vasp并行总结 安装.doc

一、安装vasp前的软件要求：C+编译器用intel的（l_cprof_p_11.1.07）Fortran编译器用intel的ifort11（l_cprof_p_11.1.072）l_mpi_p_3.2.011MKL 有非商业版本可以免费下载，本来要用l_mkl_p_10.2.5.035的，但发现ifort11里/home/bjwang/intel/Compiler/11.1/072/mkl就有，这里免装，在.bashrc里把ifort11下mkl的路径包括进去。附完整安装后的.bashrcsource /home/bjwang/intel/Compiler/11.1/072/bin/intel64/ifortvars_intel64.sh-ifortsource /home/bjwang/intel/Compiler/11.1/073/bin/intel64/iccvars_intel64.sh -c+export LD_LIBRARY_PATH=/home/bjwang/intel/Compiler/11.1/072/ifort/mkl/lib/em64t/:$LD_LIBRARY_PATH-ifort中包含的mklsource /home/bjwang/intel/impi/3.2.0.011/bin64/mpivars.sh -l_mpi请确认mpi、C+、Fortran编译器都已正确安装，并设定好相关的PATH路径和LD_LIBRARY_PATH路径，具体参见新浪博客的其它相关内容。示意如下：1、安装英特尔c+编译器l_cproc_p_11.1.073bjwangnano vasp$ tar zxvf l_cproc_p_11.1.073.tgzbjwangnano vasp$ cd l_cproc_p_11.1.073bjwangnano l_cproc_p_11.1.073$ ./install.sh2、安装ifort11.1（l_cprof_p_11.1.072）内含mkl数据库bjwangnano $cd /home/bjwang/software/ifort11bjwangnano ifort11$ tar zxvf l_cprof_p_11.1.072.tgzbjwangnano $ cd l_cprof_p_11.1.072bjwangnano l_cprof_p_11.1.072$ ./install.sh3、安装l_mpi_p_3.2.011参考文件自带安装指导/home/bjwang/software/l_mpi_p_3.2.011/INSTALL.html 1.解压：bjwangnano software$ tar zxvf l_mpi_p_3.2.011.tgz2.拷贝*.lic文件到解压目录下：cp .lic .3.在解压目录下运行install.sh文件bjwangnano l_mpi_p_3.2.011$ ./install.sh二、安装vasp1、编译vasp数据库解压缩后，进入vasp.5.lib路径bjwangnano vasp$ cd vasp.5.libbjwangnano vasp.5.lib$ cp makefile.linux_ifc_P4 makefilebjwangnano vasp.5.libvi makefile把lib中Makefile文件中FC=ifc项改为：FC=ifort，其他不动# C-preprocessorCPP = gcc -E -P -C $*.F $*.fFC=ifortCFLAGS = -OFFLAGS = -O0 -FIFREE = -FRDOBJ = preclib.o timing_.o derrf_.o dclock_.o diolib.o dlexlib.o drdatab.o在make lib 出现个小问题（不影响，被忽略！）bjwangnano vasp.5.lib$ makerm libdmy.arm: cannot remove libdmy.a: No such file or directorymake: libdmy.a Error 1 (ignored)ar vq libdmy.a preclib.o timing_.o derrf_.o dclock_.o diolib.o dlexlib.o drdatab.oar: creating libdmy.aa - preclib.oa - timing_.oa - derrf_.oa - dclock_.oa - diolib.oa - dlexlib.oa - drdatab.objwangnano vasp.5.lib$2、并行编译vasp（利用ifort编译器和c+编译器，版本最好一致，这里ifort用l_cprof_p_11.1.072,c+用 l_cproc_p_11.1.073）解压缩后进入vasp.5.2路径，bjwangnano vasp$ cd vasp.5.2bjwangnano vasp.5.2$ cp makefile.linux_ifc_P4 makefilebjwangnano vasp.5.2vi makefile（具体修改的地方见bjwang-Vasp并行版本 make文件.doc）保存退出后bjwangnano vasp.5.2make运行并行vasp（算si）命令：bjwangnano si$mpirun n 8 /home/bjwang/vasp/vasp.5.2/vasp out &注：&符表示在后台运行，即使关掉SSH后计算仍然运行，如果不加这个符号则关掉SSH后计算