试验九质粒DNA的制备.ppt

实验九碱变性法小量制备质粒DNA 一 实验目的及背景 质粒是染色体外的DNA分子 大小可为1kb到200kb 大多数来自细菌的质粒是双链 共价闭合环状的分子 以超螺旋形式存在 它是细菌内的共生型遗传因子 其复制和遗传独立于细菌染色体 但复制和转录依赖于宿主编码的蛋白和酶 质粒特点 质粒能在细菌中垂直遗传并且赋予宿主细胞一些表型 是比病毒更简单的原始生命 质粒通过细菌的结合作用 从雄性体转移到雌性体 是细菌有性繁殖的性因子 年由Lederburg正式命名为质粒 质粒类型 质粒按复制方式分为两种类型 松弛型质粒和严紧型质粒1 松弛型质粒松弛型质粒的复制不需要质粒编码的功能蛋白 完全依赖于宿主提供的半衰期较长的酶 即使蛋白质合成受抑制 质粒的复制依然进行 当抑制蛋白质合成并阻断细菌染色体复制的氯霉素等抗生素存在时 质粒的拷贝数可达2000 3000拷贝 2 严紧型质粒 严紧型质粒复制需要一个质粒编码的蛋白 质粒的拷贝数不能通过用氯霉素等蛋白合成抑制剂来增加 质粒的应用 大多数基因工程使用松弛型质粒 严紧型质粒用来表达一些可使宿主细胞受毒害致死的基因 质粒的特点使质粒成为携带外源基因进入细菌中扩增或表达的重要媒介物 这种基因运载工具在基因工程中具有极广泛的应用价值 本实验目的 本实验要求掌握最常用的质粒的提取方法 分离质粒DNA方法 从大肠杆菌中分离质粒DNA方法众多 目前常用的碱变性法 煮沸法 SDS法 羟基磷灰石层析法等各方法分离是依据宿主菌株类型 质粒分子大小 碱基组成及结构等特点加以选择的 其中碱变性法既经济且收得率较高 提取的质粒DNA可用于酶切 连接与转化 碱变性法基本原理 在pH12 0 12 6碱性环境中 线性的大分子量细菌染色体DNA变性 而共价闭环质粒DNA仍为自然状态 将PH调至中性并有高盐浓度存在的条件下 染色体DNA之间交联形成不溶性网状结构 大部分DNA和蛋白质在去污剂SDS的作用下形成沉淀 而质粒DNA仍为可溶状态 通过离心可除去大部分细胞碎片 染色体DNA RNA及蛋白质 质粒DNA尚在上清中 再用酚氯仿抽提进一步纯化质粒DNA 实验试剂 培养基 胰化蛋白胨10g酵母提取物5g定容1000mlpH7 5NaCl10g 0 1MNaCl10mMTrisHCl pH8 0 1mMEDTA 50mg ml溶菌酶10mg ml 用10mMTris HClpH8 0新鲜配制 试剂 溶液 50mM葡萄糖25mMTris HCl pH8 0 10mMEDTA溶液 新鲜配制 0 2NNaOH1 SDS溶液 5MKAC10ml冰醋酸11 5ml水28 5ml酚 氯仿 乙醇RNase琼脂糖 10mMTris HCl pH8 0 1mMEDTA pUC18 链长2 686bppUC18是适合于双脱氧法DNA测序的载体 在lacZ领域中含有多克隆位点 因此在含有IPTG X Gal的平板培养基上 很容易判断有无外源基因的插入 此外 也可以利用lacpromoter表达外源基因 进行DNA测序时 可以很方便地使用M13系列Primers 多克隆位点 EcoRI SacI KpnI SmaI BamHI XbaI SalI PstI SphI和HindIII只有一个酶切位点 用途克隆外源基因 利用lacpromoter进行基因表达 使用M13primers进行DNA测序 pUC18 pUC19cloningsite图 三 实验方法 挑取琼脂培养板上的单菌落至5mlLB培养液中 含AmP50 g ml 强烈摇荡过度 取1 5ml培养液至Eppendorf管中 12000g离心30秒 弃上清 用 mlSTE悬浮菌体 再离心回收菌体 并重复一次 弃上清 取沉淀 将细菌沉淀悬浮于100 l预冷溶液 中 振荡混匀 冰上放置5分钟 加入200 l溶液 盖严管盖轻柔颠倒 次以混匀内容物 冰上放置5分钟 加入150 l溶液 温和振荡数次 冰上放置 分钟 12000g4 离心 分钟 取上清移到 个新的Eppendorf管中 加入等体积酚 氯仿 振荡混匀 12000g4 离心 分钟 取上清移至另 个Eppendorf管中 加入 倍体积无水乙醇 振荡混匀 于室温静置2分钟 g 4 离心 分钟 弃上清 加入 ml70 乙醇漂洗沉淀 盖严管盖颠倒数次 000g于4 离心 分钟 弃上清 抽干乙醇 室温干燥 5 15分钟 加入50 lTE 含20 g mlRNA酶 不含DNA酶 溶解DNA 13 取10 lDNA溶解液用 稀释至1000ul测定OD260和OD280 计算OD260 OD280之比 14 同时以以下公式计算得率 质粒DNA得率 稀释倍数 OD260 0 05 50 1 5ml15 取10 lDNA溶解液加2 lLoadingbuffer于1 琼脂糖 电泳3小时 电压40伏 16 电泳凝胶在透射式紫外检测仪上观察 记录结果 四 结果分析 质粒DNAOD260 OD280的值 由此计算质粒DNA得率和 纯度 记录电泳结果并说