辣椒英文文献已读.doc

2001年，C. Djian-Caporalino L. Pijarowski A. Fazari M. Samson L. Gaveau C. OByrne V. Lefebvre C. Caranta A. Palloix P. Abad发表文章High-resolution genetic mapping of the pepper (Capsicum annuum L.)resistance loci Me3 and Me4 conferring heat-stable resistance to root-knot nematodes (Meloidogyne spp.)采用从C. annuum F1代得到的双单倍体(DH)群体构建了两张种内图谱，主要采用AFLP 和 RAPD标记。图谱长度1,582 cM ，共 227 标记，18个连锁群，覆盖了67%的辣椒基因。本研究采用的材料是C. annuum parents Yolo Wonder(YW) and PM687。抗性品系PM687来源于印度，从PI322719群体中获得，YW是一个感病品种，Me3和Me4都是抗根结线虫基因。PM687和YW杂交F1代有103个单双倍体（DH）,163株F2代个体，Perennial, another inbred line of C. annuum (see Table 1)used to generate the DH200 pepper map，另外一个亲本。采用RAPD和AFLP标记，分析产生了与Me3连锁的8个相斥性标记和4个相引性标记。在基因两边最近的距离是0.5,1.0,1.5和3cm，Me4与Me3相距100cm,Me3最近的基因名为Q04-0.3，距RAPD标记10.1cm,名为CT135d的距RFLP标记2.7cm.。Me4 maps 104 cM from Me3，The most-tightly linked AFLP markers we have identified so far are separated from Me3 by 0.5 cM on one side and 3 cM on the other side。2006年Yasuhiro Minamiyama Masato Tsuro Masashi Hirai发表文章，An SSR-based linkage map of Capsicum annuum，利用SSR标记。亲本为Manganji微辣，长圆锥型果实，另一个亲本为Tongari无辣，长块状型，种内杂交后代共117株，构建一张C. annuum图谱，种间双单倍体群体，包含9个已报道过的SSR，AFLP,CAPS,和RAPD和果实辛辣性状的标记。这个图谱包含374个标记，含106个新型SSR，13个连锁群，共1042cm,，每个位点平均等位基因有2.9个，平均PIC值（多态信息含量）为0.46.覆盖了Capsicum annuum大部分的基因。本研究分析了114个SSR位点，288个AFLP标记，60个RAPD标记，一个CAPS标记，长度1042.2cm,13个连锁群，LOD值为6.5，标记之间的平均距离是2.8cm,x辛辣性状位点c与SSR标记CAMS327连锁，位于LG13上。2000年，A. Ben Chaim R.C. Grube M. Lapidot M. Jahn I. Paran发表文章Identification of quantitative trait loci associated with resistance to cucumber mosaic virus in Capsicum annuum本研究中，亲本为自交甜铃型Capsicum annnum Maor,，感病品种，和自交辛辣小果型印度抗病品种C. annuum var. Perennial，种内自交获得180株F3群体，采用RFLP,AFLP,RAPD分子标记技术构建图谱，检测到4个抗CMV的QTL,，主要OTL是cmw11.1,与抗烟草花叶病毒的L基因相连，解释了表型变异的25-46%。其余三个QTL分别是cmv4.1,cmv6.1,cmv13.1.2004年，L. H. Wang . B. X. Zhang . V. Lefebvre . S.W. Huang . A. M. Daubze . A. Palloix发表文章QTL analysis of fertility restoration in cytoplasmic male sterile pepper-辣椒的细胞质雄性不育的育性恢复的QTL检测。本研究采用亲本为测交后代77013A（严格的细胞质雄性不育系），和双单倍体群体114型，此亲本来源于Yolo wonder（不良保持系）和Perennial（育性恢复系）。育性恢复的主要QTL位于染色体6上，解释恩了2069%的表型变异，4个副效QTL分别位于染色体P5，P2，连锁群PY3，PY1.解释了717%的表型变异。得到的图谱包括了630个分子标记，50个RFLP,46个AFLP,27个RAPD,38个已知基因，和2个表性基因。