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文档简介

信息资源分类:简述文献分类依据一、不同载体类型1.印刷型:利用纸张为存储介质,以手写、印刷为记录手段而产生的文献。包括图书、期刊、专利文献等。2.缩微型:是以感光材料为存储介质,利用缩微照相技术使文献缩微化的文献。缩微胶片、平片、胶卷。3.视听型:以磁性或感光材料为存储介质,利用特定的设备及技术,直接记录声音、图像信息的文献。录音带、录像带、电影胶片4. 机读型:以电子数据的方式将图、文、声、像等信息存储在磁光介质上,通过网络通信、计算机或类似设备再现的信息资源。电子期刊、图书、数据库二、按出版类型(填空)1.图书:内容比较成熟、系统、可靠的出版物,是学习和参考的主要信息源。国际标准书号(ISBN)2.连续出版物:有固定名称和连续卷号、期号的定期出版物。所含信息量大、新颖,是科研工作主要信息源。期刊、报纸、年度出版物期刊:ISSN (国际标准刊号)核心期刊:是指某一学科中高水平、高影响力的期刊3.特种文献(类型):其它文献资料出版物的总称,信息全面、密度高,一般图书馆不做重点收藏。专利文献、标准文献、学位论文、科技报告、会议文献、政府出版物、档案资料、产品资料三、按加工程度 1.零次文献:指未经公开发表或未交流于社会的文献。如:私人笔记、设计草图、实验记录、论文草稿、会议记录等2.一次文献:原始创作:记录科研活动,报道新技术、新发明、新见解的文献。指以著者本人的研究成果为依据而创作或撰写,并通过某种渠道而公开的文献。如:期刊论文、科技报告、会议论文、学位论文等(填空)3.二次文献:书目文献:收集整理一次文献而形成的索引、目录、摘要等指对一次文献进行浓缩、整序及加工处理而形成的报道性与检索性文献。如:各种检索工具4.三次文献:高级信息产物:综合分析研究大量一次文献,浓缩提炼而成的文献。指从一次文献中提取数据、事实和有关结论,并经过综合分析与重新组合而编写的文献。如:参考工具书、述评、综述、进展报告等。关系:零次文献是文献的毛坯、一次文献的素材;一次文献是检索的对象、知识的第1次加工、具创造性;二次文献是检索的工具、知识的第2次加工、具有序性;三次文献是检索的对象和工具、情报研究的成果、具创造性和有序性四、网络信息资源:通过计算机网络可以利用的各种信息资源的总和网络资源类型:网络搜索引擎:Google, Medscape联机馆藏目录:OPAC(联机公共目录检索系统)数据库资源:CBM, cnki, Medline,PubMed电子出版物: 电子期刊,电子图书参考工具:牛津大词典,网际金典网络动态信息:E-Mail, BBS, News Group人作用于信息和信息作用于人一次文献(原始文献)=情报源 二次文献(检索工具)=情报线索 三次文献(综述专著)=高级情报产物 零次文献(作者原始创作阶段)中国图书馆分类法是我国目前统一使用的分类法,其分类号由字母与数字组成,共分为22个大类,R类为医药卫生类,共有17个二级类目,按概念间的隶属关系进行排列信息检索的作用:知识更新、继续教育;贯穿科研始终,是其重要组成部分;决策作用;节约时间、精力、金钱。信息检索的原理:是指通过一定的方法和手段,使信息存储与检索两个过程所采用的特征和标识达到一致,以便有效地获取和利用文献。 存储过程-对文献进行标引 检索过程-根据需求,确定提问式三、信息检索语言(Retrieval language)(一)检索语言的定义:(填空) 用以描述文献信息特征,表达检索需求的一种专门的人工语言,是联系标引人员与检索人员的桥梁。根据文献信息检索的需要而创制的人工语言。(检索语言、文献存储与检索语言、标引语言、索引语言等)检索语言是一种在文献存储和检索过程中共同使用的语言。它的用途是描述文献特征,表达情报提问,并使两者能相互沟通。(二)检索语言的种类描述信息特征外部特征:题名、著者、序号、引文内部特征:分类、主题、代码(分子式)规范性-受控语言 or自然语言非规范化:标题、关键词、文本词规范化:分类、叙词(主题词)分类检索语言(Classification language):按学科、专业集中文献,从知识分类的角度揭示多种不同文献在内容上的区别和联系,提供以学科分类为出发点的文献信息检索途径。(美国国会图书馆图书分类法、杜威十进分类法、国际十进分类法、中国图书馆分类法、国际疾病分类等)分类语言的特点:体现学科系统性;反映事物间的从属、派生、平行等隶属关系 分类号使用数字/字母有序排列; 从上到下,从总体到局部,等级分明分类语言的缺点:不易分类;文献分散;不能反映新概念;检索不够灵活 主题检索语言(Subject language):以反映文献内容的主题词或关键词作为文献存储和检索的标识。