糖核酸酶,有些核酸酶专一性较低,既能作用于RNA也能作用于DNA,因此统称为核酸酶。根据核酸酶作用的位置不同,又可将核酸酶分为核酸外切酶和核酸内切酶。5.非特异性核酸酶 6.中心法则:述从一个基因到相应蛋白质的信息流的途径。遗传信息贮存在DNA中,DNA被复制传给子代细胞,信息被拷贝或由DNA转录成RNA,然后RNA翻译成多肽。不过,由于逆转录酶的反应,也可以以RNA为模板合成DNA。 7.复制:以亲代DNA或RNA为模板,根据碱基配对的原则,在一系列酶的作用下,生成与亲代相同的子代DNA或RNA的过程。 8.转录 在由RNA聚合酶和辅助因子组成的转录复合物的催化下,从双链DNA分子中拷贝生物信息生成一条RNA链的过程。9.翻译:亦叫转译,以mRNA为模板,将mRNA的密码解读成蛋白质的氨基酸顺序的过程。 10.逆转录:以RNA为模板,在逆转录酶的作用下,生成DNA的过程。11.半保留复制DNA复制的一种方式。每条链都可用作合成互补链的模板,合成出两分子的双链DNA,每个分子都是由一条亲代链和一条新合成的链组成。 12.岗崎片段相对比较短的DNA链(大约1000核苷酸残基),是在DNA的滞后链的不连续合成期间生成的片段,这是Reiji Okazaki在DNA合成实验中添加放射性的脱氧核苷酸前体观察到的。13.有意义链:双链DNA中无转录活性的链称为编码链,又称有意义链(或正链)。 14.无意义链:双链DNA中具有转录活性的链称为模板链,又称反意义链(或负链)。 15.cDNA为具有与某RNA链呈互补的碱基单链DNA即complementary DNA之缩写,或此DNA有与之互补的碱基序列的DNA链所形成的DNA双链 16.基因文库:个生物体的基因组DNA用限制性内切酶部分酶切后,将酶切片段插入到载体DNA分子中,所有这些插入了基因组DNA片段的载体分子的集合体,将包含这个生物体的整个基因组,也就是构成了这个生物体的基因文库。17.光复活第九章 蛋白质代谢1.氧化脱氨作用氨基酸在酶的催化下脱去氨基生成相应酮酸的过程,称作氧化脱氨作用2.必需氨基酸:人体(或其它脊椎动物)必不可少,而机体内又不能合成的,必须从食物中补充的氨基酸,称必需氨基酸。3.遗传密码 核酸中的核苷酸残基序列与蛋白质中的氨基酸残基序列之间的对应关系。;连续的3个核苷酸残基序列为一个密码子,特指一个氨基酸。标准的遗传密码是由64个密码子组成的,几乎为所有生物通用。4.密码子 mRNA(或DNA

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