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文档简介
生物化学复习资料氨基酸的等电点:在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等, 所带净电荷为零,呈电中性,此时溶液的pH称为该氨基酸的等电点。(P40)茚三酮反应:在加热条件下,所有氨基酸及具有游离-氨基的肽与茚三酮反应都产生紫色 物质的反应。只有脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮反应产生(亮)黄色物质。(P43)氨基酸残基:肽链中的氨基酸由于参加肽键的形成已不是原来完整的分子,因此称为氨基酸 残基。(P45)必需脂肪酸:指人体维持机体正常代谢不可缺少而自身又不能合成、或合成速度慢无法满足 机体需要,必须通过食物供给的脂肪酸。(亚油酸和亚麻酸)(P25)必需氨基酸:指人体自身不能合成或合成速度不能满足人体需要,必须从食物中摄取的 氨基酸。(P39)超二级结构:也称之基元。在蛋白质中,特别是球蛋白中,经常可以看到由若干相邻的二级 结构单元组合在一起,彼此相互作用,形成的有规则、在空间上能辨认的二级 结构组合体。(P53)分子病:由于遗传上的原因而造成的蛋白质分子结构或合成量的异常所引起的疾病。(P60)DNA变性:指DNA分子由稳定的双螺旋结构松解为无规则线性结构的现象。(P98)解链温度:双链DNA或RNA分子丧失半数双螺旋结构时的温度。符号:Tm。每种DNA或 RNA分子都有其特征性的Tm值,由其自身碱基组成所决定,G+C含量越多, Tm值越高。(P98)增色效应:核酸(DNA和RNA)分子解链变性或断链,其紫外吸收值(一般在260nm处测量) 增加的现象。(P98)酶的活性中心:在酶蛋白分子中直接参与和底物结合并起催化作用的区域称为酶的活性部位 或活性中心。酶的活性中心一般包括结合部位和催化部位。(P147)酶的别构效应:调节物与酶分子的调节部位结合后,引起酶分子构象发生变化,从而提高或 降低酶活性的效应称为别构效应。提高酶活性的别构效应,称为别构激活或 正协同效应;降低酶活性的别构效应,称为别构抑制或负协同效应。(P167)酶的比活力:每毫克蛋白所含的酶活力单位数。(P172) 对于同一种酶来说,比活力愈大,表示酶的纯度愈高。米氏方程:表示一个酶促反应的起始速度(V)与底物浓度(S)关系的速度方程, VVmaxS/(Km+S)。(P157)米氏常数:在酶促反应中,某一给定底物的动力学常数,是由反应中每一步反应的速度常数 所合成的。根据米氏方程,其值是当酶促反应速度达到最大反应速度一半时的底 物浓度。符号Km。(P157)同工酶:一类来自同一生物不同组织或同一细胞而不同亚细胞结构、能催化相同反应、其 分子结构却有所不同的一组酶。(P169)氧化磷酸化:指细胞内伴随有机物氧化,利用生物氧化过程中释放的自由能,促使ADP与 无机磷酸结合生成ATP的过程。主要在线粒体中进行。(P206)底物水平磷酸化:指直接由一个代谢中间产物(如磷酸稀醇式丙酮酸)上的磷酸基团转移到 ADP分子上,而生成ATP的反应。(P206)解偶联剂:指那些不阻断呼吸链的电子传递,但能抑制ADP通过磷酸化作用转为ATP的 化合物。(P212)酮体:在肝脏中,脂肪酸氧化分解的中间产物乙酰乙酸、-羟基丁酸及丙酮,三者统称为 酮体。(P296)呼吸链:线粒体内膜上存在多种酶与辅酶组成的电子传递链,可使还原当量中的氢传递到氧 生成水。