22个连锁群，覆盖长度为1770cm,平均距离为11.8cm(9.0).本研究是第一个在辣椒中研究细胞质雄性不育系育性恢复的QTL研究。2003年，V. Lefebvre A.-M. Daub_ze J. Rouppe van der Voort J. Peleman M. Bardin A. Palloix等人发表文章QTLs for resistance to powdery mildew in pepper under natural and artificial infections在自然和人工条件下辣椒抗白粉病的QTL研究本研究是第一个研究辣椒白粉病的亲本 H3-辛辣小果型C. annuum 自交系，抗白粉病品种。Vania是铃型自交系感病品种。杂交得到 F1 代杂合体。F1代杂合体形成101株双单倍体群体(HV population),得到的图谱包括553个分子标记，最小LOD值为5.0，最大重组分数是0.3.共有134个标记进入谱图，包含一个形态标记，32个RFLP，27个RAPD,和74个AFLP标记。图谱长度1513cm,20个连锁群，标记之间的距离为12.9cm.。检测到5个QTL，分别位于染色体P5, P6, P9, P10 and P12。上位效应检测到额外两个QTL，位于P2和未分配连锁群HV1上，染色体6上的QTL区域最多，解释了26%的表型变异。2001年，C. Caranta S. Pflieger V. Lefebvre A.M. Daubze A. Thabuis A. Palloix等人发表文章QTLs involved in the restriction of cucumber mosaic virus (CMV) long-distance movement in pepper本研究采用亲本为Vania，CMV抗性基因，铃型自交系，另一亲本为H3，杂交得到F1代，花粉在体外培养得到双单倍体（101DH系），采用两种方法。一种是在植株叶片上接种普通CMV,另一种是在籽苗上接种非典型性CMV.本研究得到184个标记图谱，包含93AFLP,51RFLP,38RAPD,和两个形态学标记。20个连锁群，共有1600cm,检测到7个染色体区段，包含一个主效QTL和几个副效QTL,主效QTL是cm12.1,解释了4563.6%的表型变异。副效基因为cm11.2,cm11.1,cm5.1.2003年，J. M. Lee S. H. Nahm Y. M. Kim B. D. Kim发表文章，Characterization and molecular genetic mappingof microsatellite loci in pepper辣椒微卫星基因座的特性和分子遗传图谱annuum cv TF68 与 C. chinense cv Habanero种间杂交，得到107株F2代植株，采用SSR和RFLP标记，得到46个SSR和287个RFLP,图谱长度为1761.5cm，标记间的平均距离为5.3cm.2000年，B.C. Kang S.H. Nahm J.H. Huh H.S. Yoo J.W. Yu M.H. Lee B.-D. Kim Theor Appl Genet (2001) 102:531539 发表文章An interspecific (Capsicum annuum C. chinese) F2 linkage map in pepper using RFLP and AFLP markers本研究构建辣椒图谱，经 TF68 (C. annuum) 和Habanero (C. chinense) 种间杂交后代F2群体107株植株，150个RFLP,430个AFLP标记。得到11个大的连锁群(20660.3 cM) 和 5 个小连锁群 (32.610.3 cM) 。总长度为1320cm，标记间的平均距离为7.5cm.。2010年 ，Jundae Lee1, Jee-Hwa Hong2, Jae Wahng Do1, Jae Bok Yoon1发表文章Identification of QTLs for Resistance to Anthracnose to Two Colletotrichum Species in Pepper辣椒两个炭蛆菌品种的炭蛆病抗性QTL分析本研究的抗性亲本Capsicum baccatum PBC81，易感亲本和轮回亲本是C. annuum SP26 (Matikas)，270株种间杂交BC1F1代与SP26回交获得87株BC1F2代群体。两个碳蛆菌为C. acutatum and C. capsici,构建图谱及进行QTL定位研究。得到218个分子标记，包括197个AFLP和21个SSR进入图谱，覆盖长度为325cm,13个连锁群。标记之间的平均距离为1.49cm.QTL检测结果。抗C. acutatum有3个QTL，抗capsici有四个QTL。副效 QTL CcR12.2 和主效 QTL CaR12.2 处于同一位置, 副效 QTL CaR9 和主效QTL CcR9 也处于同一位置。