叙词法:严格规范化、可进行概念组配、具有完善参照系统、具有范畴索引等;关键词法:以出现在文献的标题、摘要或全文中能表达文献实质内容的词或关键性专业名词术语作为检索标识。主题检索语言以语词作为检索标识来表达各种概念、并按字顺组织起来的一种检索语言。具有专指性、直接性的特点根据表达概念的不同分为:标题词语言(篇名词);关键词语言;叙词语言(主题词)单元词语言(自由词、文本词)主题语言的特点:直接揭示文献的内容特征;按照字顺编排,检索方便;文献集中;表达新概念;叙词语言最具代表性主题语言的类型: 文本词(自由词) 摘要词 关键词:能表达文献主要内容的词汇或术语,未经过规范化处理。 标题词(篇名词) 主题词(叙词): 能表达文献的实质内容,经过规范化处理的名词术语。Eg:肿瘤 关键词:cancer,carcinoma,tumor, neoplasm 主题词:neoplasm叙词(主题词)的特点词语与概念唯一对应 可组配副主题词增加专指性 采用参照系统揭示词间关系有主题词分类索引(Tree Structure)内容与规则构成一部主题词表(MeSH)医学主题词表MeSH美国NLM出版,相当于一部医学检索词典,用于指导医学检索工具的主题标引和检索,是规范标引用词和检索用词的工具。目前,MeSH 使用的主题词约26853个,副主题词83个。主要结构:字顺表把主题词、款目词、副主题词按英文字母顺序排列而成 树状结构表按主题词的词义范畴和学科属性分类编排,解释主题词间的上下隶属关系,进而控制检索范围。代码检索语言(Code language):用代表事物的代码作为标识系统的索引语言。(化合物分子式索引、环状化合物环系索引、化学物质号索引等)第四节 信息检索基础一、检索工具检索工具的定义 根据一定的目标,将有关的文献按一定的检索语言标引在一定的载体上以一定的结构顺序组织起来,并提供一定检索方式的工具(或系统)。是搜集报道、存贮和查找文献线索的工具 。 检索工具的作用:存储作用、检索作用、报道作用、交流作用检索工具的特点 收录内容的有限性、报道信息的时滞性、标引深度的有限性 收摘一次文献、著录文献特征、多种检索手段检索工具的类型 (简答) 印刷型:目录、索引、文摘电子型:书目型、事实型、全文型、多媒体型按编制方式分:目录、题录或索引、文摘、全文检索工具的结构 印刷型:说明、正文、辅助索引、附录 电子型:文档、记录、字段检索工具的要求 收录全面,标引准确,检索途径多,更新迅速,使用方便检索工具的评价(简答): 收录范围广,文献报道量大,摘储率高标引质量高,标引深度高,检索语言使用得当检索途径多,著录程度详;文献时差短、使用方便检索途径(检索入口) 是指检索文献信息的出发点和路线,是在使用不同检索语言有序存储信息的同时形成已知项检索:书名、刊名、作者未知项检索:主题词、分类号、关键词检索标识(检索词) 是指能表达检索课题主题概念和信息需求的名词术语、分类号、名称及代码等的总称,它与检索途径相对应,是检索途径的具体化。包括主题词、关键词、分类号、专利号等二、检索途径与检索标识(填空)篇名途径:文献篇名中的名词术语主题途径:规范化的主题词分类途径:学科分类号或类目名称关键词途径:文献的关键词著者途径:著者姓名或机构名称引文途径:被引文献著者地址:著者地址或机构名称刊名途径:期刊全称或简称中的词汇序号途径:文献的各种代码,如专利号、ISSN号、化学物质登记号等其他检索途径:如分子式、药物名称等三、检索步骤分析拟检课题,明确检索要求 选择检索工具,确定检索方法 确定检索途径和检索标识构建检索策略修正检索策略获取原始文献 检索效率: 检索结果的有效程度,是对检索结果好坏的评价 。指全、准、快、便、省地查阅文献(检全率、检准率、检索速度、检索方便性、检索成本与效益)。主要是全、准。评价指标:查全率 查准率影响因素:检索策略制定、检索系统和工具、检索途径和标识、检索技能等检全率(Recall ratio,R):指系统在进行课题检索时,检出的相关文献量与系统文献库中的相关文献总量的比率。衡量全面性。查全率=检出相关文献量/相关文献总量*100%检准率(Pertinency ratio ,p):指系统在进行课题检索时,检出的相关文献量与检出文献总量的比率。衡量准确性。