(P199)磷氧比(P/O):指当一对电子经呼吸链传给氧的过程中所产生的ATP分子数,即消耗的无 机磷酸的分子数与消耗分子氧的氧原子数之比。(P210)磷酸戊糖途径:又称已糖单磷酸旁路或磷酸葡萄糖旁路。此途径由6-磷酸葡萄糖开始生成 具有重要生理功能的NADPH和5-磷酸核糖。全过程中无ATP生成,因此 此过程不是机体产能的方式。(P237)转氨基作用:指的是一种-氨基酸的-氨基转移到一种-酮酸上的过程。转氨基作用是 氨基酸脱氨基作用的一种途径。密码子:由3个相邻的核苷酸组成的信使核糖核酸(mRNA)基本编码单位。SD序列:mRNA中用于结合原核生物核糖体的序列。SD序列在细菌mRNA起始密码子AUG 上游10个碱基左右处,有一段富含嘌呤的碱基序列,能与细菌16SrRNA3端识别, 帮助从起始AUG处开始翻译。冈崎片段:在DNA复制过程中,后随链的合成是不连续的,由许多断断续续的小片段组成, 称这些不连续的小片段为冈崎片段。中心法则:是指遗传信息从DNA传递给RNA,再从RNA传递给蛋白质,即完成遗传信息 的转录和翻译的过程。也可以从DNA传递给DNA,即完成DNA的复制过程。 这是所有有细胞结构的生物所遵循的法则。在某些病毒中的RNA自我复制 (如烟草花叶病毒等)和在某些病毒中能以RNA为模板逆转录成DNA的过程 (某些致癌病毒)是对中心法则的补充。 有义链:DNA双链在转录过程中与转录形成的RNA序列相同(T对应U)的那条链叫做 有义链。密码的简并性:大多数氨基酸都是由几个不同的密码子编码的,这一现象称密码的的简并性。密码子摆动性:配位时,密码子的第一、第二位碱基严格配对,第三位碱基可以有一定的 变动。同义密码子:编码相同氨基酸的密码子。启动子:DNA分子上能与RNA聚合酶结合并形成转录起始复合体的区域,在许多情况下, 还包括促进这一过程的调节蛋白的结合位点。 DNA半保留复制:DNA复制时,亲代DNA的双螺旋先解旋并分开,后以每条链为模板, 按照碱基配对原则,各形成一条互补链,从亲代的一个DNA双螺旋分子 复制成两个与亲代碱基序列完全相同的子代DNA分子,每个子代DNA 中都有一条链来自亲代DNA,另一半则是新形成的。半不连续复制:指DNA复制时,前导链上DNA的合成是连续的,后随链上是不连续的,故 称为半不连续复制。DNA复制的最主要特点是半保留复制,另外,它还是半 不连续复制。半不连续模型是DNA复制的基本过程。翻译:在多种因子辅助下,核糖体结合信使核糖核酸(mRNA)模板,通过转移核糖核酸(tRNA) 识别该mRNA的三联体密码子和转移相应氨基酸,进而按照模板mRNA信息依次连续 合成蛋白质肽链的过程。 三羧酸循环(TCA循环):是需氧生物体内普遍存在的代谢途径,因为在这个循环中几个主 要的中间代谢物是含有三个羧基的柠檬酸,所以叫做三羧酸循环,又称为柠檬酸循环。体内物质糖类、脂肪或氨基酸有氧氧化的主要过程。通过生成的乙酰辅酶A与草酰乙酸缩合生成柠檬酸(三羧酸)开始,再通过一系列氧化步骤产生CO2、NADH及FADH2,最后仍生成草酰乙酸,进行再循环,从而为细胞提供了降解乙酰基而提供产生能量的基础。由克雷布斯(Krebs)最先提出。三羧酸循环是三大营养素(糖类、脂类、氨基酸)的最终代谢通路,又是糖类、脂类、氨基酸代谢联系的枢纽。糖异生:体内从非糖类物质如氨基酸、丙酮酸、甘油等合成葡萄糖的代谢,是维持血糖水平 的重要过程。1.引起蛋白质沉淀的因素有哪些?