对C. acutatum碳蛆菌检测到个主要QTL，CaR12.2和CaR12.1，对C. capsici检测到一个主效QTL，CcR9，2011年，Arnon Brand Yelena Borovsky Sagit Meir Ilana Rogachev Asaph Aharoni Ilan Paran发表文章pc8.1, a major QTL for pigment content in pepper fruit,is associated with variation in plastid compartment size本研究亲本材料为暗绿色辣椒亲本自交系C. annuum1154，浅绿色亲本PI152225(C. chinense)，1154作为轮回亲本，由BC2F1代自交得到150株BC2F2代植株，构建图谱。采用RFLP和AFLP标记，图谱由200个AFLP,RFLP,COSII组成，覆盖长度为1374cm,共11个连锁群。检测到两个关于色素含量的QTL，位于连锁群8上的(pc8.1) 和 连锁群10 上的(pc10.1)。其中，pc8.1是主效QTL，解释了表型变异的54%，pc10.1是副效QTL,解释了15%的表型变异。2009年，Feinan Wu Nancy T. Eannetta Yimin Xu Richard Durrett Michael Mazourek Molly M. Jahn Steven D. Tanksley发表文章，A COSII genetic map of the pepper genome provides a detailed picture of synteny with tomato and new insights into recent chromosome evolution in the genus Capsicum就某种意义而言，这是第一张完全图谱，所有标记分配到12个连锁群上。本研究作图群体是种间杂交C. frutescens var. BG 2814-6 x C. annuum cv. NuMex RnakyF2群体共94株。该图谱由299单拷贝直系同源标记（主要是COSII markers）标记组成，其中有169个COSII标记，图谱覆盖长度为1613cm,共12个连锁群，标记间的平均距离为6.9cm,。2008年，Hyoun-Joung Kim Seok-Hyeon Nahm Heung-Ryul Lee Gi-Bo Yoon Ki-Taek Kim Byoung-Cheorl Kang Doil Choi Oh Yeol Kweon Myeong-Cheoul Cho Jin-Kyung Kwon Jung-Heon Han Jeong-Ho Kim MinKyu Park Jong Hwa Ahn Soon Ho Choi Nam Han Her Joo-Hee Sung Byung-Dong Kim发表文章BAC-derived markers converted from RFLP linked to Phytophthora capsici resistance in pepper(Capsicum annuum L.)辣椒抗疫霉病的QTL检测。本实验使用100个F2代个体，通过Capsicum annuumCM334 和C. annuum Chilsungcho杂交得到。连锁图包括202个RFFP标记，6个WRKY，1个SSR,覆盖长度1482.3cm,标记间的距离为7.09cm。12条染色体。检测到4个抗根腐病QTL，位于染色体5，6,9上，解释了66.3%的表型变异，3个猝倒病的QTL，位于染色体5,8上，解释了44.9%的表型变异。2010年，Hyun Jung Kim Jung-Heon Han Seungill Kim Heung Ryul Lee Jun-Sung Shin Jeong-Ho Kim发表文章Trichome density of main stem is tightly linked to PepMoV resistance in chili pepper (Capsicum annuum L.) PepMoV辣椒斑驳病毒Trichome density根毛密度本实验研究了辣椒毛状体与辣椒斑驳病之间的关系，构建了种内F2群体图谱，亲本为Capsicum annuum CM334 (附着毛状体和抗斑驳病) 和 Chilsungcho (光滑无毛和易感斑驳病),结果表明:两个性状的主要QTL位于连锁群24上，控制主干毛状物密度的主要QTL是Ptel1，解释了81%的表型变异。控制花萼毛状物QTL是Ptel2，对于PepMoV，两个QTL(Pep1 and Pep2)位于LG24上，分别为解释了34%和57%的表型变异。2009年Heung-Ryul Lee1, Ik-Hyun Bae1, Soung-Woo Park1, Hyoun-Joung Kim1, Woong-Ki Min2, Jung-Heon Han2,Ki-Taek Kim3, and Byung-Dong Kim1,2,4,*发表文章Construction of an Integrated Pepper Map Using RFLP, SSR, CAPS, AFLP, WRKY, rRAMP, and BAC End Sequences本研究开发了132个单拷贝已PCR为基础的标记（包括(源于 BAC-end 序列的57 STS,源于 RFLP的13 STS, 和 62 SSR)）连同1830个已经开发的标记。