查准率=检出相关文献量/检出文献总量*100%A 检准的文献C 漏检的文献 B 误检的文献D 无关的文献R 检全率= A/(A+C) O 漏检率=C/(A+C)P 检准率=A/(A+B) N 误检率=B/(A+B)决定检索效率的因素:检索语言的质量、标引质量、检索质量、检索用户的水平影响检索效果的因素 客观:文献的收录是否全面 文献的标引水平 检索途径的多少 检索系统功能:逻辑组配、扩展、加权 使用方便性 主观:专业检索人员的知识水平、认真程度和责任心 用户对检索系统的认识能力 外语水平计算机检索的特点 检索速度快,效率高 提供多条检索途径 采用灵活的逻辑运算 范围广泛,容易查全 更新迅速,内容新颖 可拷贝获得大量信息数据库的类型书目数据库(Bibliographic database)数值数据库(Numeric database)全文数据库(Full-text database)事实数据库(Fact database)超文本数据库(Hypertext database)数据库检索途径与检索标识词语(Text,Abstract,KeyWord,Title)主题词(Subject Headings, Descrptor)分类(Classification)著者(Author)机构及地址( Institution, Address)刊名 (Journal Name)其它 引文,ISSN,记录号数据库选择依据收录范围:年代、学科、文献类型检索途径:常用途径、特殊途径、必要途径工具质量:标引深度、准确性、著录格式更新速度:更新及时、时差短、信息新使用方便:网络、免费、下载计算机检索技术 计算机检索的查寻过程实际上就是将用户的检索提问与数据库的检索标识相比较决定取舍的过程,两者比较结果相一致者即为命中。命中的中间结果可以再次与新的提问式相比较匹配。一个检索课题通常经过如此多次的修饰匹配检索,直至最终命中检出的文献符合用户的需求。在这个查寻过程中,主要采用以下几种基本检索技术。 布尔逻辑检索 (Boolean searching)截词检索和通配检索 (Truncation & wildcard)字段限制检索 (Limit searching )加权检索扩展检索与缩小检索布尔逻辑检索(Boolean searching)布尔逻辑符的运算顺序: NOTANDOR可用括号改变运算顺序:如:(利福平 or 异烟肼)and 肺结核=利福平 and 肺结核 or 异烟肼 and 肺结核截词检索(Truncation searching)截词检索(Truncation searching)把检索词截断,取其中的一部分片段,再加上截词符号一起检索,计算机按照词的片段与数据库里的索引词对比匹配,凡包含有这些词的片段的文献均被检出。在不同的检索系统里用不同的符号,有问号?、星号*、井字符#等。截词方式有右(后)截词、左(前)截词和中间截词(插入)截词三种。右(后)截词是使用最多的一种截词检索方式。 Immun* Immune Immunifaction ImmunologyChild* children childhood childlike 通配检索:Wildcard searching 对拼法稍异的词汇进行检索 如:Wom?n Woman Women用以上两种检索可以避免漏检,提高检全率,另一方面也避免了多次输入的麻烦限定检索(Limit searching)是缩小或约束检索结果的方法,最常用的是对特定字段的限定检索。限制符多为:in、 选择限定内容:不同字段、 研究对象、文献类型、出版日期、语种、数据库子文档 使用限制符: In (模糊限制) eg: Heart in ti (篇名) 山西 in 地址 (ad) = (精确限制) eg: LA = Chinese(语种) PY = 2000-2004(年限) 加权检索是针对主要主题词或篇名主题词的检索,可命中核心概念的文献,提高查准率。 CBMDisc: 加权检索 PubMed: Restrict Search to Major Topic headings only OVID : Focus扩展检索:将某概念及其下位概念内容的文献全部检出的技术方法。可提高检全率。初始设定的检索范围太小,命中文献不多,需要扩大检索范围时用。主要有:概念的扩大,增加同义词,年代的扩大缩小检索:又称二次检索,指开始的范围太大,命中文献太多,或查准率太低,需要增加查准率的一种方法。主要有:概念的缩小,语种的限定,特定期刊的限定等第二章 中文信息检索中国生物医学文献服务系统(SinoMed)/SinoMed介绍由中国医学科学院医学信息研究所/图书馆开发研制,于2009年推出。数据库特点:资源丰富、中西兼有;深度加工、数据规范;功能强大、方便易用 。中国生物医学文献数据库注重数据的规范化处理和知识管理,全部题录均根据美国国立医学图书馆最新版医学主题词表、中国中医研究院中医药信息研究所中国中医药学主题词表,以及中国图书馆分类法 医学专业分类表进行主题标引和分类标引。覆盖数据库中国生物医学文献数据库(CBM)中国医学科普文献数据库北京协和医学院博硕学位论文库西文生物医学文献数据库(WBM)日文生物医学文献数据库俄文生物医学文献数据库英文会议文摘数据库英文文集汇编文摘数据库中国生物医学文献数据库(CBM):收录1978以来1600余种中国生物医学期刊,以及汇编、会议论文的文献题录530余万篇,全部题录均进行主题标引和分类标引等规范化加工处理。