什么是蛋白质变性,蛋白质变性以后有哪些表现?(P64)答:引起蛋白质沉淀的因素:(1)加高浓度的中性盐类;(2)加有机溶剂;(3)加重金属盐; (4)加生物碱试剂或某些酸类;(5)加热变性沉淀。 天然蛋白质因受物理或化学因素的影响,其分子内部原有的高度规律性结构发生变化, 致使蛋白质的理化性质和生物学性质都有所改变,但并不导致蛋白质一级结构的破坏, 这种现象称变性作用。 蛋白质变性后的表现:(1)生物学活性丧失;(2)理化性质改变; (3)生物化学性质的改变。2.维持蛋白质构象的作用力?(P47)答:(1)一级结构:肽键、二硫键。(2)二级结构:氢键。(3)超二级机构:氢键。 (4)三级结构:(非共价键、次级键)氢键、范德华力、疏水相互作用、盐键、二硫键。 (5)四级结构:(非共价键、次级键)氢键、范德华力、疏水相互作用、盐键、二硫键。3.-螺旋的结构特点?(P51)答:(1)多肽主链可以按右手方向或左手方向盘绕形成右手螺旋或左手螺旋。 (2)每圈螺旋包括3.6个氨基酸残基,螺距为0.54nm,相当于每个氨基酸残基绕螺旋轴 旋转100,沿轴上升0.15nm。 (3)氢键维持其稳定性。4.Waston-Click所建立的DNA双螺旋结构有哪些特点?(P84)答:(1)双螺旋是反向平行双链绕理想的空心轴作右手螺旋。 (2)双螺旋的外侧是两条由脱氧核糖磷酸构成的主链(骨架),双螺旋的内部是配对 碱基(每个脱氧核苷酸残基沿纵轴旋转36并上升0.34nm,碱基对的平面与纵轴 垂直)。 (3)双螺旋内部的碱基按AT,CG配对。 (4)双螺旋的两条链是互补关系。 (5)双螺旋的直径是2nm,大沟与小沟是蛋白质识别DNA的碱基序列。5.生物氧化的概念和特点?(P191)答:生物氧化:是指糖类、脂质、蛋白质等有机物质在细胞中被氧化分解,产生CO2和H2O, 同时释放出能量的过程。 特点:(1)生物氧化在温和条件下进行。 (2)生物氧化需要一系列酶、辅酶和中间递质体参与。 (3)生物氧化是逐步释放能量的过程,且大部分能量被贮存到ATP中。6.酶的活力、活力单位、比活力、米氏方程及其计算。(P171)答:酶的活力:指酶催化一定化学反应的能力。通常用最适条件下酶所催化的某一化学反应 的速率来衡量酶活力的大小。 酶的活力单位:在特定条件下,1min内将1mol的底物转化为产物的量,或是转化底 物中1mol有关基团的量定义为一个单位(IU)。 酶的比活力:每毫克蛋白所含的酶活力单位数。 对于同一种酶来说,比活力愈大,表示酶的纯度愈高。 米氏方程:表示一个酶促反应的起始速度(V)与底物浓度(S)关系的速度方程, VVmaxS/(Km+S)。7.简述诱导契合学说。(P149)答:诱导契合学说认为:酶在发挥催化作用时,必需与底物结合,这种结合是酶与反应物相互诱导,相互发生构象变化的适应过程,即酶分子的构象与底物的结构原来并不完全吻合,当酶接近底物时,其两者才相互诱导适应。8.比较竞争性、非竞争性、反竞争性抑制作用的特点。(P165)抑制类型对动力学常数的影响动力学方程竞争性抑制Km增大,Vmax不变V= VmaxSKm(1+I/ki)+S非竞争性抑制Km不变,Vmax减小V= VmaxS(Km+S )(1+I/ki)反竞争性抑制Km减小,Vmax减小V= VmaxS Km+S(1+I/ki)9.脲酶的Km值为25mM,为使其催化尿素水解的速度达到最大速度的95%,反应系统中尿素浓度应为多少?