构建了一张整合图谱包括169 SSR, 354 RFLP, 23 STS from BAC-end sequences, 6 STS from RFLP, 152 AFLP, 51WRKY, and 99 rRAMP markers on 12 chromosomes这张整合图谱包含了4个基因图谱，两张种间图谱（Capsicum annuum TF68和C.chineseHabanero）和两张种内图谱(C.annuumCM334和C.annuumChilsungcho),该图谱包含了805个种间群体的标记，图谱距离为1858cm,745个种内群体的标记，图谱距离为1892cm.2004年，Roeland E. Voorrips . Richard Finkers . Lia Sanjaya .Remmelt Groenwold发表文章QTL mapping of anthracnose (Colletotrichum spp.) resistance in a cross between Capsicum annuum and C. chinense抗炭蛆病本研究采用的亲本为易感病印度尼西亚辣椒品种(Capsicum annuum)var. Jatilaba，抗病品种C. chinense accession PRI95030杂交后代得到F2代群体共346株植株。研究得到图谱长度为997cm,26个连锁群，连锁群长度范围14-71cm，最小群有4个标记，还有6个附加小群，长度为63cm,每个连锁群标记数量2-3个。QTL mapping经过C. gloeosporioides,侵染后，对于全部病变直径，检测到4个QTL，B1，B2，H1和D1，解释了表型变异的39.7%，对于侵染频数，检测到3个QTL，B1，B2，H1解释了表型变异的29.6%。对实际侵染直径，检测到4个QTL, ，B1，B2，H1和D1,解释了35.5%的表型变异。经过C. capsici,侵染后，实际病变直径有2个QTL，B1和G1，解释了表型变异的23.9%。2010年，Won-Hee Kang Ngoc Huy Hoang Hee-Bum Yang Jin-Kyung Kwon Sung-Hwan Jo Jang-Kyun Seo Kook-Hyung Kim Doil Choi Byoung-Cheorl Kang发表文章Molecular mapping and characterization of a singledominant gene controlling CMV resistance in peppers(Capsicum annuum L.)本研究采用的作图群体为C. annuum Bukang F2 群体，含有抗性基因，C. annuum Bukang 和C. annuumJeju,易感CMV，杂 交得到的回交群体，AC 99 F2 群体，由C. chinensePI 159234 (CA4) 和C. annuum NuMex RNaky(RNaky)杂交得来，构建图谱采用SSR 和 CAPS标记。通过基因图谱和FISH（荧光原位杂交） 表明抗黄瓜花叶病毒-cmv1位于染色体2上，且cmv1基因是单一优势显性基因。利用辣椒-番茄比较基因图谱，开发了SNP（单核苷酸多态性）标记，表明CaTmint3HRM离cmv1最近，大约2cm。2006年，Arnon Ben-Chaim Yelena Borovsky Matthew Falise Michael Mazourek Byoung-Cheorl Kang Ilan Paran Molly Jahn等人发表QTL analysis for capsaicinoid content in Capsicum-辣椒素本研究中，采用辛辣品种Capsicum annuum NuMex RNaky和野生强辣品种C. frutescens accession BG2814-6杂交得到234株.F3代构建图谱，采用SSR标记。728个分子标记包括489个SSR标记，195个AFLP,8个特定PCR标记和36个RFLP以及候选基因pAMT, COMT, and Bcat用于构建图谱，图谱长度共1358.7cm,共12个主要连锁群和4个小的连锁群。研究分析了辣椒素的三中成分，capsaicin, dihydrocapsaicin 和nordihydrocapsaicin影响辣椒素含量的6个主效QT L位于染色体3,4,7上，主要是由cap7.1和位于染色2上的基因交互作用影响，另一主效基因是Cap7.2.。在染色体2和3上也检测到2个果重QTL,. (fw2.1) and 3 (fw3.1).这两个QTL与辣椒素含量成负相关。