学科范围覆盖基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学和中药学等生物医学各领域。中国医学科普文献数据库:收录2000年以来国内出版的医学科普期刊近百种,文献总量8万余篇,重点突显养生保健、心理健康、生殖健康、运动健身、医学美容、婚姻家庭、食品营养等与医学健康有关的内容。每月更新。北京协和医学院博硕学位论文库:收录1981年以来协和医学院培养的博士、硕士研究生学位论文,学科范围涉及医学、药学各专业领域及其他相关专业,内容前沿、丰富,可在线浏览全文。每季更新。2.1 跨库检索-简单检索检索步骤: 选择多个数据库; 输入检索词或构建逻辑组配检索式; 点击“检索”按钮,检索完成; 选择检索结果进行浏览。 检索入口即检索字段,用于限制检索的范围。SinoMed根据各个数据库的特点,对常用检索字段进行组合后设置了“缺省字段”检索入口。其中在中国生物医学文献数据库(CBM)和中国医学科普文献数据库中,缺省字段包括 中文标题、摘要、作者、关键词、主题词和刊名。在北京协和医学院硕博学位论文库中则包括中文标题、中文摘要、研究生姓名、导师、关键词、主题词2.2 单库检索:中国生物医学文献数据库(CBM)高级检索常用字段:在中国生物医学文献数据库(CBM)中,是中文标题、摘要、关键词、主题词的组合。智能检索:自动实现检索词及其同义词(含主题词)的同步扩展检索。精确检索:是检索结果等同于检索词的一种检索,适用于关键词、主题词、作者、刊名等字段限定检索:可以方便您限定文献的年代、文献类型、年龄组、性别、研究对象等。CBM高级检索步骤:1、分析课题2、确定检索词或检索式3、选择检索入口,输入检索词或检索式4、根据需要,调整检索策略CBM主题检索主题词的概念和优点: * 利于提高查全率和查准率。 * 主题检索可用中文主题词、英文主题词及同义词进行查找,可浏览主题词注释信息和树形结构,帮助您确定恰当的主题词。 * 通过设置是否加权、是否扩展、选择合适的副主题词,使检索结果更符合您的需求。主题检索的功能:将非主题词引见到主题词形式提供主题词的定义和注释显示主题词之间的族性关系(上位词、下位词、同位词)主题词的加权检索:主题词“加权”表示主题词的重要程度,反映文章论述的主要内容。加权主题词用“ * ”表示加权检索表示仅对加星号 (*) 主题词 ( 主要概念主题词 ) 检索,非加权检索表示对加星号主题词和非加星号主题词(非主要概念主题词)均进行检索。如何寻找合适的主题词:1、用上位词或倒置 创伤性休克- 休克,创伤性 病毒性肝炎- 肝炎,病毒性2、多用几个自由词查找 先天/髋关节/脱位-髋脱位,先天性3、用关键词先试行检索,“抛砖引玉”找到适用的主题词。 AIDS、艾滋病-获得性免疫缺陷综合症扩展检索指对当前主题词及其所有下位主题词进行检索,非扩展检索则仅限于当前主题词的检索。CBM分类检索可通过分类号和分类名进行检索,也可通过分类导航逐级浏览。优点:族性检索类名检索类号检索CBM期刊检索可通过选择刊名、出版地、出版单位、期刊主题词或者ISSN等检索入口直接查找期刊。也可通过“分类导航”或“首字母导航”逐级查找浏览期刊。CBM作者检索检索步骤:输入作者姓名,勾选“第一作者”后即指定为第一作者查找;显示命中作者的信息列表,勾选“第一作者”的用户可继续第三步,查看选中作者在系统中的单位分布;显示选中作者在系统中的单位分布;请用户根据实际需求对作者单位进行选择,可多选。链接检索作者链接: 点作者,检索该作者发表的文献。期刊链接:点期刊名称,检索该期刊收录的所有文献。点期刊卷期,检索该期刊该期收录的文献。关键词链接:点关键词,在缺省字段检索该词。特征词链接:点特征词,在特征词字段检索该词命中的文献。主题词和副主题词链接:点主题词,对该主题词标引的所有文献进行检索。点副主题词,仅检索该主题词与该副主题词组配的文献。相关文献链接:点“主题相关”,按照内置算法检出与该篇主题内容相关的文献;点“参考文献”,显示该篇文献的参考文献。 3 个性化服务:我的空间我的检索策略可用于定期跟踪某一课题的最新文献。我的数据库用于在检索过程中随时保存检索结果,供再次查阅或索取原文。可通过“标题”、“作者”、“标签”三个字段在数据库中查找有关文献。用户根据需要可添加“标签”或“备注信息”。 “我的数据库”最多保存500条记录,每页显示50条记录。 第四章 PUBMED什么是PubMed?生物医学研究领域应用最广泛也最重要的数据库,由美国国立卫生研究院(NIH)下属的美国国立医学图书馆(NLM)的国家生物技术信息中心(NCBI)开发、维护。面向全世界免费提供最新的生物医学信息。、一、数据库概况 收录学科内容 主要收录生物医学和健康科学以及生命科学相关领域的文献。