解:根据米氏方程:VVmaxS/(Km+S) 故 0.95VmaxVmaxS/(Km+S) S19Km1925mM475mM答:反应系统中尿素浓度应为475mM。10.若一个酶的Km24104mol/L,当S0.05mol/L时,测得V128mol/Lmin,试计算当S104mol/L时的酶促反应速度。解:根据米氏方程:VVmaxS/(Km+S) 将V128mol/Lmin,S0.05mol/L,Km24104mol/L代入得 Vmax128mol/Lmin 当S104mol/L时 VVmaxS/(Km+S)5.12mol/Lmin答:当S104mol/L时的酶促反应速度为5.12mol/Lmin。11.一个蛋白质的分子量是100000,那么它编码的一个基因DNA的分子量大约是多少?为便于计算,氨基酸的平均分子量以100计,核苷酸对的平均分子量以670计。解:M蛋白质100 n蛋白质100000/1001000 需要3000个核苷酸编码1000个氨基酸 基因DNA的分子量为M1.23000670402000012.与一般催化剂相比酶的催化反应的特点?影响酶促反应速度的因素?答:酶的催化反应的特点:(1)反应条件温和;(2)高效性;(3)专一性; (4)活性的可调性;(5)不稳定性。 影响酶促反应的因素:(1)底物浓度;(2)酶浓度;(3)温度; (4)PH值;(5)激活剂;(6)抑制剂。13.请写出三羧酸循环中四步脱氢反应和一步底物水平磷酸化的反应。答:四步脱氢反应:3.4.6.8 3.异柠檬酸生成酮戊二酸:在异柠檬酸脱氢酶作用下,异柠檬酸脱下2个H+使NAD+ 生成NADH+H+,同时异柠檬酸生成草酰琥珀酸,草酰琥珀酸很不稳定,在Mg2+和Mn2+ 协助下脱去羧基生成酮戊二酸。 4.酮戊二酸生成琥珀酰CoA:酮戊二酸在酮戊二酸脱氢酶系作用下,脱氢、 脱羧生成琥珀酰CoA。 6.琥珀酸生成延胡索酸:琥珀酸脱氢酶催化琥珀酸氧化成为延胡索酸。 8.苹果酸生成草酰乙酸:在苹果酸脱氢酶作用下,苹果酸脱下两个氢生成草酰乙酸。 一步底物水平磷酸化反应:5 5.琥珀酸CoA生成琥珀酸:在琥珀酸CoA合成酶,也称琥珀酸硫激酶的作用下,水解 琥珀酰CoA的硫酯键,同时释放出一个高能磷酸酯键交给GDP生成一个GTP。14.何为糖的异生作用?它通过哪些反应绕过了糖酵解的三步不可逆反应?(可以不写结构式用中文或代号表示但要写出催化反应的酶)答:葡萄糖异生作用是指以非糖有机物作为前体合成葡萄糖的过程。这是植物、动物体内一种重要的单糖合成途径。 (1)丙酮酸 草酰乙酸 磷酸稀醇式丙酮酸 (丙酮酸羧化酶、稀醇式丙酮酸酶) (2)果糖1,6二磷酸 果糖6磷酸 (果糖1,6二磷酸酶) (3)葡萄糖6磷酸 葡萄糖 (葡萄糖磷酸酶)15.假定下面的DNA从右到左进行转录 5 TATCGCAGGCTT 3 链1 3 ATAGCGTCCGAA 5 链2(1)那条链是有义链? 答:链2为有义链。转录是在DNA指导下,以ATP为原料,在RNA聚合酶的作用下合成 RNA的过程,由5 3。(2)产生的mRNA核苷酸的顺序如何? 答:AUAGUGUCCGAA。(3)由此mRNA编码的多肽链是什么?(用三字符号表示氨基酸残基) 注:密码子编码的氨基酸为:AAGLys(赖氨酸) CCUPro(脯氨酸) GCGAla(丙氨酸) AUAIle(异亮氨酸) GAAGlu(谷氨酸) UCCSer(丝氨酸) 答:Lys-Pro-Ala-Ile。5AAGCCUGCGAUA 316.