几种重要的氢键.doc

一.氢键产生的条件和影响 在许多情况下，一个氢原子不仅仅被一个原子而是被两个原子强有力地吸引着，因此可以把它看作是在两个原子之间的键-氢键，可表示为X-HY 氢键是一种弱键，键能在2-10kcal/mol范围，因为键能小，它在形成和分离时所需的活化能也很小，特别适合在常温下的反应. 氢键能使蛋白质分子限制在它的天然构型上。今天，正当生命科学对我们生存的社会发生越来越大的影响时，了解氢键在蛋白质、核酸等大分子中的作用有更重要的意义。 氢键是氢的正离子（异常小）把一个负离子吸引到一个平衡距离，同样，它还可以吸引第二个负离子，从而形成一个稳定的复合体，但是由于负离子的排斥作用，氢质子不可能再吸引第三个负离子，所以氢的配位数为2。一般说来，氢原子只与电负性最大的元素如F、O、N、Cl等形成氢键。而电负性越大，氢键强度也越大。实验发现，氟生成的氢键很强，氧的较弱，氮、氯更弱。在所有的氢键中，氢原子总是比较靠近两个原子中的一个，例如冰的晶体中，质子离一个氧原子的距离为100pm，离另一个氧原子为176pm。形成氢键的物质的物理性质，如沸点、熔点会发生明显的变化-由此得出结论， HF、NH3、H2O晶体中的氢键在熔化时一部分被破坏，还有一部分（超过半数）还留在液体中，最后汽化时才破坏。只有HF中的氢键特别强，在蒸汽中仍有部分聚合体。 有些液态物质如NH3、H2O，观察到反常的高介电常数，可归结为氢键产生的连续聚合作用。 二.几种重要化合物的氢键 1.水 水是地球上数量最多的化合物之一，与人们的生活、动植物生长、工农业生产密切相关。由于水的结构在不同温度、压力下都有变化，几个世纪前人们就开始研究水的结构，这种研究一直持续至今日。 气态单个水分子的结构已确定键长95.7pm，HOH为在冰、水或水合物晶体中，H2O分子均可看作按四面体方向分布的电荷体系。水分子的两个氢原子指向四面体的两个顶点，显正电性。而氧原子上的两个孤对电子指向四面体另外的两个顶点，显负电性。正电性一端常和另一水分子的负电性一端或其它负离子结合，形成，或型氢键；负电性的一端常和正离子或其它分子的正电性一端结合，形成，等型式的氢键。常压下，水冷至0以下即可形成六方晶系的冰-Ih，生活中常见的冰、雪、霜都属于这种结构。0C时，冰的六方晶系参数为：a=452.27pm，c=736.71pm。晶胞中包含4个水分子，空间群为P61/mmc，密度为0.9168gcm-3。在冰的晶体中，氢原子核为无序分布，氢原子与近端氧原子的平均距离为97pm，与远端氧相距约为179pm。在真空中，控制温度在133153k，可从水蒸气直接结晶成立方晶系的冰Ic，Ic晶体中氧原子排列和金刚石相似，而氢原子也是无序排列。冰在加压条件下，还可转变成一列不同晶型IIIX，其中VIII与IX为低温时的晶型。各种高压晶型的冰，其密度都比冰I高( 1.17， 1.16， 1.29，V 1.23，VI 1.31，1.65，IX1.16gcm-3)。其原因不是高压下氢键O-HO缩短所致，而是O原子配位数增加，出现O和O的非键配位，使其密度增大。液态水的结构也有多种变化，至今仍是研究热点，国际上有人用分子动力学模拟液态水的结构。2.醇与羧酸 在结晶醇中，分子通常用折链状氢键联合成聚合体。甲醇晶体就具有这种链状结构，氢键长度为266pm。晶体熔化时形成链状或环状联合体，一般氢键未破坏。从液态变为气态，氢键受到破坏，气化热与沸点均明显升高。有人发现甲醇蒸气中有四聚体存在，它的结构可能是四个氢键组成的正方形结构： 季戊四醇形成四方晶体，氢键键长269pm，把氧原子联结成与甲骨醇四聚体相同的正方形结构。 图616 季戊四醇C(CH2OH)4结构 大圆圈表示氧原子，中等圆圈表示碳原子小圆圈表示与碳原子联结的氢原子，双线表示氢键 许多羧酸由于氢键可产生二聚体，例如乙酸二聚体中氧氢键长度为107.5pm，比冰中101pm大得多，这是由于氢键强度增加所致。 氢键对晶体物理性质的影响在草酸中表现很突出。草酸有两种无水晶型。型形成氢键结合的分子层，因此很容易解离，一层层剥开。 型晶体含有长分子链结构, 两种晶型中氢键长度约为265pm。二者的结构如图所示。 图617 草酸型晶体的层状结构 图618 草酸型晶体的链结构 其它的羧酸都有类似结构，如丁二酸COOH(CH2)2COOH，戊二酸COOH(CH2)3COOH，己二酸COOH(CH2)4COOH等。 3.核酸中的氢键 核酸构成遗传的基因，同时控制着蛋白质的制造和有机体细胞的机能。去氧核糖核酸结构中，氢键起着重要的作用。这个结构包含形成一个双螺旋体的两个相互交织的多核甙酸链的细致互补结构，链上的每一对核甙酸分子来说，一个链上的嘧啶根与另一个链上的嘌呤根之间