分子诊断技术在肿瘤个体化医疗中的应用.pptx

分子诊断技术在肿瘤个体化医疗中的应用 孙奋勇上海市第十人民医院检验科 毒黄瓜 引发的思考 今年5月份 德国毒黄瓜事件造成14人死亡 华大基因在收到德国汉堡大学提供的样本后 短短三天时间内便完成了引起这次疫情的大肠杆菌全基因组测序 并于7日研制出该大肠杆菌的诊断试剂盒 并将诊断方案无偿在全球共享 病菌 是常见的肠出血性大肠杆菌的一个非常远的远亲 它大约80 的基因来自血清型为O104型的大肠杆菌 其余20 的基因来自另外一种大肠杆菌 细菌鉴定方法 细菌培养 表型鉴定 血清型分型 毒素分析 细菌培养 基因组测序 确定细菌种类 表型检测 基因型检测 基因组测序 基因型检测 基因组测序 基因组测序 基因型检测 基因型检测 拯救Beery 出生时确诊为脑瘫 在5岁半 病情开始恶化 14岁时 Alexis开始患有严重呼吸问题 时任LifeTechnologies公司首席信息官的孩子爸爸提出了全基因组测序的想法 最终发现了罪魁祸首 SPR基因突变两个双胞胎都遗传了这个基因变异副本 当SPR发生变异时 破坏了产生五羟色胺和去甲肾上腺素的细胞途径 医生建议增加补充小剂量五羟色胺药物 Alexis可以参加田径运动了 Noah也受益了 他的书写有所改善 基因组计划完成带来的机会TheGenomicOpportunity 个体化医疗 Personalizedmedicine Individualizedmedicine 就是通过对个体携带的信息进行检测 制定针对某些疾病的预防和治疗策略 指导临床开具适合每一个个体治疗的 基因处方 使患者获得最佳治疗效果 并尽可能避免药物不良反应 Genotyping 病因诊断 指导治疗 预后评估 疾病表征 Phenotyping 临检 生化 免疫 微生物 新的检验医学模式 肿瘤何以难治 目前肿瘤临床用药存在的问题 无效 同一起源肿瘤组织有不同基因型 不同基因型决定不同的转移方式 肿瘤 进化树 肿瘤异质性 肿瘤的 游击战术 放疗与化疗 肿瘤DNA损伤 哪里有 压迫 哪里就有反抗 加速转移与复发 治疗可导致肿瘤复发与转移 加速异质化进程 肿瘤治疗模式的历史演变 个体化医疗 为什么重要 DiagnosisSaveLivesDiagnosisSaveMoney 肿瘤个体化医疗的意义 疾病的早发现 早诊断更有效进行治疗选择最佳治疗方案降低药品不良反应增加病人治疗的依从性改进药靶选择 有利于新药物发现降低临床试验中的成本 研究时间和失败率以预防为重点的转变减少整体的医疗成本 qRT PCRSequencingFISH 液相芯片MLPA焦磷酸测序 固相芯片 深度测序 Genotyping 分子诊断技术种类 检测通量 低通量 中通量 高通量 全通量 PredictiveTestingMultipletechnologyplatformsneededforhigheranalyticvalidityMulti factorialtestingforcommon complexdiseasesMulti genesignaturesasstandardforcancer 95 confidenceintervalcurvesRecurrencescoreforindividualpatients Source Paik etal NEnglJMed December2004 GenomicsIsNotJustAboutHeredity UsingGeneExpressionToPredictCancerRecurrence Multigeneassaypredictsrecurrenceoftamoxifen treated node negativebreastcancerGeneexpressionanalysiswascombinedwithanalgorithmforcalculatingriskfordistantrecurrence 铂损伤DNA阻断复制 DNA损伤的修复需要 ERCC1错配修复酶 XRCC1X线修复交叉互补蛋白 XPD着色性干皮病修复酶 C118T Arg194TrpArg399Gln Asp312AsnLys751Gln VKORC1 DiseasewithGeneticComponent 肺癌的传统分类观点 小细胞肺癌 SCLC 非小细胞肺癌 NSCLC 腺癌鳞癌大细胞癌 KRAS 不清楚 EGFR HER2 BRAF ALKfusion PIK3CA MEK1 ROSfusion PDGFRamp 2009 肺腺癌的分子亚型 肺腺癌的分子分类 KRAS 不清楚 EGFR HER2 BRAF ALKfusion PIK3CA MEK1 ROSfusion PDGFRamp 药物敏感性突变G719X exon19del L858R L861Q药物继发性耐药 1年 exon20dup药物继发性耐药 2年 L747S D761Y T854A T790MMETamplification 2009 肺腺癌的分子亚型 肺腺癌的分子分类 肺腺癌的个体化分子靶向治疗 肿瘤小分子靶向药物与分子诊断 小分子靶向药物 小分子靶向药物通常是信号传导抑制剂 它能够特异性地阻断肿瘤生长 增殖过程中所必需的信号传导通路 从而达到治疗的目的 各种靶向治疗药物在中国的上市时间 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 美罗华 MabThera 希罗达 Xeloda 赫赛汀 Herceptin 格列卫 Glivec 易瑞沙 Iressa 特罗凯 Tarceva 爱必妥 Erbitux 恩度Endostatin Avastin Thediscoveryofimatinib Identifythecurrentindicationsforimatinib适应症 用于治疗费城染色体阳性的慢性髓性白血病 Ph CML 的慢性期 加速期或急变期 用于治疗不能切除和 或发生转移的恶性胃肠道间质肿瘤 GIST 的成人患者 1 2 MechanismofImatinib ImatinibismetabolizedbythecytochromeP450 CYP isoenzymesinthegutwallandliver ThemetabolismismainlymediatedbyCYP3A4andCYP3A5 butotherCYPisoenzymessuchasCYP1A2 CYP2D6 CYP2C9 andCYP2C19alsoplayminorroles Imatinib用药剂量的个体化差异 Cytochromep450 CYP3A4 SubstratesAcetaminophenAmiodaroneNifedipineCyclosporinCorticosteroidsWarfarinCannabinoidsEstradiolPantoprazole InhibitorsAmiodaroneAzithromycinCyclosporineMetronidazoleItraconazoleRanitidineTroglitazone Substrates concentrationincreaseswhengivenwithGleevecInhibitors concentrationofGleevecincreaseswhengivenwithInhibitor Imatinib的耐药机制 CML耐药机制 1 ABL激酶突变2 Src家族激酶通路的代偿作用3 BCR ABL本身的过度表达 耐药蛋白BCRP ABCG2的过度表达 GIST耐药机制 1 CD117的过表达2 突变 外显子的突变和CD117的突变3 药物代谢 BCR ABL融合基因的结构 BCR ABL激酶突变位点的检测 KantarjianH