包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学,基础研究和临床、护理、公共卫生、卫生政策发展或相关教育活动的内容。2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。PubMed的收录范围-13个子数据库收录全世界80多个国家5200多种生物医学期刊的文摘及题录数据绝大部分可回溯至1948年,最早回溯至1865年(1809至今)全球80多个国家和地区;5700余种生物医学期刊;涉及40多个语种47%为美国本土出版文献,90%为英文文献,79%的文献有著者撰写的英文文摘部分文献可直接获取全文,包括:PubMed Central (PMC,收录期刊780余种):NLM开发的免费生物医学数字化期刊全文数据库开放获取(Open Access,OA)期刊部分出版商提供的免费文献 与出版商的电子期刊文献同步发布,标注为Epub ahead of print(先于印刷版期刊发表的电子文献)或EpubPubMed的记录来源Medline:PubMed主体部分PubMed-indexed for MEDLINEIn-process citations: 尚未进行MeSH主题词标引的最新文献PubMed-in ProcessPublisher supplied citations:出版商提供,但不被Medline收录的文献PubMed - as supplied by publisherOLDMEDLINE:部分1966年以前出版且未被MEDLINE收录的文献PubMed-OLDMEDLINE Pubmed与Medline区别 广泛的链接:包括其它功能链接,如帮助功能、期刊数据库、主题词表等;检索结果显示链接,有全文、文摘、相关文献等链接;NCBI其它数据库的链接,如PMC(Pubmed生物医学期刊)、OMIM(人类孟德尔遗传数据库)、Genome(基因组数据库)等;收录更加广泛:Pubmed包括了Medline数据库在内的13个数据库,如AIDS、CANCER、OLDMEDLINE等,其中包括Medline未能收录的许多生命科学方面的期刊论文,如天体物理学、化学等领域的期刊中有关生命科学方面的论文。从2003年9月30日起,Pubmed文献记录回溯至1953年,比前增加了150万条记录;更新及时:pubmed时效性要强于medline。出版单位以电子版形式向NLM提供已经或将要出版的文献书目数据,每周增添新的内容,比光盘版Medline数据库更加及时。 Pubmed具有更强的检索功能,提供检索词自动转换功能(Automatic Term Mapping):能获得部分期刊全文查全率:同一的检索课题从pubmed查的结果要比medline多免费使用,而且采用的是web界面,不需要安装客户端,使用方便。PubMed记录的主要字段字段标识:字段名称 AB:Abstract AD:Affiliation ALL:All Field AU:Authors 1AU:First Author FAU:Full Author Name LASTAU:Last Author PMID:PubMed Unique Identifier CY:Country DP:Publication Date EDAT:Entrez Date GS:Gene Symbol GN:Grant Number IS:ISSNLA:LanguageMH:MeSH TermsMAJR:MeSH Major TopicSH:MeSH SubheadingsPT:Publication Type 出版物类型SO:SourceTA:Journal TitleTI:TitleTW:Text WordsUID:Unique IdentifiersNM:Substance NumberTIAB:Title/Abstract4.1.2 PubMed的检索方法基本检索自动词语匹配检索著者检索期刊检索短语精确检索截词检索字段限定检索布尔逻辑检索高级检索检索史组合检索其他检索检索限定主题词检索期刊数据库检索单篇引文匹配器临床查询专类查询 自动词语匹配检索(Automatic Terms Mapping) 输入有实际意义的检索词,点击“Search”,系统按照自动词语匹配的原理进行检索PubMed最具特色的检索功能之一智能化的检索过程基本原理:对输入的检索词,首先在多个索引词表进行搜索、比对,并自动转换为相应的MeSH主题词、著者或刊名,再将检索词在all fields(所有字段)中检索,并执行“OR”逻辑运算。