2007年，Jundae Lee Jae Bok Yoon Hyo Guen Park发表A CAPS marker associated with the partial restoration of cytoplasmic male sterility in chili pepper细胞质雄性不育性CMS能被特定的显性核基因修复(Rf or Fr)，部分修复基因是由隐形核基因控制的。Pr稳定CMSHD1-A1 (S cytoplasm)选自Peterson CMS 种，作为母本，自交系GD 和 SM作为父本，二者回交，然后父本与HF3-SC1（完全修复系）杂交。87株(S)GD/HF3-SC1杂交f2代植株用来鉴定部分不育性的恢复，采用AFLP标记。E-AGC/MGCA122和 E-TCT/M-CCG116与pr位点紧密连锁。基因距离仅1.8cm。2002年，A. B. Chaim Y. Borovsky W. De Jong I. Para发表Linkage of the A locus for the presence of anthocyanin and fs10.1, a major fruit-shape QTL in pepper花青素和主要果形QTL的联系花青素由完全显性基因A控制IL 579 紫色花丝和 100/63白色花丝 杂交后代195株F2代构建紫色纤维丝和果形基因图谱。绘制紫色花药纤维位点FcC. annuum 5226 -紫色小圆形果，紫色花茎叶 与C. chinense PI 15923-瘦长绿色果，茎，叶，白色花品种。4种间杂交100株F2代植株。绘制A。A基因与Fc基因是等位基因，位于染色体10上的同一位置，都控制花青素色素。Ben Chaim et al. (2001),发现一个单独的QTLfs3.1控制辣椒果形，解释了60%的表型变异，本研究检测到控制果形副效QTL在染色体10上本研究检测到另一个主要果形QTL解释了40%的变形变异。但在5226 PI 159234杂交后代中检测到与果形有关，RFLP标记TG130与果形QTL fs3.1紧密相连锁。表明在圆果和瘦长果杂交的后代中，果实颜色和果形指数基因是连锁的。2005年，S. Zygier A. B. Chaim A. Efrati G. Kaluzky Y. Borovsky I. Paran发表QTLs mapping for fruit size and shape in chromosomes 2 and 4 in pepper and a comparison of the pepper QTL map with that of tomato针对辣椒(Capsicum spp.)果重和果形QTL图谱是用C. chinense 和 C. frutescens的染色体2和4的基因渗入系来分析，在染色体2上，在两个图谱上都检测到一个单独的果重QTL，解释了62%的表型变异，与控制果形副效QTL,fs2.1，与番茄果形基因ovate.处于同一位置。在染色体4上，检测到2个果重QTL, fw4.1 和 fw4.2, 在两个图谱上处于相同位置。控制果形QTL与一个果重QTL共同定位表明控制果实大小和形状的基因紧密连锁。2009年，Hyun Jung Kim Jung-Heon Han Jin-Kyung Kwon Minkyu Park Byung-Dong Kim Doil Choi发表Fine mapping of pepper trichome locus 1 controlling trichome formation in Capsicum annuum L. CM334控制毛状体构造在Capsicum annuum, Mexican Criollo de Morelos-334(CM334)中，.辣椒毛状体是由一个等位基因（ptl1）控制，Capsicum annuum, MexicanCriollo de Morelos-334 (CM334) 和 韩国Chilsungcho品种杂交得到653株F2代植株，用SSR标记，HpmsE031和ptl1共分离。使用HpmsE031作为探针得到的细菌性人造染色体（BAC）,ptl1区域被80kbBAC克隆（TT1B7覆盖。且TT1B7位于染色体10上， 从TT1B7序列得到了2个标记。分别是Tco,共显性标记，Tsca,显性标记。Tco在ptl1上面距0.33cm,Tsca在ptl1下面距0.75cm.2005年，E. A. Quirin E. A. Ogundiwin J. P. Prince M. Mazourek M. O. Briggs T. S. Chlanda K-T Kim M. Falise B-C Kang M. M. Jahn发表Development of sequence characterized amplified region (SCAR)primers for the detection of Phyto.5.2, a major QTL for resistance to Phytophthora capsici Leon. in pepper抗辣椒疫霉病的QTL材料为高抗基因型C. annuum Criollos