磷酸戊糖途径的特点及其生物学意义。答:特点:(1)产生NADPH。 (2)生成磷酸核糖,为核酸代谢做物质准备。 (3)分解戊糖。 生物学意义:(1)补充糖酵解。 (2)氧化阶段产生NADPH,促进脂肪酸和固醇合成。 (3)非氧化阶段产生大量中间产物为其它代谢提供原料。17.试计算1分子棕榈酸(软脂酸)彻底氧化分解产生ATP的分子数。答:分析:棕榈酸(C15H31COOH)需经历7轮氧化作用而生成8分子乙酰CoA,乙酰CoA再进入三羧氨循环彻底氧化。(1)活化:需要1分子ATP转变成AMP,相当于消耗2分子ATP。 (2ATP)(2)氧化:每经历一轮氧化,1分子FAD被还原成FADH2(第一步脱氢),1分子NAD+被还原成NADH+H+,两者进入呼吸链可分别生成1.5分子ATP,2.5分子ATP。即每经历一轮氧化作用,产生4分子ATP。总共七轮反应,故生成的ATP分子数为4728。(28ATP)(3)乙酰CoA彻底氧化:每分子乙酰CoA经三羧氨循环可产生10分子ATP,总:10880。 (80ATP)综上:1分子棕榈酸彻底氧化分解产生的ATP分子数为80+282106。18.以软脂酸为例比较脂肪酸氧化和从头合成的不同。(P304)区别点饱和脂肪酸从头合成脂肪酸-氧化细胞内进行部位脂酰基载体加入或断裂的二碳单位电子供体或受体能量(以软脂酸为例)对HCO3-和柠檬酸的需求底物的转运链延伸或缩短的方向动物:细胞质;植物:叶绿体/前质体ACP、p-酮脂酰-ACP合酶、CoA丙二酸单酰CoANADPH消耗7个ATP及14个NADPH需要柠檬酸穿梭系统从位到羧基线粒体、过氧化物酶体、乙醛酸体CoA乙酰CoANAD+、FAD产生106个ATP不需要肉碱转运从羧基端开始19.尿素循环的特点。(P324)答:(1)前两步反应在线粒体中进行,后三步反应在胞液中进行。(2)整个进程中有4种氨基酸参与,他们是精氨酸、天冬氨酸、瓜氨酸、鸟氨酸。(3)形成1分子尿素消耗4个高能磷酸键。(4)参与反应的酶有:氨甲酰磷酸合成酶氨甲酰磷酸转移酶精氨琥珀酸合成酶精氨琥珀酸裂解酶 精氨酸酶。(5)是动物细胞排氨的主要方式。20.简述原核生物DNA复制过程?(P368)答:(1)复制的启动:从特定的位点开始,这一位置叫复制原点。(2)复制眼的形成:双螺旋解开的过程:解螺旋酶使DNA双螺旋局部解链;SSB结合到解开的。单链上:拓扑异构酶向DNA中引入负超螺旋,以消除由解链产生的扭曲张力。(3)复制叉的推进:先导链的合成:引物酶,DNA聚合酶;随后链的合成:引物的合成,冈崎片段的合成,冈崎片段的连结。这种先导链连续合成,随后链断续合成的方式,称为半不连续复制。先导链和随后链中DNA的延伸由同一个DNA聚合酶全酶二聚体催化。(4)复制的结束。21.比较复制与转录的差异。DNA复制DNA转录原料dNTPNTP模板完整两条链双向复制DNA区段一条链不对称转录引物DNA为引物不需要产物两条DNA双链一条单链mRNA酶与蛋白因子9种酶和蛋白因子全酶校正功能有无差错率109-1010104-10522.何为半保留复制,DNA复制保持准确性(或高保真度)的机制有哪些?答:DNA复制时,亲代DNA的双螺旋先解旋并分开,然后以每条链为模板,按照碱基配对原则,各形成一条互补链。这样,从亲代的一个DNA双螺旋分子复制成两个与亲代的碱基序列完全相同的子代DNA分子。每个子代DN
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