如有多个检索词或短语词组,则继续将其拆分为单词后分别在all fields(所有字段)中检索,单词之间的逻辑关系为“AND”Search Details框详细显示自动词语匹配的实际检索式有较好的查全率,同时保证一定的查准率Eg:查找阿司匹林防治心肌梗死的文献,最简单的方法是在检索框中直接输入heart attack aspirin三个词,系统即进行自动词语匹配检索,Detail栏目显示PubMed实际执行的检索式为(myocardial infarctionMeSH Terms OR (myocardialAll Fields AND infarctionAll Fields) OR myocardial infarctionAll Fields OR (heartAll Fields AND attackAll Fields) OR heart attackAll Fields) AND (aspirinMeSH Terms OR aspirinAll Fields)著者检索在检索框中输入著者姓名,PubMed自动执行著者检索一般姓在前名在后,姓用全称,名用首字母Eg:输入Smith SR可检索出姓为Smith,名的首字母为SR的所有著者的文献为提高查准率,可将著者与著者单位、主题等信息结合起来检索2002年以后的文献,PubMed可实现对姓名全称的检索,而且姓名排列顺序不限Eg:输入Smith SR的姓名全称Steven R Smith,可检索出2002年以来该著者被收录的文献。通过字段限定检索及组合检索可实现更精确的著者检索Eg:输入Smith SR 1AU可检索出第一著者为Smith SR的所有文献。 期刊检索在检索框中输入期刊信息,PubMed自动检索出该期刊的文献:刊名全称:如the American Journal of Pathology标准的Medline刊名缩写:如Am J Pathol期刊的ISSN号:如0002-9440, Am J Pathol ISSN号当刊名与MeSH词相同时,PubMed默认将其作为MeSH词检索。为避免误检,可采用刊名字段限定检索Eg:Cell TA可检索出在期刊Cell被PubMed收录的所有文献利用PubMed的Journals Database可查找期刊的详细信息 短语精确检索短语精确检索是将检索词加上双引号进行强制检索短语精确检索时,PubMed关闭自动词语匹配功能,直接将该短语作为一个检索词进行检索,避免了自动词语匹配时将短语拆分可能造成的误检,可提高查准率Eg:输入“metabolic syndrome”, PubMed在所有可检索字段中查找含有短语词组metabolic syndrome的文献 截词检索在检索词后加“*”可实现截词检索,以提高查全率截词检索时,PubMed关闭自动词语匹配功能 Eg:输入immun*可检索出immun开头的所有词语,如immunity, immunology, immune, 等字段限定检索字段限定检索的形式:检索词 字段标识Eg:leukemia TI可检索出篇名中含有leukemia的文献myocarditis MAJR可检索出MeSH Major Topic为myocarditis的文献字段限定检索可提高查准率布尔逻辑检索支持AND,OR,NOT布尔逻辑运算逻辑运算符要大写直接输入几个检索词,系统默认词之间是AND的逻辑组配关系可以输入检索式的序号进行布尔逻辑运算,如#1 AND #3 2、高级检索Search Builder:构建检索策略使用字段限制使用不同的索引利用逻辑算符Search History:提供检索历史显示历次检索式、时间和检出结果检索序号可用于组配检索式More Resources:其它资源链接检索史(Search History)点击Search History,显示检索史,包括检索式序号、检索提问式、检索时间及检索结果数单击检索式序号,显示Options选项,可执行AND, OR, NOT、Delete(删除检索式)、Go(直接检索)、Details(显示检索式详情)、Save in My NCBI(把检索式保存在My NCBI)等不同操作检索史最多保留8小时 组合检索(Search by Author,Journal,Publication Date,and more)组合检索可以实现多个字段的逻辑组配检索默认在最近一次检索式的基础上进行字段限定检索,以提高查准率检索时,先选择检索字段,输入检索词(点击Index显示该检索词的索引,帮助选词),再确定检索词的逻辑关系,默认为All of these(AND),也可以选Any of these (OR),点击Search,完成检索 检索限定(Limit by Topics,Languages, and Journal Groups)检索限定可以对检索结果进行精确的限定,包括:Full Text, Free Full Text, and Abstracts(限定检索结果含全文链接、免费全文或摘要)Human or