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基因启动子序列的查找 1 一 基因序列查找 NCBI 选择 Gene 输入基因的名字 eg p53 Search 2 基因序列查找 选择特定物种的p53基因 eg TP53 human 3 基因序列查找 获得TP53基因的详细信息 基因名称 全称 别名 类型等 下拉获得更多详细信息 4 基因序列查找 基因组结构 不同版本中 此基因在染色体中的位置 转录方向等 5 基因序列查找 基因组区域 转录 产出 p53基因在不同转录本中的信息 点击GenBank 6 GenBank 获得基因详细信息 位置 定义 登录号 版本 特征 碱基序列等 7 基因序列查找 FASTA 获得基因的全部序列 包括非转录区序列 8 启动子序列的查找 1 在NCBI中查找所需的基因 以p53为例 查找P53的基因序列 9 启动子序列的查找 1 在NCBI中查找所需的基因 以p53为例 选择特定物种的P53基因 例如human 10 启动子序列的查找 1 在NCBI中查找所需的基因 以p53为例 获得humanp53基因的详细信息 11 启动子序列的查找 2 确定此基因在染色体上的位置和转录方向 正向 反向 在染色体上的位置 Chromosome17 NC 000017 11转录方向 从右向左 反向转录 说明启动子区与第一外显子区位于此段基因的右侧 12 启动子序列的查找 3 确定启动子区与第一外显子区的长度 获得FASTA格式的序列信息 右侧为此段基因的长度 766bp 启动子区位于基因5 端2000bp 即768bp 13 启动子序列的查找 3 确定启动子区与第一外显子区的长度 查找第一外显子的位置 在p53基因的详细信息页面中查找mRNA的详细信息 确定其在基因序列中的位置 14 启动子序列的查找 3 确定启动子区与第一外显子区的长度 进入P53基因mRNA的详细信息界面 15 启动子序列的查找 3 确定启动子区与第一外显子区的长度 进入P53基因mRNA的详细信息界面 找到exon 第一外显子 的位置 1 174bp 16 启动子序列的查找 3 确定启动子区与第一外显子区的长度 进入P53基因FASTA信息的界面 确定第一外显子的长度 第一外显子位于基因5 端1 174bp的位置 由于基因为从右向左反向转录 第一外显子位于启动子 768bp 的左侧174bp 7687376 7687550bp 第一外显子 启动子 7687376 7689550bp 17 启动子序列的查找 4 下载启动子区与第一外显子区的序列 数据保存为FASTA格式 18 启动子序列的查找 4 下载启动子区与第一外显子区的序列 数据保存为FASTA格式 用word打开 19 启动子序列的查找 4 下载启动子区与第一外显子区的序列 去除序列中的段落标记 Word 查找替换 特
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