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在真核生物的染色体末端,也就是线状DNA末端,存在一种特殊结构,即所谓的 端粒。端粒的DNA序列是一段简单碱基(一般是6-8个核苷酸)的多次重复(人的端粒总长度大于300kb),几乎所有真核生物的端粒的5-3 方向,都富含T和G两种核苷酸,(如人类是5-TTAGGG-3)。端粒也是有碱基互补配对的,其反义链就是5-CCCTAA-3。在端粒的最末端几十至数百个碱基,往往由于端粒酶活性不足、连接酶无法有效结合等问题,形成游离的单链。这里就不能正常互补配对了。好在端粒的几个特点可以保障末端结构的稳定性:1, 通常DNA缠绕在组蛋白上,但端粒组蛋白含量偏低,而是另一类蛋白:端粒结合因子-I (telomeric repeatbinding factor-1 ,TRF1)在其双链区域,并使端粒发生环化。称为telomere loops 或T-loops。2,TRF家族蛋白还有一个重要成员TRF2,可以结合在端粒终了的未配对区域,制造特殊的环,如图B所示,让单链与已形成的DNA双链重新形成特殊的三链互补配对环,这个小环也叫 displacement loop,或 D-loop。有了D-loop,端粒就彻底封闭了。3,上图A、B中所示的仅是染色体上最后一个的T-loop(也就是含有D-loop的T-loop),其实T-loop有很多个,他们在TRF-1的作用下,形成弹簧一样的螺线圈,这也就是端粒的超螺旋了。这一就从更高级的结构上,保护了端粒末端。4,不仅如此,端粒还有很多可以与GGG序列亲和的蛋白,保护又一步加强了。当然了,端粒上单链DNA的保护机制与双链DNA的拓扑结构还有很多种。如下图(a)的4条互补链形成的螺旋。以及下图所示四条互补链螺旋相应的拓扑结构:这种特殊结构的形成与端粒DNA富含GGG序列有直接关系
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