细菌的分类和鉴定课件

细菌的分类和鉴定 一 微生物的分类 根据微生物的大小 结构 组成等分三类 二 细菌的分类方法 根据每种细菌各自特征 并按照它们的亲缘关系分类 分类方法有两类1 生理学与生化学分类法 传统方法 2 遗传学分类法 一 生理学与生化学分类法 主要以细菌的形态 染色以及细菌的特殊结构为最基本的分类依据 其它依据还包括细菌生长条件等等 主要有两种方法1 传统分类法2 数值分类法 1 传统分类法 主要以细菌的形态 生理特征为分类基础 选择一些较稳定的生物学性状如细菌的形态结构 染色性 培养特性 生化反应 抗原性等作为依据 然后按主次顺序逐级区分 2 数值分类法 对细菌各种生物学性状按 等重要原则 进行分类 选用多项生理 生化指标逐一进行比较 通过查表或计算机分析各菌间相似度 完成细菌分类 二 遗传学分类法 以细菌的核酸 蛋白质等在组成的同源性程度分类 主要有三种方法1 DNAG Cmol 测定2 核酸同源值测定3 核蛋白体RNA碱基序列测定 1 DNAG Cmol 测定 DNA分子两条链上4种碱基的总分子量为100 测定其中G C或A T摩尔百分比 能反应出细菌间DNA分子的同源程度 习惯上以G C作为细菌的分类标记 不同菌属间的G Cmol 范围很大 在25 75 之间 但同一种细菌G Cmol 相当稳定 不受菌龄 培养条件和其它外界因素影响 亲缘关系越近的细菌 它们G Cmol 越接近 但并非G Cmol 越接近 亲缘关系就越近 2 核酸同源值测定 为什么不能说G Cmol 越接近 亲缘关系就越近 因为G Cmol 只能反映细菌的碱基总数而不能反映碱基序列 而利用DNA分子杂交的技术就可以精确测定DNA分子的碱基序列 这就是核酸同源值测定 3 核蛋白体RNA碱基序列测定 核蛋白体RNA碱基序列测定属于核酸范畴 由于核蛋白体RNA rRNA 序列比较保守 其变化十分缓慢 其中 16srRNA具有高度的保守性和特异性以及该基因序列足够长 因此 被作为细菌鉴定的快速 准确方法 素有 细菌化石之称 三 两类分类法的优点和意义 三 原核微生物 广义细菌 分类系统 伯杰鉴定细菌手册 Bergey sManualofDeterminativeBacteriology 伯杰氏手册 是目前进行细菌分类 鉴定的最重要参考书 其特点是描述非常详细 包括对细菌各个属种的特征及进行鉴定所需做的实验的具体方法 四 细菌的分类等级 界 Kingdom 门 Phylum 纲 Class 目 Order 科 Family 属 Genus 种 Species 五 细菌的命名 一 细菌的命名依据 国际细菌命名法规 的规定 学名用拉丁文 遵循 双名法 即每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分构成 属名第一个字母必须大写 其余均应小写 即使种名以人名或地名命名 整个属名及种名在出版物中应排成斜体 如 Escherichiacoli属名 种名 属名重复出现 可缩写如 E coli 大肠杆菌 只确定属名 未确定种名的某一株细菌Salmonellasp 沙门菌属 只确定属名 未确定种名的若干菌Salmonellaspp 亚种用subsp 正体 表示Pasteurellamultocidasubsp septica 几种不同的书写情况 五 细菌的命名 二 六 微生物分类鉴定的依据 根据微生物分类学中使用的技术和方法 可把它们分成四个不同的水平 细胞形态和行为水平 细胞组分水平 蛋白质水平 基因组水平 在微生物分类学发展的早期 主要的分类鉴定指标是以在细胞形态和习性为主 可称为经典的分类鉴定法 七 细菌的分类方法 生物分类的传统指标分子生物学指标微型 简便 快速或自动化鉴定技术细菌的数值分类 形态学特征 生理 生化学特征 从不同层次 用不同学科的技术方法来研究和比较不同微生物的细胞 细胞组分或代谢产物 从中发现反映微生物类群特征的资料 八 生物分类的传统指标 一 形态学特征 包括培养特征 细胞形态及其染色特性 特殊的细胞结构 运动性等等 形态学特征指标特点 易于观察和比较 尤其是真核微生物和具有特殊形态结构的细菌 许多形态学特征依赖于多基因的表达 具有相对的稳定性 二 生理生化特征 包括营养类型 与氧的关系 对温度的适应性 碳水化合物的代谢试验 蛋白质和氨基酸的代谢试验及的碳源和氮源利用试验 各种酶类试验 抑菌试验等等 生理生化特征特点 对微生物生理生化特征的比较也是对微生物基因组的间接比较 测定生理生化特征比直接分析基因组要容易 二 生理生化特征 包括营养类型 与氧的关系 对温度的适应性 碳水化合物的