Animals(研究对象)Gender(性别)Language(语种)Type of Article(文献类型)Ages(年龄)Subsets(子集,可以按Journal Groups、Topics等划分)注意:检索限定一经选定,会保持激活状态而在此后的检索中持续起作用 检索限制(Limit)全文、免费全文、摘要限定研究对象人/动物限制、性别限制、文献类型限制、语种限制、子文档限制、年龄限制MeSH主题词检索(MeSH) MeSH主题词检索是PubMed最具特色的检索功能之一,能保证较好的查全率和查准率主题词对同一概念的不同表达方式进行了规范主题词可以组配相应的副主题词,使检索结果更加专指主题词的树状结构表:系统默认对含有下位概念的主题词进行扩展检索(点选Do Not Explode this term则不进行扩检)应用Major Topic(主要主题词)检索,可以使检索结果更加准确注意:用MeSH词检索时,只检索来源于MEDLILNE的文献,不检索PubMed其他来源的文献(包括in-process, supplied by publisher, OLDMEDLINE等) 3、Mesh Database 检索词规范化主题词查看主题词词义注释树状结构表选择副主题词扩展主题词确定主要主题词检索(加权检索)近期有关肾癌的治疗进展肾癌的不同表达形式: renal cancer/tumor/carcinoma/ kidney cancer/tumor/carcinoma/治疗包括:drug therapy、therapy、surgery、radiotherapy、rehabilitation4、 Journal database 通过输入刊名、部分刊名或缩写等了解该刊基本情况浏览期刊上发表的文献获得相关期刊信息提供电子全文的超链按钮期刊数据库检索(Journals)期刊数据库检索可查询PubMed及Entrez平台其他数据库所收录的期刊信息提供Topic、刊名全称、Medline刊名缩写、ISSN等检索途径,也可以按学科(Subject Terms)进行浏览在Journal Database主页面点击Limits可以按语种、不同子集及其他字段进行期刊检索点击Lists of all Entrez Journals,链接到Entrez平台所收录期刊一览表(包括PubMed收录的所有期刊)点击Links to full-text web sites,可链接到LinkOut Journal Lists页面,了解能提供期刊全文的Web站点 单篇引文匹配器(Single Citation Matcher)单篇引文匹配器主要用于查找某一篇文献的准确信息点击Journal Citation Matcher,在系统给出的选项中输入已知信息,点击Go,返回符合要求的文献信息 Journal:输入刊名的任何有效信息,系统会主动给出提示,帮助选择正确的刊名Date:输入期刊的出版日期Volume、Issue、First Page:输入期刊的卷、期、起始页码Author name:输入著者Title Works中:输入文献篇名中的任意词5、Clinical Queries临床研究疾病的治疗、诊断、病因、预后及临床实践指南系统评价文献疾病遗传学研究文献临床查询(Clinical Queries)临床查询是专门为临床医生设计的检索服务,包括Search by Clinical Study Category查找疾病的etiology、diagnosis、therapy、prognosis及clinical predictions guides文献,综合考虑检索结果的敏感性(broad,sensitive search,查全率较高)与特异性(narrow,specific search,查准率较高) Finding Systematic Reviews提供systematic reviews、meta analysis、reviews of clinical trials、guidelines等循证医学文献 Medical Genetics Searches查询疾病的遗传学文献,有ALL 、Diagnosis、Differential Diagnosis、Clinical Description、Management、Genetics Counseling、Molecular Genetics、Genetics Testing等选项专题查询(Special Queries)专题查询汇总整合了PubMed提供的其他专题检索功能(Directory of Topic-Specific PubMed Queries),并提供相应的链接,包括:不同的学科专题(Subjects)设立的子集(Subsets):如AIDS,Toxicology、Cancer、History of Medicine等;不同的期刊专辑(Journal Collections); 4.1.3 PubMed检索结果的处理检索结果显示PubMed检索结果显示默认为Summary格式,包括:篇名、著者、刊名、出版年月及卷期页码、PMID号记录状态(Indexed for MEDLINE; in Process;)、相关文献(Related Articles)链接如有免费全文,则有Free Article链接Summary显示格式的页面右侧有多个栏目,主要包括:Limits Activated:处于激活状态的检索限定点击,Remove去除限定,Change更改限定 Filter your results:结果过滤,包括综述、免费全文等Titles with your search terms:提供20条篇名中包含了检索词的文献记录(密切相关文献)Free full-text articles in PubMed Central:在PubMed Central中能直接获取全文的文献 Find related data:链接到NCBI其他数据库中检索 Search details:详细显示PubMed实际完成的检索式 Recent Activity:显示最近8小时内在NCBI的操作记录 检索结果保存及输出点击检索结果显示页面的Send to下拉菜单,PubMed提供了以下保存及输出方式,包括:File:选中文献记录以文件的形式保存( 用MEDLINE格式保存文件可以将结果直接转入EndNote等文件管理软件)Clipboard(剪贴板):浏览、选择选所需文献,在Send to中选择Clipboard,点选Add to Clipboard,选中文献用绿色提示“item in Clipboard” 。剪贴板中最多可保存500条记录,保存时间为8小时。点击Clipboard链接,显示所有暂存文献,再集中进行处理Collections:注册了My NCBI的用户可以选择Collections将检索结果保存在My NCBI中,特别是对那些尚不确定是否相关的检索结果,可以先保存在Collections中,以后再登录My NCBI对这些文献记录进行浏览、删除、排序Email:将选中的检索结果直接发送到指定的电子邮箱中。一次最多发送200条文献记录Order:如果用户无法获取选中文献的全文,可用Order选项通过LoansomeDoc文献传递系统向NLM订购全文,这项服务需支持一定的费用RSS Feed:点击RSS图标,再点击Create RSS即可订阅,随时浏览追踪这一检索策略的最新检索结果 4.1.4 PubMed的其他工具与链接My NCBI(我的NCBI)My NCBI:提供个性化服务,非常实用的文献管理工具PubMed主页的右上方有登录My NCBI 按钮用户注册并建立My NCBI账号后,可以管理在NCBI所有数据库的检索过程及检索结果,追踪了解所在研究领域的最新进展 My NCBI的主要功能:1. 保存检索策略及Email定期自动更新检索结果完成检索后,点击Save Search,进入My NCBI的My Saved Data页面,在Name of search栏中输入检索策略的名称,点击Save,系统自动提示是否需要通过Email定期自动发送新的检索结果,以及发送的频率、格式保存检索策略后,登录My NCBI主页面,点击Saved Searches子栏目下已保存的各个检索策略,即可完成检索点击Saved Searches子栏目下的Manage按钮,可以对保存的多个检索策略进行排序、删除、更改2. 保存检索结果浏览并选定检索结果后,在send to菜单中选择collections,即进入My NCBI中的Collections子页面默认为建立一个新文件保存选定的检索结果,输入文件名,系统自动提示保存了多少条记录;也可以将检索结果添加到已有的文件记录中保存检索结果后,只要登录My NCBI主页面, 点击Collections子栏目下的文件名,即可显示已保存的检索结果点击Collections子栏目下的Manage按钮,可以对保存的检索结果进行删除、排序、重命名、合并、共享等操作 3. 过滤检索结果 My NCBI的过滤器(Filter)提供了个性化的检索结果过滤功能在My NCBI主页面,点击左栏的Search Filters,点选PubMed,进入PubMed Filters,点击Frequently Requested Filters可对检索结果进行过滤,有综述、临床试验、免费全文、全文、最近5年的文献、英文、人类、有摘要等多个选项,勾选所需的项目,即可完成检索结果过滤的设置。以后只要登